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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6n7pJ_ | 3.60 | PDB header: rna binding protein | Chain: J: PDB Molecule: pre-mrna-processing protein prp40; |
Added to library: Sat Sep 21 08:26:58 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | R | I | A | R | D | N | F | K | S | L | L | R | E | V | P | I | K | I | K | A | N | T | R | W | S | D | I | Y | P | H | I | K | S | D | P | R | F | L | H | M | L | G | R | N | G | S | S | C | L | D | L | F | L | D | F | V | D | E | Q | R | M | Y | I | F | A | Q | R | S | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | Q | Q | T | L | I | D | Q | N | F | E | W | N | D | A | D | S | D | E | I | T | K | Q | N | I | E | K | V | L | E | N | D | R | K | F | D | K | V | D | K | E | D | I | S | L | I | V | D | G | L | I | K | Q | R | N | E | K | I | Q | Q | K | L | Q | N | E | R | R | I | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | G | G | G | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Q | K | K | H | Y | F | W | L | L | L | Q | R | T | Y | T | K | T | G | K | P | K | P | S | T | W | D | L | A | S | K | E | L | G | E | S | L | E | Y | K | A | L | G | D | E | D | N | I | R | R | Q | I | F | E | D | F | K | P | E | ||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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