HHsearch 1.5 NAME c2zgdA_ FAM FILE c2zgdA_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c2zgdA_.a3m DATE Wed Mar 10 19:09:43 2010 LENG 96 match states, 96 columns in multiple alignment FILT 127 out of 22877 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 9.2 EVD 0.5348 2.9226 SEQ >ss_dssp CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHTTCCTTCCCTTCCCHHHHHHHTTCHHHHHHHHHTTCCCCCCTTSCCHHHHHHHHTCHHHHHHHC >sa_dssp DDECDCEEEEDCDEABDAADDCDCEDADEBCEEEBECDCDDEECABAAABAACCCCCEAADCACEDEBEDCEBDDDCCADCAADCBECDEABDCBE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHCC >ss_conf 984438888888389999980999999998741112111011111111111111100000001210356553452289999999829999998609 >Consensus hxxxnxxxxdxxTxLhxAaxxgxxeivxxLlxxgaxxxxxxxxxxtxlxxaxxxxxxxxvxxLxxxxxxxxxxxxgxtpLxxAxxxxxxeivxxLx >c2zgdA_ HHHHHSSGSDLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGADVAAKDKNGSTPLHLAARNGHLEVVKLLLEAGADVAQDKFGKTAFDISIDNGNEDLAEILQ >UniRef50_UPI0000E817D9(522-622:668) PREDICTED: hypothetical protein n=1 Tax=Gallus gallus RepID=UPI0000E817D9 E=4e-09 s/c=0.62 id=16% cov=89% -----------NTALHYSVSHSNFHIVKLLLDTGVCNVDHQNKAGYTALMLAalaaveQEDDMNVVRRLFSMgNVNAKASQAGQTALMLAVSHGRQEMVE AL- >UniRef50_A0D707(95-187:700) Chromosome undetermined scaffold_4, whole genome shotgun sequence n=1 Tax=Paramecium tetraurelia RepID=A0D707_PARTE E=6e-07 s/c=0.59 id=18% cov=89% ------------TLLHWICYFGKLEILKVYLPYCLDINQETLDGWTSLMISIRQQHLQITRYLLNYQsINPNLVTQQSSALHLACRMENTQAIQMLQ >UniRef50_A8QBC4(305-401:1072) FYVE zinc finger family protein n=1 Tax=Brugia malayi RepID=A8QBC4_BRUMA E=0.0002 s/c=0.49 id=16% cov=100% HFDINDVDNDSKTPFIKAVDSENIEIIELLLQKSAVDINKMDRKGCSPISSAlfKIRNMALAELIAKAGTDLNILYKGVFMIHHAVYTSNLDAVQFL- >UniRef50_A2DKY8(332-426:463) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Trichomonas vaginalis RepID=A2DKY8_TRIVA E=0.001 s/c=0.47 id=16% cov=96% ----NAKSEDNLSALMFAAINNTSEVAEVILSDpNVNMYDTAIDNVNSLMLCGLYNSPDVARVLIAKGYDVNKAAlNNYTPIVFAAMGNSYETAKIL- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * H 1 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 4267 0 0 H 2 2449 * * * 3867 * 1211 * * * * 3900 2942 4054 * 4079 * * * * 2 0 * * * * * * 5586 0 0 H 3 * * 1635 2210 * * 2298 4321 * * * * * * 4381 * * 4265 * 3204 3 0 * * * * * * 5915 0 0 H 4 * * * * * * 2676 859 4844 4785 * 4793 * 4641 4574 * * 3974 * 4664 4 0 * * * * * * 6704 0 0 H 5 * * 5014 3504 * * 2157 * * 5096 * 884 5044 5240 5115 * * * * * 5 35 5388 * 1000 1000 * * 7506 1000 0 S 6 2682 * 3600 4324 5417 * * 4234 4099 5139 5321 4267 4918 5105 5275 2728 3583 2745 * * 6 0 * * * * * * 7595 0 0 S 7 5623 5326 * * * * * 4579 3761 * * 5521 * 2694 3959 1678 2866 2748 * * 7 0 * * * * * * 7827 0 0 G 8 * * 2436 * * 2189 * * 4540 5376 * 1739 * * 4439 2642 * 5443 * * 8 0 * * * * * * 7998 0 0 S 9 4711 * 3051 3352 * 4011 * * 4039 5880 * 2714 4634 5615 5881 2118 3074 5368 * * 9 0 * * * * * * 8124 0 0 D 10 5797 * 1052 2490 5930 6036 4491 * 4978 5863 * 3033 * 5783 5682 5831 5700 * * * 10 73 4914 5924 2000 415 * * 8371 1764 0 L 11 4874 * 5945 5728 3217 2145 * 4298 3695 3349 3437 5249 * 5936 4811 4066 5820 * * 3022 11 0 * * * * 0 * 8531 0 1000 G 12 4860 6342 4188 3568 * 2763 5904 * 4006 4634 5874 2090 5782 4216 4051 3838 5045 * * 3987 12 71 4918 6090 1933 438 * * 8667 1741 0 K 13 4859 * 4513 5202 * * * * 4935 * * 3139 6413 * * 3501 625 * * * 13 16 6500 * 0 * 0 * 9024 1000 1000 K 14 1393 * * 6670 * * * 5203 6990 4248 5713 6578 1442 6796 6640 4768 5048 4712 * * 14 12 * 6916 * * * * 9369 0 0 L 15 6529 * * * 3880 * * 3334 * 360 6791 * * * * * * 4889 * * 15 0 * * * * 0 * 9540 0 1000 L 16 6898 6664 6769 * 4026 6963 1090 3970 * 3612 3354 7082 * 3617 * 6852 6685 5417 * 4071 16 0 * * * * * * 9547 0 0 E 17 4676 4874 6104 4874 5311 6945 3837 2975 4669 2299 6595 5594 * 4830 4708 4838 5417 4210 4382 2833 17 15 6561 * 0 * * * 9547 1000 0 A 18 276 5144 * * * 5301 6705 6856 * 6817 * * * * * 3996 6312 5798 * * 18 0 * * * * * * 9548 0 0 A 19 1307 3078 * * * 6484 * 2648 * 5017 6185 * * * * 3763 5402 2602 * * 19 12 6973 * 1000 1000 * * 9553 1000 0 R 20 3097 4630 5113 3470 4784 5306 5310 4410 3398 4707 5929 4749 * 3180 3326 4422 3747 5802 5656 4876 20 0 * * * * * * 9553 0 0 A 21 4971 4967 * 3828 5443 4178 4311 4826 3628 4728 5892 2492 * 4304 3279 3754 4343 7115 * 3260 21 13 6834 * 2000 415 * * 9553 1000 0 G 22 6684 * 4442 5610 * 933 6666 7021 4981 * * 2014 * 5940 4635 4694 6957 * * * 22 0 * * * * * * 9553 0 0 Q 23 5308 5407 3312 5818 5532 * 2433 * 4907 4997 * 1779 7137 4095 3899 3584 * * * 4215 23 0 * * * * * * 9555 0 0 D 24 5371 6589 6060 4326 4262 5625 7072 3053 3733 1867 6095 6077 4679 5984 5937 4328 4759 3068 * 4497 24 10 7205 * 2000 415 * * 9555 1000 0 D 25 3456 7142 2217 1500 * 4667 * * 3677 5408 * 4519 7137 4362 4635 5396 6259 5981 * * 25 0 * * * * * * 9555 0 0 E 26 3424 4503 * 7365 7009 5441 * 1643 7052 2996 3202 * * 5844 7398 4773 4316 2862 * 5935 26 0 * * * * * * 9555 0 0 V 27 3384 4039 * * 4376 6677 * 2661 * 2761 4891 * * * * 6338 4702 1339 * * 27 10 * 7175 * * * * 9555 0 0 R 28 6168 * 5365 2366 * 5356 6725 6745 1915 5084 * 3904 * 3377 3076 4188 4121 6001 * 5607 28 16 6461 * 0 * 0 * 9553 1000 1000 I 29 3617 6739 * 4197 3334 * 6069 4780 4809 1922 4417 * * * 5381 5116 5349 3259 5804 2662 29 0 * * * * * * 9555 0 0 L 30 5160 4940 * * 4154 * * 3757 * 444 5467 * * * * * 6930 6073 * 5119 30 34 5815 7474 1585 585 * * 9555 1595 0 M 31 5379 5671 6744 7195 5263 * 5000 2113 6943 989 5206 * * * * * * 3390 5859 * 31 53 4806 * 2701 241 * 0 9558 2857 1000 A 32 3805 * 2788 2136 * 5064 * 6689 4212 6979 7064 3996 5490 3830 4254 2394 5246 6719 * 6217 32 43 5098 * 1666 546 0 * 9558 2959 1000 N 33 2933 5020 6816 4634 5131 6930 2679 5660 2927 4007 6882 3907 * 3421 3811 4323 5615 * 6983 3949 33 66 4489 * 186 3050 * * 9555 3616 0 G 34 * 6018 5337 4337 5556 898 * * 4111 6351 6050 3202 4458 4542 6436 5406 7367 5586 6936 * 34 47 5482 6720 1891 453 * * 9555 2301 0 A 35 1357 4490 5992 4993 4627 4269 6034 3546 5830 4497 * 7144 4256 5444 5426 3901 5402 4084 * 7015 35 33 7055 6059 1000 1000 0 * 9545 1000 1000 D 36 5007 5477 1877 4236 4926 5406 5119 6917 4290 5251 * 2621 4072 5250 5549 3248 4620 5801 * 5895 36 23 5990 * 1273 771 984 1016 9544 1689 1728 V 37 4052 * 3771 5995 5053 5842 5680 2436 4278 2471 6217 * 3485 7008 5538 6983 4395 2730 5111 * 37 52 5112 7340 2272 335 0 * 9549 2824 1000 A 38 6059 5985 3127 3713 6064 5310 4434 5238 4111 4333 5915 1924 5386 5429 4159 4034 4595 4914 5690 5651 38 11 7015 * 1000 1000 * 0 9557 1000 1000 A 39 4052 5250 4153 4233 5437 5245 5214 3095 4384 3196 5811 4342 4452 4128 5603 3441 3997 3842 6018 5431 39 11 6979 * 3585 126 0 * 9557 1000 1000 K 40 4998 4798 4211 5076 6947 4612 5973 3565 3183 4130 5922 5769 4423 4064 2723 6739 3479 3474 5677 4998 40 35 5941 7043 2715 238 * * 9552 1723 0 D 41 4269 5171 2049 7025 7040 4150 5438 4349 5919 6127 5252 2296 7059 5368 5528 3934 3249 5549 6336 5923 41 27 5751 * 2341 317 0 * 9552 1786 1000 K 42 4225 * 3785 4357 4393 4226 5588 4970 3428 3896 * 3026 5083 3716 4279 4206 4246 3818 5849 4783 42 11 6988 * 1000 1000 * * 9552 1000 0 N 43 4645 * 2943 4355 5067 3469 4276 7931 3527 4683 * 2833 6052 3867 4089 4446 3972 6018 * 3797 43 9 * 7295 * * * * 9552 0 0 G 44 5995 5797 4231 7013 5022 1793 5446 5275 3969 4399 6916 3080 5646 5327 4659 3381 4573 6233 5562 4554 44 65 4503 * 2318 323 * 0 9554 3386 1000 S 45 4722 4831 3976 4309 4430 3229 5305 5372 4459 4505 3978 3531 6054 3530 3779 4440 5892 4670 4140 4733 45 21 6849 7409 2585 263 0 * 9554 1000 1000 T 46 6194 5852 4771 4642 5672 5316 6338 * 5161 5902 6638 3261 5008 * 5733 2771 1226 6769 6446 4983 46 0 * * * * 0 * 9557 0 1000 P 47 2320 4539 5885 5867 5246 * 5923 3780 5277 3819 5973 7011 1869 * 5393 3996 4232 3924 * 7098 47 10 7160 * 0 * * * 9552 1000 0 L 48 4235 6860 6927 * 3293 5636 * 3029 * 1298 5056 * 4049 6805 5574 5947 5748 3533 * 4758 48 0 * * * * * * 9552 0 0 H 49 4527 5957 4101 5187 4781 6850 2325 3636 * 3001 3180 5334 6101 4167 5364 4551 5070 5271 6890 3869 49 19 7310 7148 1000 1000 * * 9552 1000 0 L 50 4045 4757 5117 4569 4074 * 3461 3662 4513 2890 4782 6867 * 5733 6880 4427 4824 3437 6003 2629 50 12 6867 * 2585 263 0 * 9555 1000 1000 A 51 1180 3994 * 6919 4220 4366 * 5518 5565 4853 4593 6463 6878 4760 6657 4007 4504 4195 6039 5385 51 29 6421 6981 0 * * * 9552 1000 0 A 52 1738 3049 6450 6379 6925 6631 * 3259 * 3775 6389 6790 * 6690 5724 3433 4152 2744 * 6336 52 48 4941 * 1566 595 0 * 9546 2896 1000 R 53 3563 7082 5454 3618 3321 4909 5115 3980 2878 3709 4911 5919 7248 4258 4197 4032 4108 4694 * 4480 53 39 5230 * 417 1994 * * 9552 2297 0 N 54 4732 5932 6981 3983 4769 4560 3839 4560 4575 3738 6309 3217 5822 4333 3238 3204 4255 5786 6449 3594 54 37 5293 * 1785 495 * * 9552 2344 0 G 55 5089 5315 4218 4125 * 1698 4889 4708 3652 6867 6027 3127 5320 5005 4151 4329 4968 6805 * 4913 55 0 * * * * * * 9552 0 0 H 56 5746 5366 3505 5517 7043 4837 2761 7095 4036 4988 * 2330 5907 3555 3923 2956 6858 6947 * 4466 56 40 5181 * 2124 376 * * 9552 2898 0 L 57 4738 5545 5029 3427 4485 5661 5274 3323 3859 2827 5086 5762 4678 5293 4016 4996 4329 3177 6229 4707 57 13 * 6810 * * * * 9552 0 0 E 58 4347 6035 2766 2352 4965 4206 6013 5126 3155 6418 6447 4479 5294 4141 4361 4426 5753 4445 * 4631 58 0 * * * * 0 * 9531 0 1000 V 59 3632 3971 5434 4463 5403 4580 6699 2039 5358 3995 3846 5449 6339 * 6919 4319 4221 2803 * 5532 59 23 5976 * 573 1608 * * 9552 1744 0 V 60 3322 5462 6595 6850 4169 * 6421 2480 * 3144 5116 6463 * 4602 5119 5309 4049 1723 * * 60 53 5474 6233 456 1885 * * 9552 2389 0 K 61 5716 5262 4261 2540 6430 6672 5142 5795 2066 4564 * 5416 5885 3030 2906 4694 5453 5974 * 6912 61 12 6924 * 1000 1000 * 0 9506 1000 1000 L 62 4034 4806 6454 4511 2949 * 5315 4290 4504 2020 4273 * * 5336 * 5140 4604 4142 5539 2972 62 42 6366 5899 1000 1000 * 0 9506 1000 1000 L 63 6725 * * * 3499 * * 3847 6659 509 4101 * 6596 6829 * * 6802 4900 * * 63 35 5831 7339 3650 120 1378 701 9468 1683 2241 L 64 4620 4993 5102 4727 4211 4905 6980 2929 4957 1849 4772 5842 * 5848 4975 4728 6224 2712 * 5818 64 0 * * * * * 0 9519 0 2370 E 65 4280 * 2802 2489 6306 5543 6733 7057 2966 7196 6030 3849 5193 3700 5407 2689 4398 5977 * 6585 65 11 7038 * 0 * 1353 716 9519 1000 2370 A 66 3600 4986 5490 4652 4062 4964 3049 4164 3112 3822 7042 3266 5593 4990 4381 4007 6979 6419 * 3726 66 51 4840 * 1659 549 * 0 9514 3277 1723 G 67 4642 5701 3391 4369 5020 1772 5439 5910 3870 5503 6324 3590 5890 5469 4648 3520 6391 5391 7057 4721 67 55 5095 6924 1371 705 * 0 9514 2901 1723 A 68 1849 3770 3707 6216 5836 3980 4728 3384 4927 6334 6693 5915 4729 6868 5624 3554 5413 3669 * 5694 68 30 7343 6095 1585 585 1378 701 9511 1000 2215 D 69 5040 * 1856 4307 5384 6970 6889 5279 4532 4322 * 2156 4809 6011 5811 3228 6567 4688 6207 5605 69 130 3910 5687 849 1168 970 1030 9497 4610 2784 V 70 5095 5790 5755 * 5563 5645 * 2370 4576 2650 4630 4238 3327 6094 5805 4653 4243 2849 6571 5019 70 169 3291 6924 1511 624 364 2165 9479 5190 2870 A 71 4301 6088 4538 3932 6162 4437 6047 3202 5412 4031 5096 2303 5300 5140 4918 3515 4539 4357 5118 5031 71 88 4083 * 335 2270 845 1174 9522 4446 1661 Q 72 4386 5425 3792 3882 5096 6778 5545 3527 3452 3996 * 4112 4415 3742 4268 3843 3768 4056 6731 4493 72 128 3561 * 2287 331 * 0 9533 4906 1000 D 73 5031 3853 2500 4229 6061 5025 6341 4327 4150 4636 5315 2763 5743 4284 4045 4740 4217 4909 5430 6051 73 83 4169 * 2302 327 0 * 9533 3966 1000 K 74 4365 4833 3169 4152 5991 4764 4410 4503 4902 5985 6752 2610 6463 5116 3194 3525 3977 6192 * 3848 74 121 3633 * 125 3592 * * 9552 4867 0 F 75 4984 6233 2419 3888 5285 4946 5123 4523 3757 5973 * 2717 5906 5436 3488 3643 4802 * 4738 4441 75 165 3460 5871 1524 616 * * 9552 5360 0 G 76 6725 6217 4116 5498 5531 949 5322 * 5242 5615 * 2741 6329 6011 5958 4596 6978 7057 6872 5218 76 12 6858 * 0 * 0 * 9535 1000 1826 K 77 6184 * 4122 3917 5085 3827 5100 5782 3200 4737 4468 3756 7010 4020 2709 5197 4629 4549 3842 4400 77 43 5084 * 339 2255 * * 9552 2903 0 T 78 4675 * 5783 7115 5588 7072 6879 6039 6487 4969 * 3694 * 6930 5628 2568 920 5923 * 5569 78 45 5478 6934 1386 696 * * 9552 2034 0 A 79 1955 5014 * 6921 * * * 6707 * 5085 6835 * 1023 * * 3876 5446 4194 * 5851 79 0 * * * * 0 * 9549 0 1000 F 80 4618 * * * 4486 * * 2580 6058 693 5897 * * * * 6487 * 4030 * 5342 80 11 7037 * 0 * * * 9552 1000 0 D 81 7047 6654 4305 4637 4337 6893 1491 4507 7038 5261 2935 5038 6681 3491 6324 4322 5646 5521 * 4782 81 0 * * * * * * 9552 0 0 I 82 4424 4984 5856 5930 4945 * 4316 2865 5751 2262 3666 * * 5374 4843 4948 5505 3851 4800 2798 82 0 * * * * * * 9552 0 0 S 83 297 4455 * * * 6228 * 6310 * 5582 * * * * * 4181 5624 6681 * 6878 83 9 7254 * 3000 193 * * 9552 1000 0 I 84 1897 2992 * 5737 6999 6942 * 3048 5387 4048 5260 5727 * * 5350 4485 4940 2239 * 7085 84 0 * * * * * * 9552 0 0 D 85 4168 5166 5419 2777 4592 5515 5523 4698 3420 3278 5401 4380 * 3405 3519 3644 4921 7061 7037 4450 85 0 * * * * * * 9552 0 0 N 86 5934 5265 5202 4056 4516 4750 3278 5976 4210 4178 5096 2410 * 4476 4024 3608 4311 * 6591 3400 86 0 * * * * * * 9552 0 0 G 87 5005 6625 3434 4551 * 1437 6920 * 3684 5793 6946 2274 * 4441 4564 4672 7017 * * * 87 22 6041 * 1521 618 * * 9546 1803 0 N 88 5389 7123 3279 5557 4213 * 2097 * 3923 5464 * 2130 * 3361 3919 5463 6625 * * 4510 88 0 * * * * * * 9546 0 0 E 89 5235 * 5933 3712 3762 * 4874 4287 3914 2791 4911 6021 3505 6625 5351 6007 3069 3313 5438 3624 89 0 * * * * * * 9546 0 0 D 90 4923 * 1987 1650 * 5074 5847 * 3203 6476 * 4030 6132 3850 4982 5374 * 5118 * * 90 21 6099 * 0 * * * 9546 1681 0 L 91 3398 3405 * * 4450 * * 1585 * 3495 3544 * * * * 6573 3360 2743 * * 91 0 * * * * * * 9504 0 0 A 92 2752 6563 * 7077 5038 * * 2905 * 3152 5090 * * * 5868 6466 4609 1179 * 5905 92 20 6169 * 0 * * * 9499 1673 0 E 93 4164 * 3788 1834 6847 6027 * * 1920 6011 * 4996 * 3285 3094 5860 5703 * * * 93 12 6885 * 0 * * * 9487 1000 0 I 94 4807 5831 * 5751 2927 * 7095 2859 5587 1949 4099 * * 5716 * 7011 5661 4568 6730 2216 94 0 * * * * * * 9475 0 0 L 95 * * * * 5934 * * * * 24 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 9107 0 0 Q 96 * * * 2124 * * * * 2735 * * * * 1128 2618 * * * * * 96 0 * * 0 * * * 5292 0 0 //