HHsearch 1.5 NAME c2n8kA_ FAM FILE c2n8kA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2n8kA_.a3m DATE Thu Feb 9 18:54:09 2017 LENG 76 match states, 76 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4685 1.5981 SEQ >ss_dssp CEEETTEEECSSEEEECCCCSSSSCCCEEEECBCTTSBCCSSCCSSSCBSSSCCBCSSEEEEECSSSSCEEEEECC >sa_dssp EDEBDEEECEDECBBACECEEDEEEDBEDDEDBEDECCBDEECDEEDCBEEDABCDDEBDCDEECEEEDCDACDEE >ss_pred CCEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEECCCCCCEEECCCC >ss_conf 9000550067884444167778666710011110288000142137820001788788500004886511201359 >Consensus svtcgGfdCkngtCCvqxsdGkgkdsrtCxxLgkxxxxCxxxpikgGiYxxHCPCxpGlxCtkvgepnklrcqees >c2n8kA_ SVTCGGKQCKPNSCCVQNSHGKGKDSPRCHPLGKLNNPCEVEPNENGIYSQHCPCGEGLSCTKVGEPNKLRCQEES >UniRef50_B7P9I7(51-103:110) Secreted protein, putative n=1 Tax=Ixodes scapularis RepID=B7P9I7_IXOSC E=9e-15 s/c=1.53 id=46% cov=71% -----GFDCKNGTCCVQSSD---KDSRTCENLGRFGQVCSEDPIKGGIYTDHCPCKPGDRC--------------- >UniRef50_B7P383(28-81:107) Secreted protein, putative n=5 Tax=Ixodes scapularis RepID=B7P383_IXOSC E=0.0002 s/c=0.87 id=33% cov=72% -----GFDCRNGTCCRKGKDG----NRTCRRLRKEDERCLDSAIKGGVYELHCPCFPGLECSR------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 T 3 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 C 4 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 G 5 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 G 6 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1694 0 0 K 7 * * * * 706 * * * 1370 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1694 0 0 Q 8 * * 706 * * * * * * * * * * 1370 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1694 0 0 C 9 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1694 0 0 K 10 * * * * * * * * 547 * * * * * 1664 * * * * * 10 0 * * * * * * 1694 0 0 P 11 * * * * * * * * * * * 706 1370 * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1694 0 0 N 12 * * * * * 706 * * * * * 1370 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1694 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 1370 706 * * * 13 0 * * * * * * 1694 0 0 C 14 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1694 0 0 C 15 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1694 0 0 V 16 * * * * * * * * * * * * * * 1664 * * 547 * * 16 0 * * * * * * 1694 0 0 Q 17 * * * * * * * * 1664 * * * * 547 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1694 0 0 N 18 * * * * * 1664 * * * * * 1370 * * * 1748 * * * * 18 0 * * * * * * 1694 0 0 S 19 * * * * * * * * 1664 * * * * * * 547 * * * * 19 0 * * * * * * 1694 0 0 H 20 * * 706 * * * 1370 * * * * * * * * * * * * * 20 510 * 1748 * * * * 1694 0 0 G 21 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 21 904 * 1103 * * * 0 1535 0 1000 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * 0 1000 0 1361 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * 974 1027 1000 0 1361 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * 0 1413 0 1000 D 25 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * 0 * 1413 0 1000 S 26 * * * * * * * * * * * 1664 * * * 547 * * * * 26 0 * * * * * * 1694 0 0 P 27 * * * * * * * * * * * * 1370 * 706 * * * * * 27 0 * * * * * * 1694 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 1370 * 706 * * * 28 0 * * * * * * 1694 0 0 C 29 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1694 0 0 H 30 * * * 1748 * * 1370 * * * * * * * 1664 * * * * * 30 0 * * * * * * 1694 0 0 P 31 * * * * * * * * * * * 1748 1370 * 1664 * * * * * 31 0 * * * * * * 1694 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1694 0 0 G 33 * * * * * 547 * * * * * * * * 1664 * * * * * 33 0 * * * * * * 1694 0 0 K 34 * * * * * * * * 510 * * * * * 1748 * * * * * 34 0 * * * * * * 1694 0 0 L 35 * * * 1664 1748 * * * * 1370 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1694 0 0 N 36 * * 1664 * * 1748 * * * * * 1370 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1694 0 0 N 37 * * * 1664 * * * * * * * 1370 * 1748 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1694 0 0 P 38 * * * * * * * * * * * * 1370 * 1664 * * 1748 * * 38 0 * * * * * * 1694 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1694 0 0 E 40 * * * 1370 * * * * * 1664 * * * * * 1748 * * * * 40 0 * * * * * * 1694 0 0 V 41 * * 1664 1748 * * * * * * * * * * * * * 1370 * * 41 0 * * * * * * 1694 0 0 E 42 * * 1748 1370 * * * * * * * * * * * 1664 * * * * 42 0 * * * * * * 1694 0 0 P 43 1664 * * * * * * * * * * * 547 * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1694 0 0 N 44 * * * * * * * 706 * * * 1370 * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1694 0 0 E 45 * * * 1370 * * * * 706 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1694 0 0 N 46 * * * * * 706 * * * * * 1370 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1694 0 0 G 47 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1694 0 0 I 48 * * * * * * * 547 * * * * * * * * * 1664 * * 48 0 * * * * * * 1694 0 0 Y 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 49 0 * * * * * * 1694 0 0 S 50 * * * 1664 * * * * * * * * * * * 1370 1748 * * * 50 0 * * * * * * 1694 0 0 Q 51 * * 1748 * * * * * * 1664 * * * 1370 * * * * * * 51 0 * * * * * * 1694 0 0 H 52 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1694 0 0 C 53 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1694 0 0 P 54 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1694 0 0 C 55 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1694 0 0 G 56 * * * * 1664 1370 * * 1748 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1694 0 0 E 57 * * * 1370 * * * * * * * * 706 * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1694 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1694 0 0 L 59 * * 1748 * * * * * * 510 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1694 0 0 S 60 * * * 1664 * * * * * * * * * * 1748 1370 * * * * 60 0 * * * * * * 1694 0 0 C 61 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1694 0 0 T 62 * * * * * * * * * * * * * * * 1103 904 * * * 62 0 * * * * * * 1535 0 0 K 63 * * * * * * * * 904 * * * * * 1103 * * * * * 63 0 * * * * * * 1535 0 0 V 64 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 G 65 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 P 67 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 N 68 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 K 69 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 L 70 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 R 71 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 C 72 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 73 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 E 74 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 76 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //