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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6qleU_ | 3.55 | PDB header: dna binding protein | Chain: U: PDB Molecule: inner kinetochore subunit ame1,inner kinetochore subunit |
Added to library: Sat Oct 5 08:23:32 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | X | F | R | K | L | L | Y | K | L | D | L | R | L | F | Q | T | I | S | D | Q | M | T | R | D | L | K | D | I | L | D | I | N | V | S | N | N | E | L | C | Y | Q | L | K | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | A | R | K | E | D | L | N | Q | Q | I | I | S | V | R | N | E | I | Q | E | L | K | A | G | K | D | W | H | D | L | Q | N | E | Q | A | K | L | N | D | K | V | K | L | N | K | R | L | N | D | L | T | S | T | L | L | G | K | D | S | E | D | D | S | I | R | D | D | S | N | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | D | I | A | H | F | V | D | L | M | D | P | Y | N | G | L | L | K | K | I | N | K | I | N | E | N | L | S | N | E | L | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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