HHsearch 1.5 NAME c2mp7A_ FAM FILE c2mp7A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2mp7A_.a3m DATE Sat May 31 08:16:30 2014 LENG 102 match states, 102 columns in multiple alignment FILT 103 out of 986 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 7.4 EVD 0.4766 -0.2409 SEQ >ss_dssp CCCCCCSCCCSEEEEEEECCCEEEESSCCBCCEEEEEETTTEEECCSSSSEEEESSTTTCEECTTSSSCCCEECSSCBCCEEEEEETTEEEEEEEEEECS CC >sa_dssp EEEDEEEDEEDCDDBDCDCDEDECEECDDBEBEBDADDDEEEEDCCBCDBDDEBEDEDABEBCDEDDEDBDADAECDDEBDBDBDBDEDDAEAEACAECE EE >ss_pred CEEEEEEECCEEEEEEECCCCCEECCCCEEEEEEEEEECCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEECCEEEEEEEEEEEC CC >ss_conf 9489998164778999857732973797399999999789976651020157776985699981677438999942514999999889868999999706 89 >Consensus xxixvxVxxxxlxxIxixpxxxxlxxGxsxqxxaxaxxsDgxxxdvtxxvxwxssnxxvaxvxxxxxxxGxvxxxxxGxtxItAxxxgxxxxxxvtVxxx xt >c2mp7A_ ENIDITVSAATLSSISISPINTNINTTVSKQFFAVGTYSDGTKADLTSSVTWSSSNQSQAKVSNASETKGLVTGIASGNPTIIATYGSVSGNTILTVNKT DT >UniRef50_A3CUU3(523-618:1279) Ig domain protein, group 2 domain protein n=1 Tax=Methanoculleus marisnigri JR1 RepID=A3CUU3_METMJ E=2e-08 s/c=0.63 id=21% cov=95% -TVTVSAEELVIDRIEVTSTTATLAIGETEAFTATVRDQFGSAMTGID-VEWASSNETVGTIDA----DGVFTALAEGTADVTATAENVTGEATVTVTAG AT >UniRef50_D2R348(230-320:894) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Pirellula staleyi DSM 6068 RepID=D2R348_9PLAN E=4e-08 s/c=0.65 id=20% cov=90% -------NEPACVKLEVFPPPSIYQPGDEQQLMVRAHYENGDVRDVTWLTQFFSNDLSVAEVSPG----GLVKMLRSGETVVRIHFQNHVEVMPLTIPFS AS >UniRef50_C2QAE0(553-649:1305) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Bacillus cereus R309803 RepID=C2QAE0_BACCE E=4e-05 s/c=0.51 id=20% cov=93% KSVNVTVkkSERKLTAINVYPNNNQiLLEGEQRPIYVVAMYDDGYTEYVTKESELIITDPEIVELNQMH-----VIAKKDGKTTLKVTYKGITLEETIVV EK--- >UniRef50_C9QFA3(134-238:781) Surface protein putative n=1 Tax=Vibrio orientalis CIP 102891 RepID=C9QFA3_VIBOR E=5e-06 s/c=0.50 id=22% cov=95% -SMTLVITPPIIKELSLESASTAITAGVPHILQVIATMSDGSQVNVTDNSTleWEVDQSGIAEITSSKGGI-VVTGIEKGEVSISVSANSFTSTIasnkT FTVI---- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * 2531 1898 * * * * 1900 * * * * 1782 * * * * * * 1 0 * * * * * * 5542 0 0 N 2 * * 5191 2894 * * * * 4907 * * 2295 5397 * 5226 1779 1948 * * * 2 0 * * * * * * 6392 0 0 I 3 4345 * * * 5307 5104 * 1757 5150 2793 5388 * * * * * 4005 1548 * * 3 0 * * * * * * 6591 0 0 D 4 4584 * 3768 3705 * 5671 5575 5853 3438 * * 5555 4003 3649 * 1483 3086 * 5703 * 4 0 * * * * * * 6825 0 0 I 5 * * * * 4397 * * 1776 * 2176 * * * * * * * 1187 * * 5 26 5792 * 0 * * * 7033 1000 0 T 6 * * 4257 3372 * * * 5156 3136 5659 * 3630 * 3169 4842 3740 1473 5173 * * 6 0 * * * * * * 7065 0 0 V 7 3843 * * 5712 * * * 2563 * 4991 * 6052 * * * * 6374 549 * * 7 43 6097 6052 1000 1000 * * 7086 1000 0 S 8 6116 * 4710 3655 * * * 4215 4600 5831 * 2656 5411 6223 4797 2925 2017 2957 * 5936 8 39 6278 6167 1585 585 0 * 7257 1000 1000 A 9 2808 * 3260 2899 6446 5209 * * 5235 * * 2769 2644 4317 * 3948 4003 3845 * * 9 45 6045 6008 2807 222 0 * 7389 1000 1000 A 10 1514 * 5470 4153 * 3603 * 4807 4493 6589 6377 * 2202 * 6297 4098 * 3559 * 6267 10 56 6097 5424 1585 585 0 * 7451 1000 1000 T 11 3941 * 6307 3587 6372 6116 * 4489 3727 6084 * 6523 4158 4111 4785 3225 2403 2180 * * 11 54 4774 * 1185 836 0 * 7459 2071 1780 L 12 4304 6276 * 6240 * * * 2284 * 1375 6082 * 5650 5479 * * 6424 1923 * * 12 17 * 6443 * * * * 7520 0 0 S 13 4708 * 4338 2557 * 6503 6695 4508 3070 4304 6825 5342 6322 3801 4567 4025 2651 2972 * * 13 0 * * * * 0 * 7517 0 1000 S 14 4011 * 3918 3639 * 3370 * * 3341 6699 6644 4026 * 4711 3520 1600 4325 6641 * * 14 15 * 6624 * * * * 7553 0 0 I 15 * * * * 6413 * * 1159 * 1497 * * * * * * * 2426 * * 15 13 6753 * 1000 1000 * 0 7604 1000 1000 S 16 3081 6304 5474 2853 * * 4388 2968 4621 6624 * 4828 * 2991 6476 2920 3471 3915 * 5567 16 0 * * * * * 0 7604 0 1000 I 17 5651 * * * 4219 * * 1658 * 1988 * * 6745 * * * * 1522 * * 17 0 * * * * 0 * 7604 0 1000 S 18 4972 * 5026 3436 4515 4948 6711 6423 6411 5132 6546 3993 * 4882 6824 1957 1989 4746 * 4490 18 46 6172 5837 0 * * * 7622 1000 0 P 19 4867 * * 4694 * 4640 * 6468 4834 5339 * 5326 790 4759 * 3170 4586 5434 * * 19 23 5968 * 3007 192 0 * 7591 1614 1617 I 20 3096 * 3190 3151 * 4743 5664 6725 3289 7111 * 3534 3513 5071 6405 2612 4204 4280 * * 20 0 * * * * * * 7605 0 0 N 21 4754 * 3642 2947 6820 5420 5746 6405 3094 5553 * 3075 4049 3828 5839 2863 3258 4536 * * 21 15 * 6643 * * * * 7605 0 0 T 22 2727 * 4470 5706 * 5829 5592 3058 4912 2658 5285 3789 4104 5684 4950 4181 3530 3741 * 6620 22 32 6558 6478 0 * 0 * 7603 1000 1000 N 23 3528 * 5461 2798 * * * 5078 5060 4439 * 4761 6450 4214 4829 2671 1968 3824 * 5601 23 42 5137 * 0 * * 0 7621 2220 1000 I 24 5390 * * * 3931 * * 2575 * 968 4195 * * * * * 6540 2785 * 5580 24 51 5181 7144 0 * * 0 7630 2132 1000 N 25 2382 * 4011 3564 6740 6755 6742 4389 3848 4786 * 3690 2690 5443 6276 3992 3708 5124 * 4516 25 105 4027 6827 0 * 959 1042 7633 3279 1577 T 26 3460 * * 3688 * * * 4232 2753 3024 6539 * 3782 5815 5224 5039 3884 1832 * * 26 14 6660 * 0 * 0 * 7628 1000 1549 T 27 5160 * 4785 5680 6386 499 * * 5820 * * 3390 6293 5779 * 6799 5793 * * 5281 27 0 * * * * * * 7619 0 0 V 28 4090 * 2735 2599 5450 3754 * 5560 4500 3686 6013 4621 * 2870 5850 4373 3601 4471 * * 28 10 7202 * 1000 1000 * * 7619 1000 0 S 29 4846 * 5137 4080 6556 5475 6853 * 4287 5421 6786 4567 6859 3729 5108 1669 2193 4237 * 6518 29 14 6729 * 0 * * * 7619 1000 0 K 30 4320 6107 6679 4666 4968 4761 5875 3816 4611 3265 5636 6447 * 2618 4004 5679 3652 2397 6386 5229 30 17 6386 * 1000 1000 * * 7619 1000 0 Q 31 3519 * 5237 4088 5709 6923 * 6859 4022 6406 6608 4662 5116 1138 4508 4316 3731 * 5981 * 31 15 6586 * 0 * * * 7619 1000 0 F 32 4704 * * 6472 2018 * * 3419 * 1440 6734 * 5591 * * * 6679 3469 * 3166 32 12 * 6909 * * * * 7619 0 0 F 33 4189 * 5455 4129 6731 6927 6500 4614 2817 4320 5382 4441 * 3877 3627 3502 2505 3786 * 4388 33 0 * * * * * 0 7618 0 1000 A 34 1103 6433 * * 6467 * * 4962 * 3881 6894 * * * * 5452 4699 1548 * * 34 0 * * * * * 0 7618 0 1000 V 35 5170 * 7020 4803 3883 * 6500 3656 3094 3856 5007 5852 * 5671 4573 4026 1951 3611 5533 4297 35 21 6099 * 1000 1000 * 0 7618 1000 1000 G 36 1200 * * 6327 6512 1784 * 3954 * 5374 6582 * * * * 5852 * 3022 * 6441 36 13 * 6780 * * * 0 7618 0 1000 T 37 5746 * 5016 4677 5089 6650 5723 3310 3350 3412 5812 4659 * 7016 4254 4108 2477 3091 * 3511 37 21 * 6100 * * 936 1067 7609 0 1553 Y 38 5700 * 3417 * 1926 * 6700 5964 * 4004 4662 * 3180 * 6554 5511 4355 6408 6672 1821 38 0 * * * * 633 1494 7623 0 2080 S 39 2812 * 3355 3783 6920 * * * 4417 6102 * 4794 5566 4088 * 1312 3730 5413 * * 39 31 6427 6748 0 * 0 * 7627 1000 1000 D 40 6311 * 668 6609 7057 6398 6988 * 4870 * * 2569 * * 6678 4897 4914 * * 4591 40 73 5120 5614 489 1799 * 0 7621 1750 1000 G 41 4081 6660 4551 4985 * 661 * * 4802 5559 * 3913 6942 5087 * 5900 6481 5377 * 6460 41 19 * 6261 * * 1383 697 7609 0 2139 T 42 5286 * 4968 3759 6258 * 5648 5497 3707 * * 5667 6777 3257 4720 1670 2725 4157 * 4507 42 28 6721 6720 0 * * 0 7592 1000 2063 K 43 5761 * 5098 4175 6640 6317 6605 5605 4245 5892 6775 4114 4280 3599 5098 2324 2361 3411 5202 5134 