HHsearch 1.5 NAME c3nngA_ FAM FILE c3nngA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3nngA_.a3m DATE Sun Aug 29 01:51:09 2010 LENG 153 match states, 153 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4119 -0.4586 SEQ >ss_dssp CCCTTEEECCCTTCEEEESCCGGGCHHHHCGGGGGSSCTTSCEEEECHHHHSCCEEEEEEEEEEEEEEEEECCCSSSCGGGBCCEEEEEEEETTCSSCEE CSSCEECCCCCTTCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEESSSEEEESCEEEEEECC >sa_dssp EDDEDBCDBECEDBECDCBDCCEECEEEBABDBACDEDCECBAAACADEDDEDBBAAACADDCBDABAAAABCACCDEEEDBADBACACACCEEDEEDDD CEEDBEBEEBEEDDCCCBDAEECCDEACCACACADDCDDCAAAABACABCDEE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEE CCCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEECC >ss_conf 9887655223321014763455246431141668503211026875420255133100258862564335542100257510013378985127720020 25337740424898524686157567302356764301244213321200049 >Consensus tkpxxwxxxdrsxwxvsxsxxyxxdxaxxgxxlaidgxixttwftwgvxxagecwwxtxlxxpxxltgfsxtxqsxxgsxynxrxaxikvxkegxtewvt xxxxxxfxxfkgxdpqyaxxxpxixnvkefrixxxtpxxxtgfaexxlyxkql >c3nngA_ TKPGNWSAVDRSAWSVSCSNVYADDDAKYGAHLAIDGEINTTWFTWGVANAGECWWNTVLDRPVTLTGFSVTKQSAYGSGYNLRSAEIKVRKEGETEWVT YPRVLTFRNFKGADPQYAAIEPPIPNVKEFRINCLTPDNYTGFAEINLYEKQL >UniRef50_A6KY09(184-331:331) Exo-alpha sialidase n=1 Tax=Bacteroides vulgatus ATCC 8482 RepID=A6KY09_BACV8 E=2e-45 s/c=1.23 id=54% cov=97% -KPAAWKPLDRTDWDVSFSYAYGYDEAQFGGRLAVDGDVSTTWFTWGVVSAGECWWATTLPAPTHLTGFSLTRQTTFGSSYNVREAKVKVKKEGDTEW-T EAGLFRFGSFKGNDPQYAVFIPAVENVKEFRIDIVSPADFTGFAELDLYQ--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * T 1 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1366 0 0 P 3 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1366 0 0 G 4 1010 * * * * 990 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1366 0 0 N 5 1010 * * * * * * * * * * 990 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1366 0 0 W 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 6 0 * * * * * * 1366 0 0 S 7 * * * * * * * * 1010 * * * * * * 990 * * * * 7 0 * * * * * * 1366 0 0 A 8 990 * * * * * * * * * * * 1010 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1366 0 0 V 9 * * * * * * * * * 1010 * * * * * * * 990 * * 9 0 * * * * * * 1366 0 0 D 10 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1366 0 0 R 11 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 11 0 * * * * * * 1366 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 990 1010 * * * 12 0 * * * * * * 1366 0 0 A 13 990 * 1010 * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1366 0 0 W 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 14 0 * * * * * * 1366 0 0 S 15 * * 1010 * * * * * * * * * * * * 990 * * * * 15 0 * * * * * * 1366 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 16 0 * * * * * * 1366 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1366 0 0 C 18 * 990 * * 1010 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1366 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1366 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 990 * * * * * * * 1010 20 0 * * * * * * 1366 0 0 V 21 1010 * * * * * * * * * * * * * * * * 990 * * 21 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 22 0 * * * * * * 1366 0 0 A 23 990 * * * * 1010 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1366 0 0 D 24 * * 990 * * * * * * * * * * * * * * * * 1010 24 0 * * * * * * 1366 0 0 D 25 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1366 0 0 D 26 * * 990 1010 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1366 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1366 0 0 K 28 * * * * * * * * 990 * * * * 1010 * * * * * * 28 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 29 * * * * 1010 * * * * * * * * * * * * * * 990 29 0 * * * * * * 1366 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1366 0 0 A 31 990 * * * * 1010 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1366 0 0 H 32 * * * * * * 990 * * * * * * * 1010 * * * * * 32 0 * * * * * * 1366 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1366 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1366 0 0 I 35 * * * * * * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * 35 0 * * * * * * 1366 0 0 D 36 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1366 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1366 0 0 E 38 * * 1010 990 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1366 0 0 I 39 * * * * * * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * 39 0 * * * * * * 1366 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 990 * * * 1010 * * * * 40 0 * * * * * * 1366 0 0 T 41 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 41 0 * * * * * * 1366 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 42 0 * * * * * * 1366 0 0 W 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 43 0 * * * * * * 1366 0 0 F 44 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1366 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 45 0 * * * * * * 1366 0 0 W 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 46 0 * * * * * * 1366 0 0 G 47 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1366 0 0 V 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 48 0 * * * * * * 1366 0 0 A 49 990 * * * * * * * * * * * * * * * * 1010 * * 49 0 * * * * * * 1366 0 0 N 50 * * * * * * * * * * * 990 * * * 1010 * * * * 50 0 * * * * * * 1366 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1366 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1366 0 0 E 53 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1366 0 0 C 54 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1366 0 0 W 55 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 55 0 * * * * * * 1366 0 0 W 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 56 0 * * * * * * 1366 0 0 N 57 1010 * * * * * * * * * * 990 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1366 0 0 T 58 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 58 0 * * * * * * 1366 0 0 V 59 * * * * * * * * * * * * * * * * 1010 990 * * 59 0 * * * * * * 1366 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1366 0 0 D 61 * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1366 0 0 R 62 1010 * * * * * * * * * * * * * 990 * * * * * 62 0 * * * * * * 1366 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1366 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * * 1010 990 * * 64 0 * * * * * * 1366 0 0 T 65 * * * * * * 1010 * * * * * * * * * 990 * * * 65 0 * * * * * * 1366 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1366 0 0 T 67 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 67 0 * * * * * * 1366 0 0 G 68 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1366 0 0 F 69 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1366 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 70 0 * * * * * * 1366 0 0 V 71 * * * * * * * * * 1010 * * * * * * * 990 * * 71 0 * * * * * * 1366 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 1366 0 0 K 73 * * * * * * * * 990 * * * * * 1010 * * * * * 73 0 * * * * * * 1366 0 0 Q 74 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 74 0 * * * * * * 1366 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * * * 990 1010 * * * 75 0 * * * * * * 1366 0 0 A 76 990 * * * * * * * * * * * * * * * 1010 * * * 76 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 77 * * * * 1010 * * * * * * * * * * * * * * 990 77 0 * * * * * * 1366 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1366 0 0 S 79 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 79 0 * * * * * * 1366 0 0 G 80 * * * * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * * * 80 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 1366 0 0 N 82 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1366 0 0 L 83 * * * * * * * * * 990 * * * * * * * 1010 * * 83 0 * * * * * * 1366 0 0 R 84 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 84 0 * * * * * * 1366 0 0 S 85 * * * 1010 * * * * * * * * * * * 990 * * * * 85 0 * * * * * * 1366 0 0 A 86 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1366 0 0 E 87 * * * 990 * * * * 1010 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1366 0 0 I 88 * * * * * * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * 88 0 * * * * * * 1366 0 0 K 89 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1366 0 0 V 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 90 0 * * * * * * 1366 0 0 R 91 * * * * * * * * 1010 * * * * * 990 * * * * * 91 0 * * * * * * 1366 0 0 K 92 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1366 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1366 0 0 G 94 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1366 0 0 E 95 * * 1010 990 * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1366 0 0 T 96 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 96 0 * * * * * * 1366 0 0 E 97 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1366 0 0 W 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 98 990 * 1010 * * * * 1366 0 0 V 99 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 99 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 T 100 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 100 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 101 * * * 1010 * * * * * * * * * * * * * * * 990 101 0 * * * * * * 1366 0 0 P 102 1010 * * * * * * * * * * * 990 * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1366 0 0 R 103 * * * * * 1010 * * * * * * * * 990 * * * * * 103 0 * * * * * * 1366 0 0 V 104 * * * * * * * * * 1010 * * * * * * * 990 * * 104 0 * * * * * * 1366 0 0 L 105 * * * * 1010 * * * * 990 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1366 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * 1010 * 990 * * * 106 0 * * * * * * 1366 0 0 F 107 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1366 0 0 R 108 * * * * * 1010 * * * * * * * * 990 * * * * * 108 0 * * * * * * 1366 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 990 * * * 1010 * * * * 109 0 * * * * * * 1366 0 0 F 110 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1366 0 0 K 111 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1366 0 0 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1366 0 0 A 113 990 * * * * * * * * * * 1010 * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1366 0 0 D 114 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1366 0 0 P 115 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1366 0 0 Q 116 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 116 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 117 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 117 0 * * * * * * 1366 0 0 A 118 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1366 0 0 A 119 990 * * * * * * * * * * * * * * * * 1010 * * 119 0 * * * * * * 1366 0 0 I 120 * * * * 1010 * * 990 * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1366 0 0 E 121 * * * 990 * * * 1010 * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1366 0 0 P 122 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1366 0 0 P 123 1010 * * * * * * * * * * * 990 * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1366 0 0 I 124 * * * * * * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * 124 0 * * * * * * 1366 0 0 P 125 * * * 1010 * * * * * * * * 990 * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1366 0 0 N 126 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1366 0 0 V 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 127 0 * * * * * * 1366 0 0 K 128 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1366 0 0 E 129 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1366 0 0 F 130 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1366 0 0 R 131 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 131 0 * * * * * * 1366 0 0 I 132 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1366 0 0 N 133 * * 1010 * * * * * * * * 990 * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1366 0 0 C 134 * 990 * * * * * 1010 * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1366 0 0 L 135 * * * * * * * * * 990 * * * * * * * 1010 * * 135 0 * * * * * * 1366 0 0 T 136 * * * * * * * * * * * * * * * 1010 990 * * * 136 0 * * * * * * 1366 0 0 P 137 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1366 0 0 D 138 1010 * 990 * * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1366 0 0 N 139 * * 1010 * * * * * * * * 990 * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 140 * * * * 1010 * * * * * * * * * * * * * * 990 140 0 * * * * * * 1366 0 0 T 141 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 141 0 * * * * * * 1366 0 0 G 142 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1366 0 0 F 143 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1366 0 0 A 144 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1366 0 0 E 145 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1366 0 0 I 146 * * * * * * * 990 * 1010 * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1366 0 0 N 147 * * 1010 * * * * * * * * 990 * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1366 0 0 L 148 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1366 0 0 Y 149 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 149 0 * * * * * * 1366 0 0 E 150 * * * 990 * * * * * * * * * 1010 * * * * * * 150 0 * * * * * * 1366 0 0 K 151 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 152 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 L 153 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 153 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //