HHsearch 1.5 NAME c2mvbA_ FAM FILE c2mvbA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2mvbA_.a3m DATE Sat Nov 8 08:16:48 2014 LENG 165 match states, 165 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4454 0.7667 SEQ >ss_dssp CCCCCCCCCCCCCCCCCCSCCCCCCCEEEEEBCCBCSSSCBCCEEEEESSSSEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHTS TTEEEEEEEEETTEEEEEEEECTTTCCHHHHTSBTTBTSSCHHHHHTSCTTHHHHHHHTTTCBCC >sa_dssp EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCADCDECEEDCDBCBCACBDEEEADBABCCCDDDCDEEDDECCEEDCEEDADECBDECBEEDECBEDAEEB EBADBDBCBDDCECBCBCBCADBDEBECEDADEBEDAEECCBEEBDECDACEBBEDCEEDEAECE >ss_pred CCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC CCCEEEEEEECHHHHHHEEEECCEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCC >ss_conf 9864012555531285201532220343456421167884103579754843776764311489489999998529899999999876301436766256 77414889810001001000000112188865336665048478860699999999841441349 >Consensus xxxxxxxkxxlxxxlpiixnaxkxxvvtktlvxpkxexgxqqxqtiTYqxkxflxLxiexltxxxdExkxaixqxgxEExqxxlxexxexDxxyvxakxL xGfxxxxxilxexeLqtxtxxDfQxldVekaaxxxxxqxlgLkellkxtPexyIxxxllNGakEe >c2mvbA_ GPATKTEKDTLQSALPVIENAEKNTVVTKTLVLPKSDDGSQQTQTITYKDKTFLSLAIQQKRPVSDELKTYIDQHGVEETQKALLEAEEKDKSIIEARKL AGFKLETKLLSATELQTTTSFDFQVLDVKKASQLEHLKNIGLENLLKNEPSKYISDRLANGATEQ >UniRef50_A3CR00(27-189:190) Conserved uncharacterized protein n=1 Tax=Streptococcus sanguinis SK36 RepID=A3CR00_STRSV E=7e-55 s/c=1.31 id=39% cov=99% --SNAADKKEISNNLPIIDNAKQQEVITRTLVFPKDERGNQQSQTVTYQGEHFKRLVIERLTTTDDEMKEAIKQMGLEEAQKSLNESLEQDADYVQARGL QGFSGSVTILNENELKMTSTYDFESLDIEKAAAMPYFQNLKLKEMIKLTPEEYINNLLMNGAEEQ >UniRef50_A8AZT1(33-190:190) Lipoprotein, putative n=2 Tax=Streptococcus RepID=A8AZT1_STRGC E=4e-46 s/c=1.17 id=48% cov=96% -------EDKLDTTLPIISNAEKNTVVTKTLVFPKTENGSQQKQVVTYKDEQFLSLSIEQVSPNADDLKQAIKEYGVEEAQAVLNRSLEADEHYQQVKDL PGFSMSLQILNENELKRVTNLDFQTLDVDKAAETEYLKALKLKELLKMNPAQYVENQLLNGAKEE >UniRef50_A3CQ94(62-199:202) Conserved uncharacterized protein n=1 Tax=Streptococcus sanguinis SK36 RepID=A3CQ94_STRSV E=4e-11 s/c=0.50 id=23% cov=74% --------------------------------------------TITYQGKKILNLRMELLTSLPEEASAASATLTPEEMTTIIREGMQSDSNYVAAKSL EGVNIDYSVTADKKLQTLIEIDLQKVNVEEVEKNSFFQGFGLKDIKDITPEMFILSLKLNGLKEE # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 3 0 * * * * * * 1523 0 0 T 4 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 4 0 * * * * * * 1523 0 0 K 5 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1523 0 0 T 6 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 6 0 * * * * * * 1523 0 0 E 7 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1523 0 0 K 8 * * * 1653 * * * * 552 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1729 0 0 D 9 * * 596 * * * * * 1562 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1729 0 0 T 10 * * * 1562 * * * * 1653 * * * * * * * 1542 * * * 10 0 * * * * * * 1729 0 0 L 11 * * * * * * * 1562 * 596 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1729 0 0 Q 12 * * 1653 * * * * * * * * * * 1542 * 1562 * * * * 12 0 * * * * * * 1729 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * 1562 * * * 1542 1653 * * * 13 0 * * * * * * 1729 0 0 A 14 1542 * * * * * * * * * * 1562 * * * * 1653 * * * 14 0 * * * * * * 1729 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1729 0 0 P 16 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1729 0 0 V 17 * * * * * * * 607 * * * * * * * * * 1542 * * 17 0 * * * * * * 1729 0 0 I 18 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1729 0 0 E 19 * * 1562 1542 * * * * * * * * * * * 1653 * * * * 19 0 * * * * * * 1729 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1729 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1729 0 0 E 22 * * * 596 * * * * 1562 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1729 0 0 K 23 * * * * * * * * 596 * * * * 1562 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1729 0 0 N 24 * * * * * * * * * * * 596 * 1562 * * * * * * 24 0 * * * * * * 1729 0 0 T 25 * * * 1562 * * * * * * * * * * * * 596 * * * 25 0 * * * * * * 1729 0 0 V 26 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 26 0 * * * * * * 1729 0 0 V 27 * * * * * * * 1562 * * * * * * * * * 596 * * 27 0 * * * * * * 1729 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1729 0 0 K 29 * * * * * * * * 596 * * * * * 1562 * * * * * 29 0 * * * * * * 1729 0 0 T 30 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 30 0 * * * * * * 1729 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1729 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1729 0 0 L 33 * * * * 607 * * * * 1542 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1729 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1729 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1729 0 0 S 36 * * 1562 * * * * * * * * * * * * 1542 1653 * * * 36 0 * * * * * * 1729 0 0 D 37 * * 1542 607 * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1729 0 0 D 38 * * 1542 * * * * * * * * 1653 * * 1562 * * * * * 38 0 * * * * * * 1729 0 0 G 39 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1729 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * 1562 * * * 596 * * * * 40 0 * * * * * * 1729 0 0 Q 41 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1729 0 0 Q 42 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1729 0 0 T 43 * * * * * * * * 1653 * * * * * * 1562 1542 * * * 43 0 * * * * * * 1729 0 0 Q 44 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 44 0 * * * * * * 1729 0 0 T 45 * * * * * * * * * * * * * * * * 377 2120 * * 45 0 * * * * * * 2284 0 0 I 46 * * * * * * * 874 * * * * * * * * * 1137 * * 46 0 * * * * * * 2284 0 0 T 47 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 47 0 * * * * * * 2284 0 0 Y 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 48 0 * * * * * * 2284 0 0 K 49 * * * * * * * * 1069 * * * * 934 * * * * * * 49 0 * * * * * * 2284 0 0 D 50 * * 1069 * * 934 * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2284 0 0 K 51 * * * 1137 * * * * 874 * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2284 0 0 T 52 * * * * * * 2155 * 1742 * * * * 2120 * * 2020 * * * 52 0 * * * * * * 2284 0 0 F 53 * * * * 512 * * 1742 * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2284 0 0 L 54 * * * * * * * * 2155 367 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2284 0 0 S 55 * * * * * * * * * * * 1742 * * 2155 1069 * * * * 55 0 * * * * * * 2284 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2284 0 0 A 57 2020 * * * * * * * * * * * * * 1742 2120 * 2155 * * 57 0 * * * * * * 2284 0 0 I 58 * * * * * * * 512 * * 1742 * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 59 * * * 408 * * * * * * * * * 2020 * * * * * * 59 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 60 * * * * * * * * * 1742 * * * 1069 2155 * * * * * 60 0 * * * * * * 2284 0 0 K 61 * * * * * * * * 2020 934 * * * * * * * 2120 * * 61 0 * * * * * * 2284 0 0 R 62 * * * * * * * * * * * * * * 2020 2120 934 * * * 62 0 * * * * * * 2284 0 0 P 63 * * * * * * * * * * * * 1069 * * 1742 2155 * * * 63 0 * * * * * * 2284 0 0 V 64 * * * * * * * * * 1742 * 2120 * * * * 2155 2020 * * 64 0 * * * * * * 2284 0 0 S 65 2120 * 2155 * * * * * * * * * 1742 * * 2020 * * * * 65 0 * * * * * * 2284 0 0 D 66 * * 512 1742 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2284 0 0 E 67 * * 2120 377 * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2284 0 0 L 68 1742 * * * * * * * * 1069 2155 * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2284 0 0 K 69 * * * * * * * * 512 * * * * * * 1742 * * * * 69 0 * * * * * * 2284 0 0 T 70 1742 * * 2155 * * * * * * * * * 2120 * * 2020 * * * 70 0 * * * * * * 2284 0 0 Y 71 408 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2020 71 0 * * * * * * 2284 0 0 I 72 * * * * * * * 512 * * * * * * * 1742 * * * * 72 0 * * * * * * 2284 0 0 D 73 1742 * 2020 * * * * * 1137 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 74 * * * 2120 * * * * * * * * * 1086 * * 1742 * * * 74 0 * * * * * * 2284 0 0 H 75 * * * * * * 2020 * * 1742 2155 * * * * * * * * 2120 75 0 * * * * * * 2284 0 0 G 76 * * * * * 512 * * * * * * * * * * 1742 * * * 76 0 * * * * * * 2284 0 0 V 77 * * * * * * * * * 2155 * * 1742 * * * * 1069 * * 77 0 * * * * * * 2284 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2284 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2284 0 0 T 80 1137 * * * * * * * * * 1742 * * * * * 2020 * * * 80 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 81 * * * * * * * * * * * * * 512 * * 1742 * * * 81 0 * * * * * * 2284 0 0 K 82 2120 * * * * * * * 1086 * * * * * * * 1742 * * * 82 0 * * * * * * 2284 0 0 A 83 2020 * * * * * * 1742 * * * * * * * 2155 * 2120 * * 83 0 * * * * * * 2284 0 0 L 84 * * * * * * * 1742 * 512 * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2284 0 0 L 85 * * * * * * * * * 2020 * 1137 * * 1742 * * * * * 85 0 * * * * * * 2284 0 0 E 86 * * * 377 * * * * * * * * * * 2120 * * * * * 86 0 * * * * * * 2284 0 0 A 87 2020 * * * * 1742 * * * * * * * * * 1137 * * * * 87 0 * * * * * * 2284 0 0 E 88 * * * 2020 * * * * * 1137 1742 * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2284 0 0 E 89 * * * 512 * * * * * * * * * 1742 * * * * * * 89 0 * * * * * * 2284 0 0 K 90 2120 * * * * * * * 2020 * * * * 2155 * 1742 * * * * 90 0 * * * * * * 2284 0 0 D 91 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2284 0 0 K 92 2155 * * 2120 * * * * 2020 * * * * * * 1742 * * * * 92 0 * * * * * * 2284 0 0 S 93 * * 2155 * * * 2120 * * * * 1742 * * * 2020 * * * * 93 0 * * * * * * 2284 0 0 I 94 * * * * * * * 2020 * * * * * * * * * * * 408 94 0 * * * * * * 2284 0 0 I 95 * * * * * * * 2020 * * * * * 2120 * * * 934 * * 95 0 * * * * * * 2284 0 0 E 96 1742 * * 2020 * * * * * * * * * 1137 * * * * * * 96 0 * * * * * * 2284 0 0 A 97 377 * * * * * * * * * * * * * * * * 2120 * * 97 0 * * * * * * 2284 0 0 R 98 * * * * * * * * 919 * * * * * 1086 * * * * * 98 0 * * * * * * 2284 0 0 K 99 * * 2120 * * 2155 * * 2020 * * * * * * 1742 * * * * 99 0 * * * * * * 2284 0 0 L 100 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2284 0 0 A 101 2020 * * 1742 * * * * * * * * 2120 2155 * * * * * * 101 0 * * * * * * 2284 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2284 0 0 F 103 * * * * 512 * * * * * * * * * * * * 1742 * * 103 0 * * * * * * 2284 0 0 K 104 * * * * * * * * 2020 * * 1742 * * * 1137 * * * * 104 0 * * * * * * 2284 0 0 L 105 * * * * * 2155 * 1742 * 2020 2120 * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2284 0 0 E 106 * * 1742 2020 * * * * * * * * * * * 1137 * * * * 106 0 * * * * * * 2284 0 0 T 107 * * * * * * * * * 2120 * * * * * * 2020 2155 * 1742 107 0 * * * * * * 2284 0 0 K 108 * * * * * * * * 2020 * * * * 2120 * 1742 2155 * * * 108 0 * * * * * * 2284 0 0 L 109 * * * * * * * 1137 * 2020 * * * * * * * 1742 * * 109 0 * * * * * * 2284 0 0 L 110 * * * * * * * * * 512 * * * * * * 1742 * * * 110 0 * * * * * * 2284 0 0 S 111 1742 * * * * * * * * * * 1137 * * * 2020 * * * * 111 0 * * * * * * 2284 0 0 A 112 2020 * 1742 1137 * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2284 0 0 T 113 * * * * * * * * 1742 * * 1137 * * * * 2020 * * * 113 0 * * * * * * 2284 0 0 E 114 * * * 512 * * * * 1742 * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 2284 0 0 L 115 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 116 * * * * * * * * 1137 * * * * 874 * * * * * * 116 0 * * * * * * 2284 0 0 T 117 * * * * * * * * * * 2155 * * * 2120 * 874 * * * 117 0 * * * * * * 2284 0 0 T 118 * * * * * * * * * 1742 * * * * * * 1086 2120 * * 118 0 * * * * * * 2284 0 0 T 119 * * * * * * * 1742 * * * * * * * 2155 1069 * * * 119 0 * * * * * * 2284 0 0 S 120 * * * 1742 * * * * * * * 2120 * * * 2020 2155 * * * 120 0 * * * * * * 2284 0 0 F 121 * * * * 2020 * * 1742 * 2120 * * * * * * * * * 2155 121 0 * * * * * * 2284 0 0 D 122 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2284 0 0 F 123 * * * * 512 * * * * 1742 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 124 * * * 2155 * * * * * * * * * 367 * * * * * * 124 0 * * * * * * 2284 0 0 V 125 * * * * * * * * 1742 * * * * * * 2155 2120 2020 * * 125 0 * * * * * * 2284 0 0 L 126 * * * * * * * * * 512 * * * * * * * 1742 * * 126 0 * * * * * * 2284 0 0 D 127 * * 512 * * * * * * * * 1742 * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2284 0 0 V 128 * * * * * * * 2155 * * * * * * * * * 367 * * 128 0 * * * * * * 2284 0 0 K 129 * * 2120 934 * * * * 2020 * * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 2284 0 0 K 130 * * * 1742 * * * * 512 * * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2284 0 0 A 131 512 * * * * * * * * * * * * * * * * 1742 * * 131 0 * * * * * * 2284 0 0 S 132 1137 * * 1742 * * * * * * * * * * * 2020 * * * * 132 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 133 2155 * * 2120 * * * * 1742 * * * * 2020 * * * * * * 133 0 * * * * * * 2284 0 0 L 134 * * * * * * * * * 2020 2155 1742 * * * * 2120 * * * 134 0 * * * * * * 2284 0 0 E 135 * * * 1069 * * * * * * * * 2155 * * 1742 * * * * 135 0 * * * * * * 2284 0 0 H 136 * * * * 1742 * 2020 * * * * * * * * * * * * 1137 136 0 * * * * * * 2284 0 0 L 137 * * * * 934 * * * * 1069 * * * * * * * * * * 137 0 * * * * * * 2284 0 0 K 138 * * * * * * * * 1069 * * * * 934 * * * * * * 138 0 * * * * * * 2284 0 0 N 139 2120 * * * * 1742 * * * * * 1086 * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 2284 0 0 I 140 * * * * 1742 * * 2020 * 1137 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2284 0 0 G 141 * * * * * 874 * * 1137 * * * * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2284 0 0 L 142 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 2284 0 0 E 143 * * * 2020 * * * * 408 * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 2284 0 0 N 144 * * 1742 1137 * * * * * * * 2020 * * * * * * * * 144 0 * * * * * * 2284 0 0 L 145 * * * * * * * 1742 * 1069 2155 * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 2284 0 0 L 146 * * * * * * * 2155 1742 1069 * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 2284 0 0 K 147 * * 1742 * * * * * 512 * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 2284 0 0 N 148 * * * * * * * 1742 * 2155 2120 2020 * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 2284 0 0 E 149 * * * 2020 * * * * * * * 2120 * * * * 934 * * * 149 0 * * * * * * 2284 0 0 P 150 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 150 0 * * * * * * 2284 0 0 S 151 2120 * * 934 * * * * * * * * * * * 2020 * * * * 151 0 * * * * * * 2284 0 0 K 152 * * * 2155 * * * * 2020 * 1742 * * 2120 * * * * * * 152 0 * * * * * * 2284 0 0 Y 153 * * * * 1742 * * * * * * * * * * * * * * 512 153 0 * * * * * * 2284 0 0 I 154 * * * * * * * 377 * * * * * * * * * 2120 * * 154 0 * * * * * * 2284 0 0 S 155 * * * 2120 * * * * * 1742 * 2155 * * * 2020 * * * * 155 0 * * * * * * 2284 0 0 D 156 * * 2020 * * * * * * * * 1137 * * * 1742 * * * * 156 0 * * * * * * 2284 0 0 R 157 * * * * * * * * * 934 * * * 2120 2020 * * * * * 157 0 * * * * * * 2284 0 0 L 158 * * * * * * * * 1742 512 * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 2284 0 0 A 159 2020 * * * * * * * * 919 2155 * * * * * * * * * 159 0 * * * * * * 2284 0 0 N 160 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 160 0 * * * * * * 2284 0 0 G 161 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 2284 0 0 A 162 512 * * * * * * * * 1742 * * * * * * * * * * 162 0 * * * * * * 2284 0 0 T 163 * * * 2155 * * * * 919 * * * * * * * 2020 * * * 163 0 * * * * * * 2284 0 0 E 164 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 2284 0 0 Q 165 * * * 919 * * * * * * * * * 1086 * * * * * * 165 0 * * 0 * * * 2284 0 0 //