HHsearch 1.5 NAME c3kowH_ FAM FILE c3kowH_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3kowH_.a3m DATE Sun Aug 29 00:55:32 2010 LENG 109 match states, 109 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.3944 -0.7176 SEQ >ss_dssp CHHHHHGGGTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHTTTCCHHHHHHHHHHHHHTTCTTTCHHHHHHHHHHTTTCCHHHHHHHHHH TTTHHHHHC >sa_dssp EEEEECEECDECCEEEDEDDEEEDCEEEDDEEEDEEEEECDDDDBDCCADECEBDEECAECAADCADEDECCEECABEBAECBBEEDECDCDEAACBACE DECBDDCEE >ss_pred CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHEEHHHCCCCHHHHHHHHHC CCHHHHHCC >ss_conf 9689998985169999999999999999889998642148812678899875101343999999999742014552033540012118538898788632 702443129 >Consensus dfxxrrxhLaxlxDxxLxxxFWxlxExvvdPlidLarxxTtPSiERsVLLRMGfxSieaxaiVexvxxrGLxgKGAGHxVxkiaxxknixireAgxalxe gkywxDxxx >c3kowH_ DFQQRRAHLANLSDEELQTRFWEMAEKIVDPLLDLGKKNTTPSIERSVLLRMGFSSLEAKAIVDKTMDRGLMGKGAGHIVYKIAKEKNISVREAGLALSE GKYWDDAIQ >UniRef50_A8MGL3(1-121:121) D-ornithine aminomutase S component n=5 Tax=Bacteria RepID=A8MGL3_ALKOO E=4e-51 s/c=0.79 id=72% cov=101% DFQVRRAHLADLTDEQLEQKFWQLAEQIVDPLIDLARKNTTPSIERAVLLRMGFSSIEAKAIVEGVIDRGLMSKGAGHVVYKVATDKNIDIREAGLALID GKYWDDAVS >UniRef50_B7IHQ1(4-119:124) D-ornithine aminomutase S component n=20 Tax=Bacteria RepID=B7IHQ1_THEAB E=6e-47 s/c=1.48 id=59% cov=101% DFLERSKHLQKMTDDELNQYFWHLVEKVVDPLIELAKTHTSPSVERSVLLRMGFNSIEASKLVDMIFQRGLLGKGAGHIVWKIAKEKNLDIIEAGRALIE GKYWEDVDR >UniRef50_Q6A5H8(7-122:140) D-ornithine aminomutase S component n=2 Tax=Propionibacterium acnes RepID=Q6A5H8_PROAC E=4e-34 s/c=1.29 id=41% cov=99% RYEALRTELADLDDAALKERFWQLCEEVMTPVVDLARTHTTPSIERSVLLRMGIDSVTTHAVVENVFAAGLGGKGAGHAVLRLSRRDGIGLRDAATRIAE DPKALD--E # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * D 1 * * 520 * * * * * * * * * * * 1724 * * * * * 1 0 * * * * * * 1801 0 0 F 2 * * * * 520 * * * * * * * * * * * * * * 1724 2 0 * * * * * * 1801 0 0 Q 3 * * * 1724 * * * * * 1978 * * * 1173 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1801 0 0 Q 4 1724 * * 1978 * * * * * * * * * 2168 * * * 2178 * * 4 0 * * * * * * 1801 0 0 R 5 * * * * * * * * * 1724 * * * * 520 * * * * * 5 0 * * * * * * 1801 0 0 R 6 * * * * * * * * * * * * * * 422 1978 * * * * 6 0 * * * * * * 1801 0 0 A 7 1173 * * * * * * * 1978 * * * * * * * 1724 * * * 7 0 * * * * * * 1801 0 0 H 8 * * * 1724 * * 520 * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1801 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1801 0 0 A 10 422 * * * * * * * * * * * * 1978 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1801 0 0 N 11 * * 933 * * * * * 1978 * * 2168 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1801 0 0 L 12 * * * * * * * * * 422 1978 * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1801 0 0 S 13 * * 1724 * * * * * * * * * * * * 2168 1075 * * * 13 0 * * * * * * 1801 0 0 D 14 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1801 0 0 E 15 1724 * 1978 1173 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1801 0 0 E 16 1724 * * 1070 * * * * * * * * * 2178 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1801 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1801 0 0 Q 18 * * * 2178 * * * * 1724 * * 1978 * 2168 * * * * * * 18 0 * * * * * * 1801 0 0 T 19 * * * 1724 * * * * * * * * * 1075 * * 2168 * * * 19 0 * * * * * * 1801 0 0 R 20 * * * * * * * * 2178 * * * * * 929 * * * * 1978 20 0 * * * * * * 1801 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1801 0 0 W 22 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 22 0 * * * * * * 1801 0 0 E 23 * * * 2168 * * 1978 * * * * * * 933 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1801 0 0 M 24 * * * * * * * * * 363 2168 * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1801 0 0 A 25 1173 1724 * * * * * * * * * * * * * * * 1978 * * 25 0 * * * * * * 1801 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1801 0 0 K 27 * * * 1724 * * * * 1070 * * * * 2178 * * * * * * 27 0 * * * * * * 1801 0 0 I 28 * * * * * * * 1173 * * * * * * * * * 845 * * 28 0 * * * * * * 1801 0 0 V 29 * * * * * * * * * * 1724 * * * * * * 520 * * 29 0 * * * * * * 1801 0 0 D 30 * * 520 * * * * * * * * * * * * * 1724 * * * 30 0 * * * * * * 1801 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1801 0 0 L 32 * * * * * * * * * 520 * * * * * * * 1724 * * 32 0 * * * * * * 1801 0 0 L 33 * * * * * * * 1075 * 2168 * * * * * * * 1724 * * 33 0 * * * * * * 1801 0 0 D 34 * * 422 1978 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1801 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1801 0 0 G 36 363 * * * * 2168 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1801 0 0 K 37 * * * * * * * * 1070 * * * * * 933 * * * * * 37 0 * * * * * * 1801 0 0 K 38 * * * * * * * * 1173 * * * * * * * 845 * * * 38 0 * * * * * * 1801 0 0 N 39 * * * * * * 845 * * * * 1173 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1801 0 0 T 40 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 40 0 * * * * * * 1801 0 0 T 41 * * * * * * * * * * * * * * * 1978 422 * * * 41 0 * * * * * * 1801 0 0 P 42 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1801 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 43 0 * * * * * * 1801 0 0 I 44 * * * * * * * 422 * * * * * * * * * 1978 * * 44 0 * * * * * * 1801 0 0 E 45 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1801 0 0 R 46 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 46 0 * * * * * * 1801 0 0 S 47 2178 * * * * * * * * * * * * * * 360 * * * * 47 0 * * * * * * 1801 0 0 V 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 48 0 * * * * * * 1801 0 0 L 49 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1801 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1801 0 0 R 51 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 51 0 * * * * * * 1801 0 0 M 52 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1801 0 0 G 53 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1801 0 0 F 54 * * * * 520 * * 1724 * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1801 0 0 S 55 * * 1724 * * * * * * * * 1978 * * * 1173 * * * * 55 0 * * * * * * 1801 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 56 0 * * * * * * 1801 0 0 L 57 * * * * * * * 1075 * 2168 * * * * * * * 1724 * * 57 0 * * * * * * 1801 0 0 E 58 * * * 520 * * * * * * * * * * * * 1724 * * * 58 0 * * * * * * 1801 0 0 A 59 520 * * * * * * * * * * * * * * * 1724 * * * 59 0 * * * * * * 1801 0 0 K 60 * * * * * * 1724 * 1173 * * * * * * 1978 * * * * 60 0 * * * * * * 1801 0 0 A 61 422 * * * * * * * 1978 * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1801 0 0 I 62 * * * * * * * 1173 * 1978 * * * * * * * 1724 * * 62 0 * * * * * * 1801 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1801 0 0 D 64 * * 1070 933 * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1801 0 0 K 65 * * * * * 2178 * * 2168 * 1978 1724 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1801 0 0 T 66 * * * * * * * 1978 * * * * * * * * 2168 933 * * 66 0 * * * * * * 1801 0 0 M 67 * * * * 845 * * 2178 * * 2168 * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1801 0 0 D 68 1724 * 1173 * * * * * * * * * * 1978 * * * * * * 68 0 * * * * * * 1801 0 0 R 69 1724 * * * * * * * * * * * * * 520 * * * * * 69 0 * * * * * * 1801 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1801 0 0 L 71 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1801 0 0 M 72 * * * * * 1724 * * * 1978 1173 * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1801 0 0 G 73 * * * * * 360 * * * * * * * * * 2178 * * * * 73 0 * * * * * * 1801 0 0 K 74 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1801 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1801 0 0 A 76 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1801 0 0 G 77 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1801 0 0 H 78 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1801 0 0 I 79 1724 * * * * * * 1070 * * * * * * * * * 2178 * * 79 0 * * * * * * 1801 0 0 V 80 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 80 0 * * * * * * 1801 0 0 Y 81 * * * * * * * * * 1724 * * * * * * * * 1978 1173 81 0 * * * * * * 1801 0 0 K 82 * * * * * * * * 520 * * * * * 1724 * * * * * 82 0 * * * * * * 1801 0 0 I 83 * * * * * * * 1070 * 1724 * * * * * * * 2178 * * 83 0 * * * * * * 1801 0 0 A 84 520 * * * * * * * * * * * * * * 1724 * * * * 84 0 * * * * * * 1801 0 0 K 85 * * * * * * * * 1070 * * * * * 1724 * 2178 * * * 85 0 * * * * * * 1801 0 0 E 86 * * 2178 1070 * * * * * * * * * * 1724 * * * * * 86 0 * * * * * * 1801 0 0 K 87 * * 1724 * * * * * 520 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1801 0 0 N 88 * * * * * 1724 * * * * * 520 * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1801 0 0 I 89 * * * * * * * 422 * 1978 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1801 0 0 S 90 * * 1075 * * 1724 * * * * * * * * * 2168 * * * * 90 0 * * * * * * 1801 0 0 V 91 * * * * * * * 1075 * 1724 * * * * * * * 2168 * * 91 0 * * * * * * 1801 0 0 R 92 * * * * * * * 1978 * * * * * * 422 * * * * * 92 0 * * * * * * 1801 0 0 E 93 * * 1724 520 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1801 0 0 A 94 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1801 0 0 G 95 1724 * * * * 520 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1801 0 0 L 96 * * * * * * * * * 1173 * * * * 1978 * 1724 * * * 96 0 * * * * * * 1801 0 0 A 97 520 * * * * * * * * * * * * * 1724 * * * * * 97 0 * * * * * * 1801 0 0 L 98 * * * * * * * 1724 * 520 * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1801 0 0 S 99 1724 * * * * * * 1075 * * * * * * * 2168 * * * * 99 0 * * * * * * 1801 0 0 E 100 * * 2178 360 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1801 0 0 G 101 * * 1724 * * 520 * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1801 0 0 K 102 * * * * * * * * 520 * * * 1724 * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1801 0 0 Y 103 * * * * * * * * 1724 * * * * * * * * * * 520 103 0 * * * * * * 1801 0 0 W 104 1724 * * * * * * * * * * * * * * * * * 520 * 104 0 * * * * * * 1801 0 0 D 105 * * 1173 1978 * * * * * 1724 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1801 0 0 D 106 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 520 * 1724 * * * * 1801 0 0 A 107 635 * * * * * * * * * * * * * * * * 1489 * * 107 0 * * * * * 0 1441 0 1000 I 108 * * 1489 * * * * 1646 * * * * * * * * * 1625 * * 108 0 * * * * 0 * 1441 0 1000 Q 109 * * * 1724 * * * * * * * * * 2168 1978 2178 * * * * 109 0 * * 0 * * * 1801 0 0 //