HHsearch 1.5 NAME c4qe0B_ FAM FILE c4qe0B_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4qe0B_.a3m DATE Sat Jul 12 08:13:50 2014 LENG 151 match states, 151 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.2 EVD 0.3738 -2.7316 SEQ >ss_dssp CCCCCSSCCCCEEEEETTEEEEEEEETTTTEEEEECCCCTTCCCCCCCCCCCCTTSCCSCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCEEEEEECTTTCB EEEEEEEEETTSTTCCCHHHHHHHHCCCCCBCCCTTCCCSSEEEEEECCCC >sa_dssp EDDCDEEECBEDDCEDEECDACACBEEEDDCABABCECCCEECCCEEEECEDDEEBDCCEEDEEBDDCBDEBACDBADDABEDBEDEACABBBABCEDAE CEBABABACBECCABABBDAACDABDBEDBDCDCECBEBCCADCDCDCCED >ss_pred CCCEEEEEEEEEEEEEECEEEEEEECCCCCEEEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCE EEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCC >ss_conf 9740158998655777035999874166758999904741899831034452000160430320024678887555315555128425799987388746 898776663156303320122343441026764146448899999854789 >Consensus xxxxxxtxxyttTfxxdgyxYqCDVxxxSxfVrLYnKxnkxxxvxxTgxxixxxxxkxxedDsxxsxkcxsIvnxaFsxxexxxgxxfxixmxlxxxTGx VxeVxfxFxxxxpyavPvsVyrEiEvkkxIxFxxexxxxnYIxxxWxqpqx >c4qe0B_ EESLEGTVIYTTTFEVDGYTYQCDVDDGSQFVTLYNENLTYEIVYDTGTYIGSWSSNVIEYDRFXSQQADFIVDQAFTAXADEIGTELXITXLLSPNTGE VXEVNFNFFTFEPYAVPLHVYREIEVLEQIHFPIEEGQLNYIXLAWXQPQG >UniRef50_A7V0G8(27-193:205) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Bacteroides RepID=A7V0G8_BACUN E=3e-48 s/c=1.15 id=79% cov=101% EESLEGTVIYkkTTTFEVDGYTYQCDVDDGSQFVTLYNKenKLTYKdIVYKaTGKiYIGSWNEkKVIEYNSSMSKQADFIVDEAFTkAMADELGKrEFTI TMLLSPDTGKVMEVNFNFTTFSPYArVPLHVYREIEVklKEQIHFkPGEVGkQLNYIMLSWRQkPQG >UniRef50_B3CBA2(33-185:185) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Bacteroides RepID=B3CBA2_9BACE E=2e-43 s/c=1.15 id=40% cov=93% ----------TKTFNQDGYIYQCDV-RASGFVRLYNKSNKWIKVYpvykSTGESFAQTDAGIelFEDDNWTSSKCKSIVNAAFSDSEKQkvKGHDFNIIM YINSSTGRVDEVSFEFHKSDPFaAIPISVYRkiEIELKKDIWFTLtaEGKMLSYIFYWWAQePQ- >UniRef50_C9KUT9(28-176:181) Putative SlyX-1 n=1 Tax=Bacteroides finegoldii DSM 17565 RepID=C9KUT9_9BACE E=5e-42 s/c=1.15 id=38% cov=90% -----------RTFVENGYTYQCDVLKGAKFVRLYNKENKFtyveQIDKNTKDMISikeNMQEKQLEDDSWTKQKCYSIINGAFSSTEKQRIKDWEFTVM LyvDPDTGKVSEVGFQFFSNTPYGfIPVSVFRQIEVelKKNIWFvPTQQGKrRNYILVGW----- >UniRef50_A5ZJX7(22-174:179) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Bacteroides caccae ATCC 43185 RepID=A5ZJX7_9BACE E=4e-37 s/c=1.01 id=28% cov=93% ------TFYYDTTQVFYAQRYVCDVTQESKSVRLYSKSNKFTEVeavnKETGAEMTDAERKEanFVDDSQLWGKCLSILNESFSEEERTRvqGCKFIIIL RVDTNTGIIRDVEYRFPAVSMLAtVPVSVYQEMEIklKKEIVFNIteKGKRFNYIPFVW----- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1116 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1116 0 0 S 3 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 3 0 * * * * * * 1116 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1116 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1116 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1116 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 7 0 * * * * * * 1716 0 0 V 8 * * * * 1243 * * * * * * * * * * * * 792 * * 8 0 * * * * * * 1716 0 0 I 9 * * * * * * * 792 * * * * * * * * * * * 1243 9 0 * * * * * * 1716 0 0 Y 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 10 506 1757 * 1000 1000 * * 1716 1000 0 T 11 * * 1701 * * * * * * * * * * * * * 530 * * * 11 0 * * * * * * 2027 0 0 T 12 * * * * * * * * 2277 * * * * * 2247 * 778 * * * 12 0 * * * * * * 2248 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 2248 0 0 F 14 * * * * 406 * * * * * * * * 2027 * * * * * * 14 0 * * * * * * 2248 0 0 E 15 * * * 1567 * * * * * * * 2277 * * * * * 1133 * * 15 0 * * * * * * 2248 0 0 V 16 * * * 2247 2027 * * * * * * * * 2277 * * * 1567 * * 16 0 * * * * * * 2248 0 0 D 17 * * 879 * * * * * * * * 2247 * * * * * * * 2027 17 0 * * * * * * 2248 0 0 G 18 2027 * * * * 406 * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * 2027 * * * * * 406 19 0 * * * * * * 2248 0 0 T 20 * * * * * * * 2277 * * * * * * 2027 * 867 * * * 20 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 21 0 * * * * * * 2248 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 406 * * * 2027 * * 22 0 * * * * * * 2248 0 0 C 23 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2248 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2248 0 0 V 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 25 333 * 2277 * * * * 2248 0 0 D 26 * * 1244 * * * * * * 1890 * * * * * * 1699 * * * 26 0 * * * * 0 * 2018 0 1000 D 27 * * 1567 * * * * * 2247 * * * * 2027 2277 * * * * * 27 0 * * * * * * 2248 0 0 G 28 2277 * * 2027 * 867 * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2248 0 0 S 29 2247 * * * * * * * * * * * * * * 341 * * * * 29 0 * * * * * * 2248 0 0 Q 30 * * * * * 2277 * * 1133 * * * * 1567 * * * * * * 30 0 * * * * * * 2248 0 0 F 31 * * * * 406 * * * * * * * * * * 2027 * * * * 31 0 * * * * * * 2248 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 2248 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * 594 * 1567 * * * 33 0 * * * * * * 2248 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 2248 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 406 * * * 2027 * * * * 36 0 * * * * * * 2248 0 0 E 37 * * * 2573 * * * * 265 * * * * * * * * * * * 37 268 2560 * 1000 1000 * * 2248 1000 0 N 38 * * * 2247 * * * * 2560 * * 2573 * * * 1147 * * * * 38 0 * * * * * * 2248 0 0 L 39 * * * * * * * * * 1567 * 594 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2248 0 0 T 40 * * * * * * * * 594 * * * * * * * 1567 * * * 40 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 41 * * * * 1133 * * * * * * * * * * * * * 2277 1567 41 341 2247 * 2000 415 * * 2248 1000 0 E 42 * * * 2573 * * * 2277 2560 * * * * 2247 * * 2027 * * * 42 268 2560 * 0 * * * 2248 1000 0 I 43 * * * 2027 * * * 867 2277 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2248 0 0 V 44 * * 2247 * * * * * * * * * * * * * * 341 * * 44 406 2027 * 2000 415 * * 2248 1000 0 Y 45 * * * * * * * * 1133 * * * * * * * * * * 879 45 333 2277 * 2000 415 * * 2248 1000 0 D 46 * * 2573 2027 * * * * 2560 * * 2247 * * * 2277 * * * * 46 268 2560 * 0 * * * 2248 1000 0 T 47 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 47 0 * * * * * * 2248 0 0 G 48 * * * * * 341 * * 2247 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2248 0 0 T 49 2027 * 2247 2277 * * * * 2560 * * * * * * * 2573 * * * 49 268 2560 * 0 * * * 2248 1000 0 Y 50 * * * 2027 * * * * * * 2247 * * * * 2277 * * * 1567 50 0 * * * * * * 2248 0 0 I 51 * * * * 2277 * * 867 * * 2027 * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2248 0 0 G 52 2277 * * * * 1567 * * * * * * * * * 2247 2027 * * * 52 341 2247 * 1585 585 * * 2248 1000 0 S 53 * * 2027 * * * * * * * * 2247 * 2277 * 1567 * * * * 53 0 * * * * * * 2248 0 0 W 54 2027 * * * * * * * * * 2247 * * * * * 2277 * 1567 * 54 0 * * * * * * 2248 0 0 S 55 * * 2277 2027 * * * * * * * 2560 * 2247 * 2573 * * * * 55 0 * * * * * * 2248 0 0 S 56 2277 * * 1395 * * * * * * * * * * 2027 2573 * * * * 56 268 2560 * 0 * * * 2248 1000 0 N 57 * * * * * 2277 * * 677 * * 2573 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2248 0 0 V 58 * * * 2027 * * * 2277 * * * * * 2247 * * * 1567 * * 58 867 1147 * 1000 1000 * * 2248 1523 0 I 59 * * * * 1147 * * 1567 * 2247 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 2248 0 0 E 60 * * * 406 * * * * * * * * * * * * * 2027 * * 60 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 61 * * 594 * * * * * * * * * * * * * * * * 1567 61 0 * * * * * * 2248 0 0 D 62 * * 268 * * * * * * * * 2560 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2248 0 0 R 63 * * * * * * * * * * * 2277 * * 2573 677 * * * * 63 0 * * * * * * 2248 0 0 F 64 * * * * 2573 * * * * * * * * 2027 * 2560 * * 1262 * 64 0 * * * * * * 2248 0 0 X 65 * * * * * * * * * 1894 1975 * * * * * 1069 * * * 65 0 * * * * * * 2171 0 0 S 66 * * * * * * * * 2247 * * * * * * 879 * * 2027 * 66 0 * * * * * * 2248 0 0 Q 67 * * * * * 2027 * * 2560 * * * * 1401 * 2277 * * * * 67 0 * * * * * * 2248 0 0 Q 68 * * * * * * * * 594 * * * * 1567 * * * * * * 68 0 * * * * * * 2248 0 0 A 69 1567 594 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2248 0 0 D 70 * * 1567 * * * * * 2277 2027 * * * * * * * * * 2247 70 0 * * * * * * 2248 0 0 F 71 * * * * 1567 * * * * * * * * * * 594 * * * * 71 0 * * * * * * 2248 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2248 0 0 V 73 * * * * * * * 2247 * 2027 * * * * * * * 879 * * 73 0 * * * * * * 2248 0 0 D 74 * * 1567 * * * * * * * * 594 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2248 0 0 Q 75 2277 * * 1269 * 2247 * * * * * * * 2573 * * * * * * 75 0 * * * * * * 2248 0 0 A 76 406 * * * * * * * * * * * * * * 2027 * * * * 76 0 * * * * * * 2248 0 0 F 77 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2248 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * 594 1567 * * * 78 268 2560 * 0 * * * 2248 1000 0 A 79 1567 * 2277 2027 * * * * * * * * * * * 2247 * * * * 79 0 * * * * * * 2248 0 0 X 80 * * * 1894 * * * * * * 1975 * * * * 2084 2054 * * * 80 0 * * * * * * 2171 0 0 A 81 1567 * * 594 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 2248 0 0 D 82 * * 1567 * * * * * 1262 * * * * * 2027 * * * * * 82 0 * * * * * * 2248 0 0 E 83 * * * 1567 * * * * * * * * * 1262 * * 2027 * * * 83 333 2277 * 1000 1000 * * 2248 1000 0 I 84 * * * * * * * 2573 2277 2560 * * * * 1133 * * * * * 84 406 2027 * 1000 1000 * * 2248 1000 0 G 85 * * * * * 341 * 2247 * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2248 0 0 T 86 * 2027 * * * * 2277 * 1395 * * * * * * * 2573 * * * 86 268 2560 * 0 * * * 2248 1000 0 E 87 * * 1262 1567 * * * * 2027 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2248 0 0 L 88 * * * * 687 * * * * 2573 * * * * * * * * 2247 * 88 0 * * * * * * 2248 0 0 X 89 * * * 2054 * * * 1894 * * * 2084 * * * * 1975 * * * 89 0 * * * * * * 2171 0 0 I 90 * * * * 2247 * * 341 * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2248 0 0 T 91 * * * * * * * 1147 * * * * * * * * 867 * * * 91 0 * * * * * * 2248 0 0 X 92 * * * * * * * * * 1894 1029 * * * * * * 2054 * * 92 0 * * * * * * 2171 0 0 L 93 * * * * * * * * * 1567 2247 * * * 2027 * * * * 2277 93 0 * * * * * * 2248 0 0 L 94 * * * * * * * 2277 * 867 * * * * * * * 2027 * * 94 341 2247 * 1000 1000 * * 2248 1000 0 S 95 * * 1133 * * * * * * * * 2277 * * * 1567 * * * * 95 0 * * * * * * 2248 0 0 P 96 * * * * * * * * * * * * 867 * * 2277 2027 * * * 96 0 * * * * * * 2248 0 0 N 97 * * 1395 * * * * * * * * 1274 * * * 2277 * * * * 97 0 * * * * * * 2248 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 98 0 * * * * * * 2248 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2248 0 0 E 100 * * * 2573 * * * 2027 1395 * * * * * 2277 * * * * * 100 0 * * * * * * 2248 0 0 V 101 * * * * * * * 2027 * * * * * * * * * 406 * * 101 0 * * * * * * 2248 0 0 X 102 * * 2084 * * * * * * * 1975 * * * 1894 2054 * * * * 102 0 * * * * * * 2171 0 0 E 103 * * 2027 406 * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2248 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 2248 0 0 N 105 * * * 2027 * 2247 * * * * * 1567 * * * 2277 * * * * 105 0 * * * * * * 2248 0 0 F 106 * * * * 406 * * * * * * * * * * * * * * 2027 106 0 * * * * * * 2248 0 0 N 107 * * * 2277 * * * * * * * 1567 * 2247 2027 * * * * * 107 0 * * * * * * 2248 0 0 F 108 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2248 0 0 F 109 * * * * 1401 * 2277 * * * * * 2027 * * * 2560 * * * 109 0 * * * * * * 2248 0 0 T 110 2027 * * * * * * * 2277 * * * * * * 2247 1567 * * * 110 0 * * * * * * 2248 0 0 F 111 * * * * 1567 * * * * * * 2247 * * * 2277 * 2027 * * 111 0 * * * * * * 2248 0 0 E 112 * * 2277 2573 * * * * * * * * * * * 1269 2247 * * * 112 0 * * * * * * 2248 0 0 P 113 * * * * * * * * * * 2027 * 406 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 114 * * * * 2277 * * * * 2027 * * * * * * * * * 867 114 333 2277 * 0 * * * 2248 1000 0 A 115 341 * * * * 2247 * * * * * * * * * * * * * * 115 1418 677 * 0 * * * 2248 1930 0 V 116 * * * * * * * 1262 * * * * * * * * * 778 * * 116 0 * * * * * * 2248 0 0 P 117 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 2248 0 0 L 118 * * * * * * * 2277 * 1567 * * * * * * * 1133 * * 118 0 * * * * * * 2248 0 0 H 119 * * * * * * 1567 * * * * * * * * 594 * * * * 119 0 * * * * * * 2248 0 0 V 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 120 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 121 * * * * 2247 * * * * * * * * * * * * * * 341 121 0 * * * * * * 2248 0 0 R 122 * * * * * * * * * * * * * 2027 406 * * * * * 122 333 2277 * 1000 1000 * * 2248 1000 0 E 123 * * * 341 * * * * * * * * * 2247 * * * * * * 123 0 * * * * * * 2248 0 0 I 124 * * * * * * * 406 * * 2027 * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2248 0 0 E 125 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 2248 0 0 V 126 * * * * * * * 2027 * 2277 * * * * * * * 867 * * 126 1418 677 * 1000 1000 * * 2248 1930 0 L 127 * * * * * * * * 265 2573 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2248 0 0 E 128 * * * 1567 * * * * 594 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2248 0 0 Q 129 * * 2277 2027 * * * * * * * 2247 * 1567 * * * * * * 129 0 * * * * * * 2248 0 0 I 130 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2248 0 0 H 131 * * * * * * 1567 * * * * * * * * * * 2027 1262 * 131 0 * * * * * * 2248 0 0 F 132 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 132 690 1395 * 0 * * * 2248 1492 0 P 133 * * * * * * * * * * * 2027 867 * * * 2277 * * * 133 0 * * * * * * 2248 0 0 I 134 * * * * * 2560 * 1274 * 2277 * * * * * * 2247 * * * 134 867 1147 * 1000 1000 * * 2248 1523 0 E 135 * * * 879 * * * * 2027 * * * * 2247 * * * * * * 135 0 * * * * * * 2248 0 0 E 136 * * * 2573 * 1147 * * * * * * * 2247 * * * 2560 * * 136 0 * * * * * * 2248 0 0 G 137 * * * * * 867 * * 1147 * * * * * * * * * * * 137 268 2560 * 0 * * * 2248 1000 0 Q 138 * * * * * * * * 2247 * 2277 * * 1567 2027 * * * * * 138 341 2247 * 0 * * * 2248 1000 0 L 139 * * * * 2027 * * * * 879 * * * * 2247 * * * * * 139 0 * * * * * * 2248 0 0 N 140 * * * * * * * * * * * 333 * * * 2277 * * * * 140 0 * * * * * * 2248 0 0 Y 141 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 141 0 * * * * * * 2248 0 0 I 142 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 2248 0 0 X 143 * * * * 2084 * * * * 2054 1975 * 1894 * * * * * * * 143 0 * * * * * * 2171 0 0 L 144 * * * * 2027 * * * * 1567 * * * * * * * 2247 * 2277 144 0 * * * * * * 2248 0 0 A 145 2573 * * * * 2247 * * * * * * * * * 2560 * 2027 2277 * 145 0 * * * * * * 2248 0 0 W 146 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 146 0 * * * * * * 2248 0 0 X 147 1010 * * * * * * * * * * * * * 990 * * * * * 147 0 * * * * * * 1486 0 0 Q 148 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 148 1789 493 * 0 * * * 1579 1485 0 P 149 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1579 0 0 Q 150 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 150 0 * * * * * * 1579 0 0 G 151 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * 0 * * * 1116 0 0 //