HHsearch 1.5 NAME c4ue0A_ FAM FILE c4ue0A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4ue0A_.a3m DATE Sat Jun 6 08:16:04 2015 LENG 115 match states, 115 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.2 EVD 0.4260 -0.4580 SEQ >ss_dssp CEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEECSSCEEEEEEECCBCCSSCCSEEEEECCHHHHTTCCSSSCEEEEEEEECTTSCEEEEEEEEEEETTEEEEEESSCCC TTSCBCCEEEEEEEC >sa_dssp EDECECEBEBEEBEACBBBCACDDEEDDBBBACBDEBDADCEBDCADBEBCECACCACDDEEDAEBDADAECEEEDDDEABADACDEECDACADBECDAD DECDACDBEBECDDE >ss_pred CCCCCEEECCCCEEEEEEEEEEEECEEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCHHEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCC CCEEEEEEEEEEEEC >ss_conf 9765177513305999999875303039999960146127872699994785601001006740346665338735899999991776489999535411 321431245666639 >Consensus txqgsxxvxfxxyxiaxxWqiixTxxxxIYiLxcTqfxPxsxvxtlxFtpxdxxxsffxxdspxxtxxxQxxgxxxvkxigvtxSksxsxixixfSsxlx xnvxxSxwtAsixrx >c4ue0A_ TRQGSRVVGFMDFIIALGWQIIPSNIRYIYILNCSQFMPTSDVTTIYFQADSGLESIFVMDSPFYASCTQQLPDKTIKTYGVTISKKQSIISINFSSSLE PNIMVSAWTASITRT >UniRef50_Q98XR5(358-468:473) Fiber protein n=1 Tax=Odocoileus adenovirus 1 RepID=Q98XR5_9ADEN E=1e-35 s/c=1.35 id=34% cov=97% TTQGSQIIPFDAYELVLMWQKFLTTRHAIYVLHCTSFIPDTSVDTITFTPNDGLKAFLSTDSPLFTAAFQQVGNE-VKTIGVKFSKiSDTEVQIKYSQML TTQVILSSWTAT---- >UniRef50_Q83893(430-538:543) Fiber n=1 Tax=Ovine adenovirus 7 RepID=Q83893_ADEO7 E=9e-33 s/c=1.29 id=46% cov=95% TKQGTITVNFLSTTpIAFGWQIIPTTVAFIYILSGTQFTPQSPVTSLGFQPPQDFLDFFVL-SPFVTSVTQIVGND-VKVIGLTISKNQSTITMKFTSPL AENVPVSMFTA----- >UniRef50_Q994D4(379-484:500) Fiber protein n=3 Tax=Mastadenovirus RepID=Q994D4_9ADEN E=8e-07 s/c=0.52 id=25% cov=90% -----------NYQIAFSWDIVETDQNYfIYTLRCTEITPQNNQVELSFTPTDpNFISFFDYINTMHTVAHQISGSTVTNIpITVTYSNSSNQLRIIFSS TVVKNLTMTPWVASVVR- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1862 0 0 R 2 * * * * * * * * 1656 * * * * * 1595 * 1508 * * * 2 0 * * * * * * 1862 0 0 Q 3 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1862 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1862 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 551 1656 * * * 5 0 * * * * * * 1862 0 0 R 6 * * * * * * * 1656 * * * * * 1508 1595 * * * * * 6 0 * * * * * * 1862 0 0 V 7 * * * * * * * 1508 * * * * * * * * 1656 1595 * * 7 0 * * * * * * 1862 0 0 V 8 * * * * * * * 1508 * * * * * * * * * 625 * * 8 0 * * * * * * 1862 0 0 G 9 * * * * * 1595 * * * * * 1656 1508 * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1862 0 0 F 10 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1862 0 0 M 11 * * 1508 * * * * * * 1656 1595 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1862 0 0 D 12 1976 * 2044 * * * * * * * * 1835 * * * 2164 * * * * 12 0 * * * * * * 2318 0 0 F 13 * * * * 2044 * * * * * * * * * * * 2164 * * 904 13 0 * * * * * * 2318 0 0 I 14 * * * 1976 * * * 2044 * * * * * 1835 * * 2164 * * * 14 364 2164 * 0 * * * 2318 1000 0 I 15 * * * * * * * 423 * 1976 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 2318 0 0 A 16 423 * * * * * * * * * * * * * * * * 1976 * * 16 0 * * * * * * 2318 0 0 L 17 * * * * 990 * * * * 1010 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2318 0 0 G 18 * * * * * 1103 * * * * 1976 * * * * 1835 * * * * 18 0 * * * * * * 2318 0 0 W 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 19 0 * * * * * * 2318 0 0 Q 20 * * 1835 * * * * * * * * * * 475 * * * * * * 20 0 * * * * * * 2318 0 0 I 21 * * * * * * * 423 1976 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2318 0 0 I 22 * * * * 1976 * * 1103 * * * * * * * * * 1835 * * 22 0 * * * * * * 2318 0 0 P 23 * * * 1835 * * * * * 1976 * * 1103 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2318 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 2044 401 * * * 24 0 * * * * * * 2318 0 0 N 25 * * 1835 * * * * * * * * 2044 * * * * 1067 * * * 25 0 * * * * * * 2318 0 0 I 26 * * * * * * * 2044 * * * * * 1835 1976 * * 2164 * * 26 0 * * * * * * 2318 0 0 R 27 2164 * * * * * 1976 * * * * 1835 * * 2044 * * * * * 27 0 * * * * * * 2318 0 0 Y 28 1976 * * * 2164 * * * * * * * * * * * * * * 936 28 475 1835 * 0 * * * 2318 1000 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2318 0 0 Y 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 30 0 * * * * * * 2318 0 0 I 31 * * * * * * * 1103 * * * * * * * * 1835 1976 * * 31 0 * * * * * * 2318 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2318 0 0 N 33 * * * * * * 1976 * * * * 2044 * * 1835 2164 * * * * 33 0 * * * * * * 2318 0 0 C 34 * 364 * * * 2164 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2318 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 2044 401 * * * 35 0 * * * * * * 2318 0 0 Q 36 * * * 1835 * * * * * * * * * 1103 * 1976 * * * * 36 0 * * * * * * 2318 0 0 F 37 * * * * 475 * * 1835 * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2318 0 0 M 38 * * * * * * * 1976 * * 2044 * * * * * 990 * * * 38 0 * * * * * * 2318 0 0 P 39 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2318 0 0 T 40 * * 1976 * * * * * * * * * * 990 * * 2044 * * * 40 0 * * * * * * 2318 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * 1835 * * * 1103 1976 * * * 41 0 * * * * * * 2318 0 0 D 42 * * 2044 * * * * * * * * 1835 2164 * * 1976 * * * * 42 0 * * * * * * 2318 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * 1835 * * * 475 * * 43 0 * * * * * * 2318 0 0 T 44 * * 1976 * * * * * * * * * * * * * 1103 1835 * * 44 0 * * * * * * 2318 0 0 T 45 * * * 1835 * * * * * * * * * * * 2164 1010 * * * 45 0 * * * * * * 2318 0 0 I 46 * * * * * * * 1010 * 990 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2318 0 0 Y 47 * * * * * 2164 * * * * * * * * * 1835 1976 * * 2044 47 0 * * * * * * 2318 0 0 F 48 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2318 0 0 Q 49 * * * * * * * * * * * * * 1103 * * 904 * * * 49 0 * * * * * * 2318 0 0 A 50 2044 * * * * * * * * * * * 401 * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2318 0 0 D 51 * * 2044 * * * * * * * * 1976 2164 * * * 1835 * * * 51 0 * * * * * * 2318 0 0 S 52 * * 904 * * * * * * * * * * 2164 * 2044 * * * * 52 475 1835 * 0 * * * 2318 1000 0 G 53 * * 2164 * * 1010 * * * * * 1835 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2318 0 0 L 54 * * * * 990 * * * * 1010 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2318 0 0 E 55 * * * 2044 * * * 1835 1976 2164 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2318 0 0 S 56 1976 * 2164 * * * * * * * * * * * * 936 * * * * 56 0 * * * * * * 2318 0 0 I 57 * * * * 401 * * 2044 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2318 0 0 F 58 * * * * 423 * * * * 1976 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2318 0 0 V 59 * * 1835 * * * * * * * * * * * * 1976 * 1103 * * 59 0 * * * * * * 2318 0 0 M 60 * * * * * * * * * 2164 2044 * * * * * 1976 * * 1835 60 364 * 2164 * * * * 2318 0 0 D 61 * * 616 * * * * 1525 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * 0 * 2111 0 1000 S 62 * * * * * * * * * * * 1835 * * * 475 * * * * 62 0 * * * * * * 2318 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 475 * * * 1835 * * * 63 0 * * * * * * 2318 0 0 F 64 * * * * 1103 * * * * 1976 1835 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2318 0 0 Y 65 * * * * 1976 * 1835 * * * * * * * * * * 2164 * 2044 65 0 * * * * * * 2318 0 0 A 66 2044 * * * * * * * * * * * * * * * 401 * * * 66 0 * * * * * * 2318 0 0 S 67 1976 * * * * * * * * * * * * * * 1103 * 1835 * * 67 0 * * * * * * 2318 0 0 C 68 904 2044 * * * * * * * * * * * * * * * 2164 * * 68 0 * * * * * * 2318 0 0 T 69 * * * * 1976 * 1835 * * * * * * * * * 1103 * * * 69 0 * * * * * * 2318 0 0 Q 70 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 70 0 * * * * * * 2318 0 0 Q 71 * * * * * * * 990 * * * * * 1010 * * * * * * 71 0 * * * * * * 2318 0 0 L 72 * * * * * * * * * 2044 * * * * * 1835 * 1067 * * 72 0 * * * * * * 2318 0 0 P 73 * * * * * 401 * * * * * * 2044 * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2318 0 0 D 74 * * 2044 * * * * * * * * 1067 * * * 1835 * * * * 74 0 * * * * * * 2318 0 0 K 75 * * 2164 1976 * * * * 2044 * * * * * * * 1835 * * * 75 936 * 1067 * * * * 2318 0 0 T 76 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 76 0 * * * * 0 * 1679 0 1571 I 77 * * * * * * * 2044 * * * * * * * * 1835 1067 * * 77 0 * * * * * * 2318 0 0 K 78 * * * * * * * * 475 * * 1835 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2318 0 0 T 79 * * * * * * * 1835 * * * * * * * * 1010 2164 * * 79 475 1835 * 0 * * * 2318 1000 0 Y 80 * * * * * * * 401 * * * * * * * * * * * 2044 80 0 * * * * * * 2318 0 0 G 81 * * * * * 475 * * * * * * * * * * 1835 * * * 81 0 * * * * * * 2318 0 0 V 82 * * * * * * * * * 2164 * * * * * * * 364 * * 82 0 * * * * * * 2318 0 0 T 83 * * * * * * * * 1976 * * * * * * * 423 * * * 83 0 * * * * * * 2318 0 0 I 84 * * * * 1976 * * 1103 * * * * * * * * * * * 1835 84 0 * * * * * * 2318 0 0 S 85 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 85 0 * * * * * * 2318 0 0 K 86 * * * * * * * * 475 * * 1835 * * * * * * * * 86 423 1976 * 0 * * * 2318 1000 0 K 87 * * * * * * * * 2044 * * 2164 * * * 904 * * * * 87 0 * * * * * * 2318 0 0 Q 88 * * 1976 * * * * * * * * * * 1103 * 1835 * * * * 88 0 * * * * * * 2318 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * 1835 * * * 1103 1976 * * * 89 0 * * * * * * 2318 0 0 I 90 * * * 1976 * * * 2044 * * * * * 1835 * * 2164 * * * 90 0 * * * * * * 2318 0 0 I 91 * * * * * * * 1103 * 1835 * * * * * * * 1976 * * 91 0 * * * * * * 2318 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * * * 1976 1835 2044 2164 * * * 92 0 * * * * * * 2318 0 0 I 93 * * * * * * * 364 * * 2164 * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2318 0 0 N 94 * * * * * * * 1835 1067 * * 2044 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2318 0 0 F 95 * * * * 423 * * * * * * * * * * * * * * 1976 95 0 * * * * * * 2318 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 364 2164 * * * 96 0 * * * * * * 2318 0 0 S 97 * * * * * * * * * * * * * 1976 * 423 * * * * 97 0 * * * * * * 2318 0 0 S 98 * * * * * * * * * * 1976 * 2164 * * 2044 1835 * * * 98 0 * * * * * * 2318 0 0 L 99 * * * * * * * * * 475 * * * * * * * 1835 * * 99 0 * * * * * * 2318 0 0 E 100 2164 * * 2044 * * * * * * * * * * * * 1976 1835 * * 100 0 * * * * * * 2318 0 0 P 101 * * * 2164 * * * * 1835 * * * 2044 * * * 1976 * * * 101 0 * * * * * * 2318 0 0 N 102 * * * * * * * * * * * 423 * 1976 * * * * * * 102 0 * * * * * * 2318 0 0 I 103 * * * * * * * 2044 * 1835 * * * * * * * 1067 * * 103 0 * * * * * * 2318 0 0 M 104 * * * * * * * 1976 * * 2044 * 2164 * * * 1835 * * * 104 0 * * * * * * 2318 0 0 V 105 * * * * * * * * * 1976 1835 * * * * * * 1103 * * 105 0 * * * * * * 2318 0 0 S 106 * * * * * * * * * * * * * * * 475 1835 * * * 106 0 * * * * * * 2318 0 0 A 107 2044 * * * * * * * * * 2164 * 1835 * * 1976 * * * * 107 0 * * * * * * 2318 0 0 W 108 * * * * 2164 * * * * * * * * * * * * * 364 * 108 0 * * * * * * 2318 0 0 T 109 * * * * * * * * * * * * * * * * 475 1835 * * 109 0 * * * * * * 2318 0 0 A 110 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2318 0 0 S 111 * * * * * * * * * * * * * * * 562 1633 * * * 111 0 * * * * * * 2111 0 0 I 112 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 112 0 * * * * * * 1679 0 0 T 113 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 113 0 * * * * * * 1679 0 0 R 114 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 114 0 * * * * * * 1679 0 0 T 115 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 115 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //