HHsearch 1.5 NAME c3wmvA_ FAM FILE c3wmvA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3wmvA_.a3m DATE Sat Dec 6 08:18:58 2014 LENG 150 match states, 150 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.9 EVD 0.4247 -0.3266 SEQ >ss_dssp CCCBEEEETTTCCEEEETTCCSSCCTTEEEEEESCCSGGGCEEEEEEETTEEEEEETTTCCEEEETTCCSSCCTTCBEEEESCCCGGGCEEEETTTTEEE ETTSCEEEETTCCSSCCTTEEEEEESCCSGGGCEEEEETTEEEEECCTTC >sa_dssp ECDAAABADDCDCBBBADEBDDEBEDDCCAAACDDDCDCACACACDDEEDCACACACDCCBABBADEBEEEBEDDCDAAACDDDCEDABABACDEEBBAC ADDDCCBBAEECDEEAEDDCCABACDDEDDBACABBACCEDDEEDCDACE >ss_pred CCEEEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCCC CCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEC >ss_conf 9428888413664640365322443583688728863168886303678763123305330243237743787786278763157501122331133310 02541673268888897652899960776517899966788760589979 >Consensus xxxxxIrHkxsGKCLHpkgGxxxPaxgtxLvxxxxxxxRxxFxfxxvxxxnGxlkHxxSgmCVhxxgGxxxppndxxlvxxxdrhxxxrxaxdxfndnxx hkxGxcvHPxGGSxnPxegTxxVxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx >c3wmvA_ MATFLIKHKASGKFLHPKGGSSNPANDTNLVLHSDIHERMYFQFDVVDERWGYIKHAASGKIVHPLGGKADPPNETKLVLHQDRHDRALFAMDFFNDNII HKAGKYVHPKGGSTNPPNETLTVMHGDKHGAMEFIFVSPKNKDKRVLVYV >UniRef50_A7RL30(1308-1420:4465) Predicted protein n=5 Tax=Eumetazoa RepID=A7RL30_NEMVE E=7e-06 s/c=0.46 id=39% cov=39% -----IQQILSGKCLHINGGAfKRPASGTQLVYYDGCgQKRLEFEFSA-----GLWKHTPFGMCVSRRGG------------------------------ ---------------------------------------------------- >UniRef50_B3PKL9(555-682:696) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Cellvibrio japonicus Ueda107 RepID=B3PKL9_CELJU E=1e-37 s/c=1.23 id=45% cov=77% ---YIIRHKTGGYCLHPRGGQANPAVGTPLIFHphcNPFEERLLFTL----LPNGSLKHVSSGMCVHPEGGTAS--SGRRLVLwnscsdgvSQDNAGNKR LAFG-FNDNgsFSHKsSGLCVHPSGGSANPAEGTELVL-------------------------- >UniRef50_A7SSA0(220-305:805) Predicted protein n=1 Tax=Nematostella vectensis RepID=A7SSA0_NEMVE E=1e-23 s/c=1.28 id=29% cov=49% -----IRHKITGKCVGPKEEIAETNKGVVLIDRCDDSTRF------KGLDNGFLQHMSSEMCVHFQSMDLSPPNDVPLVFYPD----------------- -------------------------------------------------- >UniRef50_C3ZH13(442-556:834) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Branchiostoma floridae RepID=C3ZH13_BRAFL E=6e-05 s/c=0.42 id=30% cov=72% ----VIRH-SGGKCLHIKSypGEEQPINKLVLKD-CGNRQRQLF----VHWPNGSLMHAVSAKCLvldtkgEIQEGTEITLGDCDETSLHVRHTPSRTLQ DM-------STGMCLHPYGGSSTPDEGTHVVI-------------------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 F 4 * * * * 919 * * * * * * * * * * * * * * 1086 4 0 * * * * * * 1425 0 0 L 5 * * * * * * * 1665 * 1453 * * * * * * * 1646 * * 5 0 * * * * * * 1820 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2378 0 0 K 7 * * * * * * * * 2190 * * * * 2246 811 * * * * * 7 0 * * * * * * 2378 0 0 H 8 * * * * * * 341 * * * * * * 2246 * * * * * * 8 304 * 2397 * * * * 2378 0 0 K 9 * * * * * * * 1992 418 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * 0 * 2157 0 1000 A 10 2190 * * * * * * 2243 * 2246 * * * * * 2397 2564 * * * 10 0 * * * * * * 2378 0 0 S 11 * * * * * 1478 * * * * * * * * * 1218 2243 * * * 11 0 * * * * * * 2378 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 2378 0 0 K 13 * * * * * * * * 267 * * * * * * * * * * 2564 13 0 * * * * * * 2378 0 0 F 14 * 357 * * 2190 * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2378 0 0 L 15 * * * * * * * * * 342 * * * * * * * 2243 * * 15 0 * * * * * * 2378 0 0 H 16 * * * * * 2243 342 * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2378 0 0 P 17 * * * * * * * 1320 * * * * 738 * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2378 0 0 K 18 * * * * * * * * 689 * * 2246 * * 2564 * * * * * 18 0 * * * * * * 2378 0 0 G 19 * * * 2243 * 739 * * * * * * * * * 2397 * * * * 19 304 2397 * 1000 1000 * * 2378 1000 0 G 20 * * * 2243 * 342 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 2378 0 0 S 21 2246 * * 2397 * * * 2243 * * * * * 2564 * 2190 * * * * 21 341 2246 * 0 * * * 2378 1000 0 S 22 1395 * * 2397 * * * * 2246 * * * * * * 2190 * * * * 22 0 * * * * * * 2378 0 0 N 23 * * * 2243 * * * * * * * 1365 * 2397 2246 * * * * * 23 0 * * * * * * 2378 0 0 P 24 * * * * * * * * * * * * 342 * * * 2243 * * * 24 0 * * * * * * 2378 0 0 A 25 739 * * * * * * 2397 * * * 2243 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 2378 0 0 N 26 * * * * * * * * 2243 * * 1290 * * * 2246 * 2564 * * 26 0 * * * * * * 2378 0 0 D 27 * * 2190 * * 759 * * 2397 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2378 0 0 T 28 * * * * * * * * * 2397 * * * * * * 739 2243 * * 28 0 * * * * * * 2378 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 2190 2564 2246 * * * 1318 * * 29 0 * * * * * * 2378 0 0 L 30 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2378 0 0 V 31 * * * * * * * 1395 2397 * * * * * * * * 1218 * * 31 0 * * * * * * 2378 0 0 L 32 * * 1318 * 2564 * * * * 2190 * * * * * * * * * 2246 32 304 * 2397 * * * * 2378 0 0 H 33 * * * * * * 1050 * * * * * * * 1911 * * * * 1992 33 345 2231 * 1585 585 0 * 2157 1000 1000 S 34 * 1318 2246 * * * * * * * * 2564 * * * 2190 * * * * 34 0 * * * * * * 2378 0 0 D 35 * * 1216 * * 1320 * * * * * * 2564 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2378 0 0 I 36 * 2246 2243 * 2564 * * 2190 * * * 2397 * * * * * * * * 36 341 2246 * 0 * * * 2378 1000 0 H 37 * * * 2564 * * 2190 * * * * * * 2246 2397 2243 * * * * 37 0 * * * * * * 2378 0 0 E 38 * * * 1365 * * * * 2246 * * * * 2397 * * 2243 * * * 38 0 * * * * * * 2378 0 0 R 39 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 39 0 * * * * * * 2378 0 0 M 40 * * * * 2243 * * * * 1396 2190 * * 2397 * * * * * * 40 342 * 2243 * * * * 2378 0 0 Y 41 * * * 1992 * * * * * 1062 * * * * * * * * * 1890 41 0 * * * * * 0 2069 0 1000 F 42 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 42 425 * 1970 * * * 0 2069 0 1000 Q 43 * * * 1626 * * * * * * * * * 1459 * * 1680 * * * 43 0 * * * * * 0 1763 0 1597 F 44 * * * * 540 * * * * 1680 * * * * * * * * * * 44 540 * 1680 * * * 0 1763 0 1597 D 45 * * 890 * * * * * * * * * * * * 1119 * * * * 45 0 * * * * * 0 1467 0 1888 V 46 1119 * * * * * * * * * * * * * * * * 890 * * 46 890 * 1119 * * 585 1585 1467 0 1888 V 47 * * * * * * * * 1690 * * * * * * * * 535 * * 47 0 * * * * * 0 1991 0 1438 D 48 * * 1407 * * 1690 1676 * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * 977 1024 1991 0 1438 E 49 * * * 1821 * * * * * 1115 * * * * * * * * 1969 * 49 0 * * * * * 0 2156 0 1000 R 50 * * 2019 * * * * * * * * * 1089 * 1821 * * * * * 50 0 * * * * * 0 2156 0 1000 W 51 * * * * * * * * * * * 480 * * * * * * 1821 * 51 0 * * * * 0 * 2156 0 1000 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2378 0 0 Y 53 * * * * 2243 * * * * 2246 * * * * * 1478 * * * 2190 53 0 * * * * * * 2378 0 0 I 54 * * * * * * * 2190 * 811 * * * * * * * * 2246 * 54 0 * * * * * * 2378 0 0 K 55 * * * * * * * * 739 * 2397 * * 2243 * * * * * * 55 0 * * * * * * 2378 0 0 H 56 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2378 0 0 A 57 1290 * * * * * * * * * 2243 * * * * * 2246 2564 * * 57 0 * * * * * * 2378 0 0 A 58 2190 * * * * * * * * * * * 2246 * * 1395 * 2397 * * 58 0 * * * * * * 2378 0 0 S 59 * * * * 2246 * * * * * * * * * * 341 * * * * 59 0 * * * * * * 2378 0 0 G 60 2397 * * 2243 * 739 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 2378 0 0 K 61 * * * * * * * * 1290 * 759 * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2378 0 0 I 62 * 357 * * * * * 2190 * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2378 0 0 V 63 * * * * * * * * * 2397 * * * * * * * 304 * * 63 304 2397 * 2585 263 * * 2378 1000 0 H 64 * * * 2397 * * 738 * * * * * * * * 2246 * * * * 64 0 * * * * * * 2378 0 0 P 65 * * * * 2243 * * 2397 * * * * 1365 * 2246 * * * * * 65 0 * * * * * * 2378 0 0 L 66 * * * 2564 * * * * * 2190 * * * 1318 2246 * * * * * 66 0 * * * * * * 2378 0 0 G 67 * * * 2397 * 739 * * * * * * * * * 2243 * * * * 67 0 * * * * * * 2378 0 0 G 68 * * * * * 342 * * * * 2243 * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2378 0 0 K 69 * * 2019 * * * * * 1821 * * * * * * * 1089 * * * 69 0 * * * * * * 2156 0 0 A 70 1006 * * 1969 * * * * * 2019 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 2156 0 0 D 71 * * 1821 * * * * 1969 * * * * * * * 1115 * * * * 71 349 * 2219 * * * * 2156 0 0 P 72 * * * * * * * * * * * * 542 * * * 1676 * * * 72 0 * * * * * 0 1991 0 1000 P 73 * * * * * * * * * 1676 * * 542 * * * * * * * 73 0 * * * * 0 * 1991 0 1000 N 74 * * * * * 1969 * * * * * 916 * * * 2219 * * * * 74 0 * * * * * * 2156 0 0 E 75 * * 994 1821 * 2219 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2156 0 0 T 76 * 1969 * * * * * * * * * * * * 2219 * 1821 2019 * * 76 0 * * * * * * 2156 0 0 K 77 * * 1969 * * * * * 1821 * * * 2019 * 2219 * * * * * 77 0 * * * * * * 2156 0 0 L 78 * * * 1969 * * * * * 425 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2156 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * 1969 425 * * 79 0 * * * * * * 2156 0 0 L 80 * * * * 2019 * * * * 1006 * * * * * 1969 * * * * 80 349 2219 * 3000 193 * * 2156 1000 0 H 81 * * * * * * 1821 * * 1969 * * * * * 2219 * * * 2019 81 0 * * * * * * 2156 0 0 Q 82 * * * * * * 1969 * * * * * 2019 1006 * * * * * * 82 0 * * * * * * 2156 0 0 D 83 * * 425 * * * * * * * * * * * * * * 1969 * * 83 0 * * * * * * 2156 0 0 R 84 * * * * * * * * * * * 1665 * * 546 * * * * * 84 0 * * * * * * 1820 0 0 H 85 1665 * * * * * 546 * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1820 0 0 D 86 * * 1453 * * 1665 * * * * * * * * * * 1646 * * * 86 0 * * * * * * 1820 0 0 R 87 * * * * * * * * * * * 1665 1646 * 1453 * * * * * 87 0 * * * * * * 1820 0 0 A 88 1453 * * * * * * * 1665 * * * * * * 1646 * * * * 88 0 * * * * * * 1820 0 0 L 89 * * * * * * * * * 1453 * * * * 656 * * * * * 89 0 * * * * * * 1820 0 0 F 90 * * * * 1453 * * * * 1665 * * * * * * 1646 * * * 90 0 * * * * * * 1820 0 0 A 91 555 * * * * * * * * 1646 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1820 0 0 M 92 * * * * 1665 * * * * * 1453 * * 1646 * * * * * * 92 0 * * * * * * 1820 0 0 D 93 * * 546 * * 1665 * * * * * * * * * * * * * * 93 546 * 1665 * * * * 1820 0 0 F 94 * * * * 852 * * * * * 1165 * * * * * * * * * 94 852 * 1165 * * 0 * 1537 0 1000 F 95 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * 0 1425 0 1000 N 96 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 96 0 * * * * * 0 1425 0 1000 D 97 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * 0 1425 0 1000 N 98 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 98 919 1086 * 1000 1000 * 0 1425 1000 1000 I 99 * * * * 1086 * * 919 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * 0 1425 0 1000 I 100 * * * * * * * 919 * * * * * * * 1086 * * * * 100 0 * * * * * 0 1425 0 1000 H 101 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * 0 * 1425 0 1000 K 102 * * * * * * * * 555 * * * * * * 1646 * * * * 102 546 1665 * 0 * * * 1820 1000 0 A 103 1453 * * * * * * * * * * * * * * 1665 1646 * * * 103 0 * * * * * * 1820 0 0 G 104 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1820 0 0 K 105 * * * * * * * * 1453 1665 1646 * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1820 0 0 Y 106 * 656 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1453 106 0 * * * * * * 1820 0 0 V 107 * * * * * * * * * 1646 * * * * * * * 555 * * 107 0 * * * * * * 1820 0 0 H 108 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1820 0 0 P 109 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1820 0 0 K 110 * * * * * * * * 1453 * * * * * * 1665 * * * 1646 110 0 * * * * * * 1820 0 0 G 111 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1820 0 0 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1820 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1820 0 0 T 114 1665 * * * * * * * * * * * * * * 1646 1453 * * * 114 0 * * * * * * 1820 0 0 N 115 * * * * * * * * * * * 555 * * * * 1646 * * * 115 0 * * * * * * 1820 0 0 P 116 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1820 0 0 P 117 1665 * 1646 * * * * * * * * * 1453 * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1820 0 0 N 118 * * * 656 * * * * * * * 1453 * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1820 0 0 E 119 * * * 1453 * 656 * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1820 0 0 T 120 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 120 0 * * * * * * 1820 0 0 L 121 * * * 1665 * * 1646 * * 1453 * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1820 0 0 T 122 * * * * * * * * * 1665 * * * * * * 1453 1646 * * 122 0 * * * * * * 1820 0 0 V 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 123 0 * * * * * * 1820 0 0 M 124 * * * * * * * 1646 * 1665 1453 * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1820 0 0 H 125 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 G 126 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 D 127 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 H 129 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 G 130 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 A 131 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 M 132 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 E 133 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 F 134 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 I 135 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 F 136 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 V 137 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 S 138 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 P 139 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 K 140 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 N 141 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 K 142 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 D 143 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 K 144 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 R 145 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 V 146 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 L 147 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 V 148 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 149 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 149 0 * * * * * * 1000 0 0 V 150 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 150 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //