HHsearch 1.5 NAME c3b21A_ FAM FILE c3b21A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c3b21A_.a3m DATE Sat Feb 25 11:24:50 2012 LENG 192 match states, 192 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4056 -0.8122 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHTSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHCTTCCCSCCHHHHHHHHHHHTTSCCBCCCCGGGGGGTGGGTTTTCHHHHTSCCEECCTTCBHHHHHH HHHHHHHHHSCTTCEEEEEETTTTEEEEEEECSSCEEEEBTTTTBSSCCCCSSCCCTTSBCCTTCEEEEECCCHHHHHHHHTSHHHHHSCBC >sa_dssp EDDCEECCEEBDEDEDEDCEBADDBADDACECABDEEDEDECCAABAAAAAABDEDCACCBBDEECCEDCBEDBBEEBEEDBEDEDCCBDEEBCBDDABD CABEDACEECEEDCBAAAABDDDDBBAAABBCDEBAAAAAABDCDBBBBDCEEEDDDECEBEEECBAABADBCEEBADEABEBEBBEEBEDC >ss_pred CCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH HHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHCCCHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHHCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9839999973031000333320159999998709888888631468999999851210037872358999999999999852203342385125899999 99998861047884899981010021311478847999981268766553601107101205777169998231565321032211001369 >Consensus nvnvkklleslnskslgdmdkdselaatlqkminpsggdgncsgcalhacmamlgygvreapvpneiseymtgffhrhleqidsegivshpnetyskfre riaenilqntskgsvvmisieqathwiagfndgekimfldvqtgkgfnlydpvekspdafvdenssvqvihvsdqefdhyanssswkskrlc >c3b21A_ NVNVKKLLESLNSKSLGDMDKDSELAATLQKMINPSGGDGNCSGCALHACMAMLGYGVREAPVPNEISEYMTGFFHRHLEQIDSEGIVSHPNETYSKFRE RIAENILQNTSKGSVVMISIEQATHWIAGFNDGEKIMFLDVQTGKGFNLYDPVEKSPDAFVDENSSVQVIHVSDQEFDHYANSSSWKSKRLC # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 N 3 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 K 6 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 L 7 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 L 8 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 G 17 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 M 19 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 K 21 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 D 22 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 E 24 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 A 26 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 30 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 K 31 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 M 32 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 I 33 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 N 34 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 G 38 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 G 40 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 N 41 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 C 42 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 S 43 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 G 44 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 C 45 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 H 48 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 C 50 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 M 51 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 M 53 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 L 54 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 56 0 * * * * * * 1000 0 0 G 57 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 R 59 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 A 61 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 P 62 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 P 64 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 N 65 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 I 67 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 E 69 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 70 0 * * * * * * 1000 0 0 M 71 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 T 72 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 G 73 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 F 74 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 F 75 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 H 76 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 R 77 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 H 78 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 E 80 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 81 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1000 0 0 D 83 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 S 84 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 E 85 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 G 86 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 I 87 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 H 90 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 P 91 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 N 92 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 E 93 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 T 94 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 95 0 * * * * * * 1000 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 K 97 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 F 98 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 R 99 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 E 100 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 R 101 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 I 102 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 A 103 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 E 104 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 N 105 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 I 106 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 L 107 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 108 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 N 109 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 T 110 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 S 111 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 K 112 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 G 113 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 S 114 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 V 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 V 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 M 117 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 I 118 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 S 119 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 I 120 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 E 121 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 122 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 A 123 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 T 124 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 H 125 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 W 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 126 0 * * * * * * 1000 0 0 I 127 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 A 128 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 G 129 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 F 130 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1000 0 0 N 131 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 131 0 * * * * * * 1000 0 0 D 132 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1000 0 0 G 133 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1000 0 0 E 134 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1000 0 0 K 135 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1000 0 0 I 136 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1000 0 0 M 137 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 1000 0 0 F 138 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1000 0 0 L 139 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 1000 0 0 D 140 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1000 0 0 V 141 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 141 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 142 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 142 0 * * * * * * 1000 0 0 T 143 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 143 0 * * * * * * 1000 0 0 G 144 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 1000 0 0 K 145 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 1000 0 0 G 146 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1000 0 0 F 147 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 N 148 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 L 149 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 149 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 150 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 150 0 * * * * * * 1000 0 0 D 151 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 151 0 * * * * * * 1000 0 0 P 152 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 152 0 * * * * * * 1000 0 0 V 153 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 153 0 * * * * * * 1000 0 0 E 154 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1000 0 0 K 155 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1000 0 0 S 156 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 156 0 * * * * * * 1000 0 0 P 157 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1000 0 0 D 158 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1000 0 0 A 159 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 1000 0 0 F 160 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 1000 0 0 V 161 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 161 0 * * * * * * 1000 0 0 D 162 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1000 0 0 E 163 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 163 0 * * * * * * 1000 0 0 N 164 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1000 0 0 S 165 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 165 0 * * * * * * 1000 0 0 S 166 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 166 0 * * * * * * 1000 0 0 V 167 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 167 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 168 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 168 0 * * * * * * 1000 0 0 V 169 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 169 0 * * * * * * 1000 0 0 I 170 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 170 0 * * * * * * 1000 0 0 H 171 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1000 0 0 V 172 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 172 0 * * * * * * 1000 0 0 S 173 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 173 0 * * * * * * 1000 0 0 D 174 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 174 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 175 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 175 0 * * * * * * 1000 0 0 E 176 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 176 0 * * * * * * 1000 0 0 F 177 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 177 0 * * * * * * 1000 0 0 D 178 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 178 0 * * * * * * 1000 0 0 H 179 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 179 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 180 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 180 0 * * * * * * 1000 0 0 A 181 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 181 0 * * * * * * 1000 0 0 N 182 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 182 0 * * * * * * 1000 0 0 S 183 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 183 0 * * * * * * 1000 0 0 S 184 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 184 0 * * * * * * 1000 0 0 S 185 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 185 0 * * * * * * 1000 0 0 W 186 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 186 0 * * * * * * 1000 0 0 K 187 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 187 0 * * * * * * 1000 0 0 S 188 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 188 0 * * * * * * 1000 0 0 K 189 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 189 0 * * * * * * 1000 0 0 R 190 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 190 0 * * * * * * 1000 0 0 L 191 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 191 0 * * * * * * 1000 0 0 C 192 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 192 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //