HHsearch 1.5 NAME c4fc3E_ FAM FILE c4fc3E_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c4fc3E_.a3m DATE Sat Jun 8 09:10:59 2013 LENG 144 match states, 144 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3983 -1.2527 SEQ >ss_dssp CCCCCTTTCHHHHTTCTTTBTCCCCCSSEEEECEEEECTTSSBCHHHHHTBCSSEEEEEETTEEEEEEEESSTTTEEEEEEEETTEECCCEEEEEETTTT EEEEEEECCTTCCEEEEEEEEEETTTEEEEEEEEEEEESSCCCC >sa_dssp EEDDDBBEBACCBBECEEBDDDECECEEEDEBDBEACBEEEEDBECADDBBCDDACBBCCEECBCABABACDADCACDACACBEEEDBEBCCCBBCDEDC CACACADBDEDBEEADACAAADDEDEDDDDCEDACADBEEDADE >ss_pred CCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCC EEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCC >ss_conf 9777420688987408211133257887541004765277967788754026830489945785589731356404457743088432279985166556 16999870588336688753231788433443257775222569 >Consensus xxYPxadesLxdAIKnPAixdKeHxxxxxxxidFqmxxkxxexQfYHyxSxxxPAxVxfTkxkxeiELxlxtastWkKFEVYExdkKLPvxLVSYdxvkD xAYIRFpVSnGTxevKIVSStxxxxxxeexYDYTxmvFAqPIyN >c4fc3E_ QQYPPADESLQDAIKNPAIIDKEHTADNWRPIDFQMKNDKGERQFYHYASTVEPATVIFTKTGPIIELGLKTASTWKKFEVYEGDKKLPVELVSYDSDKD YAYIRFPVSNGTREVKIVSSIEYGENIHEDYDYTLMVFAQPITN >UniRef50_Q931P4(81-225:891) Iron-regulated surface determinant protein H n=70 Tax=Staphylococcus aureus RepID=ISDH_STAAM E=1e-54 s/c=1.47 id=53% cov=101% KNYPAADESLKDAIKDPALENKEHDIGPREQVNFQLLDKNNETQYYHFFSIKDPADVYYTKKKAEVELDINTASTWKKFEVYENNQKLPVRLVSYSPVpE DHAYIRFPVSDGTQELKIVSSTQIDDGEETNYDYTKLVFAKPIYN >UniRef50_Q6GHV7(126-369:652) Iron-regulated surface determinant protein B n=53 Tax=Staphylococcus aureus RepID=ISDB_STAAR E=5e-89 s/c=0.61 id=65% cov=100% NTYPILNQELREAIKNPAIKDKDHSAPNSRPIDFEMKKKDGTQQFYHYASSVKPARVIFTDSKPEIELGLQSGQFWRKFEVYEGDKKLPIKLVSYDTVKD YAYIRFSVSNGTKAVKIVSSTHFN-NKEEKYDYTLMEFAQPIYN # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * 1472 * * 1610 * 1681 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1577 0 0 Q 2 * * * * * * * * * * * 1472 * 1681 * * 1610 * * * 2 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1577 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1577 0 0 P 5 1472 * * * * * * 1610 * * * * 1681 * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1577 0 0 A 6 572 * * * * * * * * 1610 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1577 0 0 D 7 * * 572 * * * * * * * * 1610 * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1577 0 0 E 8 * * * 572 * * * * * * * * * 1610 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1577 0 0 S 9 * * * 1610 * * * * * * * * * * * 572 * * * * 9 0 * * * * * * 1577 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1577 0 0 Q 11 * * * * * * * * 1472 * * * * 1681 1610 * * * * * 11 0 * * * * * * 1577 0 0 D 12 * * 572 1610 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1577 0 0 A 13 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1577 0 0 I 14 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1577 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1577 0 0 N 16 * * 1472 * * * * * * * * 645 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1577 0 0 P 17 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1577 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1577 0 0 I 19 * * * * * * * 645 * 1472 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1577 0 0 I 20 * * * 1472 * * * 1681 1610 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1577 0 0 D 21 * * 645 * * * * * * * * 1472 * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1577 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1577 0 0 E 23 * * 1610 572 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1577 0 0 H 24 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1577 0 0 T 25 * * 1472 * * * * * * * * * * * * 1610 1681 * * * 25 0 * * * * * * 1577 0 0 A 26 645 * * * * * * 1472 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1577 0 0 D 27 * * 1681 * * 1472 * * * * * * 1610 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1577 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 645 1472 * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1577 0 0 W 29 * * * * * * * * * * * * * * 1472 1610 * * 1681 * 29 0 * * * * * * 1577 0 0 R 30 * * * 1472 * * * * * * * * * * 645 * * * * * 30 0 * * * * * * 1577 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 645 1472 * * * * * * 31 0 * * * * * * 1577 0 0 I 32 * * * * * * * 645 * * * * * * * * * 1472 * * 32 0 * * * * * * 1577 0 0 D 33 * * 645 * * * * * * * * 1472 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1577 0 0 F 34 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1577 0 0 Q 35 * * * 1610 * * * * * * * * * 572 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1577 0 0 M 36 * * * * * * * * * 1472 645 * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1577 0 0 K 37 * * * * * * * * 645 1472 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1577 0 0 N 38 * * 1472 * * * * * 1610 * * 1681 * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1577 0 0 D 39 * * 1681 * * * * * 539 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1577 0 0 K 40 * * 1610 * * * * * 1681 * * 1472 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1577 0 0 G 41 * * * * * 645 * * * * * 1472 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1577 0 0 E 42 * * * 572 * * * * * * * * * * * * 1610 * * * 42 0 * * * * * * 1577 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * 1610 1681 * 1472 * * * 43 0 * * * * * * 1577 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1577 0 0 F 45 * * * * 645 * * * * * * * * * * * * * * 1472 45 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 46 0 * * * * * * 1577 0 0 H 47 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 48 * * * * 1472 * * * * * * * * * * * * * * 645 48 0 * * * * * * 1577 0 0 A 49 645 * * * 1472 * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1577 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 50 0 * * * * * * 1577 0 0 T 51 * * * * * * * 1472 * * * * * * * 1610 1681 * * * 51 0 * * * * * * 1577 0 0 V 52 * * * * * * * * 1472 * * * * * * * * 645 * * 52 0 * * * * * * 1577 0 0 E 53 * * 1472 1681 * * * * 1610 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1577 0 0 P 54 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1577 0 0 A 55 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1577 0 0 T 56 * * 1472 * * * * * * * * * * * 1610 * 1681 * * * 56 0 * * * * * * 1577 0 0 V 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 57 0 * * * * * * 1577 0 0 I 58 * * * * * * * 645 * * * * * * * * * * * 1472 58 0 * * * * * * 1577 0 0 F 59 * * * * 645 * * * * * * * * * * * * * * 1472 59 0 * * * * * * 1577 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 60 0 * * * * * * 1577 0 0 K 61 * * 1610 * * * * * 572 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1577 0 0 T 62 * * * * * * * * 1472 * * * * * * 1610 1681 * * * 62 0 * * * * * * 1577 0 0 G 63 * * * * * 1681 * * 539 * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1577 0 0 P 64 1472 * * * * * * * * * * * 645 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1577 0 0 I 65 * * * 539 * * * 1681 * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1577 0 0 I 66 * * * * * * * 645 * * * * * * * * * 1472 * * 66 0 * * * * * * 1577 0 0 E 67 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1577 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1577 0 0 G 69 * * 1472 * * 645 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1577 0 0 L 70 * * * * * * * 1472 * 645 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1577 0 0 K 71 * * * * * * * * 1681 * * 1472 * 1610 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1577 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * 1610 572 * * * 72 0 * * * * * * 1577 0 0 A 73 572 * * * * 1610 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1577 0 0 S 74 * * * * * * * * * * * * * 1610 * 572 * * * * 74 0 * * * * * * 1577 0 0 T 75 * * * * 1610 * * * * * * * * * * * 572 * * * 75 0 * * * * * * 1577 0 0 W 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 76 0 * * * * * * 1577 0 0 K 77 * * * * * * * * 572 * * * * * 1610 * * * * * 77 0 * * * * * * 1577 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1577 0 0 F 79 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1577 0 0 E 80 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1577 0 0 V 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 81 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * * * * * 1577 0 0 E 83 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1577 0 0 G 84 * * * * * 645 * * * * * 1472 * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1577 0 0 D 85 * * 645 * * * * * * * * 1472 * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1577 0 0 K 86 * * * * * * * * 645 * * * * 1472 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1577 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1577 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1577 0 0 P 89 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1577 0 0 V 90 * * * * * * * 1610 * * * * * * * * * 572 * * 90 0 * * * * * * 1577 0 0 E 91 * * * 1681 * * * * 1610 * * * * * 1472 * * * * * 91 0 * * * * * * 1577 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1577 0 0 V 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 93 0 * * * * * * 1577 0 0 S 94 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 94 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 95 0 * * * * * * 1577 0 0 D 96 * * 645 * * * * * * * * * * * * 1472 * * * * 96 0 * * * * * * 1577 0 0 S 97 * * * * * * * * * * * * 1472 * * 1681 1610 * * * 97 0 * * * * * * 1577 0 0 D 98 * * 1681 * * * * * * * * * * * * * * 539 * * 98 645 1472 * 0 * * * 1577 1000 0 K 99 * * * 1472 * * * * 645 * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1577 0 0 D 100 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 101 * * * * * * 1472 * * * * * * * * * * * * 645 101 0 * * * * * * 1577 0 0 A 102 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1577 0 0 I 104 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1577 0 0 R 105 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 105 0 * * * * * * 1577 0 0 F 106 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1577 0 0 P 107 * * * * * * * * * * * * 572 * * 1610 * * * * 107 0 * * * * * * 1577 0 0 V 108 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 108 0 * * * * * * 1577 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1577 0 0 N 110 * * 1472 * * * * * * * * 645 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1577 0 0 G 111 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1577 0 0 T 112 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 112 0 * * * * * * 1577 0 0 R 113 * * * * * * * * 1610 * * * * 1472 1681 * * * * * 113 0 * * * * * * 1577 0 0 E 114 1610 * * 572 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1577 0 0 V 115 * * * * * * * * * 1472 * * * * * * * 645 * * 115 0 * * * * * * 1577 0 0 K 116 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1577 0 0 I 117 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1577 0 0 V 118 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 118 0 * * * * * * 1577 0 0 S 119 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 119 0 * * * * * * 1577 0 0 S 120 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 120 0 * * * * * * 1577 0 0 I 121 * * * * * * * 1681 * * * * * * * * 539 * * * 121 0 * * * * * * 1577 0 0 E 122 * * * 1681 * * 1610 * * * * * * 1472 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 123 * * * * 1610 * * 1472 * * * * * * * * * * * 1681 123 0 * * * * * * 1577 0 0 G 124 * * 1472 * * 1681 * * * * * 1610 * * * * * * * * 124 572 * 1610 * * * * 1577 0 0 E 125 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * 0 * 1381 0 1000 N 126 * * * * * 1472 * * * * * 645 * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1577 0 0 I 127 * * * 1472 * * * 1681 1610 * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1577 0 0 H 128 * * * 539 * * 1681 * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1577 0 0 E 129 * * * 645 * * * * * * * * * * * * 1472 * * * 129 0 * * * * * * 1577 0 0 D 130 * * 1681 * * * * * 1610 * * 1472 * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 131 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 131 0 * * * * * * 1577 0 0 D 132 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1577 0 0 Y 133 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 133 0 * * * * * * 1577 0 0 T 134 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 134 0 * * * * * * 1577 0 0 L 135 * * * * * * * * 1472 645 * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1577 0 0 M 136 * * * * * * * * * 1472 645 * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1577 0 0 V 137 * * * 1610 * * * * * * * * * * * * * 572 * * 137 0 * * * * * * 1577 0 0 F 138 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1577 0 0 A 139 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1577 0 0 Q 140 * * * * * * * * 1472 * * * * 645 * * * * * * 140 0 * * * * * * 1577 0 0 P 141 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1577 0 0 I 142 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1577 0 0 T 143 * * * * * * * * * * * * * * * * 1681 * * 539 143 0 * * * * * * 1577 0 0 N 144 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 144 0 * * 0 * * * 1577 0 0 //