HHsearch 1.5 NAME c1bi6H_ FAM FILE c1bi6H_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i c1bi6H_.a3m DATE Tue Mar 9 03:57:23 2010 LENG 41 match states, 41 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4828 2.7969 SEQ >ss_dssp CCSSCEECCCCSSCCTTCSSEEEETTEEEECEECCSSSCCC >sa_dssp EDEDCDCEEDBEECBEEAEECEDDEEDCCAEBEECEDEDEE >ss_pred CCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHCC >ss_conf 95068860543438124576675223366776316323029 >Consensus eeykcyctdtysdcpgfcktckaefgkyicldlispndcvk >c1bi6H_ EEYKCYCTDTYSDCPGFCKTCKAEFGKYICLDLISPNDCVK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 3 0 * * * * * * 1000 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 C 5 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 6 0 * * * * * * 1000 0 0 C 7 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 T 8 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 T 10 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 11 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 11 0 * * * * * * 1000 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 D 13 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 C 14 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 P 15 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 G 16 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 F 17 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 C 18 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 K 19 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 T 20 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 C 21 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 K 22 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 A 23 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 E 24 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 F 25 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 G 26 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 K 27 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 28 0 * * * * * * 1000 0 0 I 29 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 C 30 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 L 31 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 D 32 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 I 34 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 S 35 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 N 37 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 D 38 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 V 40 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 K 41 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 41 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //