HHsearch 1.5 NAME c4v1lC_ FAM FILE c4v1lC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4v1lC_.a3m DATE Sat Jan 23 08:53:01 2016 LENG 131 match states, 131 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4212 0.0790 SEQ >ss_dssp CCEEEECCCEEEEGGGSCTTCCEEEEEGGGTTCCTTCCEEEEEEEEECSSCCEEEEECEEEEBSCGGGTTEEECCCEEEEECSSEEEEEEECCHHHHTTB CCSTTCEEEEECSEESSSEEEEEEEEEEECC >sa_dssp EEDCDBECEDEBCBEECCEEDCCBDBCAEEBEBCEECCACCACACACBEEEACDACACAAACADCEEEEEDCDBEECECEBECDECDACBEBDEEBBECC CBDEEBCACAAACEADBCDACADBBBADBDE >ss_pred CCCEEECCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHE ECCCCCEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEECC >ss_conf 9751532686376200287521553331013546554167999985226746666641056433566622640133321104881189996681267431 2045754899899873450788478997519 >Consensus sdgytikpnkkvtysalgedermigfsykdfgisssekitevqvnisanknigkyvgqfgtsttdsangywamgdeitqsisGxxGxIxWxVPxdisxxi xxxygGEikFGxxWxDCDxxxiDSVvlkleh >c4v1lC_ SDGYTIKPNKKVTYSALGEDERMIGFSYKDFGISSSEKITEVQVNISANKNIGKYVGQFGTSTTDSANGYWAMGDEITQSISGNSGTITWKVPSDISSII QTQYGGEIKFGVWWIDCDEFTIDSVVLKLEH >UniRef50_UPI0001C37637(119-195:682) endoglucanase family protein 5 n=1 Tax=Ruminococcus flavefaciens FD-1 RepID=UPI0001C37637 E=2e-05 s/c=0.66 id=40% cov=32% ----------------------------------------------------------------------------------GGYGEIRWDVPPEVAEYV NVN--GEVQFGYYWGDCDSVKLDSV------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 D 2 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 P 8 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 N 9 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 V 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1000 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 A 16 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 G 18 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 E 19 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 M 23 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 S 27 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1000 0 0 K 29 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 F 31 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 S 34 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 K 38 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 T 40 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 E 41 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 V 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 43 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 I 46 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 N 51 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 I 52 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 G 53 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 55 0 * * * * * * 1000 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 58 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 F 59 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 T 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 D 65 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 A 67 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 N 68 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 1000 0 0 W 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 M 73 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 D 75 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 I 77 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 79 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 S 80 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 I 81 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 G 83 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1471 0 0 N 84 * * * * * 1069 * * * * * 934 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1471 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * * * * 934 * * * 1069 85 0 * * * * * * 1471 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1471 0 0 T 87 * * * 1069 * * * * * * * * * * * * 934 * * * 87 0 * * * * * * 1471 0 0 I 88 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1471 0 0 T 89 * * * * * * * * * * * * * * 1069 * 934 * * * 89 0 * * * * * * 1471 0 0 W 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 90 0 * * * * * * 1471 0 0 K 91 * * 1069 * * * * * 934 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1471 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 92 0 * * * * * * 1471 0 0 P 93 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1471 0 0 S 94 * * * * * * * * * * * * 1069 * * 934 * * * * 94 0 * * * * * * 1471 0 0 D 95 * * 934 1069 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1471 0 0 I 96 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 1069 * * 96 0 * * * * * * 1471 0 0 S 97 1069 * * * * * * * * * * * * * * 934 * * * * 97 0 * * * * * * 1471 0 0 S 98 * * * 1069 * * * * * * * * * * * 934 * * * * 98 0 * * * * * * 1471 0 0 I 99 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * * * 1069 99 0 * * * * * * 1471 0 0 I 100 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 1069 * * 100 0 * * * * * * 1471 0 0 Q 101 * * * * * * * * * * * 1069 * 934 * * * * * * 101 0 * * * * * * 1471 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * * * * * * 934 1069 * * 102 0 * * * * * * 1471 0 0 Q 103 * * * * * * * * * * * 1069 * 934 * * * * * * 103 934 * 1069 * * * * 1471 0 0 Y 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 104 0 * * * * * 0 1000 0 1000 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 G 106 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1471 0 0 E 107 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1471 0 0 I 108 * * * * * * * 934 * * * * * * * * * 1069 * * 108 0 * * * * * * 1471 0 0 K 109 * * * * * * * * 934 * * * * 1069 * * * * * * 109 0 * * * * * * 1471 0 0 F 110 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1471 0 0 G 111 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1471 0 0 V 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * 934 * 1069 112 0 * * * * * * 1471 0 0 W 113 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 934 1069 113 0 * * * * * * 1471 0 0 W 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 114 0 * * * * * * 1471 0 0 I 115 * * * * * 1069 * 934 * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1471 0 0 D 116 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1471 0 0 C 117 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1471 0 0 D 118 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1471 0 0 E 119 * * * 934 * * * * * * * * * * * 1069 * * * * 119 0 * * * * * * 1471 0 0 F 120 * * * * 934 * * * * * * * * * * * * 1069 * * 120 0 * * * * * * 1471 0 0 T 121 * * * * * * * * 1069 * * * * * * * 934 * * * 121 0 * * * * * * 1471 0 0 I 122 * * * * * * * 934 * 1069 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1471 0 0 D 123 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1471 0 0 S 124 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 124 0 * * * * * * 1471 0 0 V 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 125 0 * * * * * * 1471 0 0 V 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 L 129 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 E 130 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 H 131 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //