HHsearch 1.5 NAME c2mfrA_ FAM FILE c2mfrA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2mfrA_.a3m DATE Sat Apr 5 08:18:20 2014 LENG 57 match states, 57 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4819 2.1529 SEQ >ss_dssp CTHHHHHHTTCCCTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSCCCCSSSCCSSCC >sa_dssp EEEEEEEDEEDEDEEDDEEEECDEEEEEEEDEEEDDEDEEEEEEEEEDEEEEEEEEE >ss_pred CCEEEEEEHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCC >ss_conf 941763003216137799999989999999999999999985048899854021059 >Consensus xtyfyvtdyldvpsniakiiigplifvflfsvvigsiylflrkrqpdgplxxxxxxx >c2mfrA_ MTYFYVTDYLDVPSNIAKIIIGPLIFVFLFSVVIGSIYLFLRKRQPDGPLEHHHHHH >UniRef50_P06213(839-1095:1382) Insulin receptor subunit beta n=70 Tax=Euteleostomi RepID=INSR_HUMAN E=1e-153 s/c=0.39 id=84% cov=102% PTYFYVTDYLDVPSNIAKIIIGPLIFVFLFSVVIGSIYLFLRKRQPDGPLGPLYASS # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1102 0 0 T 2 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 2 0 * * * * * * 1102 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1102 0 0 F 4 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1102 0 0 Y 5 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 5 0 * * * * * * 1102 0 0 V 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 6 0 * * * * * * 1102 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 7 0 * * * * * * 1102 0 0 D 8 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1102 0 0 Y 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 9 0 * * * * * * 1102 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1102 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1102 0 0 V 12 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 12 0 * * * * * * 1102 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1102 0 0 S 14 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 14 0 * * * * * * 1102 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1102 0 0 I 16 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1102 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1102 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1102 0 0 I 19 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1102 0 0 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1102 0 0 I 21 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1102 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1102 0 0 P 23 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1102 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1102 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1102 0 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1102 0 0 V 27 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 27 0 * * * * * * 1102 0 0 F 28 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1102 0 0 L 29 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1102 0 0 F 30 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1102 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1102 0 0 V 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 32 0 * * * * * * 1102 0 0 V 33 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 33 0 * * * * * * 1102 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1102 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1102 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1102 0 0 I 37 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1102 0 0 Y 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 38 0 * * * * * * 1102 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1102 0 0 F 40 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1102 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1102 0 0 R 42 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 42 0 * * * * * * 1102 0 0 K 43 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1102 0 0 R 44 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 44 0 * * * * * * 1102 0 0 Q 45 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 45 0 * * * * * * 1102 0 0 P 46 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1102 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1102 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1102 0 0 P 49 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1102 0 0 L 50 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1102 0 0 E 51 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1102 0 0 H 52 * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1102 0 0 H 53 * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1102 0 0 H 54 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 54 0 * * * * * * 1102 0 0 H 55 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1102 0 0 H 56 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * 56 0 * * * * * * 1102 0 0 H 57 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * 57 0 * * 0 * * * 1102 0 0 //