HHsearch 1.5 NAME c4k15A_ FAM FILE c4k15A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4k15A_.a3m DATE Sat Apr 20 08:28:02 2013 LENG 138 match states, 138 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4337 0.4216 SEQ >ss_dssp CCCCSSTTTSEEEEEECTTCCEEEEEECCCCCSSCCSSSBSCCCSEEEEEEEEEECSSEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEEEECCTTCEEEEEEEEE CSSSSEEEEEEEEECSSCEEEEEEEEEEETTEEEEEEC >sa_dssp EEEEEDCEECEDEEDEEEEEEEDDEEEDEEEEEEECEEBEEEAEEDECDDDBEDDCECCCAAABADACADEDEBDADCCCEDDDDCEDEDBDDEEDECDD DEEADBACBCADBDCEEDECDBBBDABBDDDCBBDDCE >ss_pred CEEEECCCEEEEEEEEECCCCEEEEEECHHHCCCHHHEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCEEEECCCCEEEHHHEEE ECCCCEEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEEC >ss_conf 9030046433124676227866225420221000121023453158734999998358999999997860351467640165045553883011220001 12665047880321100037999999964936875419 >Consensus etfdlngnixxxxxIxxExGxxGTLGiePiiDxxxxxxxsYxxxxGxSTWKIYWYSGxxNxxFxxxINiSxGxxxITxAYNxWYqFxsPxxxVKKxxiSx xxxxxsxsxxxxxrxxisxWxixLxAxVxxxxLxTsfk >c4k15A_ ETFDLNGNIAQEKEIVLEDGTEGTLGVXPIIDERPLLKGTYSLANGTSTWKIYWYSGVYNCSFNAKINVSKGKGKITSAYNPWYQFYSPGLDVKKSKLSK TSSGSSASYVFDCKNKISNWNVTLKASVSGKKLTTSFK >UniRef50_C9RTB9(31-170:173) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Geobacillus sp. Y412MC61 RepID=C9RTB9_GEOSY E=1e-40 s/c=1.19 id=36% cov=92% --------VVKSQKIYNENGEYvGTLGIEPVLsagsnDNIMSALASYKVGTGNSTWKIYWYSGTVNYHFYVDINIgSTGLATITRAYNGWY-FITPPYTV KKDWISILRKTETYTLPAEARYHLTlnsiwggEWTIYLYARVKDQTLYT--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 F 3 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 N 6 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 G 7 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 N 8 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 I 9 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 9 0 * * * * * * 1539 0 0 A 10 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 10 0 * * * * * * 1539 0 0 Q 11 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1539 0 0 E 12 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1539 0 0 K 13 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1539 0 0 E 14 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1539 0 0 I 15 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1539 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 16 0 * * * * * * 1539 0 0 L 17 * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1539 0 0 E 18 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1539 0 0 D 19 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1539 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1539 0 0 T 21 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 21 0 * * * * * * 1539 0 0 E 22 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 22 1000 1000 * 0 * * * 1539 1000 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1539 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 24 0 * * * * * * 1539 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1539 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1539 0 0 V 27 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 27 0 * * * * * * 1539 0 0 X 28 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 P 29 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1539 0 0 I 30 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 30 0 * * * * * * 1539 0 0 I 31 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 31 1000 1000 * 2322 322 * * 1539 1000 0 D 32 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1539 0 0 E 33 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1539 0 0 R 34 * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * 34 0 * * * * * * 1539 0 0 P 35 * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1539 0 0 L 36 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 36 0 * * * * * * 1539 0 0 L 37 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1539 0 0 K 38 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1539 0 0 G 39 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1539 0 0 T 40 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 40 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 41 0 * * * * * * 1539 0 0 S 42 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 42 0 * * * * * * 1539 0 0 L 43 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 43 0 * * * * * * 1539 0 0 A 44 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1539 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 45 0 * * * * * * 1539 0 0 G 46 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1539 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 47 0 * * * * * * 1539 0 0 S 48 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 48 0 * * * * * * 1539 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 49 0 * * * * * * 1539 0 0 W 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 50 0 * * * * * * 1539 0 0 K 51 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1539 0 0 I 52 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 53 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 53 0 * * * * * * 1539 0 0 W 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 54 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 55 0 * * * * * * 1539 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 56 0 * * * * * * 1539 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1539 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 58 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 59 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 59 0 * * * * * * 1539 0 0 N 60 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1539 0 0 C 61 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 61 0 * * * * * * 1539 0 0 S 62 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * 62 0 * * * * * * 1539 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1539 0 0 N 64 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 64 0 * * * * * * 1539 0 0 A 65 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 65 0 * * * * * * 1539 0 0 K 66 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1539 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1539 0 0 N 68 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1539 0 0 V 69 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 69 1000 1000 * 0 * * * 1539 1000 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1539 0 0 K 71 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 71 0 * * * * * * 1539 0 0 G 72 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1539 0 0 K 73 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1539 0 0 G 74 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1539 0 0 K 75 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 75 0 * * * * * * 1539 0 0 I 76 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1539 0 0 T 77 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 77 0 * * * * * * 1539 0 0 S 78 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 78 0 * * * * * * 1539 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 80 0 * * * * * * 1539 0 0 N 81 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1539 0 0 P 82 * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1539 0 0 W 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 83 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 84 1000 * 1000 * * * * 1539 0 0 Q 85 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 85 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 F 86 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 87 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 87 0 * * * * * * 1539 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 88 0 * * * * * * 1539 0 0 P 89 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1539 0 0 G 90 * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1539 0 0 L 91 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 91 0 * * * * * * 1539 0 0 D 92 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 92 0 * * * * * * 1539 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 93 0 * * * * * * 1539 0 0 K 94 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1539 0 0 K 95 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1539 0 0 S 96 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 96 0 * * * * * * 1539 0 0 K 97 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * 97 0 * * * * * * 1539 0 0 L 98 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1539 0 0 S 99 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 99 0 * * * * * * 1539 0 0 K 100 * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1539 0 0 T 101 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 101 0 * * * * * * 1539 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 102 0 * * * * * * 1539 0 0 S 103 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 103 0 * * * * * * 1539 0 0 G 104 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 104 0 * * * * * * 1539 0 0 S 105 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 105 0 * * * * * * 1539 0 0 S 106 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 106 0 * * * * * * 1539 0 0 A 107 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 107 0 * * * * * * 1539 0 0 S 108 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 108 0 * * * * * * 1539 0 0 Y 109 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 109 0 * * * * * * 1539 0 0 V 110 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * 110 0 * * * * * * 1539 0 0 F 111 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1539 0 0 D 112 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1539 0 0 C 113 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1539 0 0 K 114 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 114 0 * * * * * * 1539 0 0 N 115 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 115 0 * * * * * * 1539 0 0 K 116 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1539 0 0 I 117 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1539 0 0 S 118 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 118 1000 1000 * 2807 222 * * 1539 1000 0 N 119 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1539 0 0 W 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 120 0 * * * * * * 1539 0 0 N 121 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 121 0 * * * * * * 1539 0 0 V 122 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 122 0 * * * * * * 1539 0 0 T 123 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 123 0 * * * * * * 1539 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1539 0 0 K 125 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 125 0 * * * * * * 1539 0 0 A 126 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1539 0 0 S 127 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 127 0 * * * * * * 1539 0 0 V 128 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 128 0 * * * * * * 1539 0 0 S 129 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 129 0 * * * * * * 1539 0 0 G 130 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1539 0 0 K 131 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 131 0 * * * * * * 1539 0 0 K 132 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 132 0 * * * * * * 1539 0 0 L 133 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1539 0 0 T 134 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 134 0 * * * * * * 1539 0 0 T 135 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 135 0 * * * * * * 1539 0 0 S 136 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 F 137 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 K 138 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 138 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //