HHsearch 1.5 NAME c4qeyD_ FAM FILE c4qeyD_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4qeyD_.a3m DATE Sat Jul 19 11:44:49 2014 LENG 123 match states, 123 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4205 -0.0156 SEQ >ss_dssp CBCEEEEEEEEESGGGEEEEEEEEEEESSSBCCEECTTCCEEESSEEESSCCSSEEEEECCTTEEEEEEEEEEEECCSSTTCEEEEEEEEEETTEEEEEE EEEEECCSSCCEEEEEEETTCCC >sa_dssp EBCABABBDBDEDCECBCACBDBCCCCEEDEADACCEEDEDCCDECECEEBECEDBBACACEEADDACADBCACBDCEEEEBCACABABACCEECDDCDC EDDBEBDDEECEDEBEBBBDDEE >ss_pred CCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCCCEECCCEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHH HHHHHCCCCEEEEEEEEEEEEEC >ss_conf 9706999850698430687899864047873256616776603532444553015776655874213320102320012584899999999746236578 77541266247866643224419 >Consensus TGiHKIVveQSGdtDxFelxxxfGaantgGpaKLYnexGeYlGdSxsvxxxxxakxSCxTxxxaffmTCAGSVxStSexaGKkLkixViaYIDxKEVNrL xKEYxTkGxtLiEnFSVSTtxie >c4qeyD_ TGVHKIVVEQSGNTDDFDLNIAFGAANTGGVAKLYNENGEYLGDSYLVNKVTENKISCQTGKEGSXXTCAGSVISTSEQAGKKLKISVIAYIDNKEVNRL EKEYITKGSTLVENFSVSTTSVE >UniRef50_A7AHN2(50-171:172) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Bacteroidales RepID=A7AHN2_9PORP E=2e-35 s/c=1.22 id=61% cov=99% TGIHKIVVEQSGDIDAFELGLVFGAVNtTSGPTKLYDEDGKYLGESHSVTRMEDAKVSCQTGDDAFFMTCAGSVTSTSDVSGKKLKVLVTAYIDGKEVNQ LVKEYETKGEILIENFSVSTTA-- >UniRef50_A6L6K5(35-154:154) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Bacteroides RepID=A6L6K5_BACV8 E=2e-32 s/c=1.16 id=59% cov=98% TGIHKIVIQQSGDTDSFEVSVSIGGADKGGPAKLYNDKGEYIGDSYSA-QIRTATMSCCTNGNAFFMTCAGSVSSISE-AGKRLHITVIGYIDDKEVNRL EKEYITDGNTLIETFSVSTKEI- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1497 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1497 0 0 V 3 * * * * * * * 553 * * * * * * * * * 1652 * * 3 0 * * * * * * 1497 0 0 H 4 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1497 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1497 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1497 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1497 0 0 V 8 * * * * * * * 1553 * * * * * * * * * 601 * * 8 0 * * * * * * 1497 0 0 E 9 * * * 601 * * * * * * * * * 1553 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1497 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1497 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 11 0 * * * * * * 1497 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1497 0 0 N 13 * * 553 * * * * * * * * 1652 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1497 0 0 T 14 * * * * * * * 1553 * * * * * * * * 601 * * * 14 0 * * * * * * 1497 0 0 D 15 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1497 0 0 D 16 1553 * 1652 * * * * * * * * * * * * 1553 * * * * 16 0 * * * * * * 1497 0 0 F 17 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1497 0 0 D 18 * * 1652 553 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1497 0 0 L 19 * * * * * * * * * 601 * * * * * * * 1553 * * 19 0 * * * * * * 1497 0 0 N 20 * * * * * 1553 * * * * * 1652 * * * 1553 * * * * 20 0 * * * * * * 1497 0 0 I 21 * * * * * * * 1652 * 1553 * * * * * * * 1553 * * 21 0 * * * * * * 1497 0 0 A 22 1652 * * * * * * * * * * * * * * 1553 * 1553 * * 22 0 * * * * * * 1497 0 0 F 23 * * * * 601 * * 1553 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1497 0 0 G 24 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1497 0 0 A 25 601 * * * * 1553 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1497 0 0 A 26 601 * * * * * * * * * * * * * * * * 1553 * * 26 0 * * * * * * 1497 0 0 N 27 * * 1553 * * * * * * * * 601 * * * * * * * * 27 601 1553 * 0 * * * 1497 1000 0 T 28 * * * * * * * * 1553 * * * * * * * 601 * * * 28 0 * * * * * * 1497 0 0 G 29 * * * * * 601 * * * * * * * * * 1553 * * * * 29 0 * * * * * * 1497 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1497 0 0 V 31 * * * * * * * * * * * * 553 * * * * 1652 * * 31 0 * * * * * * 1497 0 0 A 32 601 * * * * * * * * * * * * * * * 1553 * * * 32 0 * * * * * * 1497 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1497 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1497 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1497 0 0 N 36 * * 1553 * * * * * * * * 601 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1497 0 0 E 37 * * 1553 601 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1497 0 0 N 38 * * 1553 * * * * * 1553 * * 1652 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1497 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1497 0 0 E 40 * * * 601 * * * * 1553 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1497 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 41 0 * * * * * * 1497 0 0 L 42 * * * * * * * 1553 * 601 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1497 0 0 G 43 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1497 0 0 D 44 * * 601 1553 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1497 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1497 0 0 Y 46 * * * * * * 1553 * * * * * * * * * * * * 601 46 0 * * * * * * 1497 0 0 L 47 * * * * * * * * * 1652 * * * * * 553 * * * * 47 0 * * * * * * 1497 0 0 V 48 1553 * * * * * * * * * * * * * * * * 601 * * 48 601 * 1553 * * * * 1497 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 1024 * * * * 976 * * * 49 0 * * * * 0 * 1287 0 1000 K 50 * * * * * * * * 1652 * * * * 1553 1553 * * * * * 50 0 * * * * * * 1497 0 0 V 51 * * * * * * * 1553 * * 1553 * * * * * * 1652 * * 51 0 * * * * * * 1497 0 0 T 52 * * * 1553 * * * * * * * * * * 1553 * 1652 * * * 52 0 * * * * * * 1497 0 0 E 53 * * 1553 1652 * * * * * * * * * * * * 1553 * * * 53 0 * * * * * * 1497 0 0 N 54 553 * * * * * * * * * * 1652 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1497 0 0 K 55 * * * * * * * * 601 * * * * * * * 1553 * * * 55 0 * * * * * * 1497 0 0 I 56 * * * * * * * 1652 * * 1553 * * * * * * 1553 * * 56 0 * * * * * * 1497 0 0 S 57 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 57 0 * * * * * * 1497 0 0 C 58 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1497 0 0 Q 59 * 1553 * * * * * * * * * * * 601 * * * * * * 59 0 * * * * * * 1497 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 60 0 * * * * * * 1497 0 0 G 61 * * * * * 601 * * * * * 1553 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1497 0 0 K 62 * * 1553 * * 1553 * * 1652 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1497 0 0 E 63 * * 1553 1652 * * * * * * * 1553 * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1497 0 0 G 64 553 * * * * 1652 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1497 0 0 S 65 * * * * 553 * * * * * * * * * * 1652 * * * * 65 0 * * * * * * 1497 0 0 X 66 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1355 0 0 X 67 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1355 0 0 T 68 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 68 0 * * * * * * 1497 0 0 C 69 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1497 0 0 A 70 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1497 0 0 G 71 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1497 0 0 S 72 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 72 0 * * * * * * 1497 0 0 V 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 73 0 * * * * * * 1497 0 0 I 74 * * * * * * * 1652 * * * * * * * 1553 1553 * * * 74 0 * * * * * * 1497 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 75 0 * * * * * * 1497 0 0 T 76 * * * * * * * 1553 * * * * * * * * 601 * * * 76 0 * * * * * * 1497 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1497 0 0 E 78 * * 1553 601 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 601 * 1553 * * * * 1497 0 0 Q 79 * * * * * * * * * * * * * 1024 * * * 976 * * 79 0 * * * * 0 * 1287 0 1000 A 80 601 * * * * * * * * * * * * * * 1553 * * * * 80 0 * * * * * * 1497 0 0 G 81 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1497 0 0 K 82 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1497 0 0 K 83 * * * * * * * * 601 * * * * * 1553 * * * * * 83 0 * * * * * * 1497 0 0 L 84 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1497 0 0 K 85 * * * * * * 1553 * 601 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1497 0 0 I 86 * * * * * * * 601 * * * * * * * * * 1553 * * 86 0 * * * * * * 1497 0 0 S 87 * * * * * * * * * 1553 * * * * * 1652 1553 * * * 87 0 * * * * * * 1497 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 88 0 * * * * * * 1497 0 0 I 89 * * * * * * * 601 * * * * * * * * 1553 * * * 89 0 * * * * * * 1497 0 0 A 90 601 * * * * 1553 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1497 0 0 Y 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 91 0 * * * * * * 1497 0 0 I 92 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1497 0 0 D 93 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1497 0 0 N 94 * * 1553 * * 1553 * * * * * 1652 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1497 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1497 0 0 E 96 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1497 0 0 V 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 97 0 * * * * * * 1497 0 0 N 98 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1497 0 0 R 99 * * * * * * * * * * * * * 1553 601 * * * * * 99 0 * * * * * * 1497 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1497 0 0 E 101 * * * 601 * * * * * * * * * * * * * 1553 * * 101 0 * * * * * * 1497 0 0 K 102 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1497 0 0 E 103 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1497 0 0 Y 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 104 0 * * * * * * 1497 0 0 I 105 * * * 1553 * * * 601 * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1497 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 106 0 * * * * * * 1497 0 0 K 107 * * 1553 * * * * * 601 * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1497 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1497 0 0 S 109 * * * 1553 * * * * * * * 1553 * * * 1652 * * * * 109 0 * * * * * * 1497 0 0 T 110 * * * * * * * 1553 * * * * * * * * 601 * * * 110 0 * * * * * * 1497 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1497 0 0 V 112 * * * * * * * 553 * * * * * * * * * 1652 * * 112 0 * * * * * * 1497 0 0 E 113 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1497 0 0 N 114 * * * * * * * * * * * 601 * * * * 1553 * * * 114 0 * * * * * * 1497 0 0 F 115 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1497 0 0 S 116 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 116 0 * * * * * * 1497 0 0 V 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 117 0 * * * * * * 1497 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 118 0 * * * * * * 1497 0 0 T 119 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 119 0 * * * * * * 1497 0 0 T 120 * * * * * * * * 1553 * * * * * * * 601 * * * 120 0 * * * * * * 1497 0 0 S 121 1553 * * 1553 * * * * * * * * * * * 1652 * * * * 121 0 * * * * * * 1497 0 0 V 122 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 122 0 * * * * * * 1306 0 0 E 123 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //