HHsearch 1.5 NAME c2mpwA_ FAM FILE c2mpwA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2mpwA_.a3m DATE Sat Nov 15 08:15:19 2014 LENG 115 match states, 115 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4677 2.1875 SEQ >ss_dssp CCGGGSCCSSCSSSCHHHHHHHHEEEEECCTTCCHHHHHHHHTCCHHHHHHHHTTTSSSHHHHHTCCTTCEEEEECCCCSSSSCSSCCCCSCTTSSCCSS CCSSSCGGGSSSSCC >sa_dssp EEEEEEEEEEDEEEEEEEEDDEEEDDCDBEEECEBDDBBEEDECEEEDADCCADEEBEDEDDBEECDEEDEACABEEEEEEEEDEEEEEDEDEEEEEEEE EEEDEDDEEDEEEEE >ss_pred CCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHEEEEHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCC CCCCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9741024435774033204544248999605852121011234340211200233201567776417986688623318752112421046730003421 234466644474339 >Consensus xngenyfklgsdskllthnsyqnrlfytlktgetvadlsksqdinlstiwslnkhlyssesemmkaapgqqiilplkklpfeysalpllgsaplvaaggv aghtnxxxxxxxxxx >c2mpwA_ MNGENYFKLGSDSKLLTHNSYQNRLFYTLKTGETVADLSKSQDINLSTIWSLNKHLYSSESEMMKAAPGQQIILPLKKLPFEYSALPLLGSAPLVAAGGV AGHTNGSGSENLYFQ >UniRef50_P19809(1-253:939) Intimin n=231 Tax=Enterobacteriaceae RepID=EAE_ECO27 E=1e-137 s/c=0.78 id=90% cov=101% ANGENYFKLGSDSKLLTHNSYQNRLFYTLKTGETVADLSKSQDINLSTIWSLNKHLYSSESEMMKAAPGQQIILPLKKLPFEYSALPLLGSAPLVAAGGV AGHTNKLTKMSPDVT # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1069 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1069 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1069 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1069 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1069 0 0 Y 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 6 0 * * * * * * 1069 0 0 F 7 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1069 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1069 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1069 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1069 0 0 S 11 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 11 0 * * * * * * 1069 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1069 0 0 S 13 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 13 0 * * * * * * 1069 0 0 K 14 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1069 0 0 L 15 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1069 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1069 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 17 0 * * * * * * 1069 0 0 H 18 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1069 0 0 N 19 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1069 0 0 S 20 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 20 0 * * * * * * 1069 0 0 Y 21 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 21 0 * * * * * * 1069 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1069 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1069 0 0 R 24 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 24 0 * * * * * * 1069 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1069 0 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1069 0 0 Y 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 27 0 * * * * * * 1069 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1069 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1069 0 0 K 30 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1069 0 0 T 31 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 31 0 * * * * * * 1069 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1069 0 0 E 33 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1069 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 34 0 * * * * * * 1069 0 0 V 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 35 0 * * * * * * 1069 0 0 A 36 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1069 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1069 0 0 L 38 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1069 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1069 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1069 0 0 S 41 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 41 0 * * * * * * 1069 0 0 Q 42 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 42 0 * * * * * * 1069 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1069 0 0 I 44 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1069 0 0 N 45 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1069 0 0 L 46 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1069 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1069 0 0 T 48 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 48 0 * * * * * * 1069 0 0 I 49 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1069 0 0 W 50 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 50 0 * * * * * * 1069 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 51 0 * * * * * * 1069 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1069 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1069 0 0 K 54 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1069 0 0 H 55 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1069 0 0 L 56 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1069 0 0 Y 57 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 57 0 * * * * * * 1069 0 0 S 58 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 58 0 * * * * * * 1069 0 0 S 59 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 59 0 * * * * * * 1069 0 0 E 60 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1069 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 61 0 * * * * * * 1069 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1069 0 0 M 63 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1069 0 0 M 64 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1069 0 0 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1069 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1069 0 0 A 67 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1069 0 0 P 68 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1069 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1069 0 0 Q 70 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1069 0 0 Q 71 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 71 0 * * * * * * 1069 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1069 0 0 I 73 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1069 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1069 0 0 P 75 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1069 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1069 0 0 K 77 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1069 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1069 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1069 0 0 P 80 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1069 0 0 F 81 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1069 0 0 E 82 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1069 0 0 Y 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 83 0 * * * * * * 1069 0 0 S 84 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 84 0 * * * * * * 1069 0 0 A 85 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1069 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1069 0 0 P 87 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1069 0 0 L 88 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1069 0 0 L 89 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1069 0 0 G 90 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1069 0 0 S 91 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 91 0 * * * * * * 1069 0 0 A 92 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1069 0 0 P 93 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1069 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1069 0 0 V 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 95 0 * * * * * * 1069 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1069 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1069 0 0 G 98 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1069 0 0 G 99 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1069 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1069 0 0 A 101 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1069 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1069 0 0 H 103 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1069 0 0 T 104 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 104 0 * * * * * * 1069 0 0 N 105 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1069 0 0 G 106 * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1069 0 0 S 107 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 107 0 * * * * * * 1069 0 0 G 108 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 108 0 * * * * * * 1069 0 0 S 109 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 109 0 * * * * * * 1069 0 0 E 110 * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1069 0 0 N 111 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 111 0 * * * * * * 1069 0 0 L 112 * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1069 0 0 Y 113 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 113 0 * * * * * * 1069 0 0 F 114 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 114 0 * * * * * * 1069 0 0 Q 115 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * 115 0 * * 0 * * * 1069 0 0 //