HHsearch 1.5 NAME c4pxuA_ FAM FILE c4pxuA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4pxuA_.a3m DATE Sat Apr 26 08:12:21 2014 LENG 152 match states, 152 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4464 -0.3789 SEQ >ss_dssp CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EEEDDEDDEDEDEEDDEEDEEDEEDEEEEEDDDDEDDEEDEEEEDEDDEEDEEEEEEEEEDEDDEEDCEEDEEEEDEDECEEEEDEDEDDEEEDDEDEEE EDEEDEDEDDEDEEEDEDDDDDDEEDEEEEDDEDEEEDEDDDEDEEDEEEEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9367889999998611668999999999999999735999999999999999996303798979999999998655765666898999999999999965 4200047999999987987666654689887699999841455455431049 >Consensus xxxxixxxxxxxeennxxhkamlxsmqxxxxsiixxsxxsxexhxxxxxxxlexlxxxslpdaexlqxlqxexaneralaxqexalxesxmmqxeqxkxl rxknsxsmsxxlxxmeexrlxxxxxixxxkxxiqxyqxxgxxasqxaqaels >c4pxuA_ MSKEIQTNLQVIEENNQRHKAMLDSMQEKFATIIDSSLQSVEEHAKQMHKKLEQLGAMSLPDAEELQNLQEELANERALAQQEDALLESMMMQMEQIKNL RSKNSISMSVHLNKMEESRLTRNHRIDDIKSGIQDYQKLGIEASQSAQAELT >UniRef50_Q29EV0(642-793:1063) GA21600 n=4 Tax=Drosophila RepID=Q29EV0_DROPS E=8e-40 s/c=1.08 id=52% cov=101% LREDIHLQVLELEENNHSHKAMLESMQQRLSSIIANSAESLEKHVTEVQRQLELLSELSLPDAENLQQLQAEVANERALAHQEEALIESLMMQLEQFKEL RAKNSHSMSQRLLQMEENRLQKSKKVEKTKASVQAYQIEGSAASQAAQAELS # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1395 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 2 0 * * * * * * 1395 0 0 K 3 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1395 0 0 E 4 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1395 0 0 I 5 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 6 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1395 0 0 T 7 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 7 0 * * * * * * 1395 0 0 N 8 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1395 0 0 L 9 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 9 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 10 * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1395 0 0 V 11 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 11 0 * * * * * * 1395 0 0 I 12 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1395 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1395 0 0 E 14 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1395 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1395 0 0 N 16 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 17 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1395 0 0 R 18 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 18 0 * * * * * * 1395 0 0 H 19 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1395 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1395 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1395 0 0 M 22 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1395 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1395 0 0 D 24 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1395 0 0 S 25 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 25 0 * * * * * * 1395 0 0 M 26 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 27 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 27 0 * * * * * * 1395 0 0 E 28 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1395 0 0 K 29 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 29 0 * * * * * * 1395 0 0 F 30 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1395 0 0 A 31 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 31 0 * * * * * * 1395 0 0 T 32 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 32 0 * * * * * * 1395 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1395 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1395 0 0 D 35 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1395 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 36 0 * * * * * * 1395 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1395 0 0 L 38 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 39 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1395 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 40 0 * * * * * * 1395 0 0 V 41 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 41 0 * * * * * * 1395 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1395 0 0 E 43 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1395 0 0 H 44 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1395 0 0 A 45 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 45 0 * * * * * * 1395 0 0 K 46 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 46 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 47 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1395 0 0 M 48 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 48 0 * * * * * * 1395 0 0 H 49 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 49 0 * * * * * * 1395 0 0 K 50 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 50 0 * * * * * * 1395 0 0 K 51 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 51 0 * * * * * * 1395 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1395 0 0 E 53 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 54 * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * 54 0 * * * * * * 1395 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1395 0 0 G 56 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 56 0 * * * * * * 1395 0 0 A 57 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1395 0 0 M 58 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1395 0 0 S 59 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 59 0 * * * * * * 1395 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1395 0 0 P 61 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1395 0 0 D 62 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1395 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1395 0 0 E 64 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1395 0 0 E 65 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1395 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 67 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 67 0 * * * * * * 1395 0 0 N 68 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 68 0 * * * * * * 1395 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 70 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1395 0 0 E 71 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1395 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1395 0 0 L 73 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 73 0 * * * * * * 1395 0 0 A 74 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1395 0 0 N 75 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1395 0 0 E 76 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1395 0 0 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * * 1395 0 0 A 78 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1395 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1395 0 0 A 80 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 81 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 81 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 82 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 82 0 * * * * * * 1395 0 0 E 83 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1395 0 0 D 84 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1395 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1395 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1395 0 0 L 87 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1395 0 0 E 88 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1395 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 89 0 * * * * * * 1395 0 0 M 90 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1395 0 0 M 91 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1395 0 0 M 92 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 93 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 93 0 * * * * * * 1395 0 0 M 94 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1395 0 0 E 95 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 96 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 96 0 * * * * * * 1395 0 0 I 97 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1395 0 0 K 98 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1395 0 0 N 99 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1395 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1395 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 101 0 * * * * * * 1395 0 0 S 102 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 102 0 * * * * * * 1395 0 0 K 103 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1395 0 0 N 104 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1395 0 0 S 105 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 105 0 * * * * * * 1395 0 0 I 106 * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1395 0 0 S 107 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 107 0 * * * * * * 1395 0 0 M 108 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1395 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1395 0 0 V 110 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * 110 0 * * * * * * 1395 0 0 H 111 * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * 111 0 * * * * * * 1395 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1395 0 0 N 113 * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1395 0 0 K 114 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 114 0 * * * * * * 1395 0 0 M 115 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1395 0 0 E 116 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1395 0 0 E 117 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1395 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 118 0 * * * * * * 1395 0 0 R 119 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 119 0 * * * * * * 1395 0 0 L 120 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1395 0 0 T 121 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * 121 0 * * * * * * 1395 0 0 R 122 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 122 0 * * * * * * 1395 0 0 N 123 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 123 0 * * * * * * 1395 0 0 H 124 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1395 0 0 R 125 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 125 0 * * * * * * 1395 0 0 I 126 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 126 0 * * * * * * 1395 0 0 D 127 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1395 0 0 D 128 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1395 0 0 I 129 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 129 0 * * * * * * 1395 0 0 K 130 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1395 0 0 S 131 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 131 0 * * * * * * 1395 0 0 G 132 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 132 0 * * * * * * 1395 0 0 I 133 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 133 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 134 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 134 0 * * * * * * 1395 0 0 D 135 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1395 0 0 Y 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 136 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 137 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 137 0 * * * * * * 1395 0 0 K 138 * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1395 0 0 L 139 * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1395 0 0 G 140 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1395 0 0 I 141 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * 141 0 * * * * * * 1395 0 0 E 142 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1395 0 0 A 143 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1395 0 0 S 144 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 144 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 145 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 145 0 * * * * * * 1395 0 0 S 146 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 146 0 * * * * * * 1395 0 0 A 147 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1395 0 0 Q 148 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 148 0 * * * * * * 1395 0 0 A 149 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1395 0 0 E 150 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1395 0 0 L 151 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1395 0 0 T 152 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 152 0 * * 0 * * * 1395 0 0 //