HHsearch 1.5 NAME c2lshA_ FAM FILE c2lshA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2lshA_.a3m DATE Wed Jan 9 16:44:09 2013 LENG 118 match states, 118 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4642 1.2344 SEQ >ss_dssp CCTTSSCCCCSSTTCTHHHHHHHHSCCCGGGEEEECCHHHHTSSTTHHHHSCTTSCCEETTEEEEEEEEHHHHTTTCCTTTEEEETTEEEESSEEEECCS SSSCBEESCSSSCSCCCC >sa_dssp EEEEDEEEEEEBEEBDAACDACEECECEEECBAAABCDEDADEDEEBCEDBCDDEBDBBDEDEBABAAACDBCEEECAEBACDECEDBBBBDDCAABACD CEEDAEBECEEDEBECDE >ss_pred CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEECCC CCCEEEEECCCCCCCCCC >ss_conf 9520000122201368875202576134564030488200103458999998644565307898520001220223603433027889730000012689 985058961755655469 >Consensus axxaxxasxxkxsxsxAxxxxxegxxCxiGxixCCnxxxexxxDgxlnnllxxGllxgLxgnxgsACAkxslIdxlnllalvxxtxdgpvCKNviACCpx gxxxCvAidxxxxxxxxx >c2lshA_ SLPASAAKNAKLATSAAFAKQAEGTTCNVGSIACCNSPAETNNDSLLSGLLGAGLLNGLSGNTGSACAKASLIDQLGLLALVDHTEEGPVCKNIVACCPE GTTNCVAVDNAGAGTKAE >UniRef50_A2QG94(17-120:122) Similarity to spore-wall fungal hydrophobin dewA - Aspergillus nidulans n=1 Tax=Aspergillus niger CBS 513.88 RepID=A2QG94_ASPNC E=4e-10 s/c=0.63 id=44% cov=86% AIPAAKSSQQKLSIDDASGQ------CSIGDIYCCNPTNEEETDGALNNALREGLLIGsLVNGKGSACAPTSLIGSLNLLAFFEEGEDDDksYCKNVIAC CPGG--NCAALD--------- >UniRef50_B8NF34(67-165:251) Hydrophobin family protein n=2 Tax=Aspergillus RepID=B8NF34_ASPFN E=1e-29 s/c=1.31 id=45% cov=85% ---------SKAGDSKALQKVAEG-KCDIGNTACCNNVHEEKDERLFN-LVKQGLIDILAGNEDYACAKSGVIDEWNLFSLVKQTNDGPVCKNVTACCSS GK--CVAIDGSA------ >UniRef50_A2QG98(16-119:131) Contig An03c0070, complete genome n=1 Tax=Aspergillus niger CBS 513.88 RepID=A2QG98_ASPNC E=3e-28 s/c=1.21 id=44% cov=89% ---ATGVSAGAVSDSQAIKTQTEG-KCDIGNVSCCNPTNEDKTDGFLNNLLEWGVIGSLVNGQGSACAPISLIDELGILALVKDTPDGPVCENVIACCPG QGAQCVAI---------- >UniRef50_B6H319(4-108:169) Pc13g16010 protein n=1 Tax=Penicillium chrysogenum Wisconsin 54-1255 RepID=B6H319_PENCW E=4e-28 s/c=1.31 id=42% cov=87% AVLGLAASATAMSLSESVALGGAKDQCSSGDISCCDSKENLSADGILGNLLAKGALNGLLGNDNAACAKTSALDDLNVLSQTEDTDNGPSCKNIIACCPE GT---------------- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 594 * * * * * * * * * * * * * * 1567 * * * * 1 0 * * * * * * 1809 0 0 L 2 * * * * * * * 1665 * 1567 * * * * * * * 1526 * * 2 0 * * * * * * 1809 0 0 P 3 * * * * * * * * * 1526 * * 615 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1809 0 0 A 4 461 * * * * 1870 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 2010 0 0 S 5 2137 * * * * * * * * 1870 * * * * * 1985 2020 * * * 5 0 * * * * * * 2010 0 0 A 6 927 * * * * 2020 * * 2137 * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 2010 0 0 A 7 927 * * * * * * * * * * * * * * 2137 * 2020 * * 7 0 * * * * * * 2010 0 0 K 8 * * * * * * * * 1985 * * * * * * 420 * * * * 8 0 * * * * * * 2010 0 0 N 9 943 * * * * * * * * * * 1985 * 2137 * * * * * * 9 0 * * * * * * 2010 0 0 A 10 2377 * * * * 2441 * * * * * * * 2453 * 2219 2146 * * * 10 0 * * * * * * 2223 0 0 K 11 1286 * * * * * * * 761 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2223 0 0 L 12 2219 * * * * * * * * 1414 2146 * * * * * * 2441 * * 12 0 * * * * * * 2223 0 0 A 13 2377 * * * * 2219 * * * * * * * * * 755 * * * * 13 0 * * * * * * 2223 0 0 T 14 * * 1326 * * * * 2453 * 2146 * * * * * * 2377 * * * 14 0 * * * * * * 2223 0 0 S 15 * * 2453 * * * * * * * * * * * * 291 * * * * 15 0 * * * * * * 2223 0 0 A 16 2377 * 2453 2146 * * * * 2219 * * * * 2441 * * * * * * 16 0 * * * * * * 2223 0 0 A 17 370 * * * * * * * * * * * * * * 2146 * * * * 17 0 * * * * * * 2223 0 0 F 18 * * * * 2377 * * 2441 * 2219 * * * * * 2453 * 2146 * * 18 0 * * * * * * 2223 0 0 A 19 1257 * * * * 2453 * * 2441 * * * * 2219 * * * * * * 19 0 * * * * * * 2223 0 0 K 20 * * * * * * * * 1296 2146 * * * 2453 * * 2441 * * * 20 291 * 2453 * * * * 2223 0 0 Q 21 * * * * * 1871 * * * * * * * 1072 * * * 1995 * * 21 0 * * * * * 0 2079 0 1000 A 22 1042 * * * * 1871 * * * * * * * * * * 2053 * * * 22 0 * * * * * 0 2079 0 1000 E 23 1871 * * 461 * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * 0 2079 0 1000 G 24 * * * * * 461 * * 1871 * * * * * * * * * * * 24 977 * 1023 * * * 0 2079 0 1000 T 25 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 25 0 * * * * 552 1653 1493 0 1701 T 26 * * * * * * * * 1023 * * * * 1871 * * 2091 * * * 26 0 * * * * 0 * 2079 0 1000 C 27 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 2223 0 0 N 28 * * 1326 * * * * * * * * 2377 * * * 1291 * * * * 28 0 * * * * * * 2223 0 0 V 29 * * * * * * * 782 * * * * * * * 2146 * 2377 * * 29 0 * * * * * * 2223 0 0 G 30 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 2223 0 0 S 31 * * 1291 * * * * * * * * 1326 * * * 2377 * * * * 31 0 * * * * * * 2223 0 0 I 32 * * * * * * * 734 * * * * * * * * 2219 2441 * * 32 0 * * * * * * 2223 0 0 A 33 1296 * * * * * * * * * * * * * * 1286 * * * 2453 33 0 * * * * * * 2223 0 0 C 34 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2223 0 0 C 35 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2223 0 0 N 36 * * 2146 * * * * * * * * 370 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 2223 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * 2219 1447 * * 1257 * * * * 37 0 * * * * * * 2223 0 0 P 38 * * * * * * * * 2146 * * * 2377 * * * 1447 2219 * * 38 0 * * * * * * 2223 0 0 A 39 2377 * * 2146 * * 2219 * * * * 1447 * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 2223 0 0 E 40 * * * 370 * * * * * * * 2146 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 2223 0 0 T 41 * * 2441 1331 * * * * * 2146 * * * * * * 2377 * * * 41 0 * * * * * * 2223 0 0 N 42 * * * 2453 * * * * 1326 * * 2377 * * * 2146 * * * * 42 0 * * * * * * 2223 0 0 N 43 2146 * 2219 * * * * * * * * 2377 * * * * 1447 * * * 43 0 * * * * * * 2223 0 0 D 44 * * 349 2219 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 2223 0 0 S 45 * * * * * 755 * * * * * * * * 2219 2377 * * * * 45 0 * * * * * * 2223 0 0 L 46 2453 * * * 2441 * * 2146 * 1296 * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2223 0 0 L 47 * * * * 2219 * * * * 349 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 2223 0 0 S 48 * * * * * 2146 * * * * * 782 * * * 2377 * * * * 48 349 * 2219 * * * * 2223 0 0 G 49 * * * * * 1985 * * * * * 420 * * * * * * * * 49 0 * * * * 0 * 2010 0 1000 L 50 2453 * * * * * * * * 291 * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2223 0 0 L 51 * * * * * * * * * 349 * * * * * * * 2219 * * 51 0 * * * * * * 2223 0 0 G 52 2146 * * 2441 * 2377 * * 2219 * * * * * 2453 * * * * * 52 0 * * * * * * 2223 0 0 A 53 2377 * * 2453 * * * * 2146 * * * * 2219 * * * * 2441 * 53 0 * * * * * * 2223 0 0 G 54 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2223 0 0 L 55 2146 * * * * * * * * 761 * * * * * * * 2441 * * 55 0 * * * * * * 2223 0 0 L 56 * * * * * * * 1326 * 734 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 2223 0 0 N 57 * * 2219 * * 2441 * 2453 * * * 1257 * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 2223 0 0 G 58 * * * * * 734 * 2219 * * * * * * * 2441 * * * * 58 291 2453 * 0 * * * 2223 1000 0 L 59 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 2223 0 0 S 60 2219 * * * * * * * * 2146 * * * * * 2377 * 1447 * * 60 0 * * * * * * 2223 0 0 G 61 * * * * * 659 * * * * * 1447 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2223 0 0 N 62 * * * * * 1447 * * * * * 659 * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 2223 0 0 T 63 * * 2146 2219 * * * * 2453 * * * * 2441 * * 2377 * * * 63 0 * * * * * * 2223 0 0 G 64 * * 2219 * * 838 * * * * * 2146 * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2223 0 0 S 65 2146 * * * * * * * * * * * * * * 838 * * * 2219 65 0 * * * * * * 2223 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2223 0 0 C 67 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2223 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2223 0 0 K 69 * * * * * * * * 659 * * * 1447 * * * * * * * 69 0 * * * * * * 2223 0 0 A 70 2377 * * * * * * 2441 * * * * * * * 2219 1291 * * * 70 0 * * * * * * 2223 0 0 S 71 * * * * * 2219 * * * * * * * * * 349 * * * * 71 0 * * * * * * 2223 0 0 L 72 2146 * * * * * * * * 838 * * * * * * * 2219 * * 72 0 * * * * * * 2223 0 0 I 73 * * * * * * * 370 * 2146 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2223 0 0 D 74 * * 291 * * 2453 * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2223 0 0 Q 75 * * 2146 1326 * * * * * * * * * 2377 * 2453 * * * * 75 0 * * * * * * 2223 0 0 L 76 * * * * * * * * * 349 * * * * * * * * 2219 * 76 0 * * * * * * 2223 0 0 G 77 * * * * * 1409 * * * * * 682 * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 2223 0 0 L 78 * * * * * * * 2441 * 761 * * * * * * * 2146 * * 78 0 * * * * * * 2223 0 0 L 79 * * * * 2219 * * * * 349 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2223 0 0 A 80 838 * * * * * * * * * * * * * * 1182 * * * * 80 0 * * * * * * 2223 0 0 L 81 * * * * 2453 * * * * 758 * * * 2146 * * * * * * 81 0 * * * * * * 2223 0 0 V 82 * * * * 2453 * * * * * * * * * * * 2146 758 * * 82 0 * * * * * * 2223 0 0 D 83 * * 2377 1291 * * * * 1326 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2223 0 0 H 84 * * 1286 2453 * * 2377 * * * * * * 2219 * * * * * * 84 0 * * * * * * 2223 0 0 T 85 * * * * * 2453 * * * * * * * * * * 291 * * * 85 0 * * * * * * 2223 0 0 E 86 * * 2146 1414 * * * * * * * 2219 2441 * * * * * * * 86 0 * * * * * * 2223 0 0 E 87 * * 782 2377 * * * * * * * 2146 * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2223 0 0 G 88 * * 2453 * * 291 * * * * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2223 0 0 P 89 * * 2453 * * * * * * * * * 291 * * * * * * * 89 291 2453 * 1000 1000 * * 2223 1000 0 V 90 * * * * * * * * * * * * * * * 2146 * 758 * 2453 90 0 * * * * * * 2223 0 0 C 91 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2223 0 0 K 92 * * * 2441 * * * * 294 * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 2223 0 0 N 93 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 2223 0 0 I 94 * * * * * * * 1257 * * * * * * * * * 782 * * 94 0 * * * * * * 2223 0 0 V 95 * * * * * * * 755 * * * * * * * * 2219 2377 * * 95 0 * * * * * * 2223 0 0 A 96 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2223 0 0 C 97 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 2223 0 0 C 98 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2223 0 0 P 99 * * * * * * * * * * * * 349 * * 2219 * * * * 99 0 * * * * * * 2223 0 0 E 100 * * * 1257 * 1447 * * * * * * * * * 2219 * * * * 100 0 * * * * * * 2223 0 0 G 101 * * * * * 294 * * * * * * * 2441 * * * * * * 101 291 * 2453 * * * * 2223 0 0 T 102 * * * * * 2053 * * 1995 * * * * * * * 977 * * * 102 611 * 1534 * * * 0 2079 0 1000 T 103 1014 * * * * * * * * * * * * * * * 986 * * * 103 0 * * * * 1060 942 1466 0 1506 N 104 * * * * * * * * * * * 590 * 1575 * * * * * * 104 0 * * * * 0 * 1700 0 1000 C 105 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1912 0 0 V 106 2090 * * * * * * * * * * * * * * * * 386 * * 106 0 * * * * * * 1912 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1912 0 0 V 108 * * * * * * * 998 * 2090 * * * * * * * 1920 * * 108 0 * * * * * * 1912 0 0 D 109 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1741 0 0 N 110 * * * * * 1057 * * * * * 945 * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1438 0 0 A 111 945 * * * * * * * * * * * * * * 1057 * * * * 111 0 * * * * * * 1438 0 0 G 112 1057 * * * * 945 * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1438 0 0 A 113 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 G 114 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 T 115 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 K 116 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 A 117 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 E 118 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //