HHsearch 1.5 NAME c2mfaA_ FAM FILE c2mfaA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2mfaA_.a3m DATE Sat Jan 11 08:54:24 2014 LENG 57 match states, 57 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4504 1.3777 SEQ >ss_dssp CEEESSSSEEECCTTCCEEEEECCSCCSSCCCCEEEEESSCCCCSSEEEECSTTCCC >sa_dssp DDABDEDEDCEBEEECECACCCEBEEEEEEEEEDBABCDEBEEEEDBDCCDEDECBE >ss_pred CCCCCCCCEEEECCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC >ss_conf 951013656885356504431258741003888733420012678982014000379 >Consensus lxcxqxxkvvtcxxxxxfcyxxxxmpfrnxxxxxxgcssxcxxxxxxkccstdrcnk >c2mfaA_ LKCFQHGKVVTCHRDMKFCYHNTGMPFRNLKLILQGCSSSCSETENNKCCSTDRCNK >UniRef50_P25678(1-56:61) Weak toxin CM-2a n=3 Tax=Elapinae RepID=TXW2A_NAJHA E=4e-09 s/c=1.11 id=51% cov=100% LECYQMSKVVTCKPEETFCYSDVFMPFRNHIVYTSGCSSYCRDGTGEKCCTTDRCN- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * L 1 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1397 0 0 K 2 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1397 0 0 C 3 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1397 0 0 F 4 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 4 0 * * * * * * 1397 0 0 Q 5 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 5 0 * * * * * * 1397 0 0 H 6 * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1397 0 0 G 7 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 7 0 * * * * * * 1397 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1397 0 0 V 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 9 0 * * * * * * 1397 0 0 V 10 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 10 0 * * * * * * 1397 0 0 T 11 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 11 0 * * * * * * 1397 0 0 C 12 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1397 0 0 H 13 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1397 0 0 R 14 * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * 14 0 * * * * * * 1397 0 0 D 15 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1397 0 0 M 16 * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1397 0 0 K 17 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 17 0 * * * * * * 1397 0 0 F 18 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1397 0 0 C 19 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1397 0 0 Y 20 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 20 0 * * * * * * 1397 0 0 H 21 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * 21 0 * * * * * * 1397 0 0 N 22 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1397 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 23 0 * * * * * * 1397 0 0 G 24 * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1397 0 0 M 25 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1397 0 0 P 26 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1397 0 0 F 27 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1397 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1397 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1397 0 0 L 30 * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1397 0 0 K 31 * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1397 0 0 L 32 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 32 0 * * * * * * 1397 0 0 I 33 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 33 0 * * * * * * 1397 0 0 L 34 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * 34 0 * * * * * * 1397 0 0 Q 35 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * 35 0 * * * * * * 1397 0 0 G 36 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1397 0 0 C 37 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1397 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 38 0 * * * * * * 1397 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 1397 0 0 S 40 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 40 0 * * * * * * 1397 0 0 C 41 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1397 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * 42 0 * * * * * * 1397 0 0 E 43 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1397 0 0 T 44 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 44 0 * * * * * * 1397 0 0 E 45 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 45 0 * * * * * * 1397 0 0 N 46 * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1397 0 0 N 47 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1397 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1397 0 0 C 49 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1397 0 0 C 50 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1397 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 51 0 * * * * * * 1397 0 0 T 52 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 52 0 * * * * * * 1397 0 0 D 53 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1397 0 0 R 54 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 54 0 * * * * * * 1397 0 0 C 55 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1397 0 0 N 56 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1397 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //