HHsearch 1.5 NAME c4qn8A_ FAM FILE c4qn8A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4qn8A_.a3m DATE Sat Jul 19 11:44:44 2014 LENG 153 match states, 153 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.7 EVD 0.4118 -0.3330 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHHHHHHTSCCCHHHHHHHTCTTSSCCCSSCCCTTSCCBTTBCCHHHHHHHHHHHHGGGSCHHHHHHHHHHHHHHSCCCSTTCTTTSCC HHHHHHHHHHHHCHHHHGGGGGSHHHHHHSCSHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHC >sa_dssp ECBCCACECCEEBBECAEECEBDDEDADDABDDECBDDBEDEDDEEDEEDDEBBCCBCAACCAADDBBEDBEDDCABDAACCAAECBDEEEEEDBADDDC BBBAAAABABBDDDECADDABECECACECBECEEDCDDACEECAEDBBDDBEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCCH HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9636899999999777304723610000054302076686730788886633411368899999985023589999999764542078677420001420 78999887776450479999866665553277405789999999999998519 >Consensus xpLxQTxxLixxYgxxLxnGTIsdxeLxxLldxxtFxkSxGyVdpNxPvtdxNHxqmDAIxDFvlxvxpxLtxevLHqLTxRmIxlaPdxgxNtFmRnst LEKafLAyElaxxPxxaexxfxxxRxxxeFxgxxDixnLkxVILxPiixxxss >c4qn8A_ XPLTQTQRLINTYGASLKNGTISNEELIILLDPNTFTKSEGYVDPNAPVSDSNHSKXDAIKDFVLTIGPTLDSEILHQLTSRXIELSPPGDRNTFXRGSS LEKAFLAFEXAHYPTKAEEHFNSTRVRTEFPGENDIDNLKAVILNPIIAFFQS >UniRef50_D1RM41(2-155:315) VipE n=1 Tax=Legionella longbeachae D-4968 RepID=D1RM41_LEGLO E=4e-44 s/c=1.16 id=57% cov=100% -PLQQTRKLLKKYGKSLNDGTISDQTLDLLLQPDTFKRSPGtaYVDPNKPVTDTNHTQMDAIKDFVETVGEELSPEVLHTLTDRIIQRAPDRGENTFMRN STLEKALLAYEMALYPDLAESHFNSERIKTTFPRETDIANLKTVILRPLVDFFSS >UniRef50_C6N4I5(2-171:219) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Legionella drancourtii LLAP12 RepID=C6N4I5_9GAMM E=9e-59 s/c=1.34 id=48% cov=100% -PLKQTKKLITAYEKKLINGTITDHELTILMDKSSFPKSEGYVHPNKPMTEKNHSQMDAIIDFILLVAPKLTREVLHQLTARMISLTPDQGANAFMRNTT LEKYFLAYELFQFPKSAQLFFEanafeisevspkyqefkaRQRMQHEFSGVNDFLFLQSVILQPIIDLYTT >UniRef50_C6N3C2(3-173:303) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Legionella drancourtii LLAP12 RepID=C6N3C2_9GAMM E=2e-58 s/c=1.32 id=53% cov=99% --LKQTNTLMKRYGEKLINGTISDRELKTLMDLKSFPKSKGFVDINQPITDKNHRKSDAINDFVLAIAPRLTLATLHQLTARMINLAPDAGRNTFMRNEG LEKAFLAYELAQFPqsaaifflkpeslesiesagsAKYEEFQARNRMQKEFSGTDDIKNLKDVILKPIIELYS- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1622 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1766 0 0 T 4 * * * * * * * * 1002 * * * * 1928 * * 2072 * * * 4 0 * * * * * * 1766 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1766 0 0 T 6 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 6 0 * * * * * * 1766 0 0 Q 7 * * * * * * * * 1978 * * 2026 * 2072 1928 * * * * * 7 0 * * * * * * 1766 0 0 R 8 * * * * * * * * 953 * * * * * 2072 * 2026 * * * 8 0 * * * * * * 1766 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1766 0 0 I 10 * * * * * * * 1024 * 1928 2026 * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1766 0 0 N 11 * * * * * * * * 976 * * 2072 * * * * 1978 * * * 11 0 * * * * * * 1766 0 0 T 12 1978 * * * * * * * 1928 * * * * * 2026 * 2072 * * * 12 0 * * * * * * 1766 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1766 0 0 G 14 * * * 1978 * 423 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1766 0 0 A 15 2072 * * 2026 * * * * 953 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1766 0 0 S 16 * * * * * * * * 1002 * * * * * * 998 * * * * 16 0 * * * * * * 1766 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1766 0 0 K 18 * * * * * * * 1002 2072 * * 1928 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1766 0 0 N 19 * * 1928 * * * * * * * * 440 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1766 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1766 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1766 0 0 I 22 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1766 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 423 1978 * * * 23 0 * * * * * * 1766 0 0 N 24 * * 392 * * * * * * * * 2072 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1766 0 0 E 25 * * * 2072 * * 1978 * * * * * * 1928 2026 * * * * * 25 0 * * * * * * 1766 0 0 E 26 * * * 440 * * * * * * * * * * * * 1928 * * * 26 0 * * * * * * 1766 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1766 0 0 I 28 * * 1928 * * * * 2072 2026 * * * * * * * 1978 * * * 28 0 * * * * * * 1766 0 0 I 29 * * * * * * * 1024 * 1928 * * * * * * 2026 * * * 29 0 * * * * * * 1766 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1766 0 0 L 31 * * * * * * * * * 998 1002 * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1766 0 0 D 32 * * 440 * * * * * * * * * * 1928 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1766 0 0 P 33 * * * * * * * * 1978 2026 * * 998 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1766 0 0 N 34 * * 1928 * * * * * 2026 * * 2072 * * * 1978 * * * * 34 0 * * * * * * 1766 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * 1002 998 * * * 35 0 * * * * * * 1766 0 0 F 36 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1766 0 0 T 37 * * * * * * * * 1928 * * * 1002 * * * 2072 * * * 37 0 * * * * * * 1766 0 0 K 38 * * * * * * * * 440 * * * * * 1928 * * * * * 38 0 * * * * * * 1766 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1766 0 0 E 40 * * * 1024 * * * * 2026 * * * 1928 * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1766 0 0 G 41 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 41 440 1928 * 1000 1000 * * 1766 1000 0 Y 42 * * * * 2026 * * * * * * * * * * * * * * 407 42 0 * * * * * * 1766 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 43 0 * * * * * * 1766 0 0 D 44 * * 423 * * * 1978 * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1766 0 0 P 45 * * * * * * * 2026 * * * * 407 * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1766 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1766 0 0 A 47 2072 * * * * * * * 953 * * * * 2026 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1766 0 0 P 48 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1766 0 0 V 49 * * * * * * * 2026 * * 1978 * * * * * * 998 * * 49 0 * * * * * * 1766 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 2072 392 * * * 50 0 * * * * * * 1766 0 0 D 51 * * 423 1978 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1766 0 0 S 52 * * * * * * * * 1002 * * * * * * 2072 1928 * * * 52 0 * * * * * * 1766 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1766 0 0 H 54 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1766 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * * * * 2026 1024 1928 * * * 55 0 * * * * * * 1766 0 0 K 56 * * * * * * * * 1049 * * * * 953 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1766 0 0 X 57 * * * * * * * * * * 560 * * * * 1636 * * * * 57 0 * * * * * * 1630 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1766 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1766 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1766 0 0 K 61 * * * * * * * 1978 998 * * 2026 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1766 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1766 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1766 0 0 V 64 * * * * * * * 1978 * * * * * * * * * 423 * * 64 0 * * * * * * 1766 0 0 L 65 * * * 1928 * * * * * 440 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1766 0 0 T 66 2026 * * * * * * * * 1978 * * * * * * 998 * * * 66 0 * * * * * * 1766 0 0 I 67 * * * * * * * 1049 * * * * * * * * * 953 * * 67 0 * * * * * * 1766 0 0 G 68 1002 * * * * 998 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1766 0 0 P 69 * * * 1928 * * * * * * * * 440 * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1766 0 0 T 70 * * * 1928 * * * * 1978 * * * * * 2026 * 2072 * * * 70 0 * * * * * * 1766 0 0 L 71 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1766 0 0 D 72 * * 2072 * * * * * * * * * * * * 1928 1002 * * * 72 0 * * * * * * 1766 0 0 S 73 * * * * * * * * * 2026 * * 1928 * 1978 2072 * * * * 73 0 * * * * * * 1766 0 0 E 74 2026 * * 407 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1766 0 0 I 75 * * * * * * * 2072 * * * * * * * * 2026 953 * * 75 0 * * * * * * 1766 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1766 0 0 H 77 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1766 0 0 Q 78 * * * * * * * * * * * * * 440 * * 1928 * * * 78 0 * * * * * * 1766 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1766 0 0 T 80 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 80 0 * * * * * * 1766 0 0 S 81 1002 * 1928 * * * * * * * * * * * * 2072 * * * * 81 0 * * * * * * 1766 0 0 R 82 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 82 0 * * * * * * 1766 0 0 X 83 * * * * * * * 1494 * * 633 * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1630 0 0 I 84 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1766 0 0 E 85 * * * 2072 * * * * * * * 2026 * 1928 * 1978 * * * * 85 0 * * * * * * 1766 0 0 L 86 * * * * * * * * * 440 * * * * 1928 * * * * * 86 0 * * * * * * 1766 0 0 S 87 976 * * * * * * * * * * * * * * 2072 1978 * * * 87 0 * * * * * * 1766 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1766 0 0 P 89 * * 392 * * * * * * * * * 2072 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1766 0 0 G 90 2026 * * * * 2072 * * * * * * * 1978 1928 * * * * * 90 0 * * * * * * 1766 0 0 D 91 * * 2072 * * 392 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1766 0 0 R 92 1978 * * 1928 * * * * * * * * * * 1049 * * * * * 92 0 * * * * * * 1766 0 0 N 93 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1766 0 0 T 94 1978 * * * * * * * * * * * * * * * 423 * * * 94 0 * * * * * * 1766 0 0 F 95 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1766 0 0 X 96 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1630 0 0 R 97 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 97 0 * * * * * * 1766 0 0 G 98 * * * * * 2072 * * * * * 392 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1766 0 0 S 99 * * * 2026 * * * * * * * * * * * 998 1978 * * * 99 0 * * * * * * 1766 0 0 S 100 * * * * * 2026 * * * * * * * * * 2072 953 * * * 100 0 * * * * * * 1766 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1766 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1766 0 0 K 103 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1766 0 0 A 104 423 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1978 104 0 * * * * * * 1766 0 0 F 105 * * * * 440 * * * * 1928 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1766 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1766 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1766 0 0 F 108 * * * * 2072 * * * * * * * * * * * * * * 392 108 0 * * * * * * 1766 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1766 0 0 X 110 * * * * * * * * * 633 1494 * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1630 0 0 A 111 423 * * * 1978 * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1766 0 0 H 112 * * * * * * 2072 * * 1928 * * * 1002 * * * * * * 112 0 * * * * * * 1766 0 0 Y 113 * * * * 1002 * * * * * * * * * * * * * * 998 113 0 * * * * * * 1766 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 407 2026 * 4392 70 * * 1766 1000 0 T 115 2026 * 1928 * * * * * 1978 * * * * * * * 2072 * * * 115 0 * * * * * * 1766 0 0 K 116 * * * * * * * * 1049 1928 * * * * * 1978 * * * * 116 0 * * * * * * 1766 0 0 A 117 407 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2026 117 0 * * * * * * 1766 0 0 E 118 * * * 423 * * * * * * * * * 1978 * * * * * * 118 0 * * * * * * 1766 0 0 E 119 * * * 1049 * * * * * 1978 * * * * * 1928 * * * * 119 0 * * * * * * 1766 0 0 H 120 * * * * 1002 * 998 * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1766 0 0 F 121 * * * * 407 * * * * * * * * 2026 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1766 0 0 N 122 2026 * * 1978 * * * * * * * 998 * * * * * * * * 122 423 1978 * 4170 82 * * 1766 1000 0 S 123 * * * * * * * * * * * * * * 1002 998 * * * * 123 0 * * * * * * 1766 0 0 T 124 * * * 1928 * * * * * * * 2026 * 1978 * * 2072 * * * 124 0 * * * * * * 1766 0 0 R 125 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 125 0 * * * * * * 1766 0 0 V 126 * * * * * * * 1928 * * 1002 * * * * * * 2072 * * 126 0 * * * * * * 1766 0 0 R 127 * * * * * * * * 1928 * * * * 1002 2072 * * * * * 127 0 * * * * * * 1766 0 0 T 128 * * * * * * 1978 * 2026 * * * * * * * 998 * * * 128 0 * * * * * * 1766 0 0 E 129 * * * 440 * * * * * * * * * * * * 1928 * * * 129 0 * * * * * * 1766 0 0 F 130 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1766 0 0 P 131 * * * * * * * * * * * * 998 * * 1002 * * * * 131 0 * * * * * * 1766 0 0 G 132 * * * * * 440 * * * * * * * * 1928 * * * * * 132 0 * * * * * * 1766 0 0 E 133 * * * 998 * * * * * * * * * * * * 2026 1978 * * 133 0 * * * * * * 1766 0 0 N 134 * * 2026 * * * * * * * * 1024 * * * * 1928 * * * 134 0 * * * * * * 1766 0 0 D 135 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1766 0 0 I 136 * * * * 1978 * * 423 * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1766 0 0 D 137 1928 * 2072 * * * * * 2026 1978 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1766 0 0 N 138 * * * * 1978 * * * * * * 423 * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1766 0 0 L 139 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1766 0 0 K 140 * * * * * * * * 423 * * * * 1978 * * * * * * 140 0 * * * * * * 1766 0 0 A 141 2072 * 2026 * * * * * * * * * * * * 1978 1928 * * * 141 0 * * * * * * 1766 0 0 V 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 142 0 * * * * * * 1766 0 0 I 143 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1766 0 0 L 144 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1766 0 0 N 145 * * * * * * * * 2026 * * 2072 * 1978 1928 * * * * * 145 0 * * * * * * 1766 0 0 P 146 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1766 0 0 I 147 * * * * * * * 440 * 1928 * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1766 0 0 I 148 * * * * * * * 440 * * * * * * * * * 1928 * * 148 0 * * * * * * 1766 0 0 A 149 2072 * 953 2026 * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1766 0 0 F 150 * * * * 998 * * * * 1002 * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1766 0 0 F 151 * * * * 998 * * * * * * * * * * * * * * 1002 151 0 * * * * * * 1766 0 0 Q 152 * * * * * * * * * * * * * 2072 * 976 1978 * * * 152 0 * * * * * * 1766 0 0 S 153 * * * * * * * * * * * * * * * 631 1497 * * * 153 0 * * 0 * * * 1622 0 0 //