HHsearch 1.5 NAME c2kzbA_ FAM FILE c2kzbA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2kzbA_.a3m DATE Sun Aug 29 03:52:44 2010 LENG 114 match states, 114 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4071 -0.4721 SEQ >ss_dssp CCCSSCCCEEEEEEEETTEEEEEEEECSSSCCCSSCEECCCSSSSSCCCCCEECCSCCCCTTCCEEEEECSCCCCCCTTCCEEEECTTSSEEEEECCCSS SCEECCCSSCCCCC >sa_dssp EDCEEDEBACACAECDEDAACADACACCDEEBDBEBDABACABDEEDDEBDBEBCDEEACDEDDDEBECDDADEEBDECACACACBEEDEDCBDBDCCED CCBDADDDEEEDEE >ss_pred CCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEECCCEEEECCCCCCCEEHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCC CEEEECCHHHCCCC >ss_conf 9778882699996277774999998475507715516996223663100100028300034431246750434784478679998247889999712788 60442381111369 >Consensus vepPNxxxLxixxxxxDNSLxFxLxNxTNxvlxGNCxxxFtxxxxxxxtqiIxMGPHEIGIKxxKExxxFPxxxxxxaxxTxxixNQxGExIxxGKxxxS xxIxLrxPsrlsae >c2kzbA_ VEPPNERSLQITMNQRDNSLYFQLFNNTNSVLAGNCKLKFTDAGDKPTTQIIDMGPHEIGIKEYKEYRYFPYALDLEAGSTIEIENQYGEVIFLGKYGSS PMINLRPPSRLSAE >UniRef50_Q12292(245-347:412) Uncharacterized protein YOL083W n=6 Tax=Saccharomyces cerevisiae RepID=YO083_YEAST E=6e-14 s/c=0.76 id=40% cov=91% ---PNDPLLHVEVSNEDNSLHFILYNKTNIIIPGNCTFEFSSQISEVFS--IKMGPHEIGIKGQKELWFFPSLPTPLSNYTMKVVNQDGETILVGKCADS NEITLKSP------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * V 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 P 3 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1496 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1496 0 0 E 6 * * 1028 973 * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1496 0 0 R 7 * * * * * * * * * * * * 1028 * 973 * * * * * 7 0 * * * * * * 1496 0 0 S 8 * * * * * * * * * 1028 * * * * * 973 * * * * 8 0 * * * * * * 1496 0 0 L 9 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1496 0 0 Q 10 * * * * * * 1028 * * * * * * 973 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1496 0 0 I 11 * * * * * * * 973 * * * * * * * * * 1028 * * 11 0 * * * * * * 1496 0 0 T 12 * * * 1028 * * * * * * * * * * * * 973 * * * 12 0 * * * * * * 1496 0 0 M 13 * * * * * * * * * * 973 * * * * * * 1028 * * 13 0 * * * * * * 1496 0 0 N 14 * * * * * * * * * * * 973 * * * 1028 * * * * 14 0 * * * * * * 1496 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * 1028 * 973 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1496 0 0 R 16 * * * 1028 * * * * * * * * * * 973 * * * * * 16 0 * * * * * * 1496 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1496 0 0 N 18 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1496 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1496 0 0 L 20 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1496 0 0 Y 21 * * * * * * 1028 * * * * * * * * * * * * 973 21 0 * * * * * * 1496 0 0 F 22 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1496 0 0 Q 23 * * * * * * * 1028 * * * * * 973 * * * * * * 23 0 * * * * * * 1496 0 0 L 24 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1496 0 0 F 25 * * * * 973 * * * * * * * * * * * * * * 1028 25 0 * * * * * * 1496 0 0 N 26 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1496 0 0 N 27 * * * * * * * * 1028 * * 973 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1496 0 0 T 28 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 28 0 * * * * * * 1496 0 0 N 29 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1496 0 0 S 30 * * * * * * * 1028 * * * * * * * 973 * * * * 30 0 * * * * * * 1496 0 0 V 31 * * * * * * * 1028 * * * * * * * * * 973 * * 31 0 * * * * * * 1496 0 0 L 32 * * * * * * * 1028 * 973 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1496 0 0 A 33 973 * * * * * * * * * * * 1028 * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1496 0 0 G 34 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1496 0 0 N 35 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1496 0 0 C 36 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1496 0 0 K 37 * * * * * * * * 973 * * * * * * * 1028 * * * 37 0 * * * * * * 1496 0 0 L 38 * * * * 1028 * * * * 973 * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1496 0 0 K 39 * * * 1028 * * * * 973 * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1496 0 0 F 40 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1496 0 0 T 41 * * * * * * * * * * * * * * * 1028 973 * * * 41 0 * * * * * * 1496 0 0 D 42 * * 973 * * * * * * * * * * * * 1028 * * * * 42 0 * * * * * * 1496 0 0 A 43 973 * * * * * * * * * * * * 1028 * * * * * * 43 0 * * * * * * 1496 0 0 G 44 * * * * * 973 * 1028 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1496 0 0 D 45 * * 973 * * * * * * * * * * * * 1028 * * * * 45 0 * * * * * * 1496 0 0 K 46 * * * 1028 * * * * 973 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1496 0 0 P 47 * * * * * * * * * * * * 973 * * * * 1028 * * 47 0 * * * * * * 1496 0 0 T 48 * * * * 1028 * * * * * * * * * * * 973 * * * 48 0 * * * * * * 1496 0 0 T 49 * * * * * * * * * * * * * * * 1028 973 * * * 49 973 * 1028 * * * * 1496 0 0 Q 50 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 50 0 * * * * * 0 1000 0 1000 I 51 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 I 52 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1496 0 0 D 53 * * 973 * * * * * 1028 * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1496 0 0 M 54 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1496 0 0 G 55 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1496 0 0 P 56 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1496 0 0 H 57 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1496 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1496 0 0 I 59 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1496 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1496 0 0 I 61 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1496 0 0 K 62 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1496 0 0 E 63 * * * 973 * 1028 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1496 0 0 Y 64 * * * * * * * * * * * * * 1028 * * * * * 973 64 0 * * * * * * 1496 0 0 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1496 0 0 E 66 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1496 0 0 Y 67 * * * * * * * * * 1028 * * * * * * * * * 973 67 0 * * * * * * 1496 0 0 R 68 * * * * * * * * * * * * * * 973 * * * 1028 * 68 0 * * * * * * 1496 0 0 Y 69 * * * * 1028 * * * * * * * * * * * * * * 973 69 0 * * * * * * 1496 0 0 F 70 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1496 0 0 P 71 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1496 0 0 Y 72 * * * * * * * * * * * * * * * 1028 * * * 973 72 0 * * * * * * 1496 0 0 A 73 973 * * * * * * * * 1028 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1496 0 0 L 74 * * * * * * * * * 973 * * 1028 * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1496 0 0 D 75 * * 973 * * * * * * * * * * * * * 1028 * * * 75 0 * * * * * * 1496 0 0 L 76 * * * * * * * * * 973 * * 1028 * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1496 0 0 E 77 * * * 973 * * * * * 1028 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1496 0 0 A 78 973 * * * * * * * * * * * * * * 1028 * * * * 78 0 * * * * * * 1496 0 0 G 79 * * * * * 973 * * * * * 1028 * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1496 0 0 S 80 * * * * * * * * * * * * * * * 973 * * * 1028 80 0 * * * * * * 1496 0 0 T 81 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 81 0 * * * * * * 1496 0 0 I 82 * * * * * * * 973 * * 1028 * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1496 0 0 E 83 * * * 973 * * * * 1028 * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1496 0 0 I 84 * * * * * * * 973 * * * * * * * * * 1028 * * 84 0 * * * * * * 1496 0 0 E 85 * * * 973 * * * * * * * * * * * * * 1028 * * 85 0 * * * * * * 1496 0 0 N 86 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1496 0 0 Q 87 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 87 0 * * * * * * 1496 0 0 Y 88 * * 1028 * * * * * * * * * * * * * * * * 973 88 0 * * * * * * 1496 0 0 G 89 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1496 0 0 E 90 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1496 0 0 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 1028 973 * * 91 0 * * * * * * 1496 0 0 I 92 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1496 0 0 F 93 * * * * 973 * * * * 1028 * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1496 0 0 L 94 * * * * * * * * * 973 * * * * * * * 1028 * * 94 0 * * * * * * 1496 0 0 G 95 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1496 0 0 K 96 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1496 0 0 Y 97 * 1028 * * * * * * * * * * * * * * * * * 973 97 0 * * * * * * 1496 0 0 G 98 1028 * * * * 973 * * * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1496 0 0 S 99 * * 1028 * * * * * * * * * * * * 973 * * * * 99 0 * * * * * * 1496 0 0 S 100 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 100 0 * * * * * * 1496 0 0 P 101 * * * * * * * * * * * 1028 973 * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1496 0 0 M 102 * * * 1028 * * * * * * 973 * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1496 0 0 I 103 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1496 0 0 N 104 * * * * * * * * * * * 973 * * * * 1028 * * * 104 0 * * * * * * 1496 0 0 L 105 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1496 0 0 R 106 * * * * * * * * 1028 * * * * * 973 * * * * * 106 0 * * * * * * 1496 0 0 P 107 * * * * * * * * * * * * 973 * * 1028 * * * * 107 0 * * * * * * 1496 0 0 P 108 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1496 0 0 S 109 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 R 110 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 S 112 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 A 113 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 E 114 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 114 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //