HHsearch 1.5 NAME c4ky3A_ FAM FILE c4ky3A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4ky3A_.a3m DATE Sat Jun 22 08:22:39 2013 LENG 160 match states, 160 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.3523 -3.3405 SEQ >ss_dssp CEEEEEEEECSSCEECCEEEESSSHHHHHHHHHHHHHHHHTCCSEEEEEEEESSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCEEEEEEEEEEECSCHHHHHHHHHHH HHHHHTTTCEEEEEECSSEEEEEEESCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCEEEEEEEEEEEC >sa_dssp EBDACACACCEEDECECECDBDECECAEEBBDEBBECBEEEDBDCACABACAECCEBADDABCCADEBAEDCEBEDCDDCABADADCEEEEBADEABECA BDBADEDEBEBEDEDEECDADACADEBDCEBACDBADCACDABEDCEBDBCABBBBBBDE >ss_pred CEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHH HHHHHHHCCEEEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEECC >ss_conf 9079999825882879999982247999999999999972577259999986481779999999999998618011453046897055368999999999 998641033589998488579999347289999999989977765007999999995119 >Consensus dvxixixIxxxGqxxexxxxVsTxxELerxLxELexxlxrxGArxVxItIsAxxxxqAxxxLxliArlxxxLGYxDINrkxtxrfrgddleaxekalkem irqarkfagtvtytldgndleixitgvpxqvxxelakeaerlakefnitxtxtxxxegql >c4ky3A_ DIQVQVNIDDNGKNFDYTYTVTTESELQKVLNELXDYIKKQGAKRVRISITARSSKEAYKFLAILAKVFAELGYNDINRKXTVRFRGDDLEALEKALKEX IRQARKFAGTVTYTLDGNDLEITITGVPRQVLEELAKEAERLAKEFNITITITVTVEGQL >UniRef50_UPI0001B04C41(5-79:85) UPI0001B04C41 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI0001B04C41 E=1e-27 s/c=1.65 id=83% cov=48% ----------------------------------------------------------------------------------IRFRGDDLEAFEKALKEM IRQARKFAGTVTYTLDGNDLEIRITGVPEQVRKELAKEAERLAKEFNITVTYTIRLE--- >UniRef50_UPI00017BDAF0(6-91:96) UPI00017BDAF0 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI00017BDAF0 E=3e-06 s/c=0.62 id=31% cov=49% -VDITIKIQRDGQEIEIDIRVSTGKELERALQELEKALARAGARNVQITISAENDEQAKELLELIARLLQKLGYKDIN---------------------- ------------------------------------------------------------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * * 981 * * 2 0 * * * * * * 1597 0 0 Q 3 * * 981 * * * * * * * * * * 1019 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1597 0 0 V 4 * * * * * * * 981 * * * * * * * * * 1019 * * 4 0 * * * * * * 1597 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 1019 * * 981 * * * 5 0 * * * * * * 1597 0 0 V 6 * * * * * * * 981 * * * * * * * * * 1019 * * 6 0 * * * * * * 1597 0 0 N 7 * * * * * * * * 981 * * 1019 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1597 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1597 0 0 D 9 * * 1019 * * * * * * * * * * 981 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1597 0 0 D 10 * * 1019 * * * * * * * * * * * 981 * * * * * 10 0 * * * * * * 1597 0 0 N 11 * * 981 * * * * * * * * 1019 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1597 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1597 0 0 K 13 * * * * * * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1597 0 0 N 14 * * * 981 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1597 0 0 F 15 * * * * 1019 * * 981 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1597 0 0 D 16 * * 1019 981 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1597 0 0 Y 17 * * * * * * * 981 * * * * * * * * * * * 1019 17 0 * * * * * * 1597 0 0 T 18 * * 981 * * * * * * * * * * * * * 1019 * * * 18 0 * * * * * * 1597 0 0 Y 19 * * * * * * * 981 * * * * * * * * * * * 1019 19 0 * * * * * * 1597 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * 981 * 1019 * * * 20 0 * * * * * * 1597 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1597 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * * * * * 981 1019 * * * 22 0 * * * * * * 1597 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 23 0 * * * * * * 1597 0 0 E 24 * * * 1019 * 981 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1597 0 0 S 25 * * * * * * * * 981 * * * * * * 1019 * * * * 25 0 * * * * * * 1597 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1597 0 0 L 27 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1597 0 0 Q 28 * * * 981 * * * * * * * * * 1019 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1597 0 0 K 29 * * * * * * * * 1019 * * * * * 981 * * * * * 29 0 * * * * * * 1597 0 0 V 30 981 * * * * * * * * * * * * * * * * 1019 * * 30 0 * * * * * * 1597 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1597 0 0 N 32 * * * * * * * * * * * 1019 * 981 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1597 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1597 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1597 0 0 X 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 D 36 * * 1019 * * * * * 981 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1597 0 0 Y 37 981 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1019 37 0 * * * * * * 1597 0 0 I 38 * * * * * * * 1019 * 981 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1597 0 0 K 39 981 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1597 0 0 K 40 * * * * * * * * 1019 * * * * * 981 * * * * * 40 0 * * * * * * 1597 0 0 Q 41 981 * * * * * * * * * * * * 1019 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1597 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1597 0 0 A 43 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1597 0 0 K 44 * * * * * * * * 1019 * * * * * 981 * * * * * 44 0 * * * * * * 1597 0 0 R 45 * * * * * * * * * * * 981 * * 1019 * * * * * 45 0 * * * * * * 1597 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1597 0 0 R 47 * * * * * * * * * * * * * 981 1019 * * * * * 47 0 * * * * * * 1597 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1597 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 1019 981 * * * 49 0 * * * * * * 1597 0 0 I 50 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1597 0 0 T 51 * * * * * * * * * * * * * * * 981 1019 * * * 51 0 * * * * * * 1597 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1597 0 0 R 53 * * * 981 * * * * * * * * * * 1019 * * * * * 53 0 * * * * * * 1597 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * 981 * * * 1019 * * * * 54 0 * * * * * * 1597 0 0 S 55 * * 981 * * * * * * * * * * * * 1019 * * * * 55 0 * * * * * * 1597 0 0 K 56 * * * 981 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1597 0 0 E 57 * * * 1019 * * * * * * * * * 981 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1597 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1597 0 0 Y 59 * * * * * * * * 981 * * * * * * * * * * 1019 59 0 * * * * * * 1597 0 0 K 60 * * * 981 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1597 0 0 F 61 * * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1597 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1597 0 0 A 63 1019 * * 981 * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1597 0 0 I 64 * * * * * * * 1019 * 981 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1597 0 0 L 65 * * * * * * * 981 * 1019 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1597 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1597 0 0 K 67 * * * * * * * * 1019 * * * * * 981 * * * * * 67 0 * * * * * * 1597 0 0 V 68 * * * * * * * * * 981 * * * * * * * 1019 * * 68 0 * * * * * * 1597 0 0 F 69 * * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1597 0 0 A 70 1019 * * * * * * * * * * * * 981 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1597 0 0 E 71 * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1597 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1597 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1597 0 0 Y 74 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 74 0 * * * * * * 1597 0 0 N 75 * * * * * * * * 981 * * 1019 * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1597 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1597 0 0 I 77 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1597 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1597 0 0 R 79 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 K 80 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 X 81 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 81 * * * * * * * 1000 0 0 T 82 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 V 83 * * * * * * * 981 * * * * * * * * * 1019 * * 83 0 * * * * * * 1107 0 0 R 84 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 84 0 * * * * * * 1107 0 0 F 85 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1107 0 0 R 86 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 86 0 * * * * * * 1107 0 0 G 87 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1107 0 0 D 88 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1107 0 0 D 89 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1107 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1107 0 0 E 91 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1107 0 0 A 92 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1107 0 0 L 93 * * * * 981 * * * * 1019 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1107 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1107 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1107 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1107 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1107 0 0 K 98 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1107 0 0 E 99 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1107 0 0 X 100 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1107 0 0 R 102 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 102 0 * * * * * * 1107 0 0 Q 103 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 103 0 * * * * * * 1107 0 0 A 104 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1107 0 0 R 105 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 105 0 * * * * * * 1107 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1107 0 0 F 107 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1107 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1107 0 0 G 109 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1107 0 0 T 110 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 110 0 * * * * * * 1107 0 0 V 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 111 0 * * * * * * 1107 0 0 T 112 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 112 0 * * * * * * 1107 0 0 Y 113 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 113 0 * * * * * * 1107 0 0 T 114 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 114 0 * * * * * * 1107 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1107 0 0 D 116 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1107 0 0 G 117 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1107 0 0 N 118 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1107 0 0 D 119 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1107 0 0 L 120 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1107 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1107 0 0 I 122 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1107 0 0 T 123 * * * * * * * * * * * * * * 981 * 1019 * * * 123 0 * * * * * * 1107 0 0 I 124 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1107 0 0 T 125 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 125 0 * * * * * * 1107 0 0 G 126 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1107 0 0 V 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 127 0 * * * * * * 1107 0 0 P 128 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1107 0 0 R 129 * * * 981 * * * * * * * * * * 1019 * * * * * 129 0 * * * * * * 1107 0 0 Q 130 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1107 0 0 V 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 131 0 * * * * * * 1107 0 0 L 132 * * * * * * * * * 1019 * * * * 981 * * * * * 132 0 * * * * * * 1107 0 0 E 133 * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1107 0 0 E 134 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1107 0 0 L 135 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1107 0 0 A 136 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1107 0 0 K 137 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1107 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1107 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1107 0 0 E 140 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1107 0 0 R 141 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 141 0 * * * * * * 1107 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1107 0 0 A 143 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1107 0 0 K 144 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1107 0 0 E 145 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1107 0 0 F 146 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1107 0 0 N 147 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1107 0 0 I 148 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1107 0 0 T 149 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 149 0 * * * * * * 1107 0 0 I 150 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * * 981 * * 150 0 * * * * * * 1107 0 0 T 151 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 151 0 * * * * * * 1107 0 0 I 152 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 981 152 0 * * * * * * 1107 0 0 T 153 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 153 0 * * * * * * 1107 0 0 V 154 * * * * * * * 981 * * * * * * * * * 1019 * * 154 0 * * * * * * 1107 0 0 T 155 * * * * * * * * * * * * * * 981 * 1019 * * * 155 0 * * * * * * 1107 0 0 V 156 * * * * * * * * * 981 * * * * * * * 1019 * * 156 0 * * * * * * 1107 0 0 E 157 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1107 0 0 G 158 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 159 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 L 160 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 160 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //