HHsearch 1.5 NAME c4qi2A_ FAM FILE c4qi2A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4qi2A_.a3m DATE Sat Jul 19 11:44:45 2014 LENG 153 match states, 153 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.4273 0.2541 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHHHHTTTCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCEEHHHHHHHHHHHHTTTCTTCCHHHHHHHHHHHHHTTCEEEEEETTEEEEEEECGG GCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCCHHHHHHHHHSSSTTHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDDEEDBCDDACDCBEECDACBCCCDBADCAADBABDBADECDDCBCEDABDCABDDADEEBEEBDEEBACCAACAADCBDABDDDEDEEEDCCBCACEE BCDCECABCCAABBABDAADDDEBEBDCDCAADCACEDDECDECADDABEECE >ss_pred CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHC >ss_conf 9878889999999998617401084779999999999821404677877999999985342503455469999999984445653201587506778998 63299999986689999998708521533501002205135899999987519 >Consensus hqxxqqxsxxLwaavRargCQflGPamQexilkLilxxlxxGxxisRKxLvxyvvqxLxxxxxqxSKTsiGhvvQLLyRasCFxVxkRdxxsSLmqLKxe fRxYealRrehDaqivqiAfexglrixpdxWSxlLYgdxxhxshmqSiiDKLq >c4qi2A_ HQNPQQLSSNLWAAVRARGCQFLGPAMQEEALKLVLLALEDGSALSRKVLVLFVVQRLEPRFPQASKTSIGHVVQLLYRASCFKVTKRDEDSSLMQLKEE FRTYEALRREHDSQIVQIAMEAGLRIAPDQWSSLLYGDQSHKSHMQSIIDKLQ >UniRef50_UPI000186EC10(165-317:680) conserved hypothetical protein n=1 Tax=Pediculus humanus corporis RepID=UPI000186EC10 E=9e-77 s/c=1.88 id=89% cov=101% HQNPQQLSANLWAAVRARGCQFLGPAMQEEVLKLVLLALEDGSALSRKVLVMFVVQRLEPHYSQASKTSIGHVVQLLYRASCFKVSKREGDSSLMQLKEE FRSYEALRREHDAQIVQIATEAGLRIAPDQWSALLYGDTAHKSHMQSIMDKLQ >UniRef50_UPI000022219C(169-320:963) C. briggsae CBR-RLE-1 protein n=1 Tax=Caenorhabditis briggsae RepID=UPI000022219C E=3e-61 s/c=1.55 id=73% cov=100% -QSNTHVSSQLWSAVRARGCQFLGPAMQDDVLRLILMTLETGECIARKNLVMYVVQTLASDYPQVSKTCVGHVVQLLYRASCFNVLKRDGESSLMQLKEE FRTYDALRREHDSQIVQIAFESGLRIGPDQWSALLYADQSHRSHMQSIIDKLQ >UniRef50_A8Q8U6(167-317:456) MKIAA2025 protein, putative n=1 Tax=Brugia malayi RepID=A8Q8U6_BRUMA E=2e-55 s/c=1.43 id=68% cov=99% HQNNSNISTILWSSIRSRGCQFLGPAMQEEILKLILLILSDGALISRKTLVLYIVQTLRVDYPQASKTCVGHVVQLLYRAGCFHVLKREGESSLMQLKTQ FRDYDALRREHDAQIVQVAFQQGLRISPDHWSALLYGDQHHRSHMQSIIDK-- >UniRef50_B3RNW3(178-333:485) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Trichoplax adhaerens RepID=B3RNW3_TRIAD E=2e-56 s/c=1.40 id=39% cov=98% ----QQQVNELFAALRSLKCQLFGPKLQEMIMRLLYNIMNEGERISRKTLTAYLIHQLDGRFKEESKnisnTSIGRAIQLLVRGSCFEVIPRDKGGSLLK LKDEIRNYEQFRQKLDAAVIKVAFEYDVHLKVEKWSLILYGSTDKSQYLNSMIDKLR # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * H 1 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1272 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1354 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 432 * * * 1950 * * * * 3 0 * * * * * * 1354 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * 925 1079 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1354 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 659 * 2425 2472 * * * 5 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 6 * * * * * * 2472 * * * * 2425 * 659 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1767 0 0 L 7 * * * * * * * 2425 * 1629 * * * 1688 * * * 2472 * * 7 0 * * * * * * 1767 0 0 S 8 * * * * * * * * * * * * * * * 536 * 1688 * * 8 0 * * * * * * 1767 0 0 S 9 2614 * * * * * * * * * * 1688 * * * 1556 2425 * * * 9 0 * * * * * * 1767 0 0 N 10 * * * 1688 * * * 2425 * * * 1629 * 2472 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1767 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1767 0 0 W 12 * * * * 1688 * * * * * * * * * * * * * 536 * 12 0 * * * * * * 1767 0 0 A 13 659 * * * * * * * * * * * * * * 1448 * * * * 13 0 * * * * * * 1767 0 0 A 14 297 * * * * * * * * * * * * * * 2425 * * * * 14 0 * * * * * * 1767 0 0 V 15 * * * * * * * 2425 * 1688 * * * * * * * 990 * * 15 0 * * * * * * 1767 0 0 R 16 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 16 0 * * * * * * 1767 0 0 A 17 990 * * * * * * * * * * * * * * 1010 * * * * 17 0 * * * * * * 1767 0 0 R 18 * * * * * * * * * 1688 * * * * 536 * * * * * 18 0 * * * * * * 1767 0 0 G 19 * * * * * 536 * * 1688 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1767 0 0 C 20 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 21 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 21 0 * * * * * * 1767 0 0 F 22 * * * * 536 * * * * 1688 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1767 0 0 L 23 * * * * 1688 * * * * 536 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1767 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1767 0 0 P 25 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1767 0 0 A 26 536 * * * * * * * 1688 * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1767 0 0 M 27 * * * * * * * * * 1688 536 * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 28 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1767 0 0 E 29 * * 2472 287 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1767 0 0 E 30 * * 2472 973 * * * * * * 1688 * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1767 0 0 A 31 2646 * * * * * * 1010 * * * * * * * * * 1541 * * 31 0 * * * * * * 1767 0 0 L 32 * * * * * * * * * 536 1688 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1767 0 0 K 33 * * * * * * * * 973 * * * * * 1028 * * * * * 33 0 * * * * * * 1767 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1767 0 0 V 35 * * * * * * * 1448 * 1688 * * * * * * * 1629 * * 35 0 * * * * * * 1767 0 0 L 36 * * * * * * * * * 536 * * * * * * * * * 1688 36 0 * * * * * * 1767 0 0 L 37 * * * * * * * * * 973 2472 1688 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1767 0 0 A 38 1629 * * * * * * 1010 * * * * * * * * 2472 * * * 38 0 * * * * * * 1767 0 0 L 39 * * * * * * * * * 536 1688 * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1767 0 0 E 40 * * * 990 * * * * * * * 1688 * * * 2425 * * * * 40 0 * * * * * * 1767 0 0 D 41 * * 973 1688 * * * * * * * * * * * * 2472 * * * 41 0 * * * * * * 1767 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1767 0 0 S 43 2425 * * 1028 * * * * * * * * * * * 1629 * * * * 43 0 * * * * * * 1767 0 0 A 44 1629 2472 * * * * * * * 2425 * * * * 1688 * * * * * 44 0 * * * * * * 1767 0 0 L 45 * * * * * * * 563 * 1629 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1767 0 0 S 46 2472 * * * * * * * * * * * * * * 287 * * * * 46 0 * * * * * * 1767 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 47 0 * * * * * * 1767 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1767 0 0 V 49 * * * * * * * * * * * 2472 * * * * 1010 1629 * * 49 0 * * * * * * 1767 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1767 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * 1688 536 * * 51 0 * * * * * * 1767 0 0 L 52 1688 * * * * * * * * 1531 1541 * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1767 0 0 F 53 * * * * 1629 * * * * * * * * * * * * * * 563 53 0 * * * * * * 1767 0 0 V 54 * * * * * * * 2425 * 1688 * * * * * * * 990 * * 54 0 * * * * * * 1767 0 0 V 55 * * * * * * * 1688 * * * * * * * * * 536 * * 55 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 56 * * * * * * 1688 * * * * * * 536 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1767 0 0 R 57 * * * * * * * * * * * * * 1688 1629 * 1448 * * * 57 0 * * * * * * 1767 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1767 0 0 E 59 2472 * 1688 1629 * * * * * * * * * * 2425 * * * * * 59 0 * * * * * * 1767 0 0 P 60 * * * * * 1688 * * * * * * 1629 * * 2472 * 2425 * * 60 0 * * * * * * 1767 0 0 R 61 * * 1448 * * * 2614 * * * * * * * 1089 * * * * * 61 0 * * * * * * 1767 0 0 F 62 * * * * 1089 * * * * * * * * * * * * * * 916 62 0 * * * * * * 1767 0 0 P 63 * * * * * * * * 1688 * * * 926 * * 2614 * * * * 63 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 64 * * * 1688 * * * * * * * * * 536 * * * * * * 64 0 * * * * * * 1767 0 0 A 65 973 * * 1688 * * * * * * * * * * * * * 2472 * * 65 0 * * * * * * 1767 0 0 S 66 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 66 0 * * * * * * 1767 0 0 K 67 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 67 536 1688 * 2000 415 * * 1767 1000 0 T 68 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 68 0 * * * * * * 1767 0 0 S 69 * 1448 * * * * * * * * * * * * * 659 * * * * 69 0 * * * * * * 1767 0 0 I 70 * * * * * * * 659 * * * * * * * * * 1448 * * 70 0 * * * * * * 1767 0 0 G 71 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1767 0 0 H 72 * * * * * * 536 * * * * * * * 1688 * * * * * 72 0 * * * * * * 1767 0 0 V 73 1688 * * * * * * * * * * * * * * * * 536 * * 73 0 * * * * * * 1767 0 0 V 74 * * * * * * * 1688 * * * * * * * * * 536 * * 74 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 75 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 75 0 * * * * * * 1767 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1767 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1767 0 0 Y 78 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1688 * 536 78 0 * * * * * * 1767 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 79 0 * * * * * * 1767 0 0 A 80 536 * * * * 1688 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1767 0 0 S 81 * * * * * 2425 * * * * * * * * * 297 * * * * 81 0 * * * * * * 1767 0 0 C 82 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1767 0 0 F 83 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1767 0 0 K 84 * * * 1688 * * 2425 * 1629 * * 2472 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1767 0 0 V 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 85 0 * * * * * * 1767 0 0 T 86 * * * * * * * 1688 * 1448 * * * * * 2614 2646 * * * 86 0 * * * * * * 1767 0 0 K 87 * * * * * * * * 536 * * * 1688 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1767 0 0 R 88 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 88 0 * * * * * * 1767 0 0 D 89 * * 621 1516 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1767 0 0 E 90 * * * 2646 * 916 * * 1688 * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1767 0 0 D 91 * * 1629 1448 * 1688 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1767 0 0 S 92 * * * * * 1688 * * * * * * * * * 536 * * * * 92 0 * * * * * * 1767 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 93 0 * * * * * * 1767 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1767 0 0 M 95 * * * * * * * * * 1688 536 * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 96 * * * * * * * * 1688 * * * * 536 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1767 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1767 0 0 K 98 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1767 0 0 E 99 * * 1688 990 * * * * * * * * * * * * 2425 * * * 99 0 * * * * * * 1767 0 0 E 100 * * * 297 * * * * * * * * * 2425 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1767 0 0 F 101 * * * * 536 * * 1688 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1767 0 0 R 102 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 102 0 * * * * * * 1767 0 0 T 103 * * 2425 * * * * * * * * 1688 * * * 2614 1556 * * * 103 0 * * * * * * 1767 0 0 Y 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 104 0 * * * * * * 1767 0 0 E 105 * * 1448 659 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1767 0 0 A 106 536 * * * * * * * * * * * * 1688 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1767 0 0 L 107 * * * * 1688 * * * * 536 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1767 0 0 R 108 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 108 0 * * * * * * 1767 0 0 R 109 * * * * * * * * * * * * * 1688 536 * * * * * 109 0 * * * * * * 1767 0 0 E 110 * * * 536 * * * * 1688 * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1767 0 0 H 111 * * * * * * 536 * * 1688 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1767 0 0 D 112 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1767 0 0 S 113 600 * * * * * * * * * * * * * * 1556 * * * * 113 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 114 1688 * * * * * * * * * * * * 536 * * * * * * 114 0 * * * * * * 1767 0 0 I 115 * * * * * * * 536 * * * * * * * * * 1688 * * 115 0 * * * * * * 1767 0 0 V 116 * * * * * * * 1688 * * * * * * * * * 536 * * 116 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 117 * * * * * * * * 1688 * * * * 536 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1767 0 0 I 118 * * * * * * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * 118 0 * * * * * * 1767 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1767 0 0 M 120 * * * * 563 * * * * * 2646 * * * * * 2614 * * * 120 0 * * * * * * 1767 0 0 E 121 * * * 297 * * * * * * * * * 2425 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1767 0 0 A 122 1629 * * * * * * * * * * * * 2425 * 2472 * * * 1688 122 0 * * * * * * 1767 0 0 G 123 * * 1688 * * 536 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1767 0 0 L 124 * * * * * * * * * 536 * * * * * * * 1688 * * 124 0 * * * * * * 1767 0 0 R 125 * * * * * * 1688 * * * * * * * 536 * * * * * 125 0 * * * * * * 1767 0 0 I 126 * * * * * * * 536 * 1688 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1767 0 0 A 127 1629 * * * * 2472 * * 1688 * * * * * * 2425 * * * * 127 0 * * * * * * 1767 0 0 P 128 * * * * * * * * * * * * 536 * * * * 1688 * * 128 0 * * * * * * 1767 0 0 D 129 * * 536 1688 * * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 130 * * * * * * 2425 * 1688 * * * * 990 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1767 0 0 W 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 131 0 * * * * * * 1767 0 0 S 132 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 132 0 * * * * * * 1767 0 0 S 133 916 * * * * * * * * 1688 * * * * * 2646 * * * * 133 0 * * * * * * 1767 0 0 L 134 * * * * * * * 1688 * 536 * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1767 0 0 L 135 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1767 0 0 Y 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 136 0 * * * * * * 1767 0 0 G 137 2472 * * * * 287 * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1767 0 0 D 138 * * 536 * * * * * * * * * * * * 1688 * * * * 138 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 139 * * * * * * * * * * * * * 926 * * 1078 * * * 139 0 * * * * * * 1767 0 0 S 140 2614 * 1688 * * * 2425 * * * * * * * * 1556 * * * * 140 0 * * * * * * 1767 0 0 H 141 * * * * * * 536 * 1688 * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1767 0 0 K 142 * * * * * * * * 1629 * * * * * 1448 1688 * * * * 142 0 * * * * * * 1767 0 0 S 143 * * * * * * * * * * * * * 1688 * 536 * * * * 143 0 * * * * * * 1767 0 0 H 144 * * * * * * 536 * * * * * * * * * * * * 1688 144 0 * * * * * * 1767 0 0 M 145 * * * * * * * * * 1688 536 * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1767 0 0 Q 146 * * * * * * * * * * * 1688 * 536 * * * * * * 146 0 * * * * * * 1767 0 0 S 147 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 147 0 * * * * * * 1767 0 0 I 148 * * * * * * * 536 * * 1688 * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1767 0 0 I 149 * * * * * * * 257 * * 2614 * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1767 0 0 D 150 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1767 0 0 K 151 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1767 0 0 L 152 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1689 0 0 Q 153 * * * * * * * * * * * * * 624 1510 * * * * * 153 0 * * 0 * * * 1689 0 0 //