HHsearch 1.5 NAME c2fz0A_ FAM FILE c2fz0A_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c2fz0A_.a3m DATE Fri Mar 12 20:43:08 2010 LENG 149 match states, 149 columns in multiple alignment FILT 5 out of 9 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.1 EVD 0.4024 -0.9295 SEQ >ss_dssp CCCCCCSEEEEEESSSCCCEEECCCSSSSSCSCCSSTTSSCCHHHHHHHHHHTTGGGCCCCSSCSSEECCSCCSSSEEEEECCCSSCTTEEEEEEEETTS CSSHHHHHHHHHTTSSCCCSTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTSSCCC >sa_dssp EEDBBAABAAAACECECCABACDEBEDEECBDBADDECDEDDDEDACECACECACEECEDCEEEDACCBEEEBCEBABAABAABEEDEEBBAAAAAAEDA DDDAACDAABAACECEDBDDEEDABDBBDEBCDDADECCEEEDEEEEEE >ss_pred CCEEEEEEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCC CCEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >ss_conf 9601136899873883743321344476654222444411008999998686303313660587368731022013022230377888649999961698 6300378874444300478679999999999999999998500311369 >Consensus MKrxnvsyvEvixxgxxxsscyxxxxxxsxYGsxxxaxxxxtpxvFhxLvxdmVipkVVxxxGNKVtKmSxxlIdGfDCyYtTxxxdxxtvlVCFxxxdv PKiLPlRxLseLkxxesnxxdexLxxxvxxildxFHeELlxYxxxtxxx >c2fz0A_ MKRFNVSYVEVIKNGETISSCFQPFQKNENYGTITSANEQITPVIFHNLIMDMVLPKVVPIKGNKVTKMSMNLIDGFDCFYSTDDHDPKTVYVCFTLVDI PKILPIRILSGLQEYESNATNELLSSHVGQILDSFHEELVEYRNQTLNS >UniRef50_Q6FX44(1-144:234) Similar to uniprot|Q12255 Saccharomyces cerevisiae YLR093c n=2 Tax=Saccharomycetaceae RepID=Q6FX44_CANGA E=2e-53 s/c=1.45 id=58% cov=95% MKRFNISYVEIIKNGVSVSSCYE--NDSSTYGATNEG--ACRPDIFHSLVVDMVVPKVIPVSGNKVTKMSTPLIDGFDCYYTTRDDDANTVLVCFTREDI PKILPIRVLSELKHNEAHeiDNDNKLSACVGNILDNFHNELIQYKNQ---- >UniRef50_C5DN15(1-141:228) KLTH0G13376p n=1 Tax=Lachancea thermotolerans CBS 6340 RepID=C5DN15_LACTC E=9e-51 s/c=1.42 id=46% cov=95% MKEYNVTYLEVIQRGDVVAKYYN--DQTSGYGSLGRAGKNATPKVFERLVEELVIPKVVHVEGNKVTKMSTPLLDGFDCYYGTA--DDATTYVCFSQIDV PKILPLRLLTELKSI-SNGSDEELAEHVRTIVRQFHEELLTYHDSS--- >UniRef50_Q6CJD6(1-142:231) KLLA0F19448p n=1 Tax=Kluyveromyces lactis RepID=Q6CJD6_KLULA E=2e-48 s/c=1.35 id=44% cov=95% MKRYSVSYVEVWDGDRVLSSWYDSKDeNNSKYGS-TDKGRADQKAVFHRLIGDMVIRTVVNLPGNKVTKTSIDLIEGYDCYYTTAENNK--VLICFVKEE VPKFLPLRLLSELKCL-NNDNDEYLKSNIDNQLDKFHEELLSYRTE---- >UniRef50_Q750A3(20-162:248) AGR054Cp n=1 Tax=Eremothecium gossypii RepID=Q750A3_ASHGO E=8e-48 s/c=1.33 id=38% cov=94% ----SLTFVEIVNRDKSTTRCqwyHDATAGSAGYGAVSNrAHKDVTQESFHNLVHEVVIPKVVRLTGNKVIKTTMTFIDGYDCYYTTN--DAGQVLVCFA SVGTPKILPLRALTRLKAMET-SDDAVLHRNLDAILKEFHQELLSYHDPT--- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1891 0 0 K 2 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1891 0 0 R 3 * * * 1987 * * * * * * * * * * 419 * * * * * 3 0 * * * * * * 1891 0 0 F 4 * * * * 1037 * * * * * * * * * * * * * * 964 4 0 * * * * * * 1891 0 0 N 5 * * * * * * * * * * * 789 * * * 1248 * * * * 5 0 * * * * * * 2161 0 0 V 6 * * * * * * * 2432 * 2206 * * * * * * * 742 * * 6 0 * * * * * * 2161 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 761 1286 * * * 7 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 8 * * * * 2206 * * * * * * * * * * * * * * 352 8 0 * * * * * * 2161 0 0 V 9 * * * * * * * * * 2370 * * * * * * * 310 * * 9 0 * * * * * * 2161 0 0 E 10 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 2161 0 0 V 11 * * * * * * * 1315 * * * * * * * * * 742 * * 11 0 * * * * * * 2161 0 0 I 12 * * * * * * * 789 * * * * * * * * * 2206 2290 * 12 0 * * * * * * 2161 0 0 K 13 * * 2290 * * * * * 1375 * * 2206 * 2370 * * * * * * 13 0 * * * * * * 2161 0 0 N 14 * * * * * 2290 * * * * * 1375 * * 1286 * * * * * 14 0 * * * * * * 2161 0 0 G 15 * * 1248 * * 789 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 2161 0 0 E 16 * * 2370 2320 * * * * 2206 * * * * * 2290 * * 2432 * * 16 0 * * * * * * 2161 0 0 T 17 * * * * * * * * * * * * * * * 1315 2320 1330 * * 17 0 * * * * * * 2161 0 0 I 18 * * * * * * * 2320 * 2290 * * * * * * 2206 1401 * * 18 0 * * * * * * 2161 0 0 S 19 2370 * * * * * * * * * * * * * * 761 2206 * * * 19 0 * * * * * * 2161 0 0 S 20 * * * * * * * * 2370 * * * * * 2206 761 * * * * 20 0 * * * * * * 2161 0 0 C 21 * 732 * * * * * * * * * * * * * * * * 2290 2370 21 352 2206 * 1585 585 * * 2161 1000 0 F 22 * * * * 2320 * 2206 * * * * * * * * * * * * 778 22 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 23 * * 1248 2432 * * * * * * * 2370 * 2320 * * * * * * 23 687 * 1401 * * * * 2161 0 0 P 24 1570 * * * * * * * * * * * 1547 * * 1640 * * * * 24 0 * * * * * 0 1838 0 1425 F 25 * * * * 1547 * * * 1640 * * * * * * * 1570 * * * 25 0 * * * * 0 * 1838 0 1425 Q 26 2206 * 1330 * * * * * * * * 2432 * 2320 * * * * * * 26 330 2290 * 0 * * * 2161 1000 0 K 27 * * 2432 * * 2206 * * 2320 * * 2290 * 2370 * * * * * * 27 0 * * * * * * 2161 0 0 N 28 * * * * * * * * * * * 1305 * * * 1315 2370 * * * 28 0 * * * * * * 2161 0 0 E 29 2206 * * 2320 * * * * * * * * * * * 778 * * * * 29 0 * * * * * * 2161 0 0 N 30 * * * * * 1286 * * 2290 * * 2320 * * * * 2432 * * * 30 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 31 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 31 0 * * * * * * 2161 0 0 G 32 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 2161 0 0 T 33 1315 * * * * * * * * * * * * * * 1330 2320 * * * 33 330 * 2290 * * * * 2161 0 0 I 34 * * * * * * * 1990 * 2042 * * * * * * 2099 1879 * * 34 0 * * * * 0 * 1969 0 1000 T 35 * * * * * 2370 * * * * * 2432 * * * 2206 1305 * * * 35 0 * * * * * * 2161 0 0 S 36 * * 2290 2432 * * * * * * * 2206 * * 2370 2320 * * * * 36 352 2206 * 0 * * * 2161 1000 0 A 37 712 * * * * 2432 * * 2290 * * * * * * * * * * * 37 296 * 2432 * * * * 2161 0 0 N 38 * * * * * 1054 1946 * * * * 1950 * * * * * * * * 38 0 * * * * * 0 2035 0 1000 E 39 * * * 1950 * * * * 1015 * * * * * 2021 * * * * * 39 0 * * * * 0 * 2035 0 1000 Q 40 1360 * 2206 * * * * * * * * 2370 * 2320 * * * * * * 40 0 * * * * * * 2161 0 0 I 41 2370 2432 2290 * * * * 2320 * * * * * * * * * 2206 * * 41 0 * * * * * * 2161 0 0 T 42 * * * * * * * * * * * * * 2290 2432 * 712 * * * 42 0 * * * * * * 2161 0 0 P 43 * * * * * * * * 2290 * * * 789 2206 * * * * * * 43 0 * * * * * * 2161 0 0 V 44 2290 * 2432 2206 * * * * 2370 * * * * * * * * 2320 * * 44 0 * * * * * * 2161 0 0 I 45 * * * * * * * 1375 * * * * * * * 2206 * 1330 * * 45 0 * * * * * * 2161 0 0 F 46 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2161 0 0 H 47 * * * 2370 * * 310 * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 2161 0 0 N 48 * * * * * * * * * * * 1262 * * 1330 2432 * * * * 48 0 * * * * * * 2161 0 0 L 49 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 2161 0 0 I 50 * * * * * * * 1305 * * * * * * * * * 748 * * 50 0 * * * * * * 2161 0 0 M 51 * * * 2370 * 2290 2206 * * * 2320 * * * * * * 2432 * * 51 0 * * * * * * 2161 0 0 D 52 * * 761 1286 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2161 0 0 M 53 * * * * * * * * * 2370 761 * * * * * * 2206 * * 53 0 * * * * * * 2161 0 0 V 54 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 54 0 * * * * * * 2161 0 0 L 55 * * * * * * * 702 * 2320 * * * * * * * 2432 * * 55 0 * * * * * * 2161 0 0 P 56 * * * * * * * * * * * * 330 * 2290 * * * * * 56 0 * * * * * * 2161 0 0 K 57 * * * * * * * * 330 * * * * * * * 2290 * * * 57 0 * * * * * * 2161 0 0 V 58 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 58 0 * * * * * * 2161 0 0 V 59 * * * * * * * 2432 * * * * * * * * * 296 * * 59 0 * * * * * * 2161 0 0 P 60 * * * * * * 2370 * * * * 2290 1375 * 2206 * * * * * 60 0 * * * * * * 2161 0 0 I 61 * * * * * * * 2320 * 1248 * * * * * * * 1401 * * 61 0 * * * * * * 2161 0 0 K 62 * * * 2370 * * * * 2320 * * * 2290 * * 2432 2206 * * * 62 0 * * * * * * 2161 0 0 G 63 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 2161 0 0 N 64 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 2161 0 0 K 65 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 2161 0 0 V 66 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 66 0 * * * * * * 2161 0 0 T 67 * * * * * * * 2206 * * * * * * * * 352 * * * 67 0 * * * * * * 2161 0 0 K 68 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2161 0 0 M 69 * * * * * * * * * * 789 * * * * * 1248 * * * 69 0 * * * * * * 2161 0 0 S 70 * * * * * * * * * * * * * * * 352 2206 * * * 70 0 * * * * * * 2161 0 0 M 71 * * * * * * * 2290 * * 1262 * * * * * 1401 * * * 71 0 * * * * * * 2161 0 0 N 72 * * 2290 * * * * * * * * 2320 1401 * * * 2206 * * * 72 0 * * * * * * 2161 0 0 L 73 * * * * 2206 * * * * 352 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 2161 0 0 I 74 * * * * * * * 310 * 2370 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2161 0 0 D 75 * * 330 2290 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 2161 0 0 G 76 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 2161 0 0 F 77 * * * * 789 * * * * * * * * * * * * * * 1248 77 0 * * * * * * 2161 0 0 D 78 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 2161 0 0 C 79 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2161 0 0 F 80 * * * * 2320 * * * * * * * * * * * * * * 322 80 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 81 0 * * * * * * 2161 0 0 S 82 * * * * * 2370 * * * * * * * * * 2320 722 * * * 82 0 * * * * * * 2161 0 0 T 83 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 83 0 * * * * * * 2161 0 0 D 84 1330 * 2320 * * * * * * * * 2206 * * 2432 * * * * * 84 761 * 1286 * * * * 2161 0 0 D 85 * * 618 1522 * * * * * * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * 0 1669 0 1479 H 86 * * 1656 * * * 1580 * * * * 1522 * * * * * * * * 86 0 * * * * 0 * 1669 0 1479 D 87 * * 330 * * * * * * * * 2290 * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2161 0 0 P 88 1315 * 2370 * * * * * 2290 * * * 2320 * * * * * * * 88 330 * 2290 * * * * 2161 0 0 K 89 2042 * * * * 1879 * * 1990 * * 2099 * * * * * * * * 89 0 * * * * * 0 1969 0 1000 T 90 * * * * * * * * * * * * * 1879 * * 458 * * * 90 0 * * * * 0 * 1969 0 1000 V 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 2370 310 * * 91 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 92 * * * * * * * * * 722 * * * * * * * * * 1345 92 0 * * * * * * 2161 0 0 V 93 * * * * * * * 2290 * * * * * * * * * 330 * * 93 0 * * * * * * 2161 0 0 C 94 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 2161 0 0 F 95 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 2161 0 0 T 96 2206 * * * * * * * * * * * * * * 2370 1375 2290 * * 96 0 * * * * * * 2161 0 0 L 97 * * * * * * * * 2290 2320 * * * 2370 2432 2206 * * * * 97 0 * * * * * * 2161 0 0 V 98 * * * 1360 * * * 2370 * * * * * * * * * 1262 * * 98 0 * * * * * * 2161 0 0 D 99 * * 789 2290 * 2206 * * * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 2161 0 0 I 100 * * * * * * * 1375 * * * * * * * * 2206 1330 * * 100 0 * * * * * * 2161 0 0 P 101 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2161 0 0 K 102 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 2161 0 0 I 103 * * * * 2290 * * 330 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 2161 0 0 L 104 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2161 0 0 P 105 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 105 0 * * * * * * 2161 0 0 I 106 * * * * * * * 1375 * 702 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 2161 0 0 R 107 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 107 0 * * * * * * 2161 0 0 I 108 2206 * * * * * * 2320 * 1330 * * * * * * * 2432 * * 108 0 * * * * * * 2161 0 0 L 109 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 2161 0 0 S 110 * * * * * * * * * * * * * * * 761 1286 * * * 110 0 * * * * * * 2161 0 0 G 111 * * * 778 * 2320 * * * * * * * * 2206 * * * * * 111 0 * * * * * * 2161 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 113 * * * * * * * * 322 * * * * 2320 * * * * * * 113 0 * * * * * * 2161 0 0 E 114 2206 2290 * 2320 * * 2432 * * * * * * * * 2370 * * * * 114 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 115 * * * * * * * 2370 * 2290 2206 2432 * * * * * * * 2320 115 732 * 1330 * * * * 2161 0 0 E 116 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * 0 * 1751 0 1428 S 117 2432 * * * * * * * * * * 2290 * * * 1345 2206 * * * 117 352 * 2206 * * * * 2161 0 0 N 118 * * * * * * 2082 * * * * 389 * * * * * * * * 118 389 2082 * 1000 1000 0 * 1891 1000 1000 A 119 2320 * 1360 * * 2370 * * * * * * * * * 2206 * * * * 119 0 * * * * * * 2161 0 0 T 120 * * 2206 * * * * * * * * 1360 * * * 2370 2320 * * * 120 0 * * * * * * 2161 0 0 N 121 * * 322 * * * * * * * * 2320 * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2161 0 0 E 122 2206 * * 742 * * * * * * * 2432 * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 2161 0 0 L 123 * * * 2370 * * * * 2432 2320 * * * * * * * 2206 * 2290 123 0 * * * * * * 2161 0 0 L 124 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2161 0 0 S 125 2370 * * * * * 2206 * 2290 * * * * * * 1375 * * * * 125 0 * * * * * * 2161 0 0 S 126 2432 * * 2370 * * * * * * * * * * 2206 1305 * * * * 126 0 * * * * * * 2161 0 0 H 127 * 2432 * * * * 1345 * * * * 1248 * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2161 0 0 V 128 * * * * * * * 2290 * 2206 * * * * * * * 789 * * 128 0 * * * * * * 2161 0 0 G 129 * * 1248 * * 1375 * * * * * * * * 2370 * * * * * 129 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 130 2206 * * * * * * * * * * 1360 * 2320 * * 2370 * * * 130 0 * * * * * * 2161 0 0 I 131 * * * * * * * 330 * * * * * 2290 * * * * * * 131 0 * * * * * * 2161 0 0 L 132 * * * * * * * * * 310 * * * * * * * 2370 * * 132 0 * * * * * * 2161 0 0 D 133 * * 761 * * * * * 2206 * * * * * 2370 * * * * * 133 0 * * * * * * 2161 0 0 S 134 * * * 2206 * * * * 2290 * * 2432 * 2370 * 2320 * * * * 134 0 * * * * * * 2161 0 0 F 135 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 2161 0 0 H 136 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 2161 0 0 E 137 * * * 742 * * * * * * * 2432 * 2206 * * * * * * 137 0 * * * * * * 2161 0 0 E 138 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 138 0 * * * * * * 2161 0 0 L 139 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 139 0 * * * * * * 2161 0 0 V 140 * * * * * * * 2432 * 702 * * * * * * * 2320 * * 140 0 * * * * * * 2161 0 0 E 141 * * * 2320 * * * * * * * * * 2432 * 1248 2370 * * * 141 0 * * * * * * 2161 0 0 Y 142 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 142 0 * * * * * * 2161 0 0 R 143 * * * * * * 1286 * 2432 * * * * * 1305 * * * * * 143 0 * * * * * * 2161 0 0 N 144 * * 1286 * * * * * * * * 1375 * * * * 2290 * * * 144 0 * * * * * * 2161 0 0 Q 145 * * * 2290 * * * * * * * * 2206 1375 * 2370 * * * * 145 0 * * * * * * 2161 0 0 T 146 * * * * * * * * * * * * * * * 1671 544 * * * 146 0 * * * * * * 1805 0 0 L 147 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1000 0 0 N 148 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1000 0 0 S 149 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 149 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //