HHsearch 1.5 NAME c2moqA_ FAM FILE c2moqA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2moqA_.a3m DATE Sat Jul 5 08:20:58 2014 LENG 148 match states, 148 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3875 -2.1220 SEQ >ss_dssp CCSCHHHHTTCTTTBTCCCCCTTEEEECEEEECTTSCBSCSSTTTSCCCEEEECCSSSCEEEEEEECTTTEEEEEEEETTEEECEEEEEEETTTTEEEEE EECCTTEEEEEEEEEEEETTEEECCSCCEEEEEEEECCCGGGCSCCCC >sa_dssp EEDDADEABEDEECCEEEDECEECEECDCDBDCEEEDEBEECEBBBDBEBCBBDDDBDABBABCBECADCBCDBDACCEEEEBEBDCCBACDEECCAAAC BDBBECAECBDBCBBCCDEEEECDDDEBDBDDEEDADBDCEEDDEEEE >ss_pred CCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEE EEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCC >ss_conf 9656888740811113325788754100476527796778875402683048993578558973135640445774318843227998516655616999 870588424588753330785334423577872343479867023469 >Consensus adesLxdAIKnPAixdKeHxaxxxrxidFqmxxkxxexQfYHyxSxxxPAxVxfTkxkxeiELxlxtastWkKFEVYExdkKLPvxLVSYdxvkDxAYIR FpVSnGTxxvKIVSStxxxnxeExYDYTxmvFAqPIyNxpdxxkxeex >c2moqA_ LNQELREAIKNPAIKDKDHSAPNSRPIDFEMKKKDGTQQFYHYASSVKPARVIFTDSKPEIELGLQSGQFWRKFEVYEGDKKLPIKLVSYDTVKDYAYIR FSVSNGTKAVKIVSSTHFNNKEEKYDYTLMEFAQPIYNSADKFKTEED >UniRef50_Q931P4(320-573:891) Iron-regulated surface determinant protein H n=70 Tax=Staphylococcus aureus RepID=ISDH_STAAM E=2e-87 s/c=0.60 id=64% cov=101% ADESLQDAIKNPAIIDKEHTADNWRPIDFQMKNDKGERQFYHYASTVEPATVIFTKTGPVIELGLKTASTWKKFEVYEGDKKLPVELVSYDSDKDYAYIR FPVSNGTRDVKIVSSIEYGeNIHEDYDYTLMVFAQPITNNPDDYVDEET >UniRef50_Q931P4(62-233:891) Iron-regulated surface determinant protein H n=70 Tax=Staphylococcus aureus RepID=ISDH_STAAM E=3e-63 s/c=1.30 id=45% cov=99% ADESLKDAIKDPALENKEHDIGPREQVNFQLLDKNNETQYYHFFSIKDPADVYYTKKKAEVELDINTASTWKKFEVYENNQKLPVRLVSYSPVpEDHAYI RFPVSDGTQELKIVSSTQIDDGEEtNYDYTKLVFAKPIYNDPSLVKSD-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 575 * * * * * * * * 1605 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1598 0 0 N 2 * * 575 * * * * * * * * 1605 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1598 0 0 Q 3 * * * 575 * * * * * * * * * 1605 * * * * * * 3 0 * * * * * * 1598 0 0 E 4 * * * 1605 * * * * * * * * * * * 575 * * * * 4 0 * * * * * * 1598 0 0 L 5 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1598 0 0 R 6 * * * * * * * * 1476 * * * * 1682 1605 * * * * * 6 0 * * * * * * 1598 0 0 E 7 * * 575 1605 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1598 0 0 A 8 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1598 0 0 I 9 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1598 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1598 0 0 N 11 * * 1476 * * * * * * * * 643 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1598 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1598 0 0 A 13 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1598 0 0 I 14 * * * * * * * 643 * 1476 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1598 0 0 K 15 * * * 1476 * * * 1682 1605 * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1598 0 0 D 16 * * 643 * * * * * * * * 1476 * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1598 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1598 0 0 D 18 * * 1605 575 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1598 0 0 H 19 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1598 0 0 S 20 * * 1476 * * * * * * * * * * * * 1605 1682 * * * 20 0 * * * * * * 1598 0 0 A 21 643 * * * * * * 1476 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1598 0 0 P 22 * * 1682 * * 1476 * * * * * * 1605 * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1598 0 0 N 23 * * * * * * * * * * * 643 1476 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1598 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * 1476 1605 * * 1682 * 24 0 * * * * * * 1598 0 0 R 25 * * * 1476 * * * * * * * * * * 643 * * * * * 25 0 * * * * * * 1598 0 0 P 26 * * * * * * * * * * * * 643 1476 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1598 0 0 I 27 * * * * * * * 643 * * * * * * * * * 1476 * * 27 0 * * * * * * 1598 0 0 D 28 * * 643 * * * * * * * * 1476 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1598 0 0 F 29 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1598 0 0 E 30 * * * 1605 * * * * * * * * * 575 * * * * * * 30 0 * * * * * * 1598 0 0 M 31 * * * * * * * * * 1476 643 * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1598 0 0 K 32 * * * * * * * * 643 1476 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1598 0 0 K 33 * * 1476 * * * * * 1605 * * 1682 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1598 0 0 K 34 * * 1682 * * * * * 539 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1598 0 0 D 35 * * 1605 * * * * * 1682 * * 1476 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1598 0 0 G 36 * * * * * 643 * * * * * 1476 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1598 0 0 T 37 * * * 575 * * * * * * * * * * * * 1605 * * * 37 0 * * * * * * 1598 0 0 Q 38 * * * * * * * * * * * * * 1605 1682 * 1476 * * * 38 0 * * * * * * 1598 0 0 Q 39 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1598 0 0 F 40 * * * * 643 * * * * * * * * * * * * * * 1476 40 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 41 0 * * * * * * 1598 0 0 H 42 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 43 * * * * 1476 * * * * * * * * * * * * * * 643 43 0 * * * * * * 1598 0 0 A 44 643 * * * 1476 * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1598 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1598 0 0 S 46 * * * * * * * 1476 * * * * * * * 1605 1682 * * * 46 0 * * * * * * 1598 0 0 V 47 * * * * * * * * 1476 * * * * * * * * 643 * * 47 0 * * * * * * 1598 0 0 K 48 * * 1476 1682 * * * * 1605 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1598 0 0 P 49 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1598 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1598 0 0 R 51 * * 1476 * * * * * * * * * * * 1605 * 1682 * * * 51 0 * * * * * * 1598 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1598 0 0 I 53 * * * * * * * 643 * * * * * * * * * * * 1476 53 0 * * * * * * 1598 0 0 F 54 * * * * 643 * * * * * * * * * * * * * * 1476 54 0 * * * * * * 1598 0 0 T 55 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 55 0 * * * * * * 1598 0 0 D 56 * * 1605 * * * * * 575 * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1598 0 0 S 57 * * * * * * * * 1476 * * * * * * 1605 1682 * * * 57 0 * * * * * * 1598 0 0 K 58 * * * * * 1682 * * 539 * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1598 0 0 P 59 1476 * * * * * * * * * * * 643 * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1598 0 0 E 60 * * * 539 * * * * * * * * * * * * * 1682 * * 60 0 * * * * * * 1598 0 0 I 61 * * * * * * * 643 * * * * * * * * * 1476 * * 61 0 * * * * * * 1598 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1598 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1598 0 0 G 64 * * 1476 * * 643 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1598 0 0 L 65 * * * * * * * 1476 * 643 * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1598 0 0 Q 66 * * * * * * * * 1682 * * 1476 * 1605 * * * * * * 66 0 * * * * * * 1598 0 0 S 67 * * * * * * * * * * * * * * * 1605 575 * * * 67 0 * * * * * * 1598 0 0 G 68 575 * * * * 1605 * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1598 0 0 Q 69 * * * * * * * * * * * * * 1605 * 575 * * * * 69 0 * * * * * * 1598 0 0 F 70 * * * * 1605 * * * * * * * * * * * 575 * * * 70 0 * * * * * * 1598 0 0 W 71 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 71 0 * * * * * * 1598 0 0 R 72 * * * * * * * * 575 * * * * * 1605 * * * * * 72 0 * * * * * * 1598 0 0 K 73 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1598 0 0 F 74 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1598 0 0 E 75 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1598 0 0 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 77 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 77 0 * * * * * * 1598 0 0 E 78 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1598 0 0 G 79 * * * * * 643 * * * * * 1476 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1598 0 0 D 80 * * 643 * * * * * * * * 1476 * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1598 0 0 K 81 * * * * * * * * 643 * * * * 1476 * * * * * * 81 0 * * * * * * 1598 0 0 K 82 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1598 0 0 L 83 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1598 0 0 P 84 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1598 0 0 I 85 * * * * * * * 1605 * * * * * * * * * 575 * * 85 0 * * * * * * 1598 0 0 K 86 * * * 1682 * * * * 1605 * * * * * 1476 * * * * * 86 0 * * * * * * 1598 0 0 L 87 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1598 0 0 V 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 88 0 * * * * * * 1598 0 0 S 89 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 89 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 90 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 90 0 * * * * * * 1598 0 0 D 91 * * 643 * * * * * * * * * * * * 1476 * * * * 91 0 * * * * * * 1598 0 0 T 92 * * * * * * * * * * * * 1476 * * 1682 1605 * * * 92 0 * * * * * * 1598 0 0 V 93 * * 1682 * * * * * * * * * * * * * * 539 * * 93 643 1476 * 0 * * * 1598 1000 0 K 94 * * * 1476 * * * * 643 * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1598 0 0 D 95 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 96 * * * * * * 1476 * * * * * * * * * * * * 643 96 0 * * * * * * 1598 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 98 0 * * * * * * 1598 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1598 0 0 R 100 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 100 0 * * * * * * 1598 0 0 F 101 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1598 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * 575 * * 1605 * * * * 102 0 * * * * * * 1598 0 0 V 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 103 0 * * * * * * 1598 0 0 S 104 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 104 0 * * * * * * 1598 0 0 N 105 * * 1476 * * * * * * * * 643 * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1598 0 0 G 106 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1598 0 0 T 107 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 107 0 * * * * * * 1598 0 0 K 108 * * * * * * * * 1605 * * * * 1476 1682 * * * * * 108 0 * * * * * * 1598 0 0 A 109 1605 * 1682 1476 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1598 0 0 V 110 * * * * * * * * * 1476 * * * * * * * 643 * * 110 0 * * * * * * 1598 0 0 K 111 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1598 0 0 I 112 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1598 0 0 V 113 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 113 0 * * * * * * 1598 0 0 S 114 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 114 0 * * * * * * 1598 0 0 S 115 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 115 0 * * * * * * 1598 0 0 T 116 * * * * * * * 1682 * * * * * * * * 539 * * * 116 0 * * * * * * 1598 0 0 H 117 * * * 1682 * * 1605 * * * * * * 1476 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1598 0 0 F 118 * * * * 1605 * * 1476 * * * * * * * * * * * 1682 118 0 * * * * * * 1598 0 0 N 119 * * 1476 * * 1682 * * * * * 1605 * * * * * * * * 119 539 1682 * 0 * * * 1598 1000 0 N 120 * * 1476 * * * * * * * * 643 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1598 0 0 K 121 * * * * * 1476 * 1682 1605 * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1598 0 0 E 122 * * * 539 * * 1682 * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1598 0 0 E 123 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 123 643 1476 * 0 * * * 1598 1000 0 K 124 * * 1682 * * * * * 1605 * * 1476 * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 125 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 125 0 * * * * * * 1598 0 0 D 126 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 127 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 127 0 * * * * * * 1598 0 0 T 128 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 128 0 * * * * * * 1598 0 0 L 129 * * * * * * * * 1476 643 * * * * * * * * * * 129 0 * * * * * * 1598 0 0 M 130 * * * * * * * * * 1476 643 * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 1598 0 0 E 131 * * * 1605 * * * * * * * * * * * * * 575 * * 131 0 * * * * * * 1598 0 0 F 132 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1598 0 0 A 133 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 1598 0 0 Q 134 * * * * * * * * 1476 * * * * 643 * * * * * * 134 0 * * * * * * 1598 0 0 P 135 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 135 0 * * * * * * 1598 0 0 I 136 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1598 0 0 Y 137 * * * * * * * * * * * * * * * * 1682 * * 539 137 0 * * * * * * 1598 0 0 N 138 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 1598 0 0 S 139 * * 1476 * * * * * * * * 1682 * * * 1605 * * * * 139 0 * * * * * * 1598 0 0 A 140 1605 * * * * * * * * * * * 575 * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1598 0 0 D 141 * * 643 * * * * * * * * * * * * 1476 * * * * 141 0 * * * * * * 1598 0 0 K 142 * * 1682 * * * * * 1605 1476 * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1598 0 0 F 143 * * * * 1605 * * * * * * * * * * * * 1476 * 1682 143 0 * * * * * * 1598 0 0 K 144 * * * * * * * * 539 * * * * * * * * 1682 * * 144 0 * * * * * * 1598 0 0 T 145 * * 1682 * * * * * * * * * * * * 1476 1605 * * * 145 0 * * * * * * 1598 0 0 E 146 * * 1476 643 * * * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * * * * * 1598 0 0 E 147 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1282 0 0 D 148 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 148 0 * * 0 * * * 1282 0 0 //