HHsearch 1.5 NAME c4p94A_ FAM FILE c4p94A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4p94A_.a3m DATE Sat Apr 25 08:17:11 2015 LENG 116 match states, 116 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4299 -0.2406 SEQ >ss_dssp CCCCEEEEEEEEETTEEEEEEEECSSSCBCCGGGCEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEECSCSSCCTTEEEESCSCBCTTCEEEEEEECSSCBCTTCEEEE EEECTTSCEEEEEEEC >sa_dssp EEBDBCCDDCDDEECCACABACADCEBDAEDBEDBDACABACACCEEEDDECECEAECCEEEEBEDDDABBECEDACDEDEBCACABACDDBDEECEACA CACBCDDDDCDCEDEC >ss_pred CCCEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEE EEEECCCCCEEEEECC >ss_conf 9615677678851874999995489710120135189999873456522899998831377898716986044046689861599996159888884599 9993577625884229 >Consensus lxtkitvxsvsltgxxlxxxxxnngsxxlxdfqxfxvivqyyanisnxstxxxslynxtxnsxpsxyxwtixtxxlxpxxxxxxxiilpyppypntxaxx vixtnygxsxiwrgsl >c4p94A_ LETKITVSSVSLTGSTLNVVLENNGSTNLYDFQGFSVIVQYYANISNISTFNLSLYNYTKNSNPSPYYWTINTPLLAPGSQATLTIILPYPPYPNTQATV VIVTNYGPSVIWRGSL >UniRef50_A4YGD3(49-161:161) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Metallosphaera sedula DSM 5348 RepID=A4YGD3_METS5 E=8e-40 s/c=1.45 id=55% cov=98% LNSKISIGSVSLSGNDLILMVTNNGSIPLWDFQHFAVIIQYYANISNKSTLLVSLYNFSN--SPSSYQWT-SSQILEPDGSSEFQIVLPYPPYPNTPAVA VISTNYGTSAVWRGTL # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1348 0 0 E 2 * * * 963 * * * * * * * 1038 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1348 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * 1038 963 * * * 3 0 * * * * * * 1348 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1348 0 0 I 5 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1348 0 0 T 6 * * * * * * * * * * * * * * * 1038 963 * * * 6 0 * * * * * * 1348 0 0 V 7 * * * * * * * 1038 * * * * * * * * * 963 * * 7 0 * * * * * * 1348 0 0 S 8 * * * * * 1038 * * * * * * * * * 963 * * * * 8 0 * * * * * * 1348 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1348 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1348 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 11 0 * * * * * * 1348 0 0 L 12 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1348 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * 1038 963 * * * 13 0 * * * * * * 1348 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1348 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * 1038 * * * 963 * * * * 15 0 * * * * * * 1348 0 0 T 16 * * 1038 * * * * * * * * * * * * * 963 * * * 16 0 * * * * * * 1348 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1348 0 0 N 18 * * * * * * * 1038 * * * 963 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1348 0 0 V 19 * * * * * * * * * 1038 * * * * * * * 963 * * 19 0 * * * * * * 1348 0 0 V 20 * * * * * * * * * * 1038 * * * * * * 963 * * 20 0 * * * * * * 1348 0 0 L 21 * * * * * * * * * 963 * * * * * * * 1038 * * 21 0 * * * * * * 1348 0 0 E 22 * * * 963 * * * * * * * * * * * * 1038 * * * 22 0 * * * * * * 1348 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1348 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1348 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1348 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 1348 0 0 T 27 * * * * * * * 1038 * * * * * * * * 963 * * * 27 0 * * * * * * 1348 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 963 1038 * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1348 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1038 963 30 0 * * * * * * 1348 0 0 D 31 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1348 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1348 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1348 0 0 G 34 * * * * * 963 1038 * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1348 0 0 F 35 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1348 0 0 S 36 1038 * * * * * * * * * * * * * * 963 * * * * 36 0 * * * * * * 1348 0 0 V 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 37 0 * * * * * * 1348 0 0 I 38 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1348 0 0 V 39 * * * * * * * 1038 * * * * * * * * * 963 * * 39 0 * * * * * * 1348 0 0 Q 40 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 40 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 41 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 42 0 * * * * * * 1348 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1348 0 0 N 44 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1348 0 0 I 45 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1348 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1348 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1348 0 0 I 48 * * * * * * * 963 1038 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1348 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * * 1348 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 50 0 * * * * * * 1348 0 0 F 51 * * * * 963 * * * * 1038 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1348 0 0 N 52 * * * * * * * * * 1038 * 963 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1348 0 0 L 53 * * * * * * * * * 963 * * * * * * * 1038 * * 53 0 * * * * * * 1348 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1348 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 56 0 * * * * * * 1348 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 58 * * * * 1038 * * * * * * * * * * * * * * 963 58 0 * * * * * * 1348 0 0 T 59 * * * * * * * * * * * * * * * 1038 963 * * * 59 0 * * * * * * 1348 0 0 K 60 * * * * * * * * 963 * * 1038 * * * * * * * * 60 963 * 1038 * * * * 1348 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 61 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 62 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 N 63 * * * * * * * * * * * 963 * * * 1038 * * * * 63 0 * * * * * * 1348 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1348 0 0 S 65 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 65 0 * * * * * * 1348 0 0 P 66 * * * * * * * * * * * * 963 * * 1038 * * * * 66 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 68 * * * * * * * * * * * * * 1038 * * * * * 963 68 0 * * * * * * 1348 0 0 W 69 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 69 0 * * * * * * 1348 0 0 T 70 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 70 963 * 1038 * * * * 1348 0 0 I 71 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 N 72 * * * * * * * * * * * 963 * * * 1038 * * * * 72 0 * * * * * * 1348 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * 1038 963 * * * 73 0 * * * * * * 1348 0 0 P 74 * * * * * * * * * * * * 963 1038 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1348 0 0 L 75 * * * * * * * 1038 * 963 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1348 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1348 0 0 A 77 963 * * 1038 * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1348 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1348 0 0 G 79 * * 1038 * * 963 * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1348 0 0 S 80 * * * * * 1038 * * * * * * * * * 963 * * * * 80 0 * * * * * * 1348 0 0 Q 81 * * * * * * * * * * * * * 963 * 1038 * * * * 81 0 * * * * * * 1348 0 0 A 82 963 * * * * * * * * * * * * * * 1038 * * * * 82 0 * * * * * * 1348 0 0 T 83 * * * 1038 * * * * * * * * * * * * 963 * * * 83 0 * * * * * * 1348 0 0 L 84 * * * * 1038 * * * * 963 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1348 0 0 T 85 * * * * * * * * * * * * * 1038 * * 963 * * * 85 0 * * * * * * 1348 0 0 I 86 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1348 0 0 I 87 * * * * * * * 963 * * * * * * * * * 1038 * * 87 0 * * * * * * 1348 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1348 0 0 P 89 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 90 0 * * * * * * 1348 0 0 P 91 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1348 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 93 0 * * * * * * 1348 0 0 P 94 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1348 0 0 N 95 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1348 0 0 T 96 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 96 0 * * * * * * 1348 0 0 Q 97 * * * * * * * * * * * * 1038 963 * * * * * * 97 0 * * * * * * 1348 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1348 0 0 T 99 * * * * * * * * * * * * * * * * 963 1038 * * 99 0 * * * * * * 1348 0 0 V 100 1038 * * * * * * * * * * * * * * * * 963 * * 100 0 * * * * * * 1348 0 0 V 101 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 101 0 * * * * * * 1348 0 0 I 102 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1348 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * 1038 * 963 * * 103 0 * * * * * * 1348 0 0 T 104 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 104 0 * * * * * * 1348 0 0 N 105 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1348 0 0 Y 106 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 106 0 * * * * * * 1348 0 0 G 107 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1348 0 0 P 108 * * * * * * * * * * * * 963 * * * 1038 * * * 108 0 * * * * * * 1348 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1348 0 0 V 110 1038 * * * * * * * * * * * * * * * * 963 * * 110 0 * * * * * * 1348 0 0 I 111 * * * * * * * 963 * * * * * * * * * 1038 * * 111 0 * * * * * * 1348 0 0 W 112 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 112 0 * * * * * * 1348 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 113 0 * * * * * * 1348 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1348 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * * * * * 963 1038 * * * 115 0 * * * * * * 1348 0 0 L 116 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 116 0 * * 0 * * * 1348 0 0 //