HHsearch 1.5 NAME c2wq4B_ FAM FILE c2wq4B_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2wq4B_.a3m DATE Sat Aug 28 17:46:51 2010 LENG 130 match states, 130 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.3813 -2.3134 SEQ >ss_dssp CEEEEEESCCCCBCCSSCEEEEEEEEETTTTTCCSSEEEEEEEECSCEEECSSSCEEEEEEEETTEEEEEEEEECSSSSCSSCCCCCEEEEEEEECCTTC CEEEEEEEEETTCEEECCSCEEEEEEEECC >sa_dssp EECECDBEEBEEDEBEECDDADEADBDADEDEBDECDADACACACDACADCEDDAAADAAAABDEDDDCDCDBDBEEDECEECDDCEBECDBDBEBDEDB DBACABACBBDEACABBDCDABACBDDCEE >ss_pred CCEEEEEECCCCEECCCEEECCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEECEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCE EEEEEEEECCCCCCEEECCCEEEEEEEECC >ss_conf 9023332138511034345447258883003688850789983477624678888616999842635741214402307643688747899999713882 588764302435711101311223222039 >Consensus xxxxasixsxpxxtsxxyvdipglxldvxkxxxxxxxxxxilniptpyasgnnfpgxxfaixtxqgxxaxgxftysskipexsgrmpftlvaxxxxxsxv sxikxqwxxirgsxvhidsyasxsavwgta >c2wq4B_ PLLSASIVSAPVVTSETYVDIPGLYLDVAKAGIRDGKLQVILNVPTPYATGNNFPGIYFAIATNQGVVADGCFTYSSKVPESTGRXPFTLVATIDVGSGV TFVKGQWKSVRGSAXHIDSYASLSAIWGTA >UniRef50_Q7MZP1(1-132:139) Hypothetical membrane protein n=1 Tax=Photorhabdus luminescens subsp. laumondii RepID=Q7MZP1_PHOLL E=1e-48 s/c=1.43 id=57% cov=98% SIVFASIdpRSNPLQTsSQNYVDIPGLKLDVSKYSNSPCLTALItLNIPTPYASGNNFPGGNFAIVTDQGeQLAYGGFTYSSKIPENSGRMPFTLVARYS LASNVSTIKAQWSNIRGSTVHIDSYASISAV---- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * P 1 * * * * * * * * * * * * 1023 * * 977 * * * * 1 0 * * * * * * 1324 0 0 L 2 * * * * * * * 977 * 1023 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1324 0 0 L 3 * * * * * * * * * 1023 * * * * * * * 977 * * 3 0 * * * * * * 1324 0 0 S 4 * * * * 977 * * * * * * * * * * 1023 * * * * 4 0 * * * * * * 1324 0 0 A 5 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1324 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 6 0 * * * * * * 1324 0 0 I 7 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 7 1023 977 * 1000 1000 * * 1324 1000 0 V 8 * * * * * * * * * * * * * * 977 * * 1023 * * 8 0 * * * * * * 1324 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1324 0 0 A 10 1023 * * * * * * * * * * 977 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1324 0 0 P 11 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1324 0 0 V 12 * * * * * * * * * 977 * * * * * * * 1023 * * 12 0 * * * * * * 1324 0 0 V 13 * * * * * * * * * * * * * 977 * * * 1023 * * 13 0 * * * * * * 1324 0 0 T 14 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 14 1023 977 * 0 * * * 1324 1000 0 S 15 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 15 0 * * * * * * 1324 0 0 E 16 * * * 1023 * * * * * * * * * 977 * * * * * * 16 0 * * * * * * 1324 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * 977 * * * * 1023 * * * 17 0 * * * * * * 1324 0 0 Y 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 18 0 * * * * * * 1324 0 0 V 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 19 0 * * * * * * 1324 0 0 D 20 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1324 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1324 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1324 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1324 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1324 0 0 Y 25 * * * * * * * * 977 * * * * * * * * * * 1023 25 0 * * * * * * 1324 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1324 0 0 D 27 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1324 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 28 0 * * * * * * 1324 0 0 A 29 1023 * * * * * * * * * * * * * * 977 * * * * 29 0 * * * * * * 1324 0 0 K 30 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1324 0 0 A 31 1023 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 977 31 0 * * * * * * 1324 0 0 G 32 * * * * * 1023 * * * * * * * * * 977 * * * * 32 0 * * * * * * 1324 0 0 I 33 * * * * * * * 1023 * * * 977 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1324 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 1023 977 * * * * 34 0 * * * * * * 1324 0 0 D 35 * * 1023 * * * * * * * * * 977 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1324 0 0 G 36 * 977 * * * 1023 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1324 0 0 K 37 * * * * * * * * 1023 977 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1324 0 0 L 38 * * * * * * * * * 1023 * * * * * * 977 * * * 38 0 * * * * * * 1324 0 0 Q 39 977 * * * * * * * * * * * * 1023 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1324 0 0 V 40 * * * * * * * * * 977 * * * * * * * 1023 * * 40 0 * * * * * * 1324 0 0 I 41 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 41 1023 977 * 0 * * * 1324 1000 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1324 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1324 0 0 V 44 * * * * * * * 977 * * * * * * * * * 1023 * * 44 0 * * * * * * 1324 0 0 P 45 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1324 0 0 T 46 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 46 0 * * * * * * 1324 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1324 0 0 Y 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 48 0 * * * * * * 1324 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1324 0 0 T 50 * * * * * * * * * * * * * * * 977 1023 * * * 50 0 * * * * * * 1324 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1324 0 0 N 52 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1324 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1324 0 0 F 54 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1324 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1324 0 0 G 56 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1324 0 0 I 57 * * * * * 977 * 1023 * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1324 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * 977 * * * * * * * 1023 58 0 * * * * * * 1324 0 0 F 59 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1324 0 0 A 60 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1324 0 0 I 61 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1324 0 0 A 62 1023 * * * * * * * * * * * * * * * * 977 * * 62 0 * * * * * * 1324 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1324 0 0 N 64 * * 977 * * * * * * * * 1023 * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1324 0 0 Q 65 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 65 0 * * * * * * 1324 0 0 G 66 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 66 1023 977 * 0 * * * 1324 1000 0 V 67 * * * * * * * * * * * * * 977 * * * 1023 * * 67 0 * * * * * * 1324 0 0 V 68 * * * * * * * * * 977 * * * * * * * 1023 * * 68 0 * * * * * * 1324 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1324 0 0 D 70 * * 1023 * * * * * * * * * * * * * * * * 977 70 0 * * * * * * 1324 0 0 G 71 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1324 0 0 C 72 * 1023 * * * 977 * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1324 0 0 F 73 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1324 0 0 T 74 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 74 0 * * * * * * 1324 0 0 Y 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 75 0 * * * * * * 1324 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 76 0 * * * * * * 1324 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1324 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1324 0 0 V 79 * * * * * * * 977 * * * * * * * * * 1023 * * 79 0 * * * * * * 1324 0 0 P 80 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1324 0 0 E 81 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1324 0 0 S 82 * * * * * * * * * * * 977 * * * 1023 * * * * 82 0 * * * * * * 1324 0 0 T 83 * * * * * * * * * * * * * * * 977 1023 * * * 83 0 * * * * * * 1324 0 0 G 84 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1324 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 85 0 * * * * * * 1324 0 0 X 86 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 P 87 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1324 0 0 F 88 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1324 0 0 T 89 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 89 0 * * * * * * 1324 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1324 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 91 0 * * * * * * 1324 0 0 A 92 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1324 0 0 T 93 * * * * * * * * * * * * * * 977 * 1023 * * * 93 0 * * * * * * 1324 0 0 I 94 * * * * * * * 1023 * * * * * * * * * * * 977 94 0 * * * * * * 1324 0 0 D 95 * * 1023 * * * * * * * * * * * * 977 * * * * 95 0 * * * * * * 1324 0 0 V 96 * * * * * * * * * 977 * * * * * * * 1023 * * 96 0 * * * * * * 1324 0 0 G 97 977 * * * * 1023 * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1324 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1324 0 0 G 99 * * * * * 1023 * * * * * 977 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1324 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1324 0 0 T 101 * * * * * * * * * * * * * * * 977 1023 * * * 101 0 * * * * * * 1324 0 0 F 102 * * * * 1023 * * * * * * * * * * * 977 * * * 102 0 * * * * * * 1324 0 0 V 103 * * * * * * * 977 * * * * * * * * * 1023 * * 103 0 * * * * * * 1324 0 0 K 104 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1324 0 0 G 105 977 * * * * 1023 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1324 0 0 Q 106 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1324 0 0 W 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 107 0 * * * * * * 1324 0 0 K 108 * * * * * * * * 1023 * * * * * * 977 * * * * 108 0 * * * * * * 1324 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * 977 * * * 1023 * * * * 109 0 * * * * * * 1324 0 0 V 110 * * * * * * * 977 * * * * * * * * * 1023 * * 110 0 * * * * * * 1324 0 0 R 111 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 111 0 * * * * * * 1324 0 0 G 112 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1324 0 0 S 113 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 113 0 * * * * * * 1324 0 0 A 114 1023 * * * * * * * * * * * * * * * 977 * * * 114 0 * * * * * * 1324 0 0 X 115 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 H 116 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1324 0 0 I 117 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1324 0 0 D 118 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1324 0 0 S 119 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 119 0 * * * * * * 1324 0 0 Y 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 120 0 * * * * * * 1324 0 0 A 121 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1324 0 0 S 122 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 122 0 * * * * * * 1324 0 0 L 123 * * * * * * * 977 * 1023 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1324 0 0 S 124 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 124 0 * * * * * * 1324 0 0 A 125 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1324 0 0 I 126 * * * * * * * 1023 * * * * * * * * * 977 * * 126 0 * * * * * * 1324 0 0 W 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 127 0 * * * * * * 1000 0 0 G 128 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1000 0 0 T 129 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 129 0 * * * * * * 1000 0 0 A 130 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 130 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //