HHsearch 1.5 NAME c2laiA_ FAM FILE c2laiA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2laiA_.a3m DATE Sat Jan 28 16:52:27 2012 LENG 101 match states, 101 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4528 1.5820 SEQ >ss_dssp CCCSSCSCCCCCCCCCTTTTTSSCSSSGGGSSCSSSSTTTSSCCSSSCCSSCCCSSCCCCCCTTTSCCSHHHHHHHHHHHHHTCTTTHHHHHHHTHHHHC C >sa_dssp EEEEEEEEEEEDEDEDECCEDEECCEEBADCEDBCDCDDEDEEEEEEEEEEDEEEEEEEEDEBDEECECDCBDEABDCACECEBECAECCACEADDDEEE E >ss_pred CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC C >ss_conf 9510100166999999995179864210102318999998865443320147125999999999856880399999998654332244331689987633 9 >Consensus sfxlxxaqdpldkffxxixxsxkpietsysakgihxkiieahdxhvsksxxapixyaxvxexlkkiyxxxdiexivstlexhdevxakxlgxxlxxaxxx q >c2laiA_ SFGLGKAQDPLDKFFSKIIFSGKPIETSYSAKGIHEKIIEAHDLHVSKSKNAPIQYASVMEYLKKTYPGPDIERIVSTLERHDEVGAKDLGAKLRDALDR Q >UniRef50_Q5G7L2(54-187:187) Avirulence protein ATR13 n=12 Tax=Hyaloperonospora parasitica RepID=Q5G7L2_9STRA E=4e-36 s/c=1.13 id=82% cov=101% SFGLGKAQDPLDKFFRKIINSRKPIETSYSAKGIHEKIIKaydrhvfeskkahdrhvskskkahgrhvskskmAHDRHVSKSEKAPIQYASVADYLKKIY PGTDIERIVSTLKRHDEVGAKDLGAKLQTAVASQ >UniRef50_B2CSN0(54-157:159) Avirulence protein n=3 Tax=Hyaloperonospora parasitica RepID=B2CSN0_9STRA E=2e-39 s/c=1.56 id=65% cov=101% SFELAMAQDPLDKFFSMLKNSGKPIETSYSAKGIHKKIIEAHDLHVSKSNEAPvpsVMYARLAEHLKKIYSDKEIELIVSTLEHHDDVRARNLGVDIWNA HERK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1351 0 0 F 2 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1351 0 0 G 3 * * * 1449 * 658 * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1351 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1351 0 0 G 5 1449 * * * * 658 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1351 0 0 K 6 * * * * * * * * 658 * 1449 * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1351 0 0 A 7 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1351 0 0 Q 8 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 8 0 * * * * * * 1351 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1351 0 0 P 10 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1351 0 0 L 11 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1351 0 0 D 12 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1351 0 0 K 13 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1351 0 0 F 14 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1351 0 0 F 15 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1351 0 0 S 16 * * * * * * * * * * * * * * 1636 560 * * * * 16 0 * * * * * * 1351 0 0 K 17 * * * * * * * * 658 * 1449 * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1351 0 0 I 18 * * * * * * * 658 * 1449 * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1351 0 0 I 19 * * * * * * * 658 1449 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1351 0 0 F 20 * * * * 1681 * * * * * * 539 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1351 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 21 0 * * * * * * 1351 0 0 G 22 * * * * * 560 * * * * * * * * 1636 * * * * * 22 0 * * * * * * 1351 0 0 K 23 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1351 0 0 P 24 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1351 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1351 0 0 E 26 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1351 0 0 T 27 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 27 0 * * * * * * 1351 0 0 S 28 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 28 0 * * * * * * 1351 0 0 Y 29 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 29 0 * * * * * * 1351 0 0 S 30 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 30 0 * * * * * * 1351 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1351 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1351 0 0 G 33 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1351 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1351 0 0 H 35 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1351 0 0 E 36 * * * 658 * * * * 1449 * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1351 0 0 K 37 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1351 0 0 I 38 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1351 0 0 I 39 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1351 0 0 E 40 * * * 560 * * * * 1636 * * * * * * * * * * * 40 560 1636 * 5044 44 * * 1351 1000 0 A 41 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1351 0 0 H 42 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1351 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1351 0 0 L 44 * * * * * * * * * 560 * * * * 1636 * * * * * 44 0 * * * * * * 1351 0 0 H 45 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1351 0 0 V 46 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 46 0 * * * * * * 1351 0 0 S 47 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 47 0 * * * * * * 1351 0 0 K 48 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1351 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * * 1351 0 0 K 50 * * * 1636 * * * * 1681 * * 1449 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1351 0 0 N 51 * * * 1449 * * * * 1636 * * 1681 * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1351 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1351 0 0 P 53 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 53 658 1449 * 1585 585 * * 1351 1000 0 I 54 * * * * * * * 658 * * * * * * * * * 1449 * * 54 0 * * * * * * 1351 0 0 Q 55 * * * * * * * * * * 1449 * * 658 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1351 0 0 Y 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 56 0 * * * * * * 1351 0 0 A 57 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1351 0 0 S 58 * * * * * * * * * * * * * * 1449 658 * * * * 58 0 * * * * * * 1351 0 0 V 59 * * * * * * * * * 1449 * * * * * * * 658 * * 59 0 * * * * * * 1351 0 0 M 60 539 * * * * * * * * * 1681 * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1351 0 0 E 61 * * 1636 560 * * * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1351 0 0 Y 62 * * * * * * 1449 * * * * * * * * * * * * 658 62 0 * * * * * * 1351 0 0 L 63 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1351 0 0 K 64 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1351 0 0 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1351 0 0 T 66 * * * * * * * 539 * * * * * * * * 1681 * * * 66 0 * * * * * * 1351 0 0 Y 67 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 67 0 * * * * * * 1351 0 0 P 68 * * * * * * * * * * * * 658 * * 1449 * * * * 68 0 * * * * * * 1351 0 0 G 69 * * 1449 * * 658 * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1351 0 0 P 70 * * * * * * * * 1449 * * * 1681 * * * 1636 * * * 70 0 * * * * * * 1351 0 0 D 71 * * 658 1449 * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1351 0 0 I 72 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1351 0 0 E 73 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1351 0 0 R 74 * * * * * * * * * 1449 * * * * 658 * * * * * 74 0 * * * * * * 1351 0 0 I 75 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1351 0 0 V 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 76 0 * * * * * * 1351 0 0 S 77 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 77 0 * * * * * * 1351 0 0 T 78 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 78 0 * * * * * * 1351 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1351 0 0 E 80 * * * 560 * * * * 1636 * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1351 0 0 R 81 * * * * * * 1449 * * * * * * * 658 * * * * * 81 0 * * * * * * 1351 0 0 H 82 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1351 0 0 D 83 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1351 0 0 E 84 * * 1449 658 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1351 0 0 V 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 85 0 * * * * * * 1351 0 0 G 86 * * * * * 658 * * * * * * * * 1449 * * * * * 86 0 * * * * * * 1351 0 0 A 87 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1351 0 0 K 88 * * * * * * * * 658 * * * * * 1449 * * * * * 88 0 * * * * * * 1351 0 0 D 89 * * 658 * * * * * * * * 1449 * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1351 0 0 L 90 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1351 0 0 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1351 0 0 A 92 658 * * * * * * * * * * * * * * * * 1449 * * 92 0 * * * * * * 1351 0 0 K 93 * * 1449 * * * * * 658 * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1351 0 0 L 94 * * * * * * * 1449 * 658 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1351 0 0 R 95 * * * * * * * * * * * * * 1636 1681 * * * 1449 * 95 0 * * * * * * 1351 0 0 D 96 * * 1681 * * * * * * * * 1449 * * * * 1636 * * * 96 0 * * * * * * 1351 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1351 0 0 L 98 * * * * * * 1449 * * 1681 * * * * * * * 1636 * * 98 0 * * * * * * 1351 0 0 D 99 1636 * 1681 1449 * * * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1351 0 0 R 100 * * * * * * * * * * * * * * 560 1636 * * * * 100 0 * * * * * * 1351 0 0 Q 101 * * * * * * * * 1449 * * * * 658 * * * * * * 101 0 * * 0 * * * 1351 0 0 //