HHsearch 1.5 NAME c1tapA_ FAM FILE c1tapA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c1tapA_.a3m DATE Wed Jan 9 21:43:33 2013 LENG 60 match states, 60 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.4 EVD 0.4413 1.5120 SEQ >ss_dssp CCCTTSCSSCTTTTCCSSSSSCEEEEEETTTEEEEEECTTTTCSCCCSBCSHHHHHHHHC >sa_dssp ECEEADCEEEAEDEBDDEECCEEABBCDEEECCDDBCBBEECEDECECCEDDEDACEDCE >ss_pred CCEEEECHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC >ss_conf 971531745776421365681489961688886505663455578410100777877419 >Consensus ynrlcikpxdxxxxcxxxexxxxxxfxxxkxxcxxfwicpexxxgxdyyssxxdcxxaci >c1tapA_ YNRLCIKPRDWIDECDSNEGGERAYFRNGKGGCDSFWICPEDHTGADYYSSYRDCFNACI >UniRef50_Q8I9U3(18-76:77) FXa inhibitor fXaI n=2 Tax=Ornithodoros savignyi RepID=Q8I9U3_9ACAR E=4e-21 s/c=1.73 id=47% cov=100% YNRLCVKPQDFTKQCSDDEDAVKVFFPHDKKSCEPFWICPEEDNGVDYYSTKEDCLSAC- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Y 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 1 0 * * * * * * 1439 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1439 0 0 R 3 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 3 0 * * * * * * 1439 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1439 0 0 C 5 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1439 0 0 I 6 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 6 0 * * * * * * 1439 0 0 K 7 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1439 0 0 P 8 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1439 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * 9 0 * * * * * * 1439 0 0 D 10 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1439 0 0 W 11 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 11 0 * * * * * * 1439 0 0 I 12 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 12 0 * * * * * * 1439 0 0 D 13 * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1439 0 0 E 14 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 14 0 * * * * * * 1439 0 0 C 15 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1439 0 0 D 16 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 16 0 * * * * * * 1439 0 0 S 17 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 17 0 * * * * * * 1439 0 0 N 18 * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1439 0 0 E 19 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1439 0 0 G 20 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1439 0 0 G 21 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1439 0 0 E 22 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 22 0 * * * * * * 1439 0 0 R 23 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 23 0 * * * * * * 1439 0 0 A 24 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 24 0 * * * * * * 1439 0 0 Y 25 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 25 0 * * * * * * 1439 0 0 F 26 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1439 0 0 R 27 * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * 27 0 * * * * * * 1439 0 0 N 28 * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1439 0 0 G 29 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1439 0 0 K 30 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1439 0 0 G 31 * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1439 0 0 G 32 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 32 0 * * * * * * 1439 0 0 C 33 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1439 0 0 D 34 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1439 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 35 0 * * * * * * 1439 0 0 F 36 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1439 0 0 W 37 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 37 0 * * * * * * 1439 0 0 I 38 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1439 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1439 0 0 P 40 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1439 0 0 E 41 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1439 0 0 D 42 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1439 0 0 H 43 * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1439 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 44 0 * * * * * * 1439 0 0 G 45 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1439 0 0 A 46 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 46 0 * * * * * * 1439 0 0 D 47 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1439 0 0 Y 48 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 48 0 * * * * * * 1439 0 0 Y 49 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 49 0 * * * * * * 1439 0 0 S 50 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 50 0 * * * * * * 1439 0 0 S 51 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 51 0 * * * * * * 1439 0 0 Y 52 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 52 0 * * * * * * 1439 0 0 R 53 * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 53 0 * * * * * * 1439 0 0 D 54 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1439 0 0 C 55 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1439 0 0 F 56 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1439 0 0 N 57 * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * 57 0 * * * * * * 1439 0 0 A 58 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1439 0 0 C 59 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1439 0 0 I 60 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 60 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //