HHsearch 1.5 NAME c4rg9S_ FAM FILE c4rg9S_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4rg9S_.a3m DATE Sat Dec 27 08:15:11 2014 LENG 35 match states, 35 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4892 3.5141 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHHHTHHHHHHHTGGGSCCHHHHTSSCC >sa_dssp EEEEDDEDEEEDDDEEEEECDEEEEDEDDEEEEDE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCC >ss_conf 90467889999999985333101116999628797 >Consensus xqqvxrmexlaglvexleadewxxkpieqllgftp >c4rg9S_ XQQVARXEKLAGLVEELEADEWRFKPIEQLLGFTP >UniRef50_Q561X1(74-106:108) Zgc:110659 n=13 Tax=Coelomata RepID=Q561X1_DANRE E=1e-08 s/c=1.85 id=79% cov=97% -QQVSRMERLAGLVEQLEADEWKYKPIEQLLGFT- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1111 0 0 Q 3 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1111 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 4 0 * * * * * * 1111 0 0 A 5 1044 * * * * * * * * * * * * * * 957 * * * * 5 0 * * * * * * 1111 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 6 0 * * * * * * 1111 0 0 X 7 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1111 0 0 K 9 * * * * * * * * 1044 * * * * * 957 * * * * * 9 0 * * * * * * 1111 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1111 0 0 A 11 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1111 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1111 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1111 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1111 0 0 E 15 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1111 0 0 E 16 * * * 1044 * * * * * * * * * 957 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1111 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1111 0 0 E 18 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1111 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1111 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1111 0 0 E 21 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1111 0 0 W 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 22 0 * * * * * * 1111 0 0 R 23 * * * * * * * * 957 * * * * * 1044 * * * * * 23 0 * * * * * * 1111 0 0 F 24 * * * * 1044 * * * * * * * * * * * * * * 957 24 0 * * * * * * 1111 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1111 0 0 P 26 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1111 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1111 0 0 E 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1111 0 0 Q 29 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 29 0 * * * * * * 1111 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1111 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1111 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1111 0 0 F 33 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1111 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 1111 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //