HHsearch 1.5 NAME c4l6tB_ FAM FILE c4l6tB_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4l6tB_.a3m DATE Sat Nov 9 08:47:06 2013 LENG 105 match states, 105 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.4056 -0.3597 SEQ >ss_dssp CCCSSHHHHHTTSTTEEEEEEEECCSEEEEECSTTCCEEEEECTTSCEEEECCCCTTSCGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCEEEEEEESSSSSEEEEEE ECCCC >sa_dssp EECEDBDDDAEDEEECDCCECECDBDDCDECEDEEEDBBCACBEEECDABABCDCEDBEEECDEDBDECBDDADDADEECDEABCAAACDEDECCABCBC CDEEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEE EECCC >ss_conf 9603589987531252588750568866663146503899995599679998484111233464799987544331200440222565328898716757 73169 >Consensus mtpqxitxlcxeyxntxiysxnxxixsytesxagkremviisfxxgxtfqvevpgsqhxxsqkxxxermkdtlrxxyxtxxkixklcxwxnkspnsiaai xxxnl >c4l6tB_ MTPQNITDLCNEYQNTMIYSLNKEIATYTESLAGKREMVIISFSNGATFQVEVPGSQHLESQKRPLERMKDTLRAAYFTGIKISKLCAWTNKSPNSIAAI ELSNL >UniRef50_P32890(23-124:124) Heat-labile enterotoxin B chain n=80 Tax=root RepID=ELBP_ECOLX E=1e-37 s/c=1.54 id=67% cov=98% --PQTITELCSEYRNTQIYTINDKILSYTESMAGKREMVIITFKSGETFQVEVPGSQHIDSQKKAIERMKDTLRITYLTETKIDKLCVWNNKTPNSIAAI SMKN- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 P 3 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1251 0 0 Q 4 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 4 0 * * * * * * 1251 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 5 0 * * * * * * 1251 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1251 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 7 0 * * * * * * 1251 0 0 D 8 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1251 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1251 0 0 C 10 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1251 0 0 N 11 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 11 0 * * * * * * 1251 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1251 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1251 0 0 Q 14 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 14 0 * * * * * * 1251 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1251 0 0 T 16 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 16 0 * * * * * * 1251 0 0 M 17 * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1251 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1251 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 19 0 * * * * * * 1251 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 20 0 * * * * * * 1251 0 0 L 21 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1251 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1251 0 0 K 23 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1251 0 0 E 24 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1251 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1251 0 0 A 26 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1251 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 27 0 * * * * * * 1251 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1251 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1251 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1251 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1251 0 0 L 32 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1251 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1251 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1251 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1251 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1251 0 0 E 37 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1251 0 0 M 38 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1251 0 0 V 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 39 0 * * * * * * 1251 0 0 I 40 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1251 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1251 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 42 0 * * * * * * 1251 0 0 F 43 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1251 0 0 S 44 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 44 0 * * * * * * 1251 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 45 0 * * * * * * 1251 0 0 G 46 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1251 0 0 A 47 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1251 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1251 0 0 F 49 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1251 0 0 Q 50 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1251 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 51 0 * * * * * * 1251 0 0 E 52 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1251 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 53 0 * * * * * * 1251 0 0 P 54 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1251 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1251 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 56 0 * * * * * * 1251 0 0 Q 57 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1251 0 0 H 58 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1251 0 0 L 59 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1251 0 0 E 60 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1251 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1251 0 0 Q 62 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 62 0 * * * * * * 1251 0 0 K 63 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1251 0 0 R 64 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 64 0 * * * * * * 1251 0 0 P 65 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1251 0 0 L 66 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1251 0 0 E 67 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1251 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 68 0 * * * * * * 1251 0 0 M 69 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1251 0 0 K 70 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1251 0 0 D 71 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1251 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 1251 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1251 0 0 R 74 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 74 0 * * * * * * 1251 0 0 A 75 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1251 0 0 A 76 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 76 0 * * * * * * 1251 0 0 Y 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 77 0 * * * * * * 1251 0 0 F 78 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1251 0 0 T 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 79 0 * * * * * * 1251 0 0 G 80 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1251 0 0 I 81 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 81 0 * * * * * * 1251 0 0 K 82 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1251 0 0 I 83 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1251 0 0 S 84 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 84 0 * * * * * * 1251 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1251 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1251 0 0 C 87 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1251 0 0 A 88 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 88 0 * * * * * * 1251 0 0 W 89 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 89 0 * * * * * * 1251 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 90 0 * * * * * * 1251 0 0 N 91 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1251 0 0 K 92 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1251 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 93 0 * * * * * * 1251 0 0 P 94 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1251 0 0 N 95 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1251 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1251 0 0 I 97 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1251 0 0 A 98 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1251 0 0 A 99 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1251 0 0 I 100 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1251 0 0 E 101 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 101 0 * * * * * * 1251 0 0 L 102 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1251 0 0 S 103 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 103 0 * * * * * * 1251 0 0 N 104 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1251 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //