HHsearch 1.5 NAME c3eukJ_ FAM FILE c3eukJ_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3eukJ_.a3m DATE Thu Jan 10 00:17:29 2013 LENG 124 match states, 124 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.4049 -0.6718 SEQ >ss_dssp CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHTTTTSSCCCCHHHHHHHHHHHSCTTSHHHHHHHHHHHHHTTBCCSTTSSCC CCCEEECSSSSCEEECCCCCSBCC >sa_dssp EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECEECCDDADEDADECEEEEDDACBBDBBEEBBEECEEEDCEDBCECADECAEECCDBCDEEEED ECEEDEACEEEDDBDDCDBDDCEE >ss_pred CCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9301024675430000576662187101566699999999999999999998418981699999999962702321239999999888731320101235 345776765467899988754239 >Consensus lLxxAxAexLxDlRDeexexxGelPxxlEYExxsxxxxqlvxxixxxLxxxkxxxxPidLxxVlrexLaxyPxsrHFDvARIvVDQAVrLGxaxxDxxxx xpxWQxIndxgAxVQAhvIdxYxx >c3eukJ_ LLYTAKAEALLDLRDDEAEAVGELPMALEYESLTDVQTQIVTAIQAELAHFRNTAQPINLGAVLQEQLARYPQSRHFDVARIIVDQAVKLGMASQDHQAV YPVWQPIDDFSAAVQAHLIDQYDK >UniRef50_Q65TL7(319-444:445) Chromosome partition protein mukF n=96 Tax=Gammaproteobacteria RepID=MUKF_MANSM E=2e-31 s/c=1.08 id=59% cov=98% -LWTAQAERLIDLRDEElalrdEDALGELPEELEYEQLSDLHDQIVDYMQNLLIAQRERNQPIDLSLVLKEQLEGYPLARHFDVARIIVDQAVRLGMASA DLSGTYPQWQEINNRGAEVQAHVIDEY-- >UniRef50_Q6D445(316-441:441) Chromosome partition protein mukF n=8 Tax=Gammaproteobacteria RepID=MUKF_ERWCT E=1e-20 s/c=0.79 id=47% cov=98% -LTFANADRLLDMRDEEltlrsEEVTGELPPELEYEEFSEMREQLIALVEQALHKYKAQQIPLDLSEVMREYLAQYPRSRHFDVARIVVDQAVRLGVADT DFTGLPALWQAINEYGAKVQAHVIDKY-- >UniRef50_B7VMH0(319-445:445) Chromosome partition protein mukF n=179 Tax=Gammaproteobacteria RepID=MUKF_VIBSL E=6e-46 s/c=1.45 id=46% cov=99% LLTYADAEKLTDLRDEalvlrDDEVMGQAPIDVEYEEFEQVNDLLSERIGDMLKAHKQQGAPIDLGLVLRDYLAAHPRTHHFDLARIVVDQAVRLGYSES DYQAIQPDWQAINDFGAKVQANVINKY-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1455 0 0 L 2 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1850 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 965 * 2069 2004 3 0 * * * * * * 1850 0 0 T 4 * * * * 2012 * * * * * * * * * * * 1036 * * 1919 4 0 * * * * * * 1850 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1850 0 0 K 6 * * 1919 * * * * * 2004 * * 2012 * 2069 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1850 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1850 0 0 E 8 * * 2012 411 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1850 0 0 A 9 2004 * * * * * * * 1919 * * * * * 1040 * * * * * 9 0 * * * * * * 1850 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1850 0 0 L 11 * * * * * * * 2069 * 1008 * * * * * * 1919 * * * 11 0 * * * * * * 1850 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1850 0 0 L 13 * * * * * * * * * 411 2012 * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1850 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 14 0 * * * * * * 1850 0 0 D 15 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1850 0 0 D 16 * * 2004 414 * * * * * * * * * * * * * * * * 16 443 1919 * 2322 322 * * 1850 1000 0 E 17 * * 1919 443 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 961 1040 * 2322 322 * * 1850 1378 0 A 18 2004 * 1919 1040 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1850 0 0 E 19 * * 2069 393 * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1850 0 0 A 20 1036 * * * * * * * * * * * * * * * * 965 * * 20 0 * * * * * * 1850 0 0 V 21 * * * * * * * * * 2069 1919 * * * * * 2012 2004 * * 21 0 * * * * * * 1850 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1850 0 0 E 23 * * * 443 * * * * * * * * * 1919 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1850 0 0 L 24 1919 * * * * * * * * 443 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1850 0 0 P 25 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1850 0 0 M 26 * * * 2069 * * * 1919 * * 2004 * 2012 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1850 0 0 A 27 2004 * 1919 1040 * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1850 0 0 L 28 * * * * * * * * * 443 * * * * * * * 1919 * * 28 0 * * * * * * 1850 0 0 E 29 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1850 0 0 Y 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 30 0 * * * * * * 1850 0 0 E 31 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1850 0 0 S 32 * * * 965 * * * * * * * * * 2069 * 2004 * * * * 32 0 * * * * * * 1850 0 0 L 33 * * * * 965 * * * * 1036 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1850 0 0 T 34 * * * 1919 * * * * * * * * * * * 1040 2004 * * * 34 0 * * * * * * 1850 0 0 D 35 * * 1036 2012 * * * * * * * * * 1919 * * * * * * 35 0 * * * * * * 1850 0 0 V 36 * * * * * * * * * 2069 2012 * * * * * * 961 * * 36 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 37 * * * * * * 2069 * * * * 1919 * 2004 2012 * * * * * 37 0 * * * * * * 1850 0 0 T 38 * * 992 2012 * * * * * * * * * * * * 2004 * * * 38 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 39 * * * * * * * * * 1919 * * * 443 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1850 0 0 I 40 * * * * * * * 1036 * 965 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1850 0 0 V 41 * * * * * * * 2012 * * * * * * * 1919 * 1036 * * 41 0 * * * * * * 1850 0 0 T 42 2012 * 2069 1919 * * * * * * * * * * * * 2004 * * * 42 0 * * * * * * 1850 0 0 A 43 2004 * * * * * * * * 2012 * * * * 1919 * * * * 2069 43 0 * * * * * * 1850 0 0 I 44 * * * * * * * 961 * * 2069 * * * * * * 2012 * * 44 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 45 * * * 2012 * 1919 * * * * * * * 1036 * * * * * * 45 0 * * * * * * 1850 0 0 A 46 2004 * 1919 * * * * * * * * 2069 * 2012 * * * * * * 46 0 * * * * * * 1850 0 0 E 47 2012 * * 2004 * * * * * 2069 1919 * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1850 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1850 0 0 A 49 2004 * * * * * 2012 2069 1919 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1850 0 0 H 50 992 * * * * * 2004 * 2012 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1850 0 0 F 51 * * * * 2004 * 1919 * * * * * * 2069 * * * * * 2012 51 0 * * * * * * 1850 0 0 R 52 * * * * * * * * 965 * * * * * 1036 * * * * * 52 0 * * * * * * 1850 0 0 N 53 2012 * * 2069 * * * * * * * 2004 * 1919 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1850 0 0 T 54 * * * * * * * * * * * * * 965 2069 * 2004 * * * 54 0 * * * * * * 1850 0 0 A 55 2004 * * * * 1919 * * * * * 2069 * 2012 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 56 1919 * * * * * * 2012 * * * * * 1036 * * * * * * 56 0 * * * * * * 1850 0 0 P 57 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1850 0 0 I 58 * * * * * * * 411 * 2012 * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1850 0 0 N 59 * * 414 * * * * * * * * 2004 * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1850 0 0 L 60 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1850 0 0 G 61 * * * * * 961 * * * * * * * * * 1040 * * * * 61 0 * * * * * * 1850 0 0 A 62 2004 * * 2012 * * * * * 992 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1850 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1850 0 0 L 64 * * * * * * * * * 411 2012 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 65 * * * * * * * * 2069 * * * * 2004 965 * * * * * 65 0 * * * * * * 1850 0 0 E 66 * * 1919 443 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 67 * * * * * * * * * * * * * 1036 * * * * * 965 67 0 * * * * * * 1850 0 0 L 68 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1850 0 0 A 69 393 * * 2069 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1850 0 0 R 70 1919 * * * * 2069 * * * * * * * 2012 2004 * * * * * 70 0 * * * * * * 1850 0 0 Y 71 * * * * * * 1919 * * * * * * * * * * * * 443 71 0 * * * * * * 1850 0 0 P 72 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 73 * * * * * * * * * 2069 * * * 2004 965 * * * * * 73 0 * * * * * * 1850 0 0 S 74 2069 * * * * * * * * * * * * * * 1008 1919 * * * 74 0 * * * * * * 1850 0 0 R 75 * * * * * * 1919 * * * * * * * 443 * * * * * 75 0 * * * * * * 1850 0 0 H 76 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1850 0 0 F 77 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1850 0 0 D 78 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1850 0 0 V 79 * * * * * * * * * 1919 * * * * * * * 443 * * 79 0 * * * * * * 1850 0 0 A 80 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1850 0 0 R 81 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 81 0 * * * * * * 1850 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1850 0 0 I 83 * * * * * * * 1036 * * * * * * * * * 965 * * 83 0 * * * * * * 1850 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1850 0 0 D 85 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 86 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 86 0 * * * * * * 1850 0 0 A 87 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1850 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 88 0 * * * * * * 1850 0 0 K 89 * * * * * * * * 2004 * * * * * 414 * * * * * 89 0 * * * * * * 1850 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1850 0 0 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1850 0 0 M 92 * * * * * * * * * * 1036 * * * * * * 2012 * 1919 92 0 * * * * * * 1850 0 0 A 93 443 * * * * * * * * * * * * * * 1919 * * * * 93 0 * * * * * * 1850 0 0 S 94 * * 2012 1919 * * * * * * * * * * * 1036 * * * * 94 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 95 2069 * * * * * * * * * * * * 2004 * 1919 2012 * * * 95 0 * * * * * * 1850 0 0 D 96 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1850 0 0 H 97 * * * * 2012 * 2004 * * 2069 * * * * * * * * * 1919 97 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 98 * * * * * * * * * * * * * 961 * 2069 2012 * * * 98 0 * * * * * * 1850 0 0 A 99 961 * * * * 1040 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1850 0 0 V 100 * * * * * * * 1919 * 2012 * * * * * * 2069 2004 * * 100 0 * * * * * * 1850 0 0 Y 101 * * * * * * * * * * * * 2012 1919 * * * * * 1036 101 0 * * * * * * 1850 0 0 P 102 2012 * * * * * * * * * * * 411 * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1850 0 0 V 103 * * 1919 * * * * * * 2012 * * * 2069 * * * 2004 * * 103 0 * * * * * * 1850 0 0 W 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 104 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 105 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 105 0 * * * * * * 1850 0 0 P 106 965 * * 2069 * * * * * * * * 2004 * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1850 0 0 I 107 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1850 0 0 D 108 * * 2004 * * * * * * * * 414 * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1850 0 0 D 109 * * 961 2012 * * * * * * * 2069 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1850 0 0 F 110 * * * * 961 * * * * * * * * * 2069 * * * * 2012 110 0 * * * * * * 1850 0 0 S 111 * * * * * 414 * * * * * * * * * 2004 * * * * 111 0 * * * * * * 1850 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1850 0 0 A 113 2004 * * 2069 * * * * 965 * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1850 0 0 V 114 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 114 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 115 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 115 0 * * * * * * 1850 0 0 A 116 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1850 0 0 H 117 * * * * * * 443 * * * * 1919 * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1850 0 0 L 118 * * * * * * * * * 2004 * * * * * * * 414 * * 118 0 * * * * * * 1850 0 0 I 119 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1850 0 0 D 120 * * 443 * * * * * * * * 1919 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1850 0 0 Q 121 * * * 2069 * * * * 965 * * * * 2004 * * * * * * 121 0 * * * * * * 1850 0 0 Y 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 122 0 * * * * * * 1850 0 0 D 123 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 K 124 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 124 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //