HHsearch 1.5 NAME c4rlrA_ FAM FILE c4rlrA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4rlrA_.a3m DATE Sat Apr 4 08:14:59 2015 LENG 126 match states, 126 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.3967 -0.5434 SEQ >ss_dssp CCCCTTTTHHHHHHHHTHHHHSTTSBSSHHHHHHTHHHHHTTTCCBCCCSHHHHHTTTTSSSTTHHHHHHCCCCCCCCCTTGGGGCSSHHHHHHHHHHHH HHHSSCCCCCGGGCCHHHHHTCCCCC >sa_dssp EDCCBECDADDBBDECCCEDBBEEBADDDEDBBEEDEECEEDEBBBDBCCCECACCBACEDCAABBACDBCCBEEEDDCECBEDABEDDCCCDECAECAD DAADDCBDDEDEEBDEDCCECBEBDD >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH HHHHHEEECCCCCCCHHHHHCEEECC >ss_conf 9630344323686422343204544741577889898687407886612154523422258811577652067888866057673677799985199998 76632010007653767651025319 >Consensus xEvTyRxdixPlxxxrCaxCHgaxxaPexxxFxxxxxxxxxxxqGxRMdsYxxLixxxaWPxTGAlMRRLDDGxxgKxGNMYqxLGxtexERqxNLaxfk aWVGxWxxkrwpxvsKeeLxxixxxY >c4rlrA_ GEVTYRKDIKPIFDVRCAGCHGADAAPEYHAFKAEKEKWLAKGQGMRMDTYSHLIFYTAWPDTGALMRRLDDGKDAKPGNMYRHLGATEEERQRNLAVFK AWVGVWNLKKWPDITKEELNAITVTY >UniRef50_A1AM87(1-150:150) Cytochrome c family protein, putative n=2 Tax=Desulfuromonadales RepID=A1AM87_PELPD E=5e-68 s/c=1.44 id=69% cov=101% QETTWRKDVKPLFDARCAACHSDVSAPEHDAFKEKKQRWLANGQGMRMNSYSHLIYYTAWPGTGALMRRLDDGRNlkgGKAGNMYQFLGATEAERQKNLA VFKAWVGTWVVKRWPDVTKDELNGIRVKY >UniRef50_B8GU62(7-155:155) Cytochrome c family protein, putative n=1 Tax=Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7 RepID=B8GU62_THISH E=6e-56 s/c=1.41 id=52% cov=100% NEVTYREHIRPLWENNCAQCHGA-TAPYRGEFREDRARYERENKGPRMDTYADLVYFIAWPSTGALMRRLDDGgntANGKPGNMYQYLGGSEEERQKNLA LFRAWVGgdeAWTMKRSGEISKEELERFKLAY >UniRef50_Q12HG1(9-157:157) Cytochrome c family protein, putative n=3 Tax=Burkholderiales RepID=Q12HG1_POLSJ E=2e-49 s/c=1.31 id=52% cov=100% QEVTYRTDIAPLWKSRCVACHGAQ-SPERADFLLDEKGYAEKSQGPRMDSYERLIAFISWPDTGAFMRRLDDGSSqyagGKSGNMYQYLGSTDAERAANL KLLKGWVgdGAWNLNRWnkrgdvPMVSKEQLDKIQLKY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 2082 * * * * * 1937 * 992 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1724 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1724 0 0 V 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 2058 396 * * 3 0 * * * * * * 1724 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 4 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2058 396 5 0 * * * * * * 1724 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 1724 0 0 K 7 * * * 1937 * * * * 1070 * * * * * * * 1929 * * * 7 0 * * * * * * 1724 0 0 D 8 * * 437 * * * 1937 * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1724 0 0 I 9 * * * * * * * 396 * * * * * * * * * 2058 * * 9 0 * * * * * * 1724 0 0 K 10 1929 * * * * * * * 1070 * * * * * 1937 * * * * * 10 0 * * * * * * 1724 0 0 P 11 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1724 0 0 I 12 * * * * * * * 2082 * 389 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1724 0 0 F 13 * * * * 1070 * * * * * * * * * * * * * 933 * 13 0 * * * * * * 1724 0 0 D 14 * * 1070 1937 * * * * 1929 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1724 0 0 V 15 2058 * * * * * * * * * * 1937 * * * 1929 * 2082 * * 15 0 * * * * * * 1724 0 0 R 16 * * * * * * * * * * * 1937 * * 437 * * * * * 16 0 * * * * * * 1724 0 0 C 17 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1724 0 0 A 18 439 * * * * * * * * * * * * * * * * 1929 * * 18 0 * * * * * * 1724 0 0 G 19 992 * * * * 2082 * * * * * * * 1937 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1724 0 0 C 20 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1724 0 0 H 21 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1724 0 0 G 22 * * * * * 396 * * * * * * * * * 2058 * * * * 22 0 * * * * * * 1724 0 0 A 23 396 * 2058 * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 437 * 1937 * * * * 1724 0 0 D 24 * * 1649 * * * * * * * * * * 1472 * * * 1640 * * 24 645 * 1472 * * 0 * 1536 0 1000 A 25 1652 * * * * * * * * * * * * * * 1634 1475 * * * 25 0 * * * * 0 * 1534 0 1000 A 26 439 * * * * * * * * * * * * * * 1929 * * * * 26 0 * * * * * * 1724 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1724 0 0 E 28 * * * 437 * * * * * * * * * * * * * * * 1937 28 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 29 * * * * * * 2058 * * * * * * * 933 * * * * 2082 29 0 * * * * * * 1724 0 0 H 30 1929 * 2058 * * 1937 2082 * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1724 0 0 A 31 1070 * 1929 1937 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1724 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1724 0 0 K 33 * * * * * * * * 1070 1929 * * * * 1937 * * * * * 33 0 * * * * * * 1724 0 0 A 34 2082 * * 996 * * * * * 1929 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1724 0 0 E 35 * * 933 2082 * * * * 2058 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1724 0 0 K 36 * * * 1929 * * * * 1070 * * * * * 1937 * * * * * 36 0 * * * * * * 1724 0 0 E 37 1937 * * 2082 * * * * 1929 * * * * 2058 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1724 0 0 K 38 * * * * * 1929 * * 2082 * * * * * 996 * * * * * 38 0 * * * * * * 1724 0 0 W 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1070 933 39 0 * * * * * * 1724 0 0 L 40 1929 * * 1937 * * * * * 1070 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1724 0 0 A 41 1070 * * 1929 * * * * * * * * * * 1937 * * * * * 41 0 * * * * * * 1724 0 0 K 42 * * * 1937 * * * * 1004 * * 2058 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1724 0 0 G 43 * * * * * 1070 * * * * * 1937 * * * 1929 * * * * 43 0 * * * * * * 1724 0 0 Q 44 * * * * * * * * 1937 * * * * 437 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1724 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1724 0 0 M 46 * * * * * * * * * * 1070 * 933 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1724 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1724 0 0 M 48 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1724 0 0 D 49 * * 396 * * * * * * * * 2058 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1724 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * 992 1008 * * * 50 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 51 0 * * * * * * 1724 0 0 S 52 1937 * * 1929 * * * * * * * * * * * 1070 * * * * 52 0 * * * * * * 1724 0 0 H 53 * * 1937 * * * 1070 * * * * * * * 1929 * * * * * 53 0 * * * * * * 1724 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1724 0 0 I 55 * * * * * * * 437 * * * * * * * * * 1937 * * 55 0 * * * * * * 1724 0 0 F 56 1929 * * * 2082 * * * * * * * * * * * * * * 996 56 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 57 * * * * 933 * * * * * * * * * * * * * * 1070 57 0 * * * * * * 1724 0 0 T 58 * * * * * * * 933 * * * * * * * * 1070 * * * 58 0 * * * * * * 1724 0 0 A 59 439 * * * * * * * * * * * * * * 1929 * * * * 59 0 * * * * * * 1724 0 0 W 60 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 60 0 * * * * * * 1724 0 0 P 61 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1724 0 0 D 62 * * 1004 * * 2058 * * * * * * * * * 1937 * * * * 62 0 * * * * * * 1724 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1724 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1724 0 0 A 65 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1724 0 0 L 66 * * * * 1929 * * * * 439 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1724 0 0 M 67 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1724 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 68 0 * * * * * * 1724 0 0 R 69 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 69 0 * * * * * * 1724 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1724 0 0 D 71 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1724 0 0 D 72 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1724 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 437 1937 * 1585 585 * * 1724 1000 0 K 74 1937 * * * * * * * 2082 * * * * * 2058 1929 * * * * 74 0 * * * * * * 1724 0 0 D 75 * * 2082 * * * * * * * * 996 * * * 1929 * * * * 75 1008 992 * 1817 481 * * 1724 1398 0 A 76 2082 * * * * 389 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1724 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1724 0 0 P 78 2058 * * * * * * * * * * * 1008 * * 1929 * * * * 78 0 * * * * * * 1724 0 0 G 79 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1724 0 0 N 80 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1724 0 0 M 81 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * * * * * 1724 0 0 R 83 * * * * * * * * * * * * * 389 2082 * * * * * 83 0 * * * * * * 1724 0 0 H 84 * * * * 2058 * 2082 * * * * * * * * * * * * 933 84 0 * * * * * * 1724 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1724 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1724 0 0 A 87 1070 * * * * 1937 * * * * * * * * * 1929 * * * * 87 0 * * * * * * 1724 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * * * * * 1937 437 * * * 88 0 * * * * * * 1724 0 0 E 89 * * 1929 439 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1724 0 0 E 90 992 * * 1008 * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1724 0 0 E 91 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1724 0 0 R 92 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 92 0 * * * * * * 1724 0 0 Q 93 1929 * * * * * * * * * * * * 439 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1724 0 0 R 94 1929 * * * * * * * 996 * * * * * 2082 * * * * * 94 0 * * * * * * 1724 0 0 N 95 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1724 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1724 0 0 A 97 439 * * * * * * * 1929 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1724 0 0 V 98 * * * * * * * * * 933 * * * * * * * 1070 * * 98 0 * * * * * * 1724 0 0 F 99 * * * * 439 * * * * 1929 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1724 0 0 K 100 * * * * * * * * 437 * * * * * 1937 * * * * * 100 0 * * * * * * 1724 0 0 A 101 439 * * * * 1929 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1724 0 0 W 102 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 102 0 * * * * * * 1724 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 439 1929 * 1000 1000 * * 1724 1000 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 437 1937 * 1585 585 * * 1724 1000 0 V 105 933 * * * * * * * * * * * * * * * 2058 2082 * * 105 0 * * * * * * 1724 0 0 W 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 106 0 * * * * * * 1724 0 0 N 107 * * * * * * * * * * * 1004 * * * * 1937 2058 * * 107 0 * * * * * * 1724 0 0 L 108 * * * * * * * * * 1004 1937 * * * * * * 2058 * * 108 0 * * * * * * 1724 0 0 K 109 * * * * * * * * 439 * * 1929 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1724 0 0 K 110 * * * * * * * * 2082 * * * * * 389 * * * * * 110 0 * * * * * * 1724 0 0 W 111 * * * * * * * * * * * * * * * 1937 * * 437 * 111 439 1929 * 2585 263 * * 1724 1000 0 P 112 * * * * * 1937 * * * * * * 437 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1724 0 0 D 113 * * 1070 1937 * * * * * * 1929 * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1724 0 0 I 114 * * * * * * * 1008 * * * * * * * * * 992 * * 114 0 * * * * * * 1724 0 0 T 115 * * * * * * * * * * * * * * * 933 1070 * * * 115 0 * * * * * * 1724 0 0 K 116 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1724 0 0 E 117 * * 2058 396 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1724 0 0 E 118 * * * 439 * * * * * * * * * 1929 * * * * * * 118 0 * * * * * * 1724 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1724 0 0 N 120 * * 1929 1937 * * * * * * * 1070 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1724 0 0 A 121 2082 * * * * 2058 * * 1929 * * * * * 1937 * * * * * 121 0 * * * * * * 1724 0 0 I 122 * * * * 1937 * * 437 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1724 0 0 T 123 * * * * * * * * 1937 * * * * 1929 2058 * 2082 * * * 123 0 * * * * * * 1724 0 0 V 124 * * * * * * * * * 933 * * * * * * * 1070 * * 124 0 * * * * * * 1724 0 0 T 125 1937 * * * * * * * 992 * * * * * * * 2082 * * * 125 0 * * * * * * 1724 0 0 Y 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 126 0 * * 0 * * * 1724 0 0 //