43 36 6242 6455 0 * * 0 7544 1000 2489 A 44 5775 * 4816 3534 5472 6314 5609 3259 2675 4091 5102 5603 5424 4604 2992 4063 4929 2952 * 5450 44 28 * 5681 * * 2269 335 7535 0 2815 D 45 * * 900 3905 * 6877 * 5585 4808 4715 * 3236 6630 6606 4679 5329 3912 5857 * 5634 45 47 6343 5665 0 * 1666 546 7526 1000 3143 L 46 5144 6326 5567 * 6822 4642 * 2212 6523 2324 * 5097 6818 6482 * * 6163 1381 6010 * 46 132 4619 4412 825 1200 2496 281 7522 2764 3131 T 47 4865 * 5631 6001 * 6396 * 5729 * 6176 6285 4994 6589 * * 2504 810 3983 * 5595 47 74 6282 4754 0 * 2136 373 7550 1000 3961 S 48 4113 * 2367 4178 6474 3462 4793 * 4436 * * 2804 4148 4231 3443 3815 3633 * 6326 * 48 41 * 5162 * * 1503 628 7513 0 4142 S 49 3460 * 3039 3116 4687 4402 6501 6594 3392 3036 * 4413 5173 3113 6614 3445 6918 4886 * 6267 49 65 5413 5608 1306 748 1313 743 7566 1652 4236 V 50 2141 * 5186 * * 4793 * 3377 * 6229 * * 6912 * * 2899 4601 1334 6988 6375 50 35 6375 6404 0 * 637 1486 7569 1000 3875 T 51 4534 * 3643 3764 5561 5893 5818 3984 3558 4430 6618 4016 * 3899 4277 3452 2684 4084 5668 4766 51 34 5417 * 1000 1000 1003 997 7517 1697 2666 W 52 * * 6820 * 3213 * 6006 4319 5741 5094 6553 5572 * * * 6285 6531 4517 869 3021 52 44 * 5070 * * 1000 1000 7567 0 1629 S 53 3862 * 6424 3352 3848 5491 * 4552 4394 4897 6235 5738 * 3733 4297 2215 2376 5094 6524 * 53 39 5898 6682 0 * 2079 390 7539 1000 2677 S 54 * * * * 6528 * * 4459 * 4956 6491 6343 * * * 943 2351 2759 5374 * 54 12 6911 * 2807 222 1006 994 7530 1000 2846 S 55 4127 * 2897 4172 * 3929 * * 4787 5357 6312 4254 6307 6790 5577 1371 3539 5019 5995 * 55 0 * * * * 949 1053 7608 0 1677 N 56 6297 * 1518 5087 * 5041 5151 * 5518 * * 1351 5396 5167 6828 3912 6717 * * * 56 14 6727 * 0 * * 0 7605 1000 1000 Q 57 4433 6487 4043 3184 6828 5715 * * 3676 5584 6686 5026 2105 4320 5205 2818 3141 4656 * * 57 12 * 6896 * * * 0 7605 0 1000 S 58 2761 * 2794 3597 * 3529 6711 * 3787 6437 * 2992 6562 5014 6699 2546 3359 * * * 58 16 6528 * 1000 1000 * 0 7609 1000 1573 Q 59 4989 * 6308 5971 6888 * * 1574 5421 3614 6711 6664 * 6723 6534 5110 4669 1386 * * 59 0 * * * * 1070 933 7609 0 1573 A 60 960 * 6463 * 6329 4125 * 3512 * 3780 * * * * 6850 * * 2084 * * 60 61 * 4584 * * 0 * 7624 0 1000 K 61 5341 * 4409 3583 5735 6625 4814 6698 3392 * * 4843 * 3569 * 2278 1877 4786 * 4585 61 16 * 6483 * * * 0 7590 0 2889 V 62 5684 * * 5947 4672 4951 * 1662 * 3790 6214 * 6243 * * * * 1119 * 5838 62 172 5241 3538 1019 982 * 0 7617 1766 3174 S 63 4633 * 2401 3757 5931 5423 * 4510 5674 * 6785 2794 6488 5657 5135 2237 3108 4253 * * 63 229 * 2769 * * * 0 7480 0 5001 N 64 3140 * 3893 3312 * 3119 * 6207 3925 5987 6162 2412 3102 4274 6120 4737 4977 4192 * * 64 133 * 3502 * * 2926 204 7450 0 5953 A 65 2770 * 3296 4276 * 4380 5051 5217 4013 4534 4543 3369 5884 5632 5950 2638 3053 * * 5992 65 410 * 2014 * * 3075 182 7426 0 5999 S 66 4293 * 4146 5932 * 1541 4801 4619 5042 4392 5569 3433 4539 * 6015 3907 4054 4610 * 4721 66 252 * 2644 * * 2630 254 7054 0 6575 E 67 4239 * 2082 2683 4613 3139 5463 4711 4669 4890 * 5858 * 5670 6130 2835 4689 6210 * 5422 67 138 5618 3823 2585 263 1853 468 7036 1000 6772 T 68 5233 * 4314 3518 5785 4345 6127 4653 4714 3633 5472 2558 * 3787 3622 2856 4965 4040 * 5729 68 63 6076 5153 1000 1000 1538 609 7196 1000 6457 K 69 3367 * 4681 4242 * 3886 * 4893 2506 6390 * 3528 5160 4215 4548 3000 2663 * * 5165 69 45 * 5015 * * 1439 664 7348 0 5955 G 70 3415 * * * * 443 * * 6319 4487 * * * 5998 * * 5134 4636 * 5091 70 30 * 5611 * * 492 1790 7474 0 5521 L 71 4674 * 6203 5426 5492 * 5951 3806 3976 1999 6326 4248 * 4510 3629 5498 3187 2665 * 5572 71 0 * * * * 728 1335 7626 0 3865 V 72 3227 * * 5190 3358 * * 3069 5560 2974 6388 6725 6375 * * 5445 5560 1241 * * 72 16 6496 * 2000 415 * 0 7658 1000 2255 T 73 3611 * 5508 4905 6323 * 5613 5116 3084 5509 * 5106 * 4631 3682 3608 1503 3875 * 6530 73 0 * * * * 1594 581 7658 0 2255 G 74 1492 * * * * 1698 * * * 4623 5387 5393 3553 6860 * 3287 4618 6513 * * 74 31 * 5570 * * 0 * 7641 0 1741 I 75 5090 * 4678 4561 * 6545 5400 3356 3007 1793 * 5044 * 4936 5656 5492 4593 2692 * 4544 75 15 * 6590 * * 970 1031 7636 0 1700 A 76 2814 * 4597 3846 6100 3040 4971 * 2154 * * 5637 * 4963 3680 3147 3588 5157 * * 76 0 * * * * 0 * 7619 0 1612 S 77 3501 * 3961 3242 * 3795 6390 4270 3622 4632 * 5214 2763 6776 4805 3739 4428 2909 * 6547 77 15 * 6638 * * * * 7644 0 0 G 78 * * * 5481 * 96 * * 5967 * * * * * * 5283 * * * * 78 17 6422 * 0 * * 0 7635 1000 1000 N 79 5234 * 3644 3364 6605 5257 6187 5521 3858 * 6415 3406 5226 4181 4584 3773 1804 3913 * * 79 16 6480 * 0 * 0 * 7635 1000 1000 P 80 1757 * * * 5608 5657 6520 4885 * 6119 * * 6734 * * 3567 1483 2829 * 6328 80 0 * * * * * * 7644 0 0 T 81 5603 * 4128 4321 5900 6194 5752 4236 4256 5529 5702 3513 6698 4913 5016 3735 1749 3153 * 5033 81 0 * * * * * * 7644 0 0 I 82 * * * * * * * 1087 * 2993 6295 * * * * * * 1355 * * 82 0 * * * * * * 7644 0 0 I 83 6784 * 6426 4292 4910 * 6758 3633 3301 6698 * 5404 * 4927 3901 3198 1324 4294 * 6493 83 10 7160 * 0 * * * 7644 1000 0 A 84 569 * * * 4623 6570 * 4050 * 5796 * * * 6504 * * 6390 2526 * * 84 39 5220 * 2225 347 * * 7644 2227 0 T 85 4157 * 4538 4478 * * 5396 6712 4038 6349 * 5187 * 4514 3272 2053 1889 4526 * 5615 85 0 * * * * * * 7637 0 0 Y 86 3384 5629 7113 * 2580 5339 * 6529 4178 3086 * 6627 * * 6479 4306 5727 3340 * 1682 86 43 5714 6604 1320 739 * * 7630 1579 0 G 87 4072 * 2640 3007 6475 1927 4613 * 4275 5393 * 3821 * 3131 * 3885 * * * 6314 87 30 5601 * 1837 474 * 0 7605 1724 1000 S 88 3518 * 4262 3823 5903 1078 * * 4279 5535 * 4290 * * 5493 3784 3863 * * 6399 88 36 5328 * 1816 482 * 0 7591 1626 1000 V 89 4874 * * 6576 3422 5779 4139 3469 3704 2332 4821 * * 3588 4874 6748 4620 2558 * 4348 89 0 * * * * * 0 7591 0 1000 S 90 5013 * 5621 3147 * 7003 5268 5515 3468 5314 * 4674 * 4754 6405 1927 2204 3533 * 6601 90 0 * * * * 0 * 7591 0 1000 G 91 2183 * 3560 5006 * 3169 6818 5007 4032 4547 * * * 4924 5329 2259 3495 4582 * 6423 91 47 4969 * 749 1304 * * 7556 2186 0 N 92 4519 * 4856 3193 * 6533 * 5113 3733 6584 * 3680 * 3835 4796 2233 2036 4882 * 6302 92 50 6242 5561 0 * * * 7507 1000 0 T 93 2358 3391 6318 6468 6277 6205 * 3241 * 3772 4882 6219 * 4970 6575 4060 2716 2592 * 6312 93 17 6458 * 2000 415 0 * 7476 1000 1568 I 94 4676 * 5359 3195 6376 * * 4539 3172 4322 * 6329 2751 3943 5494 3098 2326 4412 * * 94 0 * * * * * * 7313 0 0 L 95 4933 6713 * * 4368 * * 2018 * 2409 * * * * 5677 6343 6137 1224 * * 95 0 * * * * * * 7308 0 0 T 96 5150 * 4861 3822 * * 6322 3679 3529 6259 * 3596 * 5537 5327 3824 1281 4291 * 6162 96 0 * * * * * * 7252 0 0 V 97 * * * 5899 * * * 3646 * * * * * * * * * 147 * * 97 0 * * * * * * 7281 0 0 N 98 4223 * 3609 4596 * 4127 * 4253 2968 4439 * 4112 5601 * 5904 3607 1679 4319 * * 98 0 * * * * * * 7012 0 0 K 99 3605 * 2281 2639 3830 * * * 3183 * * 5412 5539 2823 3677 4699 4395 5610 * * 99 0 * * * * * * 6620 0 0 T 100 2499 * * * 5215 4115 * 4803 4036 4898 * 4922 5206 4683 * 2052 1900 * * * 100 0 * * * * * * 6166 0 0 D 101 1864 * 1859 2557 * 4605 * * * * * 3512 * * * 4740 4393 3924 * * 101 0 * * * * * * 5756 0 0 T 102 * * * * * * * * * * * * * * * 2718 238 * * * 102 0 * * 0 * * * 4762 0 0 //