HHsearch 1.5 NAME c4heoA_ FAM FILE c4heoA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4heoA_.a3m DATE Sat Oct 12 08:26:15 2013 LENG 56 match states, 56 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4386 1.3609 SEQ >ss_dssp CBCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCBHHHHHHHHHHHHHHHTTCC >sa_dssp EEBEEDCBDEBCDCADDDBEDEECCDEBCEDADEBECDEDBDDABDDADECCEEEE >ss_pred CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >ss_conf 97632577999999997621579899999974201268999999998888750779 >Consensus pxaddxsxdvixtlirthikdrelrselixylnxaexdeeiqeiantvndiidgni >c4heoA_ XVADDASKDVVRTXIRTHIKDRELRSELXDYLNRAETDEEVQEVANTVNDIIDGNI >UniRef50_Q9IK91(554-709:709) Phosphoprotein n=10 Tax=Henipavirus RepID=PHOSP_NIPAV E=9e-76 s/c=0.49 id=75% cov=102% PMADDSSRDVIKTLIRTHIKDRELRSELIGYLNKAENDEEIQEIANTVNDIIDGNI # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 V 2 * * * * * * * * * * 925 * * * * * * 1079 * * 2 0 * * * * * * 1131 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1131 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1131 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1131 0 0 A 6 1079 * * * * * * * * * * * * * * 925 * * * * 6 0 * * * * * * 1131 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 7 0 * * * * * * 1131 0 0 K 8 * * * * * * * * 1079 * * * * * 925 * * * * * 8 0 * * * * * * 1131 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1131 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1131 0 0 V 11 * * * * * * * 925 * * * * * * * * * 1079 * * 11 0 * * * * * * 1131 0 0 R 12 * * * * * * * * 925 * * * * * 1079 * * * * * 12 0 * * * * * * 1131 0 0 T 13 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 13 0 * * * * * * 1131 0 0 X 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 I 15 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1131 0 0 R 16 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 16 0 * * * * * * 1131 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 17 0 * * * * * * 1131 0 0 H 18 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1131 0 0 I 19 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1131 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1131 0 0 D 21 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1131 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * * 1131 0 0 E 23 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1131 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1131 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1131 0 0 S 26 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 26 0 * * * * * * 1131 0 0 E 27 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1131 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1131 0 0 X 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 D 30 * * 1079 * * 925 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1131 0 0 Y 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 31 0 * * * * * * 1131 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1131 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1131 0 0 R 34 * * * * * * * * 925 * * * * * 1079 * * * * * 34 0 * * * * * * 1131 0 0 A 35 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1131 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1131 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * 925 * * * * 1079 * * * 37 0 * * * * * * 1131 0 0 D 38 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1131 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1131 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1131 0 0 V 41 * * * * * * * 925 * * * * * * * * * 1079 * * 41 0 * * * * * * 1131 0 0 Q 42 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1131 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1131 0 0 V 44 * * * * * * * 925 * * * * * * * * * 1079 * * 44 0 * * * * * * 1131 0 0 A 45 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1131 0 0 N 46 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1131 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 47 0 * * * * * * 1131 0 0 V 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 48 0 * * * * * * 1131 0 0 N 49 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1131 0 0 D 50 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1131 0 0 I 51 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1131 0 0 I 52 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1131 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1131 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1131 0 0 N 55 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1131 0 0 I 56 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 56 0 * * 0 * * * 1131 0 0 //