HHsearch 1.5 NAME c3zc4G_ FAM FILE c3zc4G_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3zc4G_.a3m DATE Sat Feb 23 08:17:20 2013 LENG 155 match states, 155 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4211 0.1045 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHTTCGGGTHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEECCCCEEEEEEESEEECGGGSCTTHHHHSTTTEE EBTTSSCEEECCEEEETTEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCTHHHHHHHHHHHSCC >sa_dssp DEDEDADEDADBBBBAABAABACDDDEBADCACECEDCEDACDBADDACECBDDCDEEDDEDCABBEEEEDCCBEACABCCBDDEDBCEECCEDBDDABB DBDEDECBAAAAACCEEEEBDCBDBDEDBCDCACEDADECCDBACCAAEDADCEC >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH HHCCCCCCEEECEEECCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCC >ss_conf 9146887889999999999999987512120121008789999999999999976414564059984378542227778985058665000233124445 1006454011012224772147537777999999987503217777655521589 >Consensus piaxxixkxfxxlikxxrfyvvlrrfgyidpliysidpkxikdvlsealrexxsyxssssxrtixiyxxxxixxxxxclviakxxeipqxfxxxyxxxix xixxxsexcisplvxxxkxxxlitpxxsvixxfxdkldxxixyarxlxslavgge >c3zc4G_ PVAETISKRFWTLIKXLRFYVVLRRFGYIDPLIYSIDPKQIKDVLSEALREFVSYTSSSSSRSIVIYDDNPVTAQAPCLVVAKRDEIPQNFPSIYRYTIY KIDKSSEYCISPLVVNDKYATLITPNESVIKEFFDKLDSNIQYARVLASLAVGGE >UniRef50_Q977B5(4-159:159) Putative uncharacterized protein ST0028 n=1 Tax=Sulfolobus tokodaii RepID=Q977B5_SULTO E=1e-31 s/c=0.88 id=46% cov=98% -IASEVGKNFRSLVKIFRFYVVLRRFGYIDPLIYSLDPKYIKDVITQALRDYTSYLASASKRTVALkYKEEQIEDSIDCLVIAKKGDIPQTFKVAYPDVV HEIVDGSDkgmLCISPIVwSKNKKPYIVTPRR--VESFLDKVEKDVNYAKTLVSLAIGG- >UniRef50_C3MWJ9(6-162:162) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Sulfolobus RepID=C3MWJ9_SULIM E=7e-60 s/c=1.47 id=89% cov=101% PIAETISKRFWALIKMLRFYVVLRRFGYIDPLIYSIDPKQIKDVLSEALREFVSYTSSSSTKTIVINDNpkNPLTTQAPCLVITKTDEIPQNFPNIYRYT IYKIDKSSEYCISPLVINDKYATLITPNESVIKEFFDKLDSNIQYARILASLAVGGE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1069 0 0 V 2 * * * * * * * 510 * * * * * * * * * 1747 * * 2 0 * * * * * * 1480 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1480 0 0 E 4 * * * 739 * * * * * * * * * * * 1319 * * * * 4 0 * * * * * * 1480 0 0 T 5 * * * 1319 * * * * * * * * * * * * 739 * * * 5 0 * * * * * * 1480 0 0 I 6 * * * * * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * 6 0 * * * * * * 1480 0 0 S 7 * * * * * 1319 * * * * * * * * * 739 * * * * 7 0 * * * * * * 1480 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1480 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * 1319 * * 739 * * * * * 9 0 * * * * * * 1480 0 0 F 10 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1480 0 0 W 11 * * * * * * * * * * * * * * 1319 * * * 739 * 11 0 * * * * * * 1480 0 0 T 12 1731 * * * * * * * * * * * * * * 1319 1747 * * * 12 0 * * * * * * 1480 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1480 0 0 I 14 * * * * * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * 14 0 * * * * * * 1480 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1480 0 0 X 16 * * * * * * * 1019 * * 981 * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1443 0 0 L 17 * * * * 1319 * * * * 739 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1480 0 0 R 18 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 18 0 * * * * * * 1480 0 0 F 19 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1480 0 0 V 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 21 0 * * * * * * 1480 0 0 V 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 22 0 * * * * * * 1480 0 0 L 23 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1480 0 0 R 24 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 24 0 * * * * * * 1480 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 1480 0 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1480 0 0 G 27 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1480 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1480 0 0 D 30 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1480 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1480 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1480 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 34 0 * * * * * * 1480 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1480 0 0 I 36 * * * * * * * 739 * 1319 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1480 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1480 0 0 P 38 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1480 0 0 K 39 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1480 0 0 Q 40 * * * * * * * * * * * * * 739 * * * * * 1319 40 0 * * * * * * 1480 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1480 0 0 K 42 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1480 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1480 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 1480 0 0 L 45 * * * * * * * 1319 * 739 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1480 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 739 1319 * * * 46 0 * * * * * * 1480 0 0 E 47 * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1480 0 0 A 48 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1480 0 0 L 49 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1480 0 0 R 50 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 50 0 * * * * * * 1480 0 0 E 51 * * 1319 739 * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1480 0 0 F 52 * * * * 739 * * * * * * * * * * * * * * 1319 52 0 * * * * * * 1480 0 0 V 53 * * * * * * * * * * * * * * * * 1319 739 * * 53 0 * * * * * * 1480 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 55 0 * * * * * * 1480 0 0 T 56 * * * * * * * * * 1319 * * * * * * 739 * * * 56 0 * * * * * * 1480 0 0 S 57 1319 * * * * * * * * * * * * * * 739 * * * * 57 0 * * * * * * 1480 0 0 S 58 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 58 0 * * * * * * 1480 0 0 S 59 1319 * * * * * * * * * * * * * * 739 * * * * 59 0 * * * * * * 1480 0 0 S 60 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 60 0 * * * * * * 1480 0 0 S 61 * * * * * * * * 1319 * * * * * * 1747 1731 * * * 61 0 * * * * * * 1480 0 0 R 62 * * * * * * * * 1731 * * * * * 517 * * * * * 62 0 * * * * * * 1480 0 0 S 63 * * * * * * * * * * * * * * * 1747 510 * * * 63 0 * * * * * * 1480 0 0 I 64 * * * * * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * 64 0 * * * * * * 1480 0 0 V 65 1319 * * * * * * * * * * * * * * * * 739 * * 65 0 * * * * * * 1480 0 0 I 66 * * * * * * * 739 * 1319 * * * * * * * * * * 66 739 1319 * 0 * * * 1480 1000 0 Y 67 * * * * * * * * * * * 1731 * * * * * * * 517 67 0 * * * * * * 1480 0 0 D 68 * * 739 * * * * * 1319 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1480 0 0 D 69 * * 1747 1319 * * * * * * * 1731 * * * * * * * * 69 517 1731 * 1000 1000 * * 1480 1000 0 N 70 * * * 1319 * * * * * * * 739 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1480 0 0 P 71 * * * * * * * * * * * * 739 1319 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1480 0 0 V 72 * * * * * * * 1319 * 1731 * * * * * * * 1747 * * 72 0 * * * * * * 1480 0 0 T 73 * * * 1319 * * * * * * * * * * * * 739 * * * 73 0 * * * * * * 1480 0 0 A 74 1747 * 1319 * * * * * * * * * * * * * 1731 * * * 74 0 * * * * * * 1480 0 0 Q 75 * * * * * * * * * * * * * 739 * 1319 * * * * 75 0 * * * * * * 1480 0 0 A 76 739 * * * * * * 1319 * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1480 0 0 P 77 * * 1319 * * * * * * * * * 739 * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1480 0 0 C 78 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1480 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1480 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1480 0 0 V 81 * * * * * * * 510 * * * * * * * * * 1747 * * 81 0 * * * * * * 1480 0 0 A 82 517 * * * * * * * * * * * * * * * 1731 * * * 82 0 * * * * * * 1480 0 0 K 83 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1480 0 0 R 84 * * * * * * * * 1319 * * * * * 1747 * 1731 * * * 84 0 * * * * * * 1480 0 0 D 85 * * 739 * * 1319 * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1480 0 0 E 86 * * 1319 739 * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1480 0 0 I 87 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1480 0 0 P 88 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1480 0 0 Q 89 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1480 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 739 * * * * 1319 * * * 90 0 * * * * * * 1480 0 0 F 91 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1480 0 0 P 92 * * * * * * * * 1319 * * * 739 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1480 0 0 S 93 * * * * * * * * * * * 1731 * * * 1747 * 1319 * * 93 0 * * * * * * 1480 0 0 I 94 1319 * * * * * * 739 * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 95 0 * * * * * * 1480 0 0 R 96 * * * * * * * * * * * * 1319 * 739 * * * * * 96 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 97 * * 1319 * * * * * * * * * * * * * * * * 739 97 0 * * * * * * 1480 0 0 T 98 * * * * * * * * * * * * * * * * 739 1319 * * 98 0 * * * * * * 1480 0 0 I 99 * * * * * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * 99 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 100 * * * * * * 1319 * * * * * * * * * * * * 739 100 0 * * * * * * 1480 0 0 K 101 * * * 1319 * * * * 739 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1480 0 0 I 102 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1480 0 0 D 103 * * 739 * * * * * * * * * * * * * * 1319 * * 103 0 * * * * * * 1480 0 0 K 104 * * 1319 * * * * * 739 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1480 0 0 S 105 * * * * * 1319 * * * * * * * * * 739 * * * * 105 0 * * * * * * 1480 0 0 S 106 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 106 0 * * * * * * 1480 0 0 E 107 * * 1319 739 * * * * * * * * * * * * * * * * 107 739 1319 * 1585 585 * * 1480 1000 0 Y 108 * * * * * * * * * 1319 * * * * * * * * * 739 108 0 * * * * * * 1480 0 0 C 109 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1480 0 0 I 110 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1480 0 0 S 111 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 111 0 * * * * * * 1480 0 0 P 112 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1480 0 0 L 113 * * * * * * * 1319 * 739 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1480 0 0 V 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 114 739 1319 * 0 * * * 1480 1000 0 V 115 * * * * * * * 1731 * * * * * * * 1319 * 1747 * * 115 0 * * * * * * 1480 0 0 N 116 * * * * * * * * 1319 * * 739 * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1480 0 0 D 117 * * 739 * * * * * * * * 1319 * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1480 0 0 K 118 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 119 * * * * * * * * 1319 * * * * * * * * * * 739 119 0 * * * * * * 1480 0 0 A 120 739 * * * * * * * * * * * 1319 * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1480 0 0 T 121 * * * * * * * * * * * * * * * * 739 * * 1319 121 0 * * * * * * 1480 0 0 L 122 * * * * * * * 1319 * 739 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1480 0 0 I 123 * * * * * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * 123 0 * * * * * * 1480 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 124 0 * * * * * * 1480 0 0 P 125 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1480 0 0 N 126 * * * * * * * * * * * 739 * * 1319 * * * * * 126 0 * * * * * * 1480 0 0 E 127 * * * 739 * * * * * * * * * * 1319 * * * * * 127 739 * 1319 * * * * 1480 0 0 S 128 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 128 0 * * * * * 0 1069 0 1000 V 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 129 0 * * * * 0 * 1069 0 1000 I 130 * * * * * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * 130 0 * * * * * * 1480 0 0 K 131 * * * 1319 * * * * 739 * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1480 0 0 E 132 * * * 739 * * * * * * * * * * * 1319 * * * * 132 0 * * * * * * 1480 0 0 F 133 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1480 0 0 F 134 * * * * 739 * * * * 1319 * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1480 0 0 D 135 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1480 0 0 K 136 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1480 0 0 L 137 * * * * * * * * * 739 * * * * * * * 1319 * * 137 0 * * * * * * 1480 0 0 D 138 * * 739 1319 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1480 0 0 S 139 * * * * * * * * 1319 * * * * * * 739 * * * * 139 0 * * * * * * 1480 0 0 N 140 * * 1319 * * * * * * * * 739 * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1480 0 0 I 141 * * * * * * * 739 * * * * * * * * * 1319 * * 141 0 * * * * * * 1480 0 0 Q 142 * * * * * * * * * * * 1319 * 739 * * * * * * 142 0 * * * * * * 1480 0 0 Y 143 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 143 0 * * * * * * 1480 0 0 A 144 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1480 0 0 R 145 * * * * * * * * 1319 * * * * * 739 * * * * * 145 0 * * * * * * 1480 0 0 V 146 * * * * * * * 1731 * * * * * * * * 1319 1747 * * 146 0 * * * * * * 1480 0 0 L 147 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1480 0 0 A 148 739 * * * * * * * * * * * * * * * * 1319 * * 148 0 * * * * * * 1480 0 0 S 149 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 149 0 * * * * * * 1480 0 0 L 150 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1480 0 0 A 151 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1480 0 0 V 152 * * * * * * * 1319 * * * * * * * * * 739 * * 152 0 * * * * * * 1480 0 0 G 153 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1480 0 0 G 154 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1480 0 0 E 155 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * 0 * * * 1069 0 0 //