HHsearch 1.5 NAME c2mfzA_ FAM FILE c2mfzA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2mfzA_.a3m DATE Sat Aug 23 08:13:42 2014 LENG 125 match states, 125 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.5109 2.4561 SEQ >ss_dssp CCSCCCCCCSSSSCCSSCCCSSCSSSCCSHHHHGGGSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHTTCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTCC CCCCCSSSHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EEEEEEEEDEEEEBEEEDECEECCDCDBCCADECCECEDADECCDEBDEDBEEDDBEBBCDBADEACECADEDECDEDBABCAABCAADCACEEBEEEDE EEEEDEECEEDDEEEDEEACCECEE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC CCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9877434476445420000010000101224554210124566654467775111235579999887668750545238999999999999999841323 2440110246889999987664339 >Consensus gsgnsvtsggygygtsaaagagvaagsyxgavnrlssaxaasrvssniaaiasxgaxalpxvisniysgvxxsgvssxealiqallexxsalihvlxsas ignvssvgvxsxlnxvqxxvgxyxg >c2mfzA_ GSGNSVTSGGYGYGTSAAAGAGVAAGSYAGAVNRLSSAEAASRVSSNIAAIASGGASALPSVISNIYSGVVASGVSSNEALIQALLELLSALVHVLSSAS IGNVSSVGVDSTLNVVQDSVGQYVG >UniRef50_Q16985(262-360:360) Fibroin-1 (Fragment) n=4 Tax=Orbiculariae RepID=Q16985_ARADI E=1e-23 s/c=1.11 id=79% cov=80% --------------------------SYGGAVNRLSSAGAASRVSSNVAAIASAGAAALPNVISNIYSGVLSSGVSSSEALIQALLEVISALIHVLGSAS IGNVSSVGVNSALNAVQNAVGAYAG # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 S 2 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 G 3 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 S 5 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 S 8 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 G 9 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 11 0 * * * * * * 1000 0 0 G 12 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 13 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 13 0 * * * * * * 1000 0 0 G 14 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 T 15 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 G 20 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 V 23 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 A 24 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 A 25 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 S 27 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 27 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1150 0 0 A 29 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1150 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1150 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1150 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1150 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1150 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 34 0 * * * * * * 1150 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1150 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1150 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1150 0 0 A 38 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1150 0 0 E 39 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1150 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1150 0 0 A 41 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1150 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 42 0 * * * * * * 1150 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 43 0 * * * * * * 1150 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 1150 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 45 0 * * * * * * 1150 0 0 S 46 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 46 0 * * * * * * 1150 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1150 0 0 I 48 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 48 0 * * * * * * 1150 0 0 A 49 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1150 0 0 A 50 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1150 0 0 I 51 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1150 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1150 0 0 S 53 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 53 0 * * * * * * 1150 0 0 G 54 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1150 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1150 0 0 A 56 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1150 0 0 S 57 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 57 0 * * * * * * 1150 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1150 0 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1150 0 0 P 60 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1150 0 0 S 61 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 61 0 * * * * * * 1150 0 0 V 62 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 62 0 * * * * * * 1150 0 0 I 63 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1150 0 0 S 64 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 64 0 * * * * * * 1150 0 0 N 65 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1150 0 0 I 66 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * * 1150 0 0 S 68 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 68 0 * * * * * * 1150 0 0 G 69 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1150 0 0 V 70 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 70 0 * * * * * * 1150 0 0 V 71 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 71 0 * * * * * * 1150 0 0 A 72 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 72 0 * * * * * * 1150 0 0 S 73 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 73 0 * * * * * * 1150 0 0 G 74 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1150 0 0 V 75 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 75 0 * * * * * * 1150 0 0 S 76 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 76 0 * * * * * * 1150 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1150 0 0 N 78 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 78 0 * * * * * * 1150 0 0 E 79 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1150 0 0 A 80 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1150 0 0 L 81 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1150 0 0 I 82 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1150 0 0 Q 83 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 83 0 * * * * * * 1150 0 0 A 84 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1150 0 0 L 85 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1150 0 0 L 86 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1150 0 0 E 87 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1150 0 0 L 88 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 88 0 * * * * * * 1150 0 0 L 89 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1150 0 0 S 90 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 90 0 * * * * * * 1150 0 0 A 91 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1150 0 0 L 92 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1150 0 0 V 93 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 93 0 * * * * * * 1150 0 0 H 94 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1150 0 0 V 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 95 0 * * * * * * 1150 0 0 L 96 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1150 0 0 S 97 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 97 0 * * * * * * 1150 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 98 0 * * * * * * 1150 0 0 A 99 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1150 0 0 S 100 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 100 0 * * * * * * 1150 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1150 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1150 0 0 N 103 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1150 0 0 V 104 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 104 0 * * * * * * 1150 0 0 S 105 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 105 0 * * * * * * 1150 0 0 S 106 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 106 0 * * * * * * 1150 0 0 V 107 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 107 0 * * * * * * 1150 0 0 G 108 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1150 0 0 V 109 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 109 0 * * * * * * 1150 0 0 D 110 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1150 0 0 S 111 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 111 0 * * * * * * 1150 0 0 T 112 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 112 0 * * * * * * 1150 0 0 L 113 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1150 0 0 N 114 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1150 0 0 V 115 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 115 0 * * * * * * 1150 0 0 V 116 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 116 0 * * * * * * 1150 0 0 Q 117 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 117 0 * * * * * * 1150 0 0 D 118 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1150 0 0 S 119 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 119 0 * * * * * * 1150 0 0 V 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 120 0 * * * * * * 1150 0 0 G 121 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1150 0 0 Q 122 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 122 0 * * * * * * 1150 0 0 Y 123 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 123 0 * * * * * * 1150 0 0 V 124 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 124 0 * * * * * * 1150 0 0 G 125 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * 0 * * * 1150 0 0 //