HHsearch 1.5 NAME c4ntqB_ FAM FILE c4ntqB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4ntqB_.a3m DATE Sat Mar 29 08:21:18 2014 LENG 146 match states, 146 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.3979 -1.1165 SEQ >ss_dssp CEEEEECSSCEEETTEEEEEEEEEETTEEEEEEEECSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSEEEEESCCCCGGGCSEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEECTT TSCCCGGGGGGGCCCCCSBCTTCCBCCCEEEEHHHHHHHHHHHHTC >sa_dssp EAABDDDEEDDEDEECEBBBABACAEECECEBDABCEDBDCEDADDBACEBACDABEEDDCAAAABBACEBDDBEDADAAAABBDEEDACABDCDBEBCE DDEBCBDDBBEDBEECDDEDEEEEECECCDBDBDBACEBCDDBEEE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCCEECCCEEEEHHHHEEEECEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCEEEEECCEEEHHH HCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9431107986542252000000110001101001122128899999999999987530110057751478553316898888870727886321420344 3189801278887543122546644034442399999999762059 >Consensus xfGifxxxkxxxxxgxxxxxasIxixdfxExlhipldyWxixdYkxSWxkslxxglsxkxhSxLixSmxePExxNFvxxWvlYxxxExvyvqnsiiflee xxxfxpexxxefiexrxtxdedgxkisewxtdlxxvxdfxxslxxx >c4ntqB_ XFGIFSKGEPVSXEGELVQPSSIVINDYEEELHLPLSYWDIKDYKNSWLKSLGEGLSNKTHSALAVSXYEPEKTNFIFTWVLYFEDEKVYVQNNVIFLEE CHGFSPENINKFIESRTTHDGDGXKISEWHTDLNSVLDFYHSLNNA >UniRef50_A4W4W6(2-143:145) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Enterobacteriaceae RepID=A4W4W6_ENT38 E=5e-58 s/c=1.58 id=64% cov=98% -FGIFPEDKQVDIEGAILAPASIVIGDFRESMNIPLTYWNINDYKKSWLKSLEEGLTKKNHAALAVSMYEPELANFVFVWVLYFKAEIVHVQNSIIFLEE HKKFSPEKINEFIDERTTHDEDGMKISEWSTDLDSVLDFYNSL--- >UniRef50_C7MZP2(12-149:175) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Saccharomonospora viridis DSM 43017 RepID=C7MZP2_SACVD E=2e-52 s/c=1.49 id=40% cov=94% --GLESSGQPSRLLGR------IAVRDFTESFHVALDFWSPRDYRASWKRALGRLLSaDVIDSCLIASVGDPETANFVTCWPLYRCKEKVYVQNSIIFLD QLEgGFDPDRPWEFIEARQSIDEDGNRVSEWETEISEVEEFLRTVD-- >UniRef50_UPI0001A45547(2-92:99) hypothetical protein NsubN_04980 n=1 Tax=Neisseria subflava NJ9703 RepID=UPI0001A45547 E=3e-15 s/c=0.91 id=44% cov=62% -FGIFFKDKGTSFDNgyGMHILASISLGEYVEELHIPIDYWGIEEYKNSWATSIADGIEKKQHSVLITSMHEPESLNFISTWIIYYDGEISY-------- ------------------------------------------------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 F 2 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1671 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 2063 0 0 I 4 * * * * * * * 459 * 1874 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2063 0 0 F 5 * * * 1874 459 * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 2063 0 0 S 6 * * * * 1864 * * * * * * * 2073 * * 1036 * * * * 6 0 * * * * * * 2063 0 0 K 7 * * * 2073 * * * * 1030 * * * * * * 1874 * * * * 7 0 * * * * * * 2063 0 0 G 8 * * 965 * * 1036 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 2063 0 0 E 9 * * * 2218 * * * * 965 * * * * 1874 * * * * * * 9 0 * * * * * * 2063 0 0 P 10 * * * * * 1864 * * * * * * 1036 2073 * * * * * * 10 0 * * * * * * 2063 0 0 V 11 * * * * * * * * * * * * * * * 1874 1864 1144 * * 11 0 * * * * * * 2063 0 0 S 12 * * 2073 * * * * * * * * * * * 1874 1030 * * * * 12 0 * * * * * * 2063 0 0 X 13 * * * * 1533 * * 1618 * 1606 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1957 0 0 E 14 * * 1864 1144 * * * * * 1874 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2063 0 0 G 15 * * * * * 463 * * * * * 1864 * * * * * * * * 15 463 1864 * 1000 1000 * * 2063 1000 0 E 16 2073 * * 2218 * 1864 * * * * * * * * 1874 * * * * * 16 459 * 1874 * * * * 2063 0 0 L 17 * * * * * * * 1601 * 1703 1461 * * * * * * * * * 17 0 * * * * * 0 1671 0 1000 V 18 * * * * * * 1461 * * 1601 * * * * * * * 1703 * * 18 0 * * * * * 0 1671 0 1000 Q 19 1601 * * * * * * 1461 * * * * * 1703 * * * * * * 19 0 * * * * * 0 1671 0 1000 P 20 * * * * * * * * * 1461 * * 651 * * * * * * * 20 0 * * * * * 0 1671 0 1000 S 21 529 * * * * * * * * * * * * * * 1703 * * * * 21 0 * * * * * 0 1671 0 1000 S 22 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 22 0 * * * * 0 * 1671 0 1000 I 23 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2063 0 0 V 24 1874 * * * * * * * * * * * * * * 1864 * 1144 * * 24 0 * * * * * * 2063 0 0 I 25 * * * * * * * 1144 * 1864 * * * * * * * 1874 * * 25 0 * * * * * * 2063 0 0 N 26 * * * * * 965 * * * * * 2218 * * 1874 * * * * * 26 0 * * * * * * 2063 0 0 D 27 * * 463 1864 * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2063 0 0 Y 28 * * * * 970 * * * * * * * * * * * * * * 1030 28 0 * * * * * * 2063 0 0 E 29 * * * 2218 * * * * * * * * * * 2073 * 1874 1864 * * 29 0 * * * * * * 2063 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2063 0 0 E 31 * * * 1030 * * * * * * * * * * * 970 * * * * 31 0 * * * * * * 2063 0 0 L 32 * * * * 1874 * * * * 1030 2073 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2063 0 0 H 33 * * * * * * 392 * * * * 2073 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 2063 0 0 L 34 * * * * * * * 965 * 2218 * * * * * * * 1874 * * 34 0 * * * * * * 2063 0 0 P 35 1874 * * * * * * * * * * * 459 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2063 0 0 L 36 * * * * * * * 1864 * 463 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 2063 0 0 S 37 * * 869 * * * * * * * * * * * * 2218 2073 * * * 37 0 * * * * * * 2063 0 0 Y 38 * * * * 1874 * * * * * * * * * * * * * * 459 38 0 * * * * * * 2063 0 0 W 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 39 0 * * * * * * 2063 0 0 D 40 * * 2218 * * 1864 * * * * * 2073 * * * 1874 * * * * 40 0 * * * * * * 2063 0 0 I 41 * * * * * * * 459 * * * * 1874 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2063 0 0 K 42 * * * 1864 * * * * 2218 * * 2073 * * 1874 * * * * * 42 0 * * * * * * 2063 0 0 D 43 * * 463 1864 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2063 0 0 Y 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 44 0 * * * * * * 2063 0 0 K 45 * * * * * * * * 459 * * * * * 1874 * * * * * 45 0 * * * * * * 2063 0 0 N 46 1874 * * * * * * * 2073 * * 1030 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2063 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 2063 0 0 W 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 48 0 * * * * * * 2063 0 0 L 49 1864 * * * * * * * 1874 1144 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2063 0 0 K 50 * * * * * * * * 1144 * * * * * 1874 * 1864 * * * 50 0 * * * * * * 2063 0 0 S 51 1874 * * * * * * * * * * * * * * 459 * * * * 51 0 * * * * * * 2063 0 0 L 52 * * * * * * * 1864 * 463 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2063 0 0 G 53 1864 * * 2073 * 1036 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2063 0 0 E 54 * * 1864 1144 * * * * * * * * * * 1874 * * * * * 54 0 * * * * * * 2063 0 0 G 55 * * * * * 459 * * * 1874 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2063 0 0 L 56 * * * * * * * 1864 * 463 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2063 0 0 S 57 * * * 1864 * * * * * * * * * * * 1036 2073 * * * 57 459 1874 * 0 * * * 2063 1000 0 N 58 * * 1874 * * * * * 965 * * 2218 * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2063 0 0 K 59 * * * * * * * * 459 * * * * * * * * 1874 * * 59 0 * * * * * * 2063 0 0 T 60 * * * * * * * 1874 * * * 2073 * 1864 * * 2218 * * * 60 0 * * * * * * 2063 0 0 H 61 * * 1874 * * * 459 * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2063 0 0 S 62 2073 * * * * * * * * * * * * * * 392 * * * * 62 0 * * * * * * 2063 0 0 A 63 1144 1874 * * * * * * * * * * * * * * * 1864 * * 63 0 * * * * * * 2063 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2063 0 0 A 65 1144 * * * * * * 869 * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2063 0 0 V 66 1874 * * * * * * * * * * * * * * * 1864 1144 * * 66 0 * * * * * * 2063 0 0 S 67 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 67 0 * * * * * * 2063 0 0 X 68 * * * * * * * * * * 575 * * * * * * 1606 * * 68 0 * * * * * * 1957 0 0 Y 69 * * * * * 1874 1864 * * * * * * * * * * * * 1144 69 0 * * * * * * 2063 0 0 E 70 * * 1874 459 * * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 2063 0 0 P 71 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 71 0 * * * * * * 2063 0 0 E 72 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2063 0 0 K 73 * * * * * * * * 2218 2073 * * * * * 1864 1874 * * * 73 0 * * * * * * 2063 0 0 T 74 970 * * * * * * * * 1864 * * * * * * 2218 * * * 74 0 * * * * * * 2063 0 0 N 75 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2063 0 0 F 76 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2063 0 0 I 77 * * * * * * * 1030 * * * * * * * * * 970 * * 77 0 * * * * * * 2063 0 0 F 78 * * * * 1144 * * * * * * * * * * 1864 1874 * * * 78 0 * * * * * * 2063 0 0 T 79 * 1874 * * * * * * * * * * * * * * 1030 2073 * * 79 0 * * * * * * 2063 0 0 W 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 80 0 * * * * * * 2063 0 0 V 81 * * * * * * * 1864 * * * * 1874 * * * * 1144 * * 81 0 * * * * * * 2063 0 0 L 82 * * * * * * * 1864 * 463 * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2063 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 2063 0 0 F 84 * * * * 1144 * * * * * * * * * 1874 * * * * 1864 84 0 * * * * * * 2063 0 0 E 85 * 1874 1864 2218 * * * * 2073 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 2063 0 0 D 86 2073 * 2218 * * 1864 * * 1874 * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 2063 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2063 0 0 K 88 * * * * * * * 965 1036 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2063 0 0 V 89 * * * * * * * * * * * * * * * 1864 * 463 * * 89 0 * * * * * * 2063 0 0 Y 90 * * * * * * 2073 * * * * * * * * * * * * 392 90 0 * * * * * * 2063 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 91 0 * * * * * * 1678 0 0 Q 92 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 92 0 * * * * * * 1678 0 0 N 93 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1678 0 0 N 94 * * * * * * * * * * * 1688 * * * 536 * * * * 94 0 * * * * * * 1678 0 0 V 95 * * * * * * * 536 * * * * * * * * * 1688 * * 95 0 * * * * * * 1678 0 0 I 96 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1678 0 0 F 97 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1678 0 0 L 98 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1678 0 0 E 99 * * 1460 652 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1678 0 0 E 100 * * * 652 * * * * * * * * * 1460 * * * * * * 100 0 * * * * * * 1678 0 0 C 101 * 1688 * * * * 1616 * * 1460 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1678 0 0 H 102 * * * 1460 * * 1688 * 1616 * * * * * * * * * * * 102 652 1460 * 0 * * * 1678 1000 0 G 103 * * * * * 570 * * 1616 * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1678 0 0 F 104 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1678 0 0 S 105 * * 1460 * * * * * * * * * * * * 652 * * * * 105 0 * * * * * * 1678 0 0 P 106 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1678 0 0 E 107 * * 1460 652 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1678 0 0 N 108 * * * * * * * * 1616 * * 1688 * * 1460 * * * * * 108 0 * * * * * * 1678 0 0 I 109 * * * * * * * 652 * * * * 1460 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1678 0 0 N 110 * * * * * * * * * * * 652 * * * * * * 1460 * 110 0 * * * * * * 1678 0 0 K 111 * * * 536 * * * * 1688 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1678 0 0 F 112 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1678 0 0 I 113 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1678 0 0 E 114 * * 1616 570 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1678 0 0 S 115 1460 * * 1616 * * * * * * * * * * * 1688 * * * * 115 0 * * * * * * 1678 0 0 R 116 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 116 0 * * * * * * 1678 0 0 T 117 * * * * * * * * * * * * * 1460 * * 652 * * * 117 0 * * * * * * 1678 0 0 T 118 * * * * * * * * * * * * * * * 1460 652 * * * 118 0 * * * * * * 1678 0 0 H 119 * * * * * * 652 1460 * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1678 0 0 D 120 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1678 0 0 G 121 * * * 536 * 1688 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1678 0 0 D 122 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1678 0 0 G 123 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1678 0 0 X 124 * * * * * * * * * * 940 1063 * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1503 0 0 K 125 * * * * * * * * 652 * * * * * 1460 * * * * * 125 0 * * * * * * 1678 0 0 I 126 * * * * * * * 652 * * * * * * * * * 1460 * * 126 0 * * * * * * 1678 0 0 S 127 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 127 0 * * * * * * 1678 0 0 E 128 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1678 0 0 W 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 129 0 * * * * * * 1678 0 0 H 130 * * * 1460 * * 1688 * * * * * * * * 1616 * * * * 130 0 * * * * * * 1678 0 0 T 131 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 131 0 * * * * * * 1678 0 0 D 132 * * 652 1460 * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1678 0 0 L 133 * * * * * * * 1460 * 652 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1678 0 0 N 134 * * 1616 * * * * * * * * 1688 * * * 1460 * * * * 134 0 * * * * * * 1678 0 0 S 135 * * * 1460 * * * * * * * * * * * 652 * * * * 135 0 * * * * * * 1678 0 0 V 136 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 136 0 * * * * * * 1678 0 0 L 137 * * * 1460 * * * * * 652 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1678 0 0 D 138 * * 652 1460 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1678 0 0 F 139 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1678 0 0 Y 140 * * * * * * * * * 1460 * * * * * * * * * 652 140 0 * * * * * * 1678 0 0 H 141 * * * * * * 1688 * * * * 1616 * * 1460 * * * * * 141 0 * * * * * * 1678 0 0 S 142 * * * * * * * * * * * * * * * 652 1460 * * * 142 0 * * * * * * 1678 0 0 L 143 * * * * * * * * * 652 * * * * * * * 1460 * * 143 0 * * * * * * 1678 0 0 N 144 * * 1031 * * * * * * * * 970 * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1463 0 0 N 145 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 A 146 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //