HHsearch 1.5 NAME c2ctuA_ FAM FILE c2ctuA_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c2ctuA_.a3m DATE Wed Mar 10 01:40:58 2010 LENG 73 match states, 73 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4789 2.2564 SEQ >ss_dssp CCCCSCCCCCCCCCCCSEEECSSSCCEEECCCCCCCSSSCCCHHHHHTCSCCCSSCCCSSCCCCCCCSSCCCC >sa_dssp EEEEEEEEEEEEEEEEECDEBEDEDEEBEEDEDEEEEEDCBAEEBBEECEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE >ss_pred CCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHCCCCCCC >ss_conf 9754322121242042101000053899870000000483568863554666423620142011010287789 >Consensus xxxxxxxkrqkihlgdrsqkcskcgiifirrstlsrrktpmcekcrkdscqeaalnkdegnesgxktxxxsxx >c2ctuA_ GSSGSSGKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRKTPMCEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGKKTSGPSSG >UniRef50_Q8TF39(272-544:744) Zinc finger protein 483 n=11 Tax=Eutheria RepID=ZN483_HUMAN E=1e-147 s/c=0.47 id=81% cov=101% SALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRKTPMCEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGEKTHKCSKC # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * G 1 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1 0 * * * * * * 1131 0 0 S 2 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 2 0 * * * * * * 1131 0 0 S 3 * * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * 3 0 * * * * * * 1131 0 0 G 4 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 4 0 * * * * * * 1131 0 0 S 5 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 5 0 * * * * * * 1131 0 0 S 6 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * 6 0 * * * * * * 1131 0 0 G 7 * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * 7 0 * * * * * * 1131 0 0 K 8 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1131 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1131 0 0 Q 10 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 10 0 * * * * * * 1131 0 0 K 11 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1131 0 0 I 12 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1131 0 0 H 13 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1131 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1131 0 0 G 15 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1131 0 0 D 16 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1131 0 0 R 17 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 17 0 * * * * * * 1131 0 0 S 18 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 18 0 * * * * * * 1131 0 0 Q 19 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 19 0 * * * * * * 1131 0 0 K 20 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1131 0 0 C 21 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1131 0 0 S 22 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 22 0 * * * * * * 1131 0 0 K 23 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1131 0 0 C 24 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1131 0 0 G 25 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1131 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1131 0 0 I 27 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1131 0 0 F 28 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1131 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1131 0 0 R 30 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 30 0 * * * * * * 1131 0 0 R 31 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 31 0 * * * * * * 1131 0 0 S 32 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 32 0 * * * * * * 1131 0 0 T 33 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 33 0 * * * * * * 1131 0 0 L 34 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1131 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1131 0 0 R 36 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 36 0 * * * * * * 1131 0 0 R 37 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 37 0 * * * * * * 1131 0 0 K 38 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1131 0 0 T 39 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 39 0 * * * * * * 1131 0 0 P 40 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1131 0 0 M 41 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1131 0 0 C 42 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1131 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1131 0 0 K 44 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1131 0 0 C 45 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1131 0 0 R 46 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 46 0 * * * * * * 1131 0 0 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1131 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1131 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 49 0 * * * * * * 1131 0 0 C 50 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1131 0 0 Q 51 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 51 0 * * * * * * 1131 0 0 E 52 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1131 0 0 A 53 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1131 0 0 A 54 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1131 0 0 L 55 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1131 0 0 N 56 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1131 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1131 0 0 D 58 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1131 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1131 0 0 G 60 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1131 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1131 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1131 0 0 S 63 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 63 0 * * * * * * 1131 0 0 G 64 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1131 0 0 K 65 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1131 0 0 K 66 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1131 0 0 T 67 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 67 0 * * * * * * 1131 0 0 S 68 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * 68 0 * * * * * * 1131 0 0 G 69 * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1131 0 0 P 70 * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1131 0 0 S 71 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 71 0 * * * * * * 1131 0 0 S 72 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 72 0 * * * * * * 1131 0 0 G 73 * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * 0 * * * 1131 0 0 //