HHsearch 1.5 NAME c4ozkA_ FAM FILE c4ozkA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4ozkA_.a3m DATE Sat Nov 15 08:12:06 2014 LENG 49 match states, 49 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4894 3.0348 SEQ >ss_dssp CCCCSSCEEEEEECCCEEETTTTEEEEEEEEEETTSCEEEEEEEEEEEC >sa_dssp ECEBEEDDECEDDDEDEDCEEEEDCCCCBCACAEEEDECDBEDDDCEED >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHEEEEECCCEEEEECCCCCCC >ss_conf 9746621036311530440231044531100234585789962136789 >Consensus acqcpdaisgwthtdyqchglenkmyrhvyaicmngtqvycrtewgssc >c4ozkA_ ACQCPDAISGWTHTDYQCHGLENKMYRHVYAICMNGTQVYCRTEWGSSC # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 C 2 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 3 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 C 4 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 P 5 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 W 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 T 12 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 H 13 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 D 15 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 16 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 17 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 C 18 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 H 19 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 E 22 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 M 25 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1000 0 0 R 27 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 H 28 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 V 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 30 0 * * * * * * 1000 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 I 32 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 C 33 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 M 34 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 N 35 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 40 0 * * * * * * 1000 0 0 C 41 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 R 42 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 T 43 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 E 44 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 W 45 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 G 46 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 S 48 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 C 49 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //