HHsearch 1.5 NAME c4k6lC_ FAM FILE c4k6lC_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4k6lC_.a3m DATE Sat Jul 20 08:41:40 2013 LENG 114 match states, 114 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4291 0.6922 SEQ >ss_dssp CCTTCTTSEEEEEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEETTSCSCCEEEEEETTSSTTGGGHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEESSCCCCHHHHHHSCSCEEE EEEEBCSSCBSSCC >sa_dssp EECCCEEBCDCCDBCBCECDECECEEADBABADACCEEEDEEDBCAABBCECDECCEDCEEBBDDADEBDEDDCCABABACDECBEEEEBCEECBCBAAB BCBDCDEEEBEDCE >ss_pred CCCCCCCCCEECCEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCEE EEEECCCCCCCCCC >ss_conf 9456655421234166544445871873675554523788773799996045431004899985110445408638999837832681366431666137 88621455235789 >Consensus ewtgdxxnxyxSxvxitxfxxGqidxxxyFCixxxkaxgsxxpxvaCxvsnxsxwaxsfxxllxqArYfYxTgqsvRiyyxxnVWTxpxFxxxfSxnalv glssCtstxCxGPx >c4k6lC_ EWTGDNTNAYYSDEVISELHVGQIDTSPYFCIKTVKANGSGTPVVACAVSKQSIWAPSFKELLDQARYFYSTGQSVRIHVQKNIWTYPLFVNTFSANALV GLSSCSATQCFGPK >UniRef50_A9ML83(22-138:151) Putative uncharacterized protein n=6 Tax=Salmonella enterica RepID=A9ML83_SALAR E=2e-38 s/c=1.36 id=71% cov=100% EWTGDYENiSYFSHEVISEFHVGQIDGGAYFCIKAVKADGsSSTPLIACSVSNKSVWAPSFKVLLEQARYFYVTEQSVRIYYDHNVWTNQPFVNTFSTNA LVGLSSCSsaATDCFGP- >UniRef50_Q6EZC3(24-135:141) SubB n=20 Tax=Enterobacteriaceae RepID=Q6EZC3_ECOLX E=6e-28 s/c=1.12 id=51% cov=98% EWTGDARDGMFSGVVITQFHTGQIDNKPYFCIEGKQSAGSS--ISACSMKNSSVWGASFSTLYNQALYFYTTGQPVRIYYKPGVWTYPPFVKALTSNALV GLSTCtTSTECFGP- >UniRef50_C0B0U4(29-129:133) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Proteus penneri ATCC 35198 RepID=C0B0U4_9ENTR E=8e-21 s/c=1.00 id=43% cov=89% ---------YYSNVTLTDFNSGKIEDGRYFC---VKAMNHGGQFIACAVSNKSDWASSYEHFFQQAHYYYTTGKSFRLYVQPNVWTHPKFTRVYSNKAIA GFASCHNSRCMGP- >UniRef50_Q404H3(27-137:141) ArtB protein n=6 Tax=Enterobacteriaceae RepID=Q404H3_SALTY E=3e-09 s/c=0.57 id=35% cov=92% -------NTYQSNVQINNLSYGVYRSgdkeSQFFCVGLKR--GSQVPNVhtICKIDVFGTHKQGFDNMLATARYYYATGEDVRIYYKENVWTDRNFTAAF SGNELIAITTCTSSDyCMGP- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1496 0 0 W 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 2 0 * * * * * * 1496 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1496 0 0 G 4 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1496 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1496 0 0 N 6 1492 * * * * * * * * * * 1604 * * * * * * * 1664 6 0 * * * * * * 1496 0 0 T 7 * * * 1664 * * * * * * * * * * 1492 * 1604 * * * 7 0 * * * * * * 1496 0 0 N 8 * * 2014 * * * * * * * * 410 * * * * * * * * 8 354 2199 * 0 * * * 1917 1000 0 A 9 2138 * * * * 2014 * * * * * * * * * 2199 1702 * * * 9 0 * * * * * * 1917 0 0 Y 10 * * * * * * * * * * 2364 * * * * * * * * 312 10 0 * * * * * * 2184 0 0 Y 11 * * * * 1479 * * * * * * * * 2024 * * * * * 1339 11 0 * * * * * * 2184 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 2184 0 0 D 13 * * 2552 * * 2364 2604 * * * * 1087 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2184 0 0 E 14 * * * 1578 * * * * * * * * * * * * * 589 * * 14 0 * * * * * * 2184 0 0 V 15 * * * * * * * * * * * * * 2024 * * 2153 918 * * 15 0 * * * * * * 2184 0 0 I 16 * * * * * * * 367 * 2153 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2184 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * 2024 * * * 1578 1254 * * * 17 0 * * * * * * 2184 0 0 E 18 * * 2153 1578 * * * * * * * 2024 * 2364 * * * * * * 18 0 * * * * * * 2184 0 0 L 19 * * * * 777 * * * * 1264 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2184 0 0 H 20 * * * * * * 918 * * * * 2153 * * * 2024 * * * * 20 0 * * * * * * 2184 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * 2153 2364 1578 * 2024 21 0 * * * * * * 2184 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2184 0 0 Q 23 * * * * * * * * 2153 * * * * 918 * * * 2024 * * 23 0 * * * * * * 2184 0 0 I 24 * * * * * * * 407 * * * * * * * * * * * 2024 24 0 * * * * * * 2184 0 0 D 25 * * 918 2153 * * * * * * * * * * 2024 * * * * * 25 0 * * * * * * 2184 0 0 T 26 * * 2153 * * 2604 * * * * * 2364 * * * 2024 2552 * * * 26 407 2024 * 2000 415 * * 2184 1000 0 S 27 * * * * * 1361 * * 2364 * * * * * * 1264 * * * * 27 0 * * * * * * 2184 0 0 P 28 2604 * * * * * * * * * * * 1455 2024 2153 * * * * * 28 0 * * * * * * 2184 0 0 Y 29 * * * * 2024 * * * * * * * * * * * * * * 407 29 0 * * * * * * 2184 0 0 F 30 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2184 0 0 C 31 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 367 * 2153 * * * * 2184 0 0 I 32 * * * * * * * 530 * * * * * * * * * 1702 * * 32 0 * * * * * 0 1917 0 1000 K 33 * * * 2014 * 1702 * * 1168 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * 0 1917 0 1000 T 34 2199 * * * * 2014 * * * 1702 * * * * * * 2138 * * * 34 0 * * * * 0 * 1917 0 1000 V 35 * * * * * * * * 1184 * * * * * * * * 837 * * 35 0 * * * * * * 2184 0 0 K 36 * * * * * * * * 837 * * * * 2364 2024 * * * * * 36 407 * 2024 * * * * 2184 0 0 A 37 437 * * * * * * * * * * * * * * 1937 * * * * 37 0 * * * * * 0 1824 0 1000 N 38 1937 * 2193 * * * * * * * 1778 2131 * * * * * * * * 38 0 * * * * 0 * 1824 0 1000 G 39 * * * * * 367 * * * * * 2153 * * * * * * * * 39 259 2604 * 0 * * * 2184 1000 0 S 40 * * * * * * 2153 * * * * * * * * 367 * * * * 40 0 * * * * * * 2184 0 0 G 41 * * * * * 1339 * * * * * * * 2024 * 1479 * * * * 41 312 * 2364 * * * * 2184 0 0 T 42 * * * * * 1902 * * * * * * * * * * 1198 1754 * * 42 0 * * * * * 0 2016 0 1000 P 43 * * * * * * * * * * * * 449 1902 * * * * * * 43 0 * * * * 0 * 2016 0 1000 V 44 * * * * 2153 * * 2364 * 2604 * 2024 * * * * * 2552 * * 44 0 * * * * * * 2184 0 0 V 45 * * * * * * * 1361 * * * * * * * 2364 * 1264 * * 45 407 2024 * 1000 1000 * * 2184 1000 0 A 46 407 * * * * * * 2024 * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2184 0 0 C 47 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 2184 0 0 A 48 1339 * * * * * * * 2024 * * * * * * 1479 * * * * 48 0 * * * * * * 2184 0 0 V 49 * * * * * * * 2024 * * 2364 * * * * * * 837 * * 49 0 * * * * * * 2184 0 0 S 50 * * 2024 * * * * * 2364 * * * * * * 837 * * * * 50 0 * * * * * * 2184 0 0 K 51 * * * * * * * * 2552 * * 777 * * * * * 2024 * * 51 0 * * * * * * 2184 0 0 Q 52 * * * * 2024 * * * 1361 * * * * 2552 * 2364 * * * * 52 0 * * * * * * 2184 0 0 S 53 * * * * * 2024 * * * * * * * * * 407 * * * * 53 0 * * * * * * 2184 0 0 I 54 * * 2153 * * * * 2552 * * * * * * * * 2024 1479 * * 54 0 * * * * * * 2184 0 0 W 55 * * * * * * 2024 * * * * * * * * * * * 407 * 55 0 * * * * * * 2184 0 0 A 56 837 * * * * 2364 * * 2024 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2184 0 0 P 57 2364 * * * * * * * * * * * 1578 2024 * 2153 * * * * 57 0 * * * * * * 2184 0 0 S 58 * * * * * 2024 * * * * * * * * * 407 * * * * 58 0 * * * * * * 2184 0 0 F 59 * * * * 367 * * * * * * * * * * * * * * 2153 59 0 * * * * * * 2184 0 0 K 60 * * 2024 2153 * * * * 1578 * * * * * * 2364 * * * * 60 0 * * * * * * 2184 0 0 E 61 * * * 2552 * * 2153 * * * * 2024 * * * * 2364 2604 * * 61 0 * * * * * * 2184 0 0 L 62 * * * * 2153 * * * * 918 2024 * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2184 0 0 L 63 * * * * 2153 * * * * 784 * * * * * * * * * 2364 63 0 * * * * * * 2184 0 0 D 64 2024 * 2552 2604 * * * * * * * 2364 * 2153 * * * * * * 64 0 * * * * * * 2184 0 0 Q 65 * * * * * * * * * * * * * 407 * * 2024 * * * 65 0 * * * * * * 2184 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2184 0 0 R 67 * * * * * * 2153 * * 2364 * * * * 784 * * * * * 67 0 * * * * * * 2184 0 0 Y 68 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 68 0 * * * * * * 2184 0 0 F 69 * * * * 918 * * * * * * * * * * * * * * 1087 69 0 * * * * * * 2184 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 2184 0 0 S 71 2024 * * * * * * * * * * * * * * 2552 1254 2604 * * 71 0 * * * * * * 2184 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 2184 0 0 G 73 * * * 2604 * 259 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2184 0 0 Q 74 * * * 2024 * * * * 2153 * * * * 918 * * * * * * 74 0 * * * * * * 2184 0 0 S 75 * * 2024 * * * * * * * * * 2364 * * 837 * * * * 75 0 * * * * * * 2184 0 0 V 76 * * * * 2153 * * * * * * * * * * * * 367 * * 76 0 * * * * * * 2184 0 0 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * * 2184 0 0 I 78 * * * * * * * 367 * 2153 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2184 0 0 H 79 * * * * * * 2552 * * * * * * * * * * * * 270 79 0 * * * * * * 2184 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1339 * 726 80 0 * * * * * * 2184 0 0 Q 81 * * 2604 * * * * * 1184 * * * * 1339 * * * * * * 81 0 * * * * * * 2184 0 0 K 82 * * * 2024 * * 2604 * 2552 * * * 1254 * * * * * * * 82 0 * * * * * * 2184 0 0 N 83 * * * * * 2364 * * * * * 312 * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2184 0 0 I 84 * * * * * * * 2552 * * * * * * * * * 270 * * 84 0 * * * * * * 2184 0 0 W 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 85 0 * * * * * * 2184 0 0 T 86 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 86 0 * * * * * * 2184 0 0 Y 87 * * 2024 * * * 2153 * * * * 2604 * * * * * * * 1455 87 0 * * * * * * 2184 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 762 2604 2024 * * * * * 88 0 * * * * * * 2184 0 0 L 89 * * * * * * * * 2153 2552 * 2024 1479 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2184 0 0 F 90 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 2184 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 1087 918 * * 91 0 * * * * * * 2184 0 0 N 92 2024 * * * * * * * 2364 * * 1578 * * 2153 * * * * * 92 0 * * * * * * 2184 0 0 T 93 1184 * * * * * * * * * * * * * * * 1578 2153 * * 93 0 * * * * * * 2184 0 0 F 94 * * * * 784 * * * * 2364 * * * * * * * * * 2153 94 0 * * * * * * 2184 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * * * 312 2364 * * * 95 0 * * * * * * 2184 0 0 A 96 2552 * * * * 2024 * * * * * 2153 * * * 2364 2604 * * * 96 0 * * * * * * 2184 0 0 N 97 * * * * * * * * 2153 * * 367 * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 2184 0 0 A 98 407 * * 2024 * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2184 0 0 L 99 * * * * * * * 2153 * 367 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2184 0 0 V 100 2153 * * * * * * 2024 * * * * * * * * * 918 * * 100 0 * * * * * * 2184 0 0 G 101 2024 * * * * 407 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2184 0 0 L 102 * * * * 2153 * * 2024 * 918 * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2184 0 0 S 103 2153 * * * * * * * * * * * * * * 918 2024 * * * 103 0 * * * * * * 2184 0 0 S 104 * * * * * * * * * * * * * * * 837 1184 * * * 104 0 * * * * * * 2184 0 0 C 105 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 312 2364 * 0 * * * 2184 1000 0 S 106 * * * * * * 2153 * * * * * * * * 1578 1184 * * * 106 259 2604 * 1000 1000 * * 2184 1000 0 A 107 1578 * * * * * * * * * * 2153 * * * 1184 * * * * 107 0 * * * * * * 2184 0 0 T 108 * * * * * * * * * * * * * * * 1087 918 * * * 108 0 * * * * * * 2184 0 0 Q 109 * * 1285 2364 * * * * * * * * * 2552 2153 * * * * * 109 407 2024 * 0 * * * 2184 1000 0 C 110 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2184 0 0 F 111 * * * * 918 * * * * * 1087 * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2184 0 0 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2184 0 0 P 113 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2184 0 0 K 114 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 114 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //