HHsearch 1.5 NAME c2ke3A_ FAM FILE c2ke3A_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c2ke3A_.a3m DATE Thu Jan 10 02:54:37 2013 LENG 43 match states, 43 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4913 3.1642 SEQ >ss_dssp CCCSSCCSSSSHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC >sa_dssp EDEEEEEEDEEDEEEDEEEEEEEEEEEEEEEEEDEDEEEEEEE >ss_pred CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC >ss_conf 9654322345667899987378631024899999999850279 >Consensus sxlxxsedslyxdyvdvfyntkpykhrddrllqalxdilneen >c2ke3A_ SKLEGSEDSLYSDYVDVFYNTKPYKHRDDRLLQALMDILNEEN >UniRef50_P29120(711-753:753) Neuroendocrine convertase 1 n=29 Tax=Euteleostomi RepID=NEC1_HUMAN E=3e-17 s/c=2.08 id=86% cov=102% SQLKDSEDSLYNDYVDVFYNTKPYKHRDDRLLQALVDILNEEN # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1084 0 0 K 2 * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * 2 0 * * * * * * 1084 0 0 L 3 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1084 0 0 E 4 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1084 0 0 G 5 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1084 0 0 S 6 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 6 0 * * * * * * 1084 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1084 0 0 D 8 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1084 0 0 S 9 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 9 0 * * * * * * 1084 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1084 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 11 0 * * * * * * 1084 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1084 0 0 D 13 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1084 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1084 0 0 V 15 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 15 0 * * * * * * 1084 0 0 D 16 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1084 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 17 0 * * * * * * 1084 0 0 F 18 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1084 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 19 0 * * * * * * 1084 0 0 N 20 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1084 0 0 T 21 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 21 0 * * * * * * 1084 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1084 0 0 P 23 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1084 0 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 24 0 * * * * * * 1084 0 0 K 25 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1084 0 0 H 26 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1084 0 0 R 27 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 27 0 * * * * * * 1084 0 0 D 28 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1084 0 0 D 29 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1084 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 30 0 * * * * * * 1084 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1084 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1084 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1084 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1084 0 0 L 35 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1084 0 0 M 36 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * 36 0 * * * * * * 1084 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1084 0 0 I 38 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1084 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1084 0 0 N 40 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1084 0 0 E 41 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1084 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1084 0 0 N 43 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 43 0 * * 0 * * * 1084 0 0 //