HHsearch 1.5 NAME c2mraA_ FAM FILE c2mraA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2mraA_.a3m DATE Sat Sep 20 08:14:36 2014 LENG 117 match states, 117 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.3634 -2.8720 SEQ >ss_dssp CCSCSEEEEEEEESCCSSCCEEEEEEESSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECSS EEEEEEECCCCCCCCCC >sa_dssp EEDEDBDBBABBCCEEEEEDDDCEBEBEEDEDBDDCCDDBADDABDCAEDEBBDEACADBDBEDCEEDCEECBDEAADDAADCABEDDDCEEBDEEEDED DBBACAEADBEECEEEE >ss_pred CCCCEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCC EEEEEEEEEEHHCCCCC >ss_conf 9874369999998246888733789998611259999999999999998448517999998214771358889999999999999850853210443285 69999999960013479 >Consensus magkelrveIkixxxxDDxxxxxDxxxsxxxEaxelLkKVxxxxxDxIKKQGxKRVkIxxxxkgldddxrKxAxKxAlxvxxKixxELGxxxxxxTxDGD TxxVExxLElehhhhhh >c2mraA_ MAGKELRVEIKIDCGNDDKETTYDLYFSKAEEAKELLKKVAEKAADKIKKQGCKRVKIRFEKKGLDDDARKKAKKWALEVANKIANELGAKQSTTTTDGD TFEVEVILELEHHHHHH >UniRef50_UPI00006833D1(3-95:106) UPI00006833D1 related cluster n=2 Tax=unknown RepID=UPI00006833D1 E=0.0001 s/c=0.51 id=37% cov=80% --------DIQVQVNIDDNGKNFDYTYTVTTESE--LQKVLNELMDYIKKQGAKRVRISITAR-----TKKEAEKFA-AILIKVFAELGYNDINVTFDGD TVTVEGQLE-------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 A 2 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 V 8 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 E 9 * * 1119 890 * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1486 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1486 0 0 K 11 * * * * * * * * 890 * * * * 1119 * * * * * * 11 0 * * * * * * 1486 0 0 I 12 * * * * * * * 890 * * * * * * * * * 1119 * * 12 0 * * * * * * 1486 0 0 D 13 * * 890 * * * * * * * * * * 1119 * * * * * * 13 0 * * * * * * 1486 0 0 C 14 * 890 * * * * * * * * * * * * * * * 1119 * * 14 0 * * * * * * 1486 0 0 G 15 * * * * * 890 * * * * * 1119 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1486 0 0 N 16 * * * * * * * 1119 * * * 890 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1486 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1486 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1486 0 0 K 19 * * * * * * * * 890 * * 1119 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1486 0 0 E 20 * * * 890 * 1119 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1486 0 0 T 21 * * * * * * * * 1119 * * * * * * * 890 * * * 21 0 * * * * * * 1486 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * 1119 * * * * 890 * * * 22 0 * * * * * * 1486 0 0 Y 23 * * * * 1119 * * * * * * * * * * * * * * 890 23 0 * * * * * * 1486 0 0 D 24 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1486 0 0 L 25 * * * * * * * * * 890 * * * * * * * * * 1119 25 0 * * * * * * 1486 0 0 Y 26 * * * * * * * * * * * * * * * * 1119 * * 890 26 0 * * * * * * 1486 0 0 F 27 * * * * 890 * * * * * * * * * * * * * * 1119 27 0 * * * * * * 1486 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * * * * * 890 1119 * * * 28 0 * * * * * * 1486 0 0 K 29 * * * * * * * * 890 * * * * * * * * 1119 * * 29 0 * * * * * * 1486 0 0 A 30 890 * * * * * * * * * * * * * * * 1119 * * * 30 0 * * * * * * 1486 0 0 E 31 * * * 890 * * * * * * * * * * * * 1119 * * * 31 0 * * * * * * 1486 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1486 0 0 A 33 890 * * * * * * * * * * * * * * 1119 * * * * 33 0 * * * * * * 1486 0 0 K 34 * * * 1119 * * * * 890 * * * * * * * * * * * 34 890 * 1119 * * * * 1486 0 0 E 35 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * 0 1000 0 1000 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 L 37 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1486 0 0 K 38 * * * * * * * * 890 * * * * 1119 * * * * * * 38 0 * * * * * * 1486 0 0 K 39 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1486 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1486 0 0 A 41 890 * * * * * * * * 1119 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1486 0 0 E 42 * * * 890 * * * * * * * 1119 * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1486 0 0 K 43 * * * 1119 * * * * 890 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1486 0 0 A 44 890 * * * * * * * * 1119 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1486 0 0 A 45 890 * * * * * * * * * 1119 * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1486 0 0 D 46 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1486 0 0 K 47 * * * * * * * * 890 * * * * * * * * * * 1119 47 0 * * * * * * 1486 0 0 I 48 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1486 0 0 K 49 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1486 0 0 K 50 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1486 0 0 Q 51 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 51 0 * * * * * * 1486 0 0 G 52 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1486 0 0 C 53 1119 890 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1486 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1486 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1486 0 0 V 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 56 0 * * * * * * 1486 0 0 K 57 * * * * * * * * 890 * * * * * 1119 * * * * * 57 0 * * * * * * 1486 0 0 I 58 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1486 0 0 R 59 * * * * * * * * * * * * * * 890 1119 * * * * 59 0 * * * * * * 1486 0 0 F 60 * * * * 890 * * 1119 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1486 0 0 E 61 * * * 890 * * * * * * * * * * * * 1119 * * * 61 0 * * * * * * 1486 0 0 K 62 1119 * * * * * * * 890 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1486 0 0 K 63 * * * * * * * * 890 * * * * * 1119 * * * * * 63 890 * 1119 * * * * 1486 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * 0 1000 0 1000 L 65 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * 0 1000 0 1000 D 66 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * 0 1000 0 1000 D 67 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * 0 1000 0 1000 D 68 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 A 69 890 * * * * * * * * * * * * * * * 1119 * * * 69 0 * * * * * * 1486 0 0 R 70 * * * * * * * * 1119 * * * * * 890 * * * * * 70 0 * * * * * * 1486 0 0 K 71 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1486 0 0 K 72 * * * 1119 * * * * 890 * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1486 0 0 A 73 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1486 0 0 K 74 * * * 1119 * * * * 890 * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1486 0 0 K 75 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1486 0 0 W 76 * * * * 1119 * * * * * * * * * * * * * 890 * 76 0 * * * * * * 1486 0 0 A 77 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 890 * 1119 * * * * 1486 0 0 L 78 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 78 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 E 79 1119 * * 890 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1486 0 0 V 80 * * * * * * * 1119 * * * * * * * * * 890 * * 80 0 * * * * * * 1486 0 0 A 81 890 * * * * * * * * 1119 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1486 0 0 N 82 * * * * * * * 1119 * * * 890 * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1486 0 0 K 83 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1486 0 0 I 84 * * * * * * * 890 * * * * * * * * * 1119 * * 84 0 * * * * * * 1486 0 0 A 85 890 * * * 1119 * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1486 0 0 N 86 1119 * * * * * * * * * * 890 * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1486 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1486 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1486 0 0 G 89 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1486 0 0 A 90 890 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1119 90 0 * * * * * * 1486 0 0 K 91 * * * * * * * * 890 * * 1119 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1486 0 0 Q 92 * * 1119 * * * * * * * * * * 890 * * * * * * 92 0 * * * * * * 1486 0 0 S 93 * * * * * * * 1119 * * * * * * * 890 * * * * 93 0 * * * * * * 1486 0 0 T 94 * * * * * * * * * * * 1119 * * * * 890 * * * 94 0 * * * * * * 1486 0 0 T 95 * * * * * * * * * * * * * * * * 890 1119 * * 95 0 * * * * * * 1486 0 0 T 96 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 96 0 * * * * * * 1486 0 0 T 97 * * * * 1119 * * * * * * * * * * * 890 * * * 97 0 * * * * * * 1486 0 0 D 98 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1486 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1486 0 0 D 100 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1486 0 0 T 101 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 101 0 * * * * * * 1486 0 0 F 102 * * * * 890 * * * * * * * * * * * * 1119 * * 102 0 * * * * * * 1486 0 0 E 103 * * * 890 * * * * * * * * * * * * 1119 * * * 103 0 * * * * * * 1486 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1486 0 0 E 105 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1486 0 0 V 106 * * * * * 1119 * * * * * * * * * * * 890 * * 106 0 * * * * * * 1486 0 0 I 107 * * * * * * * 890 * * * * * 1119 * * * * * * 107 0 * * * * * * 1486 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1486 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1486 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 E 111 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 H 112 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 H 113 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 H 114 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 H 115 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 H 116 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 H 117 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //