HHsearch 1.5 NAME c4fz4A_ FAM FILE c4fz4A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4fz4A_.a3m DATE Thu Jan 10 01:17:07 2013 LENG 154 match states, 154 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.6 EVD 0.3872 -2.1860 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCCCSCGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCTTCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCSCH HHHHHHHHHTCCCSSSSTTSCCHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >sa_dssp ECEEDCEDACDBBDDBEECCDDAEECDDBDEDEDBDCBCDBBDDBDDDBDDCBDCADEBECECEEBEEBCCCADBADBBADBABBABCAACCCEECEECE DACECAEDCBCBDEEDBADECECEEADEBAEEDACDABDDADECBDDCEEEEEE >ss_pred CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9513458899999999999999972003776013345889889866569999999998200038999999998754689999999999999997389827 999999999875422730100117899998899998687999998777655129 >Consensus xxxaxxxexqxxvxElEkxlxeLxxxpxypdxxxYxxQkxlWxexxrixxxxxxxxkkxxxDxxxxkkxyxdlxxyxxxaxvExlxRqvxxYrkKYPxnx eIexxxxxxlKxxxxgxYxsqEgxxlxxYxxxxxxxxxnkIxxiVnxLexxxxx >c4fz4A_ EAMAKVEEVQKVVKELEKELGELDKVPSYGDAQDYSYQKALWEEFLRIGKDNMDYASKMKADDKFFHKVKGDLNDFKYQIKVENYIRQVAELRKKYPGDN TIEEEYNAHLKQDEGKSIASQEGATLRDYVDREASEAMGRIKQRVAELEILEHH >UniRef50_P27951(572-722:1164) IgA FC receptor n=71 Tax=Streptococcus agalactiae RepID=BAG_STRAG E=0.0005 s/c=0.30 id=24% cov=94% -----IKSAQQELEKLEKAIKELMEQPEIPSNPEYGIQKSIWESQKEPIQEAITSFKKIIGDSSskyytehYFNKYKSDFMNYQLHAQMEMLTRKVVQYM NKYPDNAEIKKIFESDMKRTKEDNYGSLENDALKGYFEKYFLTPFNKIKQIVDDLD----- >UniRef50_B9WU99(139-283:802) LPXTG-motif cell wall anchor domain protein n=1 Tax=Streptococcus suis 89/1591 RepID=B9WU99_STRSU E=5e-43 s/c=1.21 id=41% cov=94% ---APLPQFQDILKELERDLEELKVFRDY-TGSDYSFQKGLWTYLLEDGQKLMSYVQTLEKDSPKIKENYDKLLDFKNHIRMERLTRQVVPYLEKYSGNE FIRSEYREHLEQsEENGSYASQEGKVFEAYVDS-AEQAFDRIVNRVNELE----- >UniRef50_C2M2L2(240-386:386) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Capnocytophaga gingivalis ATCC 33624 RepID=C2M2L2_CAPGI E=2e-06 s/c=0.36 id=26% cov=91% ------EEYKRLIEErlvaYEKLMLKLENLEKYPlDIYRYRDQDALYQEGIRISRAVKQFYKENKDtvSDRDLKNTYENLHQYGVcYAEVEIMVRIAEQY RKKYPTHTEIENL----IKENFNGEYGNIDGPNLTDYLNRNMVATYNKIIDIVNTLQ----- >UniRef50_UPI000185D20E(57-198:199) hypothetical protein CAPSP0001_1616 n=1 Tax=Capnocytophaga sputigena ATCC 33612 RepID=UPI000185D20E E=0.0002 s/c=0.33 id=27% cov=89% --------VDQTVAEYNILLAAVDKLPQYPkDKYKYARQDYAWTEGKRISNELLQNYnnKKSNIDVALAKKTYEDLYQYGIvYAHIELMARQAEVYRKQY PTNTEIENL----IKATFDGLYTTQEGNEhFIKSTNEEIVANYNKIINIVNKL------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 M 3 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 A 4 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1497 0 0 K 5 * * * * * * * * 980 * * * 1020 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1497 0 0 V 6 * * * * * * * 1465 * 1665 * * * * * * * 1633 * * 6 0 * * * * * * 2071 0 0 E 7 * * * 1015 * * * * 1909 * * * 2065 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 2546 0 0 E 8 * * * 1015 * * * * * * * * * 2065 * 1909 * * * * 8 0 * * * * * * 2546 0 0 V 9 2152 * * * 2308 * * * * * * * * * * * * 1396 * 2371 9 0 * * * * * * 2755 0 0 Q 10 * * 2435 * * * * * 2371 * * * * 685 * * * * * * 10 0 * * * * * * 2755 0 0 K 11 * * 2308 * * * * * 2359 * * * * 1287 2371 * * * * * 11 0 * * * * * * 2755 0 0 V 12 * * * 2152 * * * 2308 * 2371 * * * * * * 2435 2359 * * 12 0 * * * * * * 2755 0 0 V 13 * * * * * * * 2371 * 1228 * * * * * * * 1396 * * 13 0 * * * * * * 2755 0 0 K 14 2435 * * 1258 * * * * 1333 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2755 0 0 E 15 * * * 368 * * * * 2152 * * * * * * * * * * * 15 310 2371 * 2000 415 * * 2755 1000 0 L 16 * * * * * * * * * 685 * * * * * * * * * 1403 16 0 * * * * * * 2755 0 0 E 17 * * * 295 * * * * * * * 2435 * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2755 0 0 K 18 * * * * * * * 2435 706 * * * * * 2308 * * * * * 18 0 * * * * * * 2755 0 0 E 19 2152 * 2308 2359 * * * * * 1403 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 2755 0 0 L 20 * * * * * * * 2152 * 782 2371 * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2755 0 0 G 21 2435 * * 2308 * 2359 * * 2152 2371 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2755 0 0 E 22 2435 * * 685 * * * * 2371 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2755 0 0 L 23 * * * * * * * * * 295 * * * * * * * 2435 * * 23 0 * * * * * * 2755 0 0 D 24 * * 1396 2371 * * * * 2308 * 2152 * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 2755 0 0 K 25 * * * 2152 * * * * 1396 * * 2371 * * * * * 2308 * * 25 0 * * * * * * 2755 0 0 V 26 * * * * 2308 * * * * 1403 * * * 2152 * * * 2359 * * 26 0 * * * * * * 2755 0 0 P 27 * * * 2371 * * * * * * * * 725 * 2308 * * * * * 27 0 * * * * * * 2755 0 0 S 28 * * 2308 2152 * * * * 2371 * * * * 2435 * 2359 * * * * 28 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 29 * * * * * * * 2152 * * * * * * * * * * * 368 29 325 * 2308 * * * * 2755 0 0 G 30 * * * * * 1894 * * * * * * 452 * * * * * * * 30 866 1148 * 0 * 0 * 2454 1443 1000 D 31 * * 803 * * * * * * * * * * * * 2152 2308 * * * 31 0 * * * * * * 2755 0 0 A 32 2359 * * * * 2308 * 2371 2435 * * 2152 * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2755 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * 2152 2359 * 2308 * * * 1403 33 0 * * * * * * 2755 0 0 D 34 * * 1333 2152 * * * * 2435 * * * * * 2371 * * * * * 34 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 2755 0 0 S 36 2435 * * * * 2152 * * * * * * * * 2371 1333 * * * * 36 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 37 * * 2371 * 2308 * * 2152 * * * * * * 2435 * * * * 2359 37 0 * * * * * * 2755 0 0 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 38 0 * * * * * * 2755 0 0 K 39 * * 1403 * * * * * 685 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2755 0 0 A 40 1365 * * * * 2308 * * * * * * * * * 2152 * * * 2435 40 0 * * * * * * 2755 0 0 L 41 2435 * * * * * * 2152 * 761 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2755 0 0 W 42 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 310 2371 42 0 * * * * * * 2755 0 0 E 43 * * * 1252 * * * * * * * * * 2371 * * 1370 * * * 43 0 * * * * * * 2755 0 0 E 44 * * * 803 * * * * * * * * * * * 2152 * * * 2308 44 0 * * * * * * 2755 0 0 F 45 * * * * 2359 1403 * * * 2308 * * * 2152 * * * * * * 45 0 * * * * * * 2755 0 0 L 46 * * * * * * * 2371 1287 1333 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2755 0 0 R 47 * * * 1228 * * * * * * * * * * 803 * * * * * 47 0 * * * * * * 2755 0 0 I 48 * * 2308 * * * * 803 * * * * 2152 * * * * * * * 48 0 * * * * * * 2755 0 0 G 49 * * * * * 1333 * 2152 * * * * * * * 1403 * * * * 49 0 * * * * * * 2755 0 0 K 50 * * * * * * * * 2359 * * 2435 * 1228 2371 * * * * * 50 0 * * * * * * 2755 0 0 D 51 2371 * 2359 1287 * * * * 2308 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2755 0 0 N 52 2152 * * * * * * * * 1370 * 2359 * * * * * 2371 * * 52 0 * * * * * * 2755 0 0 M 53 * * * * * * * 2152 2371 2435 1333 * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2755 0 0 D 54 * * 2359 * * * * * * * * * * 1403 * 2308 2152 * * * 54 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 55 * * * * 2371 * * * * * * 2435 * * * 2152 * * * 1333 55 0 * * * * * * 2755 0 0 A 56 2359 * * * 2152 * * * * * * * * * * * * 2308 * 1403 56 295 2435 * 1000 1000 * * 2755 1000 0 S 57 * * * * * * * * 729 * * * * 2308 * 2359 * * * * 57 0 * * * * * * 2755 0 0 K 58 * * * 2371 * * * * 725 * * * * * * * 2308 * * * 58 0 * * * * * * 2755 0 0 M 59 * * * * * * * 2152 * 2308 2359 2371 * * * 2435 * * * * 59 0 * * * * * * 2755 0 0 K 60 * * * 2308 * * * 2152 1365 * * 2435 * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 2755 0 0 A 61 2359 * 2371 * * 2152 * 2435 2308 * * * * * * * * * * * 61 310 2371 * 1000 1000 * * 2755 1000 0 D 62 * * 310 * * * * * * * * * * * * 2371 * * * * 62 0 * * * * * * 2755 0 0 D 63 * * 1365 * * * * * * * * * * * * 1228 * 2435 * * 63 0 * * * * * * 2755 0 0 K 64 2435 * * * * * * * 2359 * * * 2308 * 2371 2152 * * * * 64 368 2152 * 2807 222 * * 2755 1000 0 F 65 * * 2371 * 2359 * * * 2308 2435 * * * * * * * * * 2152 65 0 * * * * * * 2755 0 0 F 66 2435 * * * 1252 * * 2308 * 2371 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2755 0 0 H 67 * * * * * * 2359 * 786 * * 2152 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2755 0 0 K 68 * * * 2308 * * * * 725 * * 2371 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2755 0 0 V 69 * * * * * * * * * * * 2308 * * * * 1403 2359 * 2152 69 0 * * * * * * 2755 0 0 K 70 * * * * * * * * 1252 * * * * * * * * * * 786 70 0 * * * * * * 2755 0 0 G 71 * * 2308 1403 * 2359 * * * * * * * * * 2152 * * * * 71 0 * * * * * * 2755 0 0 D 72 * * 725 * * * * * 2308 * * 2371 * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2755 0 0 L 73 * * * * 2152 * * * * 368 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2755 0 0 N 74 * * * * * * 2371 * * 2308 2152 2359 * * * * * * * 2435 74 0 * * * * * * 2755 0 0 D 75 * * 1333 * * * * * * * * 2152 * 1403 * * * * * * 75 0 * * * * * * 2755 0 0 F 76 * * * * 1333 * * * * * * * * * * * * * * 729 76 0 * * * * * * 2755 0 0 K 77 * * * * * 1403 * * 1333 * * * * 2152 * * * * * * 77 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 78 * * * * * * * 2435 * 2152 * 2308 * * * * * 2371 * 2359 78 685 1403 * 0 * * * 2755 1443 0 Q 79 * * * * * * 1228 * * * * * * 2359 * * * * * 1403 79 0 * * * * * * 2755 0 0 I 80 729 * * * * * * 1333 * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 2755 0 0 K 81 * * * 2371 * * 2435 * 2359 * * * * 2152 2308 * * * * * 81 0 * * * * * * 2755 0 0 V 82 * * * * * * * 2435 * * 1228 * * * * * * 1365 * * 82 0 * * * * * * 2755 0 0 E 83 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2755 0 0 N 84 * * * * * * * 2371 * 2435 2152 2359 * * 2308 * * * * * 84 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 85 * * * * * * * * * 1228 1403 * * * * * * * * 2359 85 0 * * * * * * 2755 0 0 I 86 2435 * * * * * * 2359 * * * * * * * * 1228 2371 * * 86 0 * * * * * * 2755 0 0 R 87 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 87 0 * * * * * * 2755 0 0 Q 88 * * * * * * * 2371 2152 * * * * 782 * * * * * * 88 0 * * * * * * 2755 0 0 V 89 1403 * * * * * * * * * * * * * * * * 685 * * 89 0 * * * * * * 2755 0 0 A 90 2359 * * 1403 * * * * * * * * * * * * * 1228 * * 90 0 * * * * * * 2755 0 0 E 91 * * * 2359 * * * * * * * * 2308 1258 * * * 2435 * * 91 0 * * * * * * 2755 0 0 L 92 * * * * * * * * * 2359 * * * * * * * * * 313 92 0 * * * * * * 2755 0 0 R 93 * * * * * * * * * 2308 2152 * * * 803 * * * * * 93 0 * * * * * * 2755 0 0 K 94 * * * 2308 * * * * 803 * * 2152 * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2755 0 0 K 95 * * * * * * * * 295 * * * * 2435 * * * * * * 95 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 96 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 96 0 * * * * * * 2755 0 0 P 97 * * * * * * * * * * * * 325 * * 2308 * * * * 97 0 * * * * * * 2755 0 0 G 98 * * 2152 * * 1333 * * * * * * * * * * 1403 * * * 98 0 * * * * * * 2755 0 0 D 99 * * 2359 * * * 2371 * * * * 709 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2755 0 0 N 100 2152 * * 2308 * * * * * * * 2359 * * * * 1403 * * * 100 0 * * * * * * 2755 0 0 T 101 * * * 729 2308 * * * * * * * * * * * 2359 * * * 101 0 * * * * * * 2755 0 0 I 102 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2755 0 0 E 103 * * * 803 * * * * 2152 * * * * * 2308 * * * * * 103 0 * * * * * * 2755 0 0 E 104 * * * 2359 * * * * 2152 * * 1403 * * * 2308 * * * * 104 0 * * * * * * 2755 0 0 E 105 * * * 1333 * * * 2152 * 1403 * * * * * * * * * * 105 685 * 1403 * * * * 2755 0 0 Y 106 * * * * 1465 * * * * * * * * * * * * * * 649 106 0 * * * * * 0 2071 0 1443 N 107 * * * 1465 * * * * * * * 1633 * * 1665 * * * * * 107 0 * * * * * 0 2071 0 1443 A 108 1633 * * 1665 * * * * * * * * * * * 1465 * * * * 108 0 * * * * * 0 2071 0 1443 H 109 * * 1465 * * * 649 * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * 0 * 2071 0 1443 L 110 * * * * * * * 1403 * 1333 2152 * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2755 0 0 K 111 * * * 2308 * * * * 325 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 2755 0 0 Q 112 2435 * * 2371 * * * * * * * * * 1333 2152 * * * * * 112 325 2308 * 0 * * * 2755 1000 0 D 113 * * 2359 2308 * * * * * * * 2371 * * * * 1287 * * * 113 0 * * * * * * 2755 0 0 E 114 * * * 1333 1403 * * * 2152 * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2755 0 0 G 115 * * 2435 2152 * 2359 * * * * * 1340 * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2755 0 0 K 116 * * 2152 * * 786 * * 2359 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 2755 0 0 S 117 * * * 2371 * * * * * 2435 * 2152 * * * 1333 * * * * 117 0 * * * * * * 2755 0 0 I 118 * * * * * * * 2359 * * * * * * * * * * * 313 118 0 * * * * * * 2755 0 0 A 119 1333 * * * * 1258 * * * * * * * * * * 2435 * * * 119 0 * * * * * * 2755 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * 2371 * * * 685 2435 * * * 120 0 * * * * * * 2755 0 0 Q 121 * * * * * * * 2371 * 2152 * * * 782 * * * * * * 121 0 * * * * * * 2755 0 0 E 122 * * 2371 310 * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2755 0 0 G 123 * * * * * 368 * * * * * 2152 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2755 0 0 A 124 2359 * 2152 * * * * * 2308 * * 2435 2371 * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2755 0 0 T 125 2152 * * 2435 * * * * * * * 2371 * * * * 2359 2308 * * 125 295 2435 * 0 * * * 2755 1000 0 L 126 * * * * 1370 * * * * 706 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 2755 0 0 R 127 * * * 2308 * * * 2435 2152 * * * * * 2359 * 2371 * * * 127 0 * * * * * * 2755 0 0 D 128 2308 * 1365 * * 2152 * * 2435 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 2755 0 0 Y 129 * * * * * * * * * * * * * * * 2435 * * * 295 129 0 * * * * * * 2755 0 0 V 130 * * * * 2152 * * * * 2371 * * * * * * 2435 1333 * * 130 0 * * * * * * 2755 0 0 D 131 * * 1333 2152 * * * * * * * 1403 * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 2755 0 0 R 132 * * * 2435 * * * * 2152 * * * * * 1365 2308 * * * * 132 325 * 2308 * * * * 2755 0 0 E 133 * * * 1024 * * * * * * * 2129 * * * * * * * 1838 133 0 * * * * 0 * 2454 0 1000 A 134 1333 * * * 2152 * * 2435 * * 2371 * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 2755 0 0 S 135 * * * 2308 * * * * * 2152 * * * * * 2359 * 1403 * * 135 0 * * * * * * 2755 0 0 E 136 1403 * * 2359 * * * * * * * * * 2308 * * 2152 * * * 136 0 * * * * * * 2755 0 0 A 137 1333 * * * * * * * * * * 2435 2152 * * * 2371 * * * 137 0 * * * * * * 2755 0 0 M 138 * * * * 1228 * * * * * 2359 * * * * * * * * 1403 138 0 * * * * * * 2755 0 0 G 139 * * 2308 * * 2359 * * * * * 729 * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 2755 0 0 R 140 * * * * * * * * 729 * * * * * 1333 * * * * * 140 0 * * * * * * 2755 0 0 I 141 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2755 0 0 K 142 * * * * * * * 1403 1252 * * * * * * * * 2308 * * 142 0 * * * * * * 2755 0 0 Q 143 * * 2371 * * * * * * * * 1370 * 1252 * * * * * * 143 0 * * * * * * 2755 0 0 R 144 * * * * * * * 729 * * * * * * 1333 * * * * * 144 0 * * * * * * 2755 0 0 V 145 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 145 0 * * * * * * 2755 0 0 A 146 2359 * 2152 * * * * * * * * 786 * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 2755 0 0 E 147 * * 2152 1333 * * * * 2435 * * * * * * * 2371 * * * 147 0 * * * * * * 2755 0 0 L 148 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 2755 0 0 E 149 * * 1909 1090 * * * * * * * * * 1921 * * * * * * 149 0 * * * * * * 2546 0 0 I 150 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1000 0 0 L 151 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 E 152 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 H 153 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 H 154 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //