HHsearch 1.5 NAME c1zzpA_ FAM FILE c1zzpA_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c1zzpA_.a3m DATE Mon Mar 8 22:15:21 2010 LENG 109 match states, 109 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4181 -0.3818 SEQ >ss_dssp CTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTSCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGCSCSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCSSSSCSSSCCCCCCHHHHHHHHH HHHHHTTTC >sa_dssp EEECECDCADEBAEDACEABEDCEEEECDDDBACECADEACDCADDACEECECEECCECADDAADDABDBAEECCECEDEEDEEEDEEEEBDDAEECBED ABDCADEBE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHC >ss_conf 9403688999899999998523732447748999965899999999984478776767999999999964999741211278887634789999999999 999998509 >Consensus sgaitkxxxlxxxxxlxxaxsrnsexxxxxSxlvdtGxqLxxyCxxyvdxIxQxRNKFAFREAvskLExsLqELQxxxAxaGxxPxaxxxxnxLLSxVqE ISDvVQRle >c1zzpA_ SGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGKNLYSFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSVKE ISDIVQRLE >UniRef50_P42684(1084-1182:1182) Tyrosine-protein kinase ABL2 n=44 Tax=Euteleostomi RepID=ABL2_HUMAN E=4e-39 s/c=1.64 id=45% cov=92% ---ISKEALLECADLLSSALT----EPVPNSQLVDTGHQLLDYCSGYVDCIPQTRNKFAFREAVSKLELSLQELQVSSAAAGV-PGTNPVLNNLLSCVQE ISDVVQR-- >UniRef50_Q9I9L1(619-721:721) Arg protein-tyrosine kinase (Fragment) n=2 Tax=Xenopus RepID=Q9I9L1_XENLA E=4e-29 s/c=1.24 id=46% cov=72% -----------------------------NSQLVDTGHQLLDYCTGICGLIPQTRNKFAFREAVSRLEVSLQELQGVSAGGGgsstAPPGANSVLNHLLS CVQEISDVVQR-- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 G 2 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 I 4 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1432 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * 1071 932 * * * 5 0 * * * * * * 1432 0 0 K 6 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1432 0 0 G 7 * * * 1071 * 932 * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1432 0 0 V 8 1071 * * * * * * * * * * * * * * * * 932 * * 8 0 * * * * * * 1432 0 0 V 9 * * * * * * * * * 1071 * * * * * * * 932 * * 9 0 * * * * * * 1432 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1432 0 0 D 11 * * 932 1071 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1432 0 0 S 12 * 1071 * * * * * * * * * * * * * 932 * * * * 12 0 * * * * * * 1432 0 0 T 13 1071 * * * * * * * * * * * * * * * 932 * * * 13 0 * * * * * * 1432 0 0 E 14 * * 1071 932 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1432 0 0 A 15 932 * * * * * * * * 1071 * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1432 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1432 0 0 C 17 * 932 * * * * * * * * * * * * * 1071 * * * * 17 0 * * * * * * 1432 0 0 L 18 * * * * * * * * * 932 * * * * * 1071 * * * * 18 0 * * * * * * 1432 0 0 A 19 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1432 0 0 I 20 * * * * * * * 932 * 1071 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1432 0 0 S 21 * * * * * * * * * * * * * * * 932 1071 * * * 21 932 * 1071 * * * * 1432 0 0 R 22 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 22 0 * * * * * 0 1000 0 1000 N 23 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 23 0 * * * * * 0 1000 0 1000 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 24 0 * * * * * 0 1000 0 1000 E 25 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * 0 * 1000 0 1000 Q 26 * * * 1071 * * * * * * * * * 932 * * * * * * 26 0 * * * * * * 1432 0 0 M 27 * * * * * * * * * * 932 * 1071 * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1432 0 0 A 28 932 * * * * * * * * * * * * * * * * 1071 * * 28 0 * * * * * * 1432 0 0 S 29 * * * * * * * * * * * * 1071 * * 932 * * * * 29 0 * * * * * * 1432 0 0 H 30 * * * * * * 1371 * * * * 705 * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1512 0 0 S 31 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 31 0 * * * * * * 1512 0 0 A 32 1371 * * * * * * * * * * * * 705 * * * * * * 32 0 * * * * * * 1512 0 0 V 33 * * * * * * * * * 705 * * * * * * * 1371 * * 33 0 * * * * * * 1512 0 0 L 34 * * * * * * * * * 1371 * * * * * * * 705 * * 34 0 * * * * * * 1512 0 0 E 35 * * 705 1371 * * * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1512 0 0 A 36 1371 * * * * * * * * * * * * * * * 705 * * * 36 0 * * * * * * 1512 0 0 G 37 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1512 0 0 K 38 * * * * * * 705 * 1371 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1512 0 0 N 39 * * * * * * * * * * * 1371 * 705 * * * * * * 39 0 * * * * * * 1512 0 0 L 40 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1512 0 0 Y 41 * * * * * * * * * 705 * * * * * * * * * 1371 41 0 * * * * * * 1512 0 0 S 42 * * 705 * * * * * * * * * * * * 1371 * * * * 42 0 * * * * * * 1512 0 0 F 43 * * * * 1371 * * * * * * * * * * * * * * 705 43 0 * * * * * * 1512 0 0 C 44 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1512 0 0 V 45 * * * * * * * * * * * * * * * 1751 1661 1371 * * 45 0 * * * * * * 1512 0 0 S 46 * * * * * 705 * * * * * * * * * 1371 * * * * 46 0 * * * * * * 1512 0 0 Y 47 * * * * * * * 1661 * * * * * * * * * * * 548 47 0 * * * * * * 1512 0 0 V 48 * 1661 * * * * * * * * * * * * * * * 548 * * 48 0 * * * * * * 1512 0 0 D 49 * * 548 * * 1661 * * * * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1512 0 0 S 50 * 1751 * * * * * * * 1661 * * * * * 1371 * * * * 50 0 * * * * * * 1512 0 0 I 51 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1512 0 0 Q 52 * * * * * * * * * * * * 705 1371 * * * * * * 52 0 * * * * * * 1512 0 0 Q 53 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1512 0 0 M 54 * * * * * * * * * * 1371 * * * * * 705 * * * 54 0 * * * * * * 1512 0 0 R 55 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 55 0 * * * * * * 1512 0 0 N 56 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1512 0 0 K 57 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1512 0 0 F 58 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1512 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1512 0 0 F 60 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1512 0 0 R 61 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 61 0 * * * * * * 1512 0 0 E 62 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1512 0 0 A 63 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1512 0 0 I 64 * * * * * * * 1371 * * * * * * * * * 705 * * 64 0 * * * * * * 1512 0 0 N 65 * * * * * * * * * * * 1371 * * * 705 * * * * 65 0 * * * * * * 1512 0 0 K 66 * * * * * * * * 548 * * * * * 1661 * * * * * 66 0 * * * * * * 1512 0 0 L 67 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1512 0 0 E 68 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1512 0 0 N 69 * * * * * * * * * 1751 * 1371 * * * * * 1661 * * 69 0 * * * * * * 1512 0 0 N 70 * * * * * * * * * * * 1371 * * * 705 * * * * 70 0 * * * * * * 1512 0 0 L 71 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1512 0 0 R 72 * * * * * * * * * * * * * 705 1371 * * * * * 72 0 * * * * * * 1512 0 0 E 73 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1512 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1512 0 0 Q 75 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 75 0 * * * * * * 1512 0 0 I 76 * * * * * 1661 * 1371 * * * * * * * * * 1751 * * 76 0 * * * * * * 1512 0 0 C 77 * 1371 * * * * * * * * * * * * * 1751 * 1661 * * 77 0 * * * * * * 1512 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * * 1371 * * 705 * * * * 78 0 * * * * * * 1512 0 0 A 79 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1512 0 0 T 80 1751 * * * * 1661 * * * * * * * * * * 1371 * * * 80 0 * * * * * * 1512 0 0 A 81 548 * * * * 1661 * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1512 0 0 G 82 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 82 548 1661 * 2000 415 * * 1512 1000 0 S 83 1661 * * * * * * * * * * * * * * 1371 * 1751 * * 83 508 * 1751 * * * * 1512 0 0 G 84 * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * 84 0 * * * * 0 * 1452 0 1000 P 85 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1512 0 0 A 86 1371 * * * * 705 * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1512 0 0 A 87 508 * * * * * * * * * * * * * * * 1751 * * * 87 0 * * * * * * 1512 0 0 T 88 * * * * * * * * * * * 705 * * * * 1371 * * * 88 0 * * * * * * 1512 0 0 Q 89 * * * * * * * * * * * * 1751 1371 * 1661 * * * * 89 0 * * * * * * 1512 0 0 D 90 * * 1371 * * * * * * * * * * * * * * 705 * * 90 0 * * * * * * 1512 0 0 F 91 * * * * 1371 * * * * 705 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1512 0 0 S 92 * * * * * * * * * * * 705 * * * 1371 * * * * 92 0 * * * * * * 1512 0 0 K 93 * * * * * * 1661 * 1371 * * 1751 * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1512 0 0 L 94 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1512 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1512 0 0 S 96 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 96 0 * * * * * * 1512 0 0 S 97 * 705 * * * * * * * * * * * * * 1371 * * * * 97 0 * * * * * * 1512 0 0 V 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 98 0 * * * * * * 1512 0 0 K 99 * * * * * * * * 1371 * * * * 705 * * * * * * 99 0 * * * * * * 1512 0 0 E 100 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1512 0 0 I 101 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1512 0 0 S 102 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 102 0 * * * * * * 1512 0 0 D 103 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1512 0 0 I 104 * * * * * * * 1371 * * * * * * * * * 705 * * 104 0 * * * * * * 1512 0 0 V 105 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 105 0 * * * * * * 1512 0 0 Q 106 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 106 0 * * * * * * 1512 0 0 R 107 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 107 0 * * * * * * 1512 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 E 109 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //