HHsearch 1.5 NAME c3nohA_ FAM FILE c3nohA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3nohA_.a3m DATE Sat Aug 28 20:27:59 2010 LENG 123 match states, 123 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4159 0.3428 SEQ >ss_dssp CCCCCSEEEEEECTTSGGGCCHHHHHHHHHHHTTSCSCCCCSSCCEEEEEEETTCHHHHHHHHHHHHHHHHTTCEEEEEEECHHHHHHHHHHTCCSEEEE ETTSSCHHHHHTSEEEEEEGGGC >sa_dssp EDECEDDAAAAACCECEDADDEEBBDCABCBBDEEDEDBDDEEDBDABABABDEBEAACDBAEDACEDADECEBEBDCDDCCBEDADECBEDDEBCAAAA DDECBCEEBBEECCDCEBDCEEC >ss_pred CCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHEECCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHCCEEEEEEE CCCEEEHHHHCCCCEEEECCCCC >ss_conf 9753430688527123767657899999998619501100168605899993388417889999999997438823732048630001120770468994 12114044511163554312569 >Consensus saxLeGxYlxxiNpxldxxxxxdxRxxLkaxxtgxtdxxrxxgxxxxxlxvxetdyxLxxYAxxLcxRLxxAGxxVxlkxySxtMlrSravxGkYdxfla xxxxixxtxlxxxDxlxlxaxEx >c3nohA_ SAQLEGSYIFCXNPLLDKLSDEDIREQLKAFVTGKTDSIRTDTELSFDIYVSETDYALIRYADSLCERLNDAGADVQIKQYSGTXLRSRAVSGKYEAFLS ESDLVSTDALENADYIILDSAEX >UniRef50_C7HAA3(46-167:175) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Faecalibacterium prausnitzii A2-165 RepID=C7HAA3_9FIRM E=4e-46 s/c=1.52 id=47% cov=100% AAPLEGNYLFCINPALEPFSDADFRNDLKAFVSGETEVLSDAGLPHMTLSVCETDYPLLCYATALCERLTAAGADVTLKQYSETMLRSRAINGRYQLLLV SENTLDATALPDADILLLSAEE- >UniRef50_B0G2M2(46-170:172) Putative uncharacterized protein n=5 Tax=Clostridiales RepID=B0G2M2_9FIRM E=2e-39 s/c=1.30 id=49% cov=98% SAQLEGSYVLGINMMSDGLDNENTRNKLKELAlddseTNETDLMKTD--ISFRLYVSETDYPLVSYAKKLCDRLKQAGFSVDLKEYSNTMMLSRVVNGKY DVFLASDDFIDVTTLSQMDYMIMDSEE- >UniRef50_D1Y8N6(46-161:166) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Pyramidobacter piscolens W5455 RepID=D1Y8N6_9BACT E=0.0004 s/c=0.39 id=30% cov=95% --ELDGLYLLAVNPRLDP--RGELRRELHAAALGRQ--ARFHGSRELKLAYADDEKALGVYARRLARRLALAGLNVKLSPCSPVMLRSKALAGKYDLFVA PRRVILMSDIERLDALTLKARE- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 1524 * * * * * * * * * * * * * * 616 * * * * 1 0 * * * * * * 1718 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1718 0 0 Q 3 * * * 1819 * * * * * * * * 2032 1082 * * * * * * 3 0 * * * * * * 2154 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2154 0 0 E 5 * * 1819 481 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 2154 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2154 0 0 S 7 * * * * * * * * * 1819 * 2032 * * * 1082 * * * * 7 0 * * * * * * 2154 0 0 Y 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 8 0 * * * * * * 2154 0 0 I 9 * * * * * * * 2143 * 922 * * * * * * * 2024 * * 9 0 * * * * * * 2154 0 0 F 10 * * * * 1087 * * * * 918 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2154 0 0 C 11 1819 1087 * * * 2024 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2154 0 0 X 12 * * * * * * * 608 * * * * * * * * * 1541 * * 12 0 * * * * * * 1974 0 0 N 13 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 2154 0 0 P 14 * * * * * * * * * * 2024 * 407 * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2154 0 0 L 15 2032 * * * * * * * * 2143 2024 * * * 1819 * * * * * 15 0 * * * * * * 2154 0 0 L 16 * * * * * * * * * 407 * * * * * 2024 * * * * 16 0 * * * * * * 2154 0 0 D 17 * * 404 2032 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 2154 0 0 K 18 * * * * * 2024 * * 2143 * * * 922 * * * * * * * 18 481 * 1819 * * * * 2154 0 0 L 19 * * * * 1524 * * * * 616 * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * 0 1718 0 1000 S 20 * * 1567 * * * * * * * * * * * * 594 * * * * 20 0 * * * * 0 * 1718 0 1000 D 21 * * 1087 * * * * * * * * 2024 * * 1819 * * * * * 21 0 * * * * * * 2154 0 0 E 22 2032 * * 1082 * 1819 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2154 0 0 D 23 * * 1087 1819 * * * * * * * 2024 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 2154 0 0 I 24 * * * * 2032 * * 2143 * 1819 * * * * * * 2024 * * * 24 0 * * * * * * 2154 0 0 R 25 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 25 0 * * * * * * 2154 0 0 E 26 * * * 2143 * * * * * * * 1028 * * 1819 * * * * * 26 0 * * * * * * 2154 0 0 Q 27 * * 2032 1819 * * * * 2024 * * * * 2143 * * * * * * 27 0 * * * * * * 2154 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2154 0 0 K 29 * * * * * * 1819 * 481 * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 2154 0 0 A 30 407 * * 2024 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2154 0 0 F 31 1819 * * * 1087 * * * * 2024 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2154 0 0 V 32 918 * * * * * * * * * * * * * * * * 1087 * * 32 407 2024 * 2322 322 * * 2154 1000 0 T 33 * * * * * * * * * 1819 * * * * * 2032 1082 * * * 33 0 * * * * * * 2154 0 0 G 34 * * * * * 407 * * * * * 2024 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2154 0 0 K 35 * * * 1028 * * * * 2143 * * * * * 1819 * * * * * 35 0 * * * * * * 2154 0 0 T 36 * * * * * * * * * * * * * 1819 * * 481 * * * 36 481 * 1819 * * * * 2154 0 0 D 37 * * 616 1524 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * 0 1718 0 1000 S 38 * * * * * * * * * 1567 * * * * * 1667 * 1524 * * 38 0 * * * * 0 * 1718 0 1000 I 39 1819 * * * * * * 2143 * 2032 2024 * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2154 0 0 R 40 * * * * * * * * 2024 * * * * * 972 2032 * * * * 40 0 * * * * * * 2154 0 0 T 41 * * 2032 * 1819 * * * * * * * * * * * 1082 * * * 41 0 * * * * * * 2154 0 0 D 42 2032 * 1082 * * * 1819 * * * * * * * * * * * * * 42 407 * 2024 * * * * 2154 0 0 T 43 * * * * * 560 * * * * * * * * * * 1637 * * * 43 0 * * * * * 0 1906 0 1000 E 44 * * * 1637 * * * * * 1618 * * * * * 1503 * * * * 44 0 * * * * 0 * 1906 0 1000 L 45 * * * * * * * 2024 * 2143 * * 2032 * 1819 * * * * * 45 0 * * * * * * 2154 0 0 S 46 * * * 1819 * * 2032 * * * * * * * * 1082 * * * * 46 0 * * * * * * 2154 0 0 F 47 * * * * 1082 * * * * 1819 2032 * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 2154 0 0 D 48 * * 2143 * * * * * 1819 * * * * * 2024 * 2032 * * * 48 0 * * * * * * 2154 0 0 I 49 * * * * * * * 2143 * 370 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2154 0 0 Y 50 1819 * * * * * * * * * * * * * * 2032 * * * 1082 50 0 * * * * * * 2154 0 0 V 51 * * * * * * * * * * * * * * * * * 481 * 1819 51 0 * * * * * * 2154 0 0 S 52 1819 2032 * * * * * * * * * * * * * 1082 * * * * 52 0 * * * * * * 2154 0 0 E 53 * * 1819 481 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2154 0 0 T 54 * * 1819 * * * * * * * * * * * * * 481 * * * 54 0 * * * * * * 2154 0 0 D 55 * * 481 1819 * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2154 0 0 Y 56 * * * * * * * * 1819 * * * * * * * * * * 481 56 0 * * * * * * 2154 0 0 A 57 972 * * * * * * * * * * * 1028 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2154 0 0 L 58 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2154 0 0 I 59 * * * * * 1819 * 2143 * 2032 * * * * * * * 2024 * * 59 0 * * * * * * 2154 0 0 R 60 * 2032 * * * * * * * * * * * * 2143 2024 * 1819 * * 60 0 * * * * * * 2154 0 0 Y 61 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 61 0 * * * * * * 2154 0 0 A 62 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2154 0 0 D 63 * * 2143 * * * * * 2024 * * * * * 1819 * 2032 * * * 63 0 * * * * * * 2154 0 0 S 64 2032 * * * * * * * 2024 * * * * * 1819 2143 * * * * 64 0 * * * * * * 2154 0 0 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2154 0 0 C 66 1819 481 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2154 0 0 E 67 * * 2024 1087 * * * * * * * * * * 1819 * * * * * 67 0 * * * * * * 2154 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 68 0 * * * * * * 2154 0 0 L 69 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2154 0 0 N 70 1819 * * * * * * * 2024 * * 2143 * * * * 2032 * * * 70 0 * * * * * * 2154 0 0 D 71 2032 * 2143 * * * * * * 1819 * * * 2024 * * * * * * 71 0 * * * * * * 2154 0 0 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2154 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2154 0 0 A 74 1087 * * * 2024 * * * * 1819 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2154 0 0 D 75 * * 1087 * * * * * * * * 1819 * * * 2024 * * * * 75 0 * * * * * * 2154 0 0 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * * * * * 2154 0 0 Q 77 * * 2024 * * * * * 1819 * * * * 2143 * * 2032 * * * 77 0 * * * * * * 2154 0 0 I 78 * * * * * * * 2143 * 370 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2154 0 0 K 79 * * * * * * * * 481 * * * * * * 1819 * * * * 79 0 * * * * * * 2154 0 0 Q 80 * * * 2024 * * * * * * * * 1819 1087 * * * * * * 80 0 * * * * * * 2154 0 0 Y 81 * 1819 * * * * * * * * * * * * * * * * * 481 81 0 * * * * * * 2154 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 82 0 * * * * * * 2154 0 0 G 83 * * * 2032 * 2143 * * * * * 2024 1819 * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2154 0 0 T 84 * * * * * * * * * * * * * * * * 481 1819 * * 84 0 * * * * * * 2154 0 0 X 85 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1974 0 0 L 86 * * * * * * * * * 407 2024 * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 2154 0 0 R 87 * * * * * * * * * 2024 * * * * 407 * * * * * 87 0 * * * * * * 2154 0 0 S 88 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 88 0 * * * * * * 2154 0 0 R 89 * * * * * * * * 1819 * * * * * 481 * * * * * 89 0 * * * * * * 2154 0 0 A 90 407 * * * * * * * * * * * * * * * * 2024 * * 90 0 * * * * * * 2154 0 0 V 91 * * * * * * * 2032 * 1819 * * * * * * * 1082 * * 91 0 * * * * * * 2154 0 0 S 92 1819 * * * * * * * * * * 1028 * * * 2143 * * * * 92 0 * * * * * * 2154 0 0 G 93 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2154 0 0 K 94 * * * * * * * * 404 * * * * * 2032 * * * * * 94 0 * * * * * * 2154 0 0 Y 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 95 0 * * * * * * 2154 0 0 E 96 * * 918 2143 * * * * * * * * * 2032 * * * * * * 96 0 * * * * * * 2154 0 0 A 97 2143 * * * * * * * * 922 * * * * * * * 2024 * * 97 0 * * * * * * 2154 0 0 F 98 * * * * 404 * * * * 2032 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2154 0 0 L 99 * * * * * * * * * 481 * * * * * * * 1819 * * 99 0 * * * * * * 2154 0 0 S 100 918 * * * * * * * * * * * * * * 2143 * 2032 * * 100 0 * * * * * * 2154 0 0 E 101 * * * 2143 * * * * * * * * 1819 * * 1028 * * * * 101 0 * * * * * * 2154 0 0 S 102 * * 2024 2032 * * * * * * * * * * 1819 2143 * * * * 102 0 * * * * * * 2154 0 0 D 103 * * 1082 * * * * * * * * 2032 * * 1819 * * * * * 103 0 * * * * * * 2154 0 0 L 104 * * * * 2024 * * * * 2143 * * * * * * 2032 1819 * * 104 0 * * * * * * 2154 0 0 V 105 * * * * * * * 918 * 2032 * * * * * * * 2143 * * 105 0 * * * * * * 2154 0 0 S 106 * * 1028 * * * * * * 1819 * * * * * 2143 * * * * 106 0 * * * * * * 2154 0 0 T 107 2032 * * * * * * * * * 1819 * * * * * 2143 2024 * * 107 0 * * * * * * 2154 0 0 D 108 * * 2143 * * * * * * * * * * * * 1819 1028 * * * 108 0 * * * * * * 2154 0 0 A 109 1087 * 1819 * * * * * * * * * * * * * 2024 * * * 109 0 * * * * * * 2154 0 0 L 110 * * * * * * * 1819 * 481 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 2154 0 0 E 111 * * * 972 * * * * * * * * 2032 * * 2024 * * * * 111 0 * * * * * * 2154 0 0 N 112 * * 2032 * * * * * * * * 2143 * 2024 1819 * * * * * 112 0 * * * * * * 2154 0 0 A 113 1087 * * * * * * * * 1819 2024 * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 2154 0 0 D 114 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2154 0 0 Y 115 1819 * * * * * * 2032 * * * * * * * * * * * 1082 115 0 * * * * * * 2154 0 0 I 116 * * * * * * * 2143 * 922 2024 * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 2154 0 0 I 117 * * * * * * * 1082 * 2032 * * * * * * 1819 * * * 117 0 * * * * * * 2154 0 0 L 118 * * * * * * * * * 407 2024 * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 2154 0 0 D 119 * * 1082 * * * * * 1819 * * * * * * 2032 * * * * 119 0 * * * * * * 2154 0 0 S 120 922 * * * * * * * * * * * * * * 1082 * * * * 120 0 * * * * * * 2154 0 0 A 121 2143 * * 1028 * * * * * * * * * * 1819 * * * * * 121 0 * * * * * * 2154 0 0 E 122 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2154 0 0 X 123 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 123 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //