HHsearch 1.5 NAME c2n99A_ FAM FILE c2n99A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2n99A_.a3m DATE Fri Feb 10 00:38:39 2017 LENG 76 match states, 76 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4905 2.9689 SEQ >ss_dssp CCEEECCCCTTTCCCEEECCSSCCEEEEEEECCSCSCCSSCEEEEEEESSCCCCGGGTTSSSCEEEEESSTTTTCC >sa_dssp ECEABCBEAEDDDEEDCEBEEEADCAACADBDCEDEECEDDBCCBCBDECDCEEDEDCECDEDECDCCEEDDCBEE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCC >ss_conf 9432125554310010007788852466310012331010245555524888874216577035677610010379 >Consensus xxxchqcxgfggcxhxsrcxrxsxxcvsxatrvxxxxxdlplvtkxcxxgcpdipslglgpxvsixccqxslcnxd >c2n99A_ MIWCHQCTGFGGCSHGSRCLRDSTHCVTTATRVLSNTEDLPLVTKMCHIGCPDIPSLGLGPYVSIACCQTSLCNHD >UniRef50_D2HHG7(1-129:129) Putative uncharacterized protein (Fragment) n=2 Tax=Eutheria RepID=D2HHG7_AILME E=6e-49 s/c=1.09 id=65% cov=101% ALNCHQCKGFGGCLHASRCPRGSNYCVSIATRVPFSVIDLPLVTKSCYSGCPDVPTLGLGPHVSIVCCQFSLCNTD # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1268 0 0 I 2 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1268 0 0 W 3 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * 3 0 * * * * * * 1268 0 0 C 4 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1268 0 0 H 5 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1268 0 0 Q 6 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1268 0 0 C 7 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1268 0 0 T 8 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 8 0 * * * * * * 1268 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1268 0 0 F 10 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1268 0 0 G 11 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1268 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1268 0 0 C 13 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1268 0 0 S 14 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 14 0 * * * * * * 1268 0 0 H 15 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1268 0 0 G 16 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1268 0 0 S 17 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 17 0 * * * * * * 1268 0 0 R 18 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 18 0 * * * * * * 1268 0 0 C 19 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1268 0 0 L 20 * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1268 0 0 R 21 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 21 0 * * * * * * 1268 0 0 D 22 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1268 0 0 S 23 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 23 0 * * * * * * 1268 0 0 T 24 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 24 0 * * * * * * 1268 0 0 H 25 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 25 0 * * * * * * 1268 0 0 C 26 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1268 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1268 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 28 0 * * * * * * 1268 0 0 T 29 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 29 0 * * * * * * 1268 0 0 A 30 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1268 0 0 T 31 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 31 0 * * * * * * 1268 0 0 R 32 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 32 0 * * * * * * 1268 0 0 V 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 33 0 * * * * * * 1268 0 0 L 34 * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1268 0 0 S 35 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 35 0 * * * * * * 1268 0 0 N 36 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 36 0 * * * * * * 1268 0 0 T 37 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 37 0 * * * * * * 1268 0 0 E 38 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1268 0 0 D 39 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1268 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1268 0 0 P 41 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1268 0 0 L 42 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1268 0 0 V 43 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 43 0 * * * * * * 1268 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 44 0 * * * * * * 1268 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1268 0 0 M 46 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * 46 0 * * * * * * 1268 0 0 C 47 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1268 0 0 H 48 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 48 0 * * * * * * 1268 0 0 I 49 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * 49 0 * * * * * * 1268 0 0 G 50 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1268 0 0 C 51 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1268 0 0 P 52 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1268 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1268 0 0 I 54 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 54 0 * * * * * * 1268 0 0 P 55 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1268 0 0 S 56 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 56 0 * * * * * * 1268 0 0 L 57 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1268 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1268 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1268 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1268 0 0 P 61 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1268 0 0 Y 62 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 62 0 * * * * * * 1268 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1268 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 64 0 * * * * * * 1268 0 0 I 65 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1268 0 0 A 66 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 66 0 * * * * * * 1268 0 0 C 67 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1268 0 0 C 68 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1268 0 0 Q 69 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 69 0 * * * * * * 1268 0 0 T 70 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 70 0 * * * * * * 1268 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1268 0 0 L 72 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1268 0 0 C 73 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1268 0 0 N 74 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1268 0 0 H 75 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * 75 0 * * * * * * 1268 0 0 D 76 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * 0 * * * 1268 0 0 //