HHsearch 1.5 NAME c2uuxA_ FAM FILE c2uuxA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2uuxA_.a3m DATE Wed Jan 9 18:26:24 2013 LENG 55 match states, 55 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4546 1.7057 SEQ >ss_dssp CCCCCCCTTCCCCCCCCCSCCEEEEEECSSSEEEEEESCCSSBSSHHHHHTTSCC >sa_dssp EEEBECCEEEEECEEDEDEDEDDCCBCBCECCCEBEBCBEDDDDDDCCADEEBEE >ss_pred CCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHCCCCHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9722002000000446888775555211782312221011640007778861797 >Consensus aaectvpxxxxxpxkglckaxfsrxyxxgnxckxyxgcyxggxxxxxxcxxxcxg >c2uuxA_ AAECTVPIGWSEPVKGLCKARFTRYYCMGNCCKVYEGCYTGGYSRMGECARNCPG >UniRef50_C9W1S6(67-116:136) Thrombin inhibitor (Fragment) n=1 Tax=Rhipicephalus sanguineus RepID=C9W1S6_RHISA E=2e-11 s/c=1.41 id=48% cov=91% ------PLCRQRPKKGLCKALFSRWYFSGNgRCKLYQGCYHGGFNTYSQCKNKCGG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 C 4 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 P 7 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1424 0 0 I 8 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1424 0 0 G 9 * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1424 0 0 W 10 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * 10 0 * * * * * * 1424 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * 11 0 * * * * * * 1424 0 0 E 12 * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 12 0 * * * * * * 1424 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1424 0 0 V 14 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * 14 0 * * * * * * 1424 0 0 K 15 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1424 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1424 0 0 L 17 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1424 0 0 C 18 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1424 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1424 0 0 A 20 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1424 0 0 R 21 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 21 0 * * * * * * 1424 0 0 F 22 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1424 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 23 0 * * * * * * 1424 0 0 R 24 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 24 0 * * * * * * 1424 0 0 Y 25 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 25 0 * * * * * * 1424 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 26 0 * * * * * * 1424 0 0 C 27 * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1424 0 0 M 28 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * 28 0 * * * * * * 1424 0 0 G 29 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1424 0 0 N 30 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 30 1000 1000 * 0 * * * 1424 1000 0 C 31 * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 31 0 * * * * * * 1424 0 0 C 32 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1424 0 0 K 33 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1424 0 0 V 34 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 34 0 * * * * * * 1424 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1424 0 0 E 36 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 36 0 * * * * * * 1424 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1424 0 0 C 38 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1424 0 0 Y 39 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 39 0 * * * * * * 1424 0 0 T 40 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * 40 0 * * * * * * 1424 0 0 G 41 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1424 0 0 G 42 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1424 0 0 Y 43 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 43 0 * * * * * * 1424 0 0 S 44 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 44 0 * * * * * * 1424 0 0 R 45 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * 45 0 * * * * * * 1424 0 0 M 46 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 46 0 * * * * * * 1424 0 0 G 47 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 47 0 * * * * * * 1424 0 0 E 48 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1424 0 0 C 49 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1424 0 0 A 50 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1424 0 0 R 51 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 51 0 * * * * * * 1424 0 0 N 52 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1424 0 0 C 53 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1424 0 0 P 54 * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1424 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * 0 * * * 1424 0 0 